BGIOSGA030242
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA030242 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030242, complete gene. |
| LocusTag |
P0501E09.27 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030242-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030242-PA |
| Length |
5215 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:560451..565665 |
| Sequence Coding Region |
565579..565665,564576..564643),complement(563789..563814,563026..563116),complement(562684..562779 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:560451..565665 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:560451..565665 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTGCCCACGACGGCGTCCAAAGGGCGCGGCGCCGCCCGCTCTGCGCCGCCGCTCTTCGGCCCCTACCTCCGCCGCATCGTCAAGTGGCAACAAATGGATATCGAGTACACATTTTGGCAAATGGTCCATCTCTGTACTTCACCAAAAGTAGTCTATCAGCACACCAAATATCACAAGCAAACAAAGAATCAGTGGGCTCGGGATGATCCTGCTTTTGTTGTCATTCTAATTCTTTTCCTTGTGTTTGCAACATCAGCTTACTGTGCAGCGTATGGAGAGAGTCCTTCACATGCTGCTTTAACAATCACTTCAGTTGTGCTTGTCCATTTCTTGTTTGCTGGGATAGTTCTGGCCACACTTTGCTGGTTTCTTACAAATTCTTACTTGAGGGAGGAACCTAACAGTCATGTGGTTGAGCAACGTGTGGAGTGGCTCTATGCATTTGATGTTCATTGCAACTCATTCTTCCCAGCCTTTGTCATCCTATATGTGCTTCAATATTTTCTATCGCCTCTGTTGGTCGCACATGGCTTCTTTCCTGCTCTATTATCAAACCTCTTGTTTGTGGTGGCAATTTCTTATTATCACTACCTGAATTTTCTAGGATATGATGTTCTTCCATTTTTGGACAGAACAACATTTTTCTTGTACCCGATTGGGCTTGTCATCATTCTCTCTCCACTGATGATACTCATAGGGTTCAATCCAACAAGATACTTTTTGAGCTTGTACTTCCGTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLPTTASKGRGAARSAPPLFGPYLRRIVKWQQMDIEYTFWQMVHLCTSPKVVYQHTKYHKQTKNQWARDDPAFVVILILFLVFATSAYCAAYGESPSHAALTITSVVLVHFLFAGIVLATLCWFLTNSYLREEPNSHVVEQRVEWLYAFDVHCNSFFPAFVILYVLQYFLSPLLVAHGFFPALLSNLLFVVAISYYHYLNFLGYDVLPFLDRTTFFLYPIGLVIILSPLMILIGFNPTRYFLSLYFR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..87#1023..1090#1852..1877#2550..2640#2887..2982#4322..4387#4669..4727#4803..4925#5010..5081#5160..5215#ATGCTGCCCACGACGGCGTCCAAAGGGCGCGGCGCCGCCCGCTCTGCGCCGCCGCTCTTCGGCCCCTACCTCCGCCGCATCGTCAAGGTTCGTCGCTCTCGGATCTCTTTCCCCTCCTCTTTGATCTCTCTCTTCGCAGGCCGTATCACCACATGCTGTCGTTTTAGGAGCCTTCAATTCCACGTTTAGGGTTCCACTCCCACCCGAAATGTCAGCTCTCTCTCACTCGCCCTATCACAGATTTTCTTAGCATACCTACCTCATGTGATTGTGTAGGGAGGGGATCTCGTGTTTCAGATTCCTTCACTATTAGTGCTGATCCAGTCGTGTCTTGTCCCGAGTGTGCTGAGGCTTACGGTCTCACCTATTTGGTGCCTGTGTGCATCCCCACTTTGGAATTGCTTGGCCATTATTTCTGATTTTTTGCAAATATCTACATTCTTGGTGCATATATCTTTCAACAAATTTGACTAATTTAAAAAATACTAGGTGATTCGGGGGAGTAGTGCATTAAGTTATATTATTATATGCAATTCTCATTTACCCATGCAATAGTGAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTAAGGGGAGTATAAAATTGATCTTCCCAGGATTACTCTATAAAAGCATGTATACTAACACATCATGAATACTTTATTTTCCATCCTCTGTTGCATATTTTTTAATTTTGAAACAGGTTTGTGGGGTACTTCTTTACAGCTTACTCTGTGGCGTTATTGTTGAATATTCCTTTGATGCTAACTTTTAACTTTTAAGTTCATCCACAGACGTCAACCTTAGGGGAAACCTGATCGAAAACTATTCAAGCACTGTCTTGTGCTTCCTACTGTTACTACAGTGAATAAATTTGGAAAAATATTCTTGTCTTTTTCTGGTGCAGTCAGTAGATATTCCAACATAGGTTTACAACAAATATATGTGTTTTTCTATGCTCTATATCCATGCATCATCTGTTCTTAAGGTATTTGCAACAATCTAATATTGTTGTTCTCATCAACAGTGGCAACAAATGGATATCGAGTACACATTTTGGCAAATGGTCCATCTCTGTACTTCACCAAAAGTAGTGTATGCATCCTGCCCTCAGTCCTTTCTTCATTGTTCGTATTATTTATTTTGTTACACAAATGCAATCTGCAAATTTTATCATGGTAACAACAAACCTCTTGTATAATGAAATTCTTAATGCCAATGTTGCATAAGTGTGTCACTCAACCTACTAAGTTTTTATTATGGATGCTCTTGTGTGGGCATAACTATCATGGAATGGAACATTGATTTCGATAAATTCTCGAGGAATCTAGTTTTGAACTTTAGTACTTCTCTTACCATTACTGTCATAAACCCAGTTCAACGACTGAGCTATAACATGACCACCTAATTCACCTGTGGCTGCATAGAACACTCTGGGTTCGGCTCTGCTGAATGAGCTGAGTTAATTTCAGCACGGAAAACAAGGTGAGCCATCAACGCATGATTAATTAACAATCAACTATGATAAACTTGAAAAATGGATTTATTTGATTTTTAAAAGAAACTCCTATATGGAAATTCTTTGCATGAAATGCAGCATTAGCAGTTTTGGAAGCGTGTTCATGGTAAATGAGGGATTTTCTCAGCCCAACCTCACTTATGAACTCAGCCTTGATTAGCTCATGCTTGCTACAGTTGAGAGATACATCCTCATTTTTAGTTTCACCACTTGAAGTTATTCACTGCTAATGAATTGTCCATTTGCTTCAATTTTCGGTGCTTGATGCACATCTTATTGTTTAAGAACCTGACTGGCTTTTGTCTATTTGTATGCATGTTATGATCCTGGAAGACAGCTATCAGCACACCAAATATCACAAGCGTATGTGGTTTACTTTAACATTATTTGTTACTGCGGAATGTACGAATCATTACCTGTATTCTTTCGATAACCAACTTGTTGCTAAGCTACTCAATTCTATTATTTTGGACATAATATTTCTTGTTATAACCTTGTGATATATATTGGACTATTTTGATATTCCCATAAAATAGCTCTGTGACCATTCTTTCAGCCCTGAGATGCACTTTTTTTTTATCCCGTCATTAACATGCACATGTTTCTACTTGTTCACATTTCCTCTGTACATACCATTCAATCCTGATAACACATTTGCGCAATTTTATTTCTTACTTAAATAGTATACTATCCCGTCAAAGCTGATGTATATTTTTTTTGAAATATGCTACAGAGATAATTTGAGTTGACAATGCTACTGCTATTTCTTTGCTGTATGATCTTGATCGGCAGACATTATCGCTATTTTCTTACTGTGTGAACTTGGCACTGTAGTTCTCGAAGTTAACCCTGTTGAACTATGTTGAAACCACTATTAATTTATCATTTGACATTGGGCAAACATGCCTTGTGCTCATTCTGTGAACGTTCATATGATTATGGAAATTTGATTCATTCTTTACTGTGGCAGCCAATTAATTGCTGTGCATTTCATATTATGGAAAAATCCTGATTTCTCTCAATACTTATTTTCAGAAACAAAGAATCAGTGGGCTCGGGATGATCCTGCTTTTGTTGTCATTCTAATTCTTTTCCTTGTGTTTGCAACATCAGCTTACTGTGCAGCGTGAGTCATTTACATCCTTCTATTTTATTTGCGGGTTCCTCTCCATAGAATATTTGGGAATTTATTTTGCTGTAGAAAGCAAAGATATCTTCTTGACAGTTCAAATCTTTATCTTGCTTGGGACATTCATGTACTTACTTTTATTAGATGTTCCATGTTTTCTCTCTAATTTTCCGTTGTACAGTTAATCCATTGACTTACTTTTACTGGTTCCTCTTATTGAAAAGTAAAATTCTTGTTCTTTAGGTATGGAGAGAGTCCTTCACATGCTGCTTTAACAATCACTTCAGTTGTGCTTGTCCATTTCTTGTTTGCTGGGATAGTTCTGGCCACACTTTGCTGGTATGTATTTCATGTGGTAATGCTCACATCTTTATGGAGCTTAATGGTCTCTGATGATTATGACCATTAATTTTTATAGCTTTTCATTAAGTTATAATAAGGAAACTATTCTAACATGAAAACATCTCTAGTATCGAGTCCATTGATGCGAATTTTACAATAAATCTAGATAGTCTCAAATATAGCTGTCACATTTTAGGTCCTGTTTGAAAGTGATGAAATTTGGATGAATGAGGTGGATGAGATCTACTTGATTATCTCGATATATTAATATTTTGAAAAATAAACTTATCAAACAGCTAGGAACAAGTTGTCTAAGCAACGCAGTAGAATAAAGTTTTTTGAGAAATCATATTTTTAAAAGTGTGGAGCAAATAATCCAGGGTGGATTATAGCTGATCATCATTTCTGAACAGTGTCTTAGAAATGTTGATGACGTGGGTTCTAGGAAAGTAGGACTTTAAATATTGAATGTAGGTAGTCTTAACTGTCAGGCAAAGCCCTGGCAGTATTTTGGTCCCCAAAAAAAAAAAAAGAATGGAGGTAGTAGTACTACCTTGCCAGCACTTCCTATGAAGTTGAGTGGGAGCAAAATCCAGAATGACCTGATTTGCACTTGTGTCCTTTTTGCTGTCTGTACTCTGTACAAGCTTTTGAGGTATTTATGGTGCTACAGAAAATTGGAAATAACAAAAGTAAGCTTCGAGCTATATGTTTCCAAAATTCTGCAATACACCCAATGTAAATTGAAGCTTTCTAGAGTAGGCCAGTGGGACATTGTTATAAGCTACTATATTATTTTGGAACAGCTTGCTTAACTATTTGGCACCTTTTTCTTATATGGGAGTGCTGCCAGGCCTTTGCCTAGCAATTAAATTTTATAAATTAAAATAACTATACAGAACAAGAGGAGAGCAAAAAGAAATAAACCAAAATTTACAAGCCTTGTAACCAGTCTAAAACTACTTGTTGGAGAGGCTCCTTCATCGTACAAACATACAGGAGAACTTCCTTCTTAAAAACTTCAAACCAACGGTCCACTCCTGGAGACCTTGAAAAATCAGTCCATTTTGTTGCTTCCATATATGCCAACATGCTACAAACATGATCTCCAAAAACCCCTTATGCTGAAACCGATAGCGAGTCCATGCAACCATCTGACAATACCATTTTACACCTTGTAAGGCATATAGCAACTTTGTTGGTTTTAGTCCACCTTTTTGCCTATGGTTTGTTGCAAGCAGCTGTCTTGATCTGACAAGTAATGGCTTTTGTTAAAATACACATGTGGATCTTCAATTGAGAATCAAGAGCTAATTTCTGCTATACTCAAATGCAGGTTTCTTACAAATTCTTACTTGAGGGAGGAACCTAACAGTCATGTGGTTGAGCAACGTGTGGAGTGGTAAATTTTGTGTTCTTTCACCTGTACATATCTATTGACTTATATTGCCATTGTTTACATGGAAGCTAAATTGACAGTAGCCAGTGGCGAACCCAGAACAAAGTTTACCATGGGTCTTATACATACTAATTATCTAATTATTATTCACTAATGTACTAATTAGCATGGCATAAATTAGCTATAATTAGATAATCTACCCAAGGTCTTGTGATCCAGGGAAACTATACGTTGGTACGCCACTGACGGTCAATATCACTAATAATGGGGAGAAATTTTTGCAGGCTCTATGCATTTGATGTTCATTGCAACTCATTCTTCCCAGCCTTTGTCATCCTATATGGTAATATTAAGTAAATGTGCTGTGTATTTGAATACTGGTTGTAATGTTCATGTATCTGACAGTTTTTCTCCTCAGTGCTTCAATATTTTCTATCGCCTCTGTTGGTCGCACATGGCTTCTTTCCTGCTCTATTATCAAACCTCTTGTTTGTGGTGGCAATTTCTTATTATCACTACCTGAATTTTCTAGGATATGATGGTAAGTTCAGTTTTTTACTAATTTAACTTTGCTGCAATGTGTGGCTGTGCTACTCCTAACAAAAGAATTGGTCTTTGTGTGTAGTTCTTCCATTTTTGGACAGAACAACATTTTTCTTGTACCCGATTGGGCTTGTCATCATTCTCTCTCCACTGAGTAAGTTCATTTTATGCAGTACTGATTACTGAGTTAACCACATGGCAATTGTCACACATATTTTTTCACGTCTTGCAGTGATACTCATAGGGTTCAATCCAACAAGATACTTTTTGAGCTTGTACTTCCGTTAA</dnaseqindica> 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