BGIOSGA027646
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027646 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027646, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1349_D05.121 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027646-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027646-PA |
| Length |
11866 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:3040941..3052806 |
| Sequence Coding Region |
3052591..3052806,3052399..3052491),complement(3052137..3052220,3051771..3051943),complement(3050768..3051041 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:3040941..3052806 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:3040941..3052806 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCTCCACCTCCGCCGCCACATCCGCCGCCCCATCCCGCGGCGGCGCGCGGGAGTGGCGCACGGCGCTCCTCACCCTCCGCGACGAGTCGGTGGTCTCGCCCTCCCCACCGGCGCTCCTCGCGCTCCTCCGCCGCGTCCTCCTCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCCCGCCGCACTCCCTCGCCGCGTCCGCCGCCGCGGTCTCCGCCCACGAGGTGGGCTCGGATGTGGCGTTCCTCGCGGAGACGGCCGCGGCGGTGTCCCCCTGCGACGGCGCCGATGATGTGCTGCGTGGCGTTTGCCATCTGAGGCTGGGAGTGTTCTCAGTACGGTTGTATCACTTTGATGTTATCTCAAAAAAGAATTCAGATGGGAGACCATTAGCACAAAATATTCATGATATCATGTACAAAACAAATATGGAGATCGACTCGTCTTGTTTACTGGCAATGCTGAAGTTTCTTGATGTTCTTATGCAATGTTCATTGGAGGGTTCATGTGGTAAGGGCCTCTCTGTTAGGAAAACCGCATTGGACACTGTATCTGAATGTTTACAGATCCTCAGGTTTTTGAGCAAAGATTTTGGCGGAAGTACTTCTTTACCTGAGAATGCACATTTGCTTCGAGTGCTCATCTCAATTGTATCATGCTTGCAATCTGAGCTGAACCTCACAGATAAACCTAATGGTGCTGGTTTTTCTTCCCACACATTTGGACCAATAAATAATAAGAATCCAAATATCTGGGATATGGAAATCTCTGCATTTTCCATGATTGAAGATGCACTATCTAAGATAGCCTCAAGTTTATCAGAAGATTTGTGGCAGTCCATTGTTGAGGTTTTGAGGAAGGTGATGGATTTTTTGACAGCAAGGAACTTTATCATAGAGAGTAGCACTATGTCAAGATTTTATACCTCATTTCTTCGTTGTCTGCATTCTGTTCTTTCAGACCCCAAAGGCCCACTTTCAGCACATGTACCAGGTTTCGTTGCGAACTTGCAAATATTTTTCATGTACGGGCTAAGGTCATCTTCACCACCTGTGATAACTCCAATGGAATATAAAATGGATACAAAATCCAATGCCGGACGATATAAACCCCCTCATTTACGTAAAAGGGGTGGAAAGGGAAATGATTCGTTCGATGGTCGAAATTCTGATAGTGAATCCTCTCGATATGATTTAAGCTCATCAGATTCAGATATGAGTGATAGCGATGGATATGCAAAAACTGGAGATCGTTTCCGAAGTTCAAAGGCTAGATTAGCTGCCATCCTTTGCATACAGGATATTTGTCGTGCTGACCCAAAATTACTTACTTCACTATGGCCATTACTTTTGCCCGAGAGTGATGTTCTCCAACAAAGAAAATATCAAGCTACTCTGATGACATGCTTGATTTTCGATCCTATAATAAAGGTGCGTATTGAGGCAGCATCAACCATTGCTTCCATGCTGGAAGGACAAGCATTAGTTTTGACACAAGTTGCCGAGTACAAGGAGTCATCAAGACGGGGATCTTTCACTACGCTATCTTCTTCACTTGGTCAAATTCTTATGCAGCTGCATACAGGAATGTTGTATTTGATACAGCGTGAAACTCAAACTACTTTGCTTTCAGCATTGTTCAAAGTTCTCATCCTTTTGATATCTGTTACACCGTATGCCCGCATGCCGAAGCAGTTGTTGCCAACTGTAATCACAGATATGCGCAGGAGATTGTTGGACAGACACTCAAATAAGAATGAGCACTATGCTTTGCTGCATTTTCAAAAGAACCACCTTCTTCAAATGTTTTTGAAGTTCTCACTCAAGATGGATGTGCAGGAAATACATGTCAGTGTGAGATTTGGAGCTCTCCAGGTGTTGAGATCAGCAGTTCATAATTATCCAAGCTGTGCAAATATCATTTGGGCAAAAGTTCAATACATTGTTCTTGATTTATTGCAAATGCAAAGCTTGGAAGACCAAAGAGATGCTAATTTTGGGCTTCCTAAAGAAGAATCATCAATTAAAGGAAGATGTCTTGTGGCTGCCATTAAGGTAATAGATGAGTGTCTGCGTGTTTCATCTGGATTCAAGGGAACAGATGACCTCAAAGAATATAGATTGCAAGATATTCAGCAAATTTCTGATTGTACCATAAACAAAACTATCAAATCTGCGCCTCACTTTGAGACTGATGTTCCTGGACCATCACAAAATTTTACTTTGGACATAACTCTCGGAACTAATCGTTGGATTGAGGTGATAGAAAGGCTTCTCCCTCAAGGATTATCACATGGCTCTGCTACGGTCAGGACAGCATCACTGACATGTTTCGCGGGCATGACTTATGATGTTTTCTTCTCCCTGCCAGAAAACAAGAGGGATTATGTGACGTCCTCATCGATTCATGCTGCATTGAGTGATACAGCTCCTGCTGTAAGGTCTGCTGCATGTAGAGCCATTGGTATTGTTGCATGTTTCCCCAGCATACTGTCAAGTCCTAGCCTACCTGGCAAGTTCATAGATGCCATTGAGTTTAACACACGGAATTCATCAACTCCAGTTCGTATCACTGCATCATGGGCCTTGGCAAATCTTTGCTCTTCTATTCGTTTTAGAGCATTAGATACCAATCCCTCTGCAGGTGTACTAGATAAATCAGCCATATCATTGCTGGTTGAAATTGCTTTGCGCCTTGCTAAAGATGGTGAAAAGGTAAAGTCAAACGCTGTTAGGGCTCTTGGATACCTTTTAAGATTTATCAGATTCAATAATCATTCTGACACAGTTGATGACCCAAGTAATTCCGTTCTCTGTGGAGATCCTGTCTGGCTTGAAAGGATGGTACATGCTTTGATGTCCTGTGTGACAACAGGAAATGTAAAGGTTCAATGGAATGTTTGCCATGCTCTTAGCAACTTATTCATGAACGACACCTTGAGACTTCCAGATATGCCTTGGGCATCAAGTGTTTATAGCATACTTCTGCTACTACTCCGTGACTCAAACAATTACAAGATAAGGATGCATGCAGCTGTTGCCTTAGCAGTTCCAGTCTCACGGCTTGATTATGGTAGCTCATTTCCAGATGTTGTTCGAGGAATCGAGCATGTTCTTGAGTCATTGAGTTCCAACAGTTTATCATCACCTTCAAATTTCAAACATAAAGGCAACCTTGAGAAACAGGTTACATTTACTGCTCTTCATTTGTTTAGTTTTGTTTCACCAAAAGATGATCAAAGCCTGAGAGATTTTCTTATCAAGAAAGCATCCTTTCTAGAAGACTGGCTGAAGTCATTGTTCTCATTGTTCAATAATGTTGAGGACCAGCCTTTGGCAAATGAGGCCATAAATGACGAGGATGGTTTCAGCCCAAACGTGGCACAAAAAGCTATGTTGTCTTCTGCTGTGAAGTCCTTGCTCGACATATATACAAGTGAAAATCAGCACACTGTTGCTCAGAGATTTGAGCAATTGGCAAGAAGCCTAGAATTATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASTSAATSAAPSRGGAREWRTALLTLRDESVVSPSPPALLALLRRVLLLSAAAAAPPHSLAASAAAVSAHEVGSDVAFLAETAAAVSPCDGADDVLRGVCHLRLGVFSVRLYHFDVISKKNSDGRPLAQNIHDIMYKTNMEIDSSCLLAMLKFLDVLMQCSLEGSCGKGLSVRKTALDTVSECLQILRFLSKDFGGSTSLPENAHLLRVLISIVSCLQSELNLTDKPNGAGFSSHTFGPINNKNPNIWDMEISAFSMIEDALSKIASSLSEDLWQSIVEVLRKVMDFLTARNFIIESSTMSRFYTSFLRCLHSVLSDPKGPLSAHVPGFVANLQIFFMYGLRSSSPPVITPMEYKMDTKSNAGRYKPPHLRKRGGKGNDSFDGRNSDSESSRYDLSSSDSDMSDSDGYAKTGDRFRSSKARLAAILCIQDICRADPKLLTSLWPLLLPESDVLQQRKYQATLMTCLIFDPIIKVRIEAASTIASMLEGQALVLTQVAEYKESSRRGSFTTLSSSLGQILMQLHTGMLYLIQRETQTTLLSALFKVLILLISVTPYARMPKQLLPTVITDMRRRLLDRHSNKNEHYALLHFQKNHLLQMFLKFSLKMDVQEIHVSVRFGALQVLRSAVHNYPSCANIIWAKVQYIVLDLLQMQSLEDQRDANFGLPKEESSIKGRCLVAAIKVIDECLRVSSGFKGTDDLKEYRLQDIQQISDCTINKTIKSAPHFETDVPGPSQNFTLDITLGTNRWIEVIERLLPQGLSHGSATVRTASLTCFAGMTYDVFFSLPENKRDYVTSSSIHAALSDTAPAVRSAACRAIGIVACFPSILSSPSLPGKFIDAIEFNTRNSSTPVRITASWALANLCSSIRFRALDTNPSAGVLDKSAISLLVEIALRLAKDGEKVKSNAVRALGYLLRFIRFNNHSDTVDDPSNSVLCGDPVWLERMVHALMSCVTTGNVKVQWNVCHALSNLFMNDTLRLPDMPWASSVYSILLLLLRDSNNYKIRMHAAVALAVPVSRLDYGSSFPDVVRGIEHVLESLSSNSLSSPSNFKHKGNLEKQVTFTALHLFSFVSPKDDQSLRDFLIKKASFLEDWLKSLFSLFNNVEDQPLANEAINDEDGFSPNVAQKAMLSSAVKSLLDIYTSENQHTVAQRFEQLARSLEL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..216#316..408#587..670#864..1036#1766..2039#2344..2411#2489..2558#2655..2966#3550..3629#3705..3756#4140..4293#4671..4758#4838..4940#5041..5103#5330..5365#6295..6474#7030..7281#7650..7745#7860..7954#8055..8118#8237..8318#8406..8476#8655..8740#8824..8908#9336..9409#10204..10310#10697..10815#10940..11017#11633..11866#ATGGCCTCCACCTCCGCCGCCACATCCGCCGCCCCATCCCGCGGCGGCGCGCGGGAGTGGCGCACGGCGCTCCTCACCCTCCGCGACGAGTCGGTGGTCTCGCCCTCCCCACCGGCGCTCCTCGCGCTCCTCCGCCGCGTCCTCCTCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCCCGCCGCACTCCCTCGCCGCGTCCGCCGCCGCGGTCTCCGCCCACGAGGTCCCCCCCCCCCGCTCCCGCGCAGCTTGGTCTCTGCTCTGCGTGTGCTCTGGTTTCGGTCTCTCTCACACTCTCGTCTGCTGCTGTGACCGTGTGCAGGTGGGCTCGGATGTGGCGTTCCTCGCGGAGACGGCCGCGGCGGTGTCCCCCTGCGACGGCGCCGATGATGTGCTGCGTGGCGTTTGCCATCTGGTGATGATTCTGATTCCACTCGCTCGAGATCTTGCTTTAATGTGGACTGACAATGATAGTGTAGAACATTCAGATTGTCTACGGATTGATGTCCCTTAATTGTCCCTGTTTAATTTTTCCTTCGTTTCAAACTAGTACGTGGGTGGGTGTTTTGGCTGTGTTCATCTTTGCTGTGCAGAGGCTGGGAGTGTTCTCAGTACGGTTGTATCACTTTGATGTTATCTCAAAAAAGAATTCAGATGGGAGACCATTAGCACAAAATGTATGGCATTTTTAGTTCTCATTACTCTAAGCTCTAATGGTTGGTGAGATATCGTGCTGCGATATGGAATTCTAATATTTGTTGATCAATGTGACTGACGAATTAAAACCGTCGGATTTGGTTTTTGTTCCTCCGTGTCAATTTGTTTGCTGAATACTTATGCTCTGATTTTTCTGAAAATCTACTCATGCAGATTCATGATATCATGTACAAAACAAATATGGAGATCGACTCGTCTTGTTTACTGGCAATGCTGAAGTTTCTTGATGTTCTTATGCAATGTTCATTGGAGGGTTCATGTGGTAAGGGCCTCTCTGTTAGGAAAACCGCATTGGACACTGTATCTGAATGTTTACAGATCCTCAGGTGAGCTTAAGATTAGTGTAAAATGCTTAAAAATCTTCTTTCTCTGCTTGTTTTTGTTGTGCTAAGTACTAATGACCTAGTACATCAACAATGTAGAGTGTGTTCCCATGGTTTTAGCTAAACTTTTGTAATAATAATCTTTTTAGTTCTTATTTGCTCGCCTCAAGAGAATGGCTTCTACATTTATTTACTTCAGTCTTTTAGGCTTAACCGACATTTATTGAAAGGACTCGATAAATTATCATCTTTTTTCTGTACATATATACTAGCTCAATCCTTTAATTGGAGTCTTTTGTTAATTCACAGCACCAAATGTTCTTTTCCAAGTTTTCAGAATCCCTCCAGTACTTTTGAAATTGGCAATTCCTCACCTATACTGGTGCGAATAAGAGAATTGCTACCTGCACATGCGGTAAACTACACTAAATTACGTAGGCAAATTGCCATAACCAAAGTAAATATGGTAATATCTATAAACCCATCATTTCAAGGGTACAGGTGTTGAATTGCCATAGTAGAAGTACGATCTTCCCAAATTTATATATTATTTTGTATTATTTCATGAAAAGATACTGCTTTTAGCTTTACCGAATGAATTGGTAATTTAATAATTTGATGTGACACCTCTATTCTAGTACCCTTTAGGAATTCACCACTATTAATGAAATTTCATCAGGCATGTACAATCTTTTTTGTGCTTCTCATTGTAGTCTTCTTCTCAATGGCCAGGTTTTTGAGCAAAGATTTTGGCGGAAGTACTTCTTTACCTGAGAATGCACATTTGCTTCGAGTGCTCATCTCAATTGTATCATGCTTGCAATCTGAGCTGAACCTCACAGATAAACCTAATGGTGCTGGTTTTTCTTCCCACACATTTGGACCAATAAATAATAAGAATCCAAATATCTGGGATATGGAAATCTCTGCATTTTCCATGATTGAAGATGCACTATCTAAGATAGCCTCAAGTTTATCAGAAGATTTGTGGCAGTCCATTGTTGAGGTCAGTATTTTGTGTTTCCTTCGCTCTGGTTGGTTGTCACATATCATTGAGCGATGTAACCATAGCAAGTACCGTAGCAAGGAAATTTGTAGCTGTTTAGTATCTGGGATGCAAACAGCATTATTGGTTCTTCCACCATTGGTCCAAGATTTGTGCTGTACTGTTGTCATTTGATGATACACTTTACCAATACTTACTACACAACCACTGGCTGATGCATTTTATGCATTTGTTTTGTTGCTAGAAGTTTACGGTGTTAGTATTCATTTTCTCTTTGTCAAATCTCCTCTCTTGCACTTTGTAGGTTTTGAGGAAGGTGATGGATTTTTTGACAGCAAGGAACTTTATCATAGAGAGTAGCACTATGTCAAGGTTAGTACTCTGGTTTTGTCATTGAATATAGTGAAATGAATGAATGCTAATCTCAAGCTAAATTCACTATCTTTCAGATTTTATACCTCATTTCTTCGTTGTCTGCATTCTGTTCTTTCAGACCCCAAAGGCCCACTTTCAGCACATGTAAGTATAAAAGGGAAGTGTATTTATTTCATTACGGAAAACAGGTTATTTTTTTCCTTATGTTGTAACTTGTAACATTGTGCCTGAAACTTTAAGGTACCAGGTTTCGTTGCGAACTTGCAAATATTTTTCATGTACGGGCTAAGGTCATCTTCACCACCTGTGATAACTCCAATGGAATATAAAATGGATACAAAATCCAATGCCGGACGATATAAACCCCCTCATTTACGTAAAAGGGGTGGAAAGGGAAATGATTCGTTCGATGGTCGAAATTCTGATAGTGAATCCTCTCGATATGATTTAAGCTCATCAGATTCAGATATGAGTGATAGCGATGGATATGCAAAAACTGGAGATCGTTTCCGAAGTTCAAAGGCTAGATTAGCTGCCATCCTTTGCATACAGGTATGCTGCTACATAATATGTTCGAACTCTCAATTGCATTTTCCATTCTTATTCTCATACATATGTTTGGATCAACTTTTGTTTTCCTAAATTGTCCAACATCTTATGTTTGGTTTCGTAATGAATTATCATGAGATAGATATCTTTCTTGGTTAATATGTAGATTTGTTCCTTTTCTTCGTAGAATGGTGGATGAATAAGGCTTGCTTTAATAAACAACTGCTAAAAGAAGGCAAATAACAGATTAATAAGATAAACTGTGTGATTTCACTGCCATATCTTAATTTGAAGAATTTTTTTTATGGCCATTCAAGTTTCAAAACTGAAGTAAATTGTTGTTATACTAAAAATTTGTAATCTGTGCTCACCATGTTTTAAAATTGCAATTTGAGTCCATATAATTCTTAGGACTAACTGTCATTGTTTTGTCGAAGGTAACATTGAATAATCATCATGAGTCATCGGGTATCTAATACCCAAAGATAACATTGAATTATCTAATACCCAAAGATAACATTGAATTATTATTTCCTTGTAGCCATAGTCTTCAAGAAACCTAACACTGCTGTTCTGATTCTTTAAGGATATTTGTCGTGCTGACCCAAAATTACTTACTTCACTATGGCCATTACTTTTGCCCGAGAGTGATGTTCTCCAACAAAGGTAAACTCTTCCATGCGCAGTATGTATGGTATTTCTCACACCCATGTAATATTTTTTTTTTGTTGGTTGGGACAGAAAATATCAAGCTACTCTGATGACATGCTTGATTTTCGATCCTATAATAAAGGTACAAGTCTGTAATTATCTATCTACATTTATTTTCATGTTTCAGTGTGAAGTTTCTCAACTATAGGCTACCTATGACCTAATTGGGATTTATATAATCTTTTTTTAGTGTTTATATTTTCTGGTAATTCTACCTTCAAACAACATTGTGCTTATCCATTACATGCTAGCTTGTGTTTTAGCTGTTGACTGAGGGTGTTCAATTGTCTTGACACCGTTGCTAGTTGAACATATATTAAATGTTTGCAAAAAGTCGATGTAGACACTTGAAAAGTTAAAATAAAAGTATTTAATGTGTGCAGACTCTTTATAGCCCATACTTCTATCAAATTAGTGTGTTTATATTTGATAATTCTCTTGATTTACCTGGATGTCTATGTGCAGGTGCGTATTGAGGCAGCATCAACCATTGCTTCCATGCTGGAAGGACAAGCATTAGTTTTGACACAAGTTGCCGAGTACAAGGAGTCATCAAGACGGGGATCTTTCACTACGCTATCTTCTTCACTTGGTCAAATTCTTATGCAGCTGCATACAGGTAGGAGGCTCGGTGACTTCTCAATTTCCAATATCTGGACACTTCCTTTCACTAGATGTTCAGAACCTTCTGCTATCAGCAAAGAGATATATTACCTCCAACCCTAAATAAGTGCACTTCTAGCTTTCAAATTTTATCCCAAAATAAGCGCACTTCTAGATTACCACTTTTCTGTCCAACCACCGCTCATTCATCCATCTTACCCCCAAGTCTCCAACCACCCTCCCAGCTCCAACCACCCCTCATTTAATTGGGGGCATCTAAGTCATTTTCTCTCAATAGTAATTTCGTCCTTCAAGTGCTATAAATGCACTTATTAGGGACGGGGGTAGTATTTTTAAAGTTTTATATGACATATTTTGTTTTCTGATTGGC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