BGIOSGA030306

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA030306

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030306, complete gene.

LocusTag

OJ1227_D07.20

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030306-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030306-PA

Length

8509

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:1563312..1571820

Sequence Coding Region

1563312..1563396,1563484..1563666,1564704..1564832,1566082..1566221,1566459..1566545
,1566679..1566807,1569698..1569850,1570194..1570295,1571187..1571366
,1571459..1571538,1571802..1571820

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:1563312..1571820 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:1563312..1571820 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGAGAAGGGGATGGGGAAACAGCGGTGGGAGAAGATGCTCCTCCAGGCCGCCTTCGACGGCAACCTTCGCCTCCTCAGGAAGATGGCGCGCGGGCTGGTCACGACGGGGCGCGGCCGCGGCGAGGCGGACGTCCTGGCGGCCGTGGCGGACGGCGGCAGCGGGAGCCGCGCGCTGCACCTGGCGGCCACCGAGGGGAGGATGGACGTCCTCACGTACCTCGTCGAGGACCTCCGCCTCGACGTCAACCAAACCAACGACAGAGGTGAAACTCCACTATTCCTTTCTGCGTTTTTTGGGAGAACTGCATCTACAAGATATCTGCTTGATCATGGTGCTGATCCAATGATTGTTGGTAAATCAGGATCACCTCTTCATGCGGCTGCCGGGAAAGGACACTGTGAAATAGTAGAATTGCTGCTGTCAAGAGGAATTGGTATTGTTTTTGATTCTCTCTATGGGACCCCGTTGCATACGGCTGCTGCTCATGGTCAATGTAGCACCATGAAGATATTATTGGACCATCATGCAGATCCTGATAAGGTTTTCAATCTTGATGATACCCCATTGAATATGGCTATATCTTCTAAATCATTGGAATGCGTCAAACTGCTCATCCAAGCTGGGGCTGATGTGAACTTTAGAGACTCCAATGGTGCTACTTATGTTATGATGGCAGCAAATTATGGTTTTTCTGGCATCATGAAATGCCTATTAGATGCTGGTGCTAATCCTAATATTCCGGACCAATTTGGTGTTTTTCCAATTGAAGTTGCTGCTCTCCAAGTCCATAGGGAAATTGTTGAGATGTTATTTCCTTTGACTTCACCAATTTCAACGGTGCTAGATTGGAGTATTGATGGAATCTTTGCCCATGCAAAAAACTTTGGTTCGAAGCCATTGCCTGAAGATCTTTGTGTAAAGAAAATAGCTCAAATGAAAGTAGAAGGTAAAGAGGCTTTCAAGAGAAAGGATTATTTACTTGCGGCACAACTCTATACAAGTGCACTGGGACTTGGACCTAGTCCTGATGATTCTGCAACTCTGCTGGCAAATAGGAGTCTCTGCTGGTTGCGCTTGGAAAATGGAAAACAAGCTCTTGCTGATGCTAATATGTGCAGAATGTTCCGGCCTCATTGGATAAAAGCCTGCTATCGGCAAGGAGCAGCTTTCATGCTTCTTAAGGAATATGGTAATGCTTGTGATGCCTTTTCAGATGGCTTGAAGCTGGACCCAGCAAATGTTGATATTGAGAATGCTCTAAGGCAGCGCTTCAGGCCGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEEKGMGKQRWEKMLLQAAFDGNLRLLRKMARGLVTTGRGRGEADVLAAVADGGSGSRALHLAATEGRMDVLTYLVEDLRLDVNQTNDRGETPLFLSAFFGRTASTRYLLDHGADPMIVGKSGSPLHAAAGKGHCEIVELLLSRGIGIVFDSLYGTPLHTAAAHGQCSTMKILLDHHADPDKVFNLDDTPLNMAISSKSLECVKLLIQAGADVNFRDSNGATYVMMAANYGFSGIMKCLLDAGANPNIPDQFGVFPIEVAALQVHREIVEMLFPLTSPISTVLDWSIDGIFAHAKNFGSKPLPEDLCVKKIAQMKVEGKEAFKRKDYLLAAQLYTSALGLGPSPDDSATLLANRSLCWLRLENGKQALADANMCRMFRPHWIKACYRQGAAFMLLKEYGNACDAFSDGLKLDPANVDIENALRQRFRP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..85#173..355#1393..1521#2771..2910#3148..3234#3368..3496#6387..6539#6883..6984#7876..8055#8148..8227#8491..8509#ATGGAGGAGAAGGGGATGGGGAAACAGCGGTGGGAGAAGATGCTCCTCCAGGCCGCCTTCGACGGCAACCTTCGCCTCCTCAGGAGTCAGTACCCACCCAACCCTCTCTCTCCCTCCTAGGGTTTCCCCCATTAATTCCTATTTTCTTCCCCCTTCTTATCGCTGGGCGTAGAGATGGCGCGCGGGCTGGTCACGACGGGGCGCGGCCGCGGCGAGGCGGACGTCCTGGCGGCCGTGGCGGACGGCGGCAGCGGGAGCCGCGCGCTGCACCTGGCGGCCACCGAGGGGAGGATGGACGTCCTCACGTACCTCGTCGAGGACCTCCGCCTCGACGTCAACCAAACCAACGACAGAGGTTCTGATCTCTGATCCCCTTCCATTCGCTCTAATGTACGAATCGTTCACTTATCCTGGATGCTCCTACCCGGGGAAACGGAAGAGATCGATATGCGTGTCCATATAGTTTAATATTCCTCACCTGCGACAGTTGGTTTCATGCTGGTTACGTACTATATGAGCTTGTGGTGTTATTTGCACGCTTGTGCAACTTTTGATGCTGTGCAATGCAATGTATGCATTTTAAATTTATACTTCAGGTTCTAGCTTGAATTGCTGCGGAATATCAAAAGATTATTACTATATCAACTATACCAGTGCCTCCCCCATTGTTTTTATATCTAGAGCTGGACCCAAATTTATATATATCCTAATGGAATTTGAATTTGATTCCAAACAATAATACCAATGCATTCTATCGGGTTGTGCTTTTTCAAAAAGGGGTCATGTTCATTTTCTATGTGCATCAAATCCATATTTTAATATGAGATCACACACCAATCCACTGTGCTTTTATACTATTAAAGACGAGACGATATTTAATTTAGCAGAATGATTTTATCAAGAAAGAAAGGTCCCACCAAACAATTACCAAAGGAACTGACTCTTGGGCAGCGGCGATGGTTTCTATTATTATATTCTGACTAAGAATTGAACTGGAATTTCCAATCTGATTCTTGCTGTCCTCGAAACTCCCATGTCATAGGAATTGAATTCCAATTCCATGATTCTAGAGCAAATTCATGGGTGCCAAACGGGGTGCAATATCATTAATTATGGCCAATGTCATTGGCATATAAATGTTTTTTTTCCCGTATTTTATTGCACAAAATTTCTGCATTACTAGTTGGACACTTTAGTTCTTTTCAAATCAGTGGTATTACATTAGGATCACTGAAGATAAATCCACATTTTTGTTGTTTTAACAGCAATAACTGCAGATATATTTTACCTTGTGGAGCAGGAGCCTTTGTAGTTTGCATTGTTGAAGGCAAGAATGGTATATGACCATATGAGTTCCCTAAGCTCTTAATATTCACTACCTTTTCTTATCAGGTGAAACTCCACTATTCCTTTCTGCGTTTTTTGGGAGAACTGCATCTACAAGATATCTGCTTGATCATGGTGCTGATCCAATGATTGTTGGTAAATCAGGATCACCTCTTCATGCGGCTGCCGGGAAAGGTATCTCTCTCACACTACGCATGTTTTGAAAAATATGTTTGATATATATGTGTAAATACTTTGTCACTTTAGATTAACCATCGGTTAATTTGTTCTATTATCTACTCTATTAGTTTTCCTGAGCAGGGCCAGGGATTGCAATTTATTTCTGAAATTTCGCCCCCCCCCCAGCCGCAAGCACATATCTTGCCTGAAATTTTCGGCATTTTGCAATTTTTTTGTGAATTTGGTCAATTTATTCAAATTCATTCAAAATTTGTCAAATTTTCTAATAATTCCGGCCAAAAAAATTCGGTACTTTTTCTAGTAAATCACAAAAAATTGTCAACACTAGGAAATTTTCTAATAATTTCGTGAATTTCAGACCGACACCCCCCCCCCCCCCCGTGCGCTCGCGCGTGCTTGGCAAAAAACATTTCGAAACTGAAAATCCTCAACAAGGCTCCAGAATTTGCACCGTTTCAGTCAAAATTTGAGCAAGTATTTGAACATAATAAATGCTGCAGGCTGTCAATTCTAGCGTTAAAGACATAATTAGTTGAGCAGCAGCCAAATGAAACTGGAGAATGCTATCTTTCTTTTTTTGTCCTGAGAACTCAATGGAAGGTCGAGATGACCCAACTTAGTTTATATGTACTTCTAAAGAGGTAGCACTACGGAGACAAAAGCCCAAGACCGGACGAGATTACAACTTAAAAGAGATGGGGAAGTGAAATAAGTACAATAAAGTTATGTTACAATCTGGTGTCATAACTTAATGAAGTTATGCGGATCTCCAATGGCACATACTGATGTGCCAATAACTCAATCCTTTGCCAATGATTTAAAAATCAACTCACACATTATACAATCCAGAAAACATCTTTTATGGTAAAGGGTAGGGGACTGTCGAGCACCAAACACCAACCCCTTTTTTCAGGCAGTGGGGATATATTTTTTCCTAGTGTTGTATAGACATATGTGCTCCTAACATGACAGATGTCTCTCATGCCTATAACAATTACAAAGAACTCAAATAACCAACCAGCCATTTTAAAAATGTAATCCCTATTTACTGGTTACCAAGTGGTTTATGGTTGGTAAACTGAACCCTGATCCTGAGTCTATTTTGAATATTTTCCTTGAATACAGGGGAATTGAATTGAATCAAATGTGACATTTCTTAGGTCTGCATCATATGCTTCTGCAGATACTATAAACATTTTGTTGCAATTTAGTTTTTTTTTATTTAACAAATGTTCTCTTCCAGGACACTGTGAAATAGTAGAATTGCTGCTGTCAAGAGGAATTGGTATTGTTTTTGATTCTCTCTATGGGACCCCGTTGCATACGGCTGCTGCTCATGGTCAATGTAGCACCATGAAGATATTATTGGACCATCATGCAGATGTAATATTTTCTTCATTTTATTTGTTCCTTTCTTAGGTGTATAACAGAAAACTTATATGTTTTTGCCTTTGGTACATGTGGTCCATCTATATCAACACTTGATTATAACTGGTTTGAATGAAATAAAGATGCCTATTTGCTCAGAATTTATGTAAATGCTGTCTAATTTCTTTGCAAGCATGCATATGATTGATAGTTCTCTATTGATCCTTATTTCCATCATTTTACTTCCAACAGCCTGATAAGGTTTTCAATCTTGATGATACCCCATTGAATATGGCTATATCTTCTAAATCATTGGAATGCGTCAAACTGCTCATCCAAGTCAGTGCCCCTTTCTTGATACGGATATTCTTATAGTTGTATTTGGAAGCTCCATTTTCATTCCATGGACATTTTCTCTGGATAGCATCTGAAACACAAACTGAACTGATCAAATAATAATTCATTTATACAGGCTGGGGCTGATGTGAACTTTAGAGACTCCAATGGTGCTACTTATGTTATGATGGCAGCAAATTATGGTTTTTCTGGCATCATGAAATGCCTATTAGATGCTGGTGCTAATCCTAATATTCCGGACCAAGTGAGTTATACTATTTCCTTCATTTTTCAGTTGCCATGAGCTATTAATGCGAGATTGGACATTCCTTAGCAAAATCCAAATACTGACGGGAATCAACTGAAAATCTTATCGGCACTCACTGGGTCCTCAGTAGTCTCCAGTCTGTTCCTCCATCCCACCAAACCAAGGTTATTAGACTAGGCGTCCAGTATTCCACTCCACCAGACCAGCCCCAATCCCTCATGTTTCGCATCCCCGTGCCTCAGGACATTGAGGTTATGAAGAGGTGAGGTTCAAGGCCTGAGGAGAAGCAACTTGAGTTTGCTGCATCCCTGGCCAAAATGCCTCAAGGATCCCATTTAAATTCCCAAGGCTTATGGTTCTCGTAGTAGGGGTCTGTTGATATGAATTGATGTGTGCCTTGTGTGGTGCATGTGGTTCTATACAGTAATTTGTCCTAAAAAAGAAAGACTACCAGATTGAAACACCCCGAGAATTTCGGTGCATAAATTCCTGAAAAAGACTAACAAAATTATTTTGGTAAATTCGGTGTGGCTTCTATTTTTCTAACTGATTTTTTTGTTGGCAATGTTGGTGTTGTCGATTAAAATCTTGACAATAGAAAACTTGTTTACCTAGGTTCTATTTGTCTGTGTTACCTTATGAGGTCCAGTCAGACAAGAGATGATTTATATAAAGGTTCGAGCCCTCAGGCCTCCCTAGACTGTTGCTTTATTGATATATGGACAAAAGAGGTGTATGTGTCTATCCTAAGCTTATTTGTTATACTCCGGTGGCTCTTGGCAGGTCGATGGATTGATGTTAGCGGGGCTTGGTTGGCGTCGTGGTTTAAGTTGATTGTTGTTCTGTAGGGTTATTCCTTGGCAGAATAAGGGATTGATCTTGGTAGGGCTTGGTTGGCGTCATGGCTTGAGTTGATTGTTGTTCTATTGGTTTCCTCGTCTGCACCCCTCCTGGGGCCGAGTATTTATACTCGTAGGTCTCGTTTCCTAGGACTTGTAGAGGTGTTTTTGGTACCAGTAGTTTTAGTGGAGTCCTTGTCGAGTCTAAGTAGGTCTCCCGCAGCCTTCCCAAAGTAGGTCTATTTGACGTTTCCTAAGTCTCAGGGGCGTGCCATAATTTTTACACCGACAGTTGGAAAACTAAGTTTTCTATGTGGTGGAAAAACTGAACTGAAGAAACCAAGTGGTGAACAAGTGTATCAGTGATTCCAGAAATAGATACTTTGCATCAGGAGGAAACACATTGTCTTGATAAAGTGTAATGTACAGTGTGGTATGTTTTACATTGTGTATATTGTATAGAGATGGTAATGATATTATTATTTCTTCCTACTGTGCGCTTCCTTGGCCTATATTATTGAGTGAATAATTGTA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