BGIOSGA028087
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028087 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028087, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28031 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028087-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028087-PA |
| Length |
9384 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:4921333..4930716 |
| Sequence Coding Region |
4921333..4921516,4921600..4921812,4921928..4922067,4922173..4922268,4922670..4922737 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:4921333..4930716 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:4921333..4930716 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGCCGCCGCCGCCGCCTTCGCCCCCGGCGGGCAGCTCTTCTCCGTCGATCCCCTCGAGCGGCACGCGGCGAGGGGCCATGGCGTGGTCACCTCCATGGCGGCCGGCAGCGACGTCATCGTCCTCGGCACCTCCCGCGGATGGCTCGTCCGCCACGACTTCTCCTTCGAGGACGCCCATGATCTCGACCTCGGGACCGGCCGCTCCGGCGAGCACTCCGTGCACCGCGTCTTCCTCGACCCCGGCGGGAAGCACTGCGTCGCCACGGTGGTCCACCCGGGGGGCGCCGAGACGTACTACCACCACGCCAGGTGGCCGCGCCCCAAGCTGCTCCCCCGCCTCCGCAACGTCCTCGTCAATGCCGTCGCGTGGAACCGCCAAACCATCACCGAAGCGTCGACCAAGGAGGTGATCCTGGGGACAGAGGATGGGCAGATCTTCGAGATTGCAGTAGACGAGGCCGACAAGAAGGAGAAGTATGTGAAGTCGCTCTTTACGCTCTCTGAGCTGCAGGAGGGCATCAAGGGCCTGCAGATGGAAACCGCCGTGGTTGGGAACGCCACAAGGTTCTATGTGATGGCTGTCACACCAACACGGTTGTACTCATTCACGGGCATCGGTTCATTAGAAACTGTTTTTGCTAGCTATTCTGATCGTGCGATACACTTTATGGAGCTCCCAGGAGATATTCCAAATAGTGAATTACATTTCTTTATCAAGCAAAGAAGGGCTAAGCATTTTGGATGGCTTTCTGGAGCTGGAATTTACCATGGTGAACTGAATTTTGGAGCTCAACACAGCTCTACAAGTGGGGATGAGAACTTTGTCGAAAATAAAGGTTTTTTTGACTACTCAAAATTGGGAGAATCTGGTATCAAGCCAAGGTCATTTGCATTGTCTGAATTCCATTTTCTGCTTCTCATCAGGGACAAGATTAAGGTAGTGAACAGAATCAGCCAGCAAATAGTGGAGGAACTTATAGTCGATAGTTCACCAGAAGTTACAAAAGGAATAATTGGACTTTGTAGTGATGCATCAACTGGGCTTTTCTATGCATACGATGAAAATTCTATATTCCAGATTTCATCATCTGATGAGGGTCGTGATATGTGGCAAGTATACCTGGACATGAAAGAATATGCTACGGCACTGTCACATTGTCGTAACTCCTTCCAGAGGGACCAAGTCTATCTAGTGCAGGCTGATACTGCATTCAATACAAAAGAGTACTATATAGCAGCTTCCTTCTATGCAAAGATGAATTATATCCTATCATTTGAGGAGATCAGCTTAAAATTTATATCTGTTGGTGAGCAGGATGCTCTCAGGACTTTCTTGTTGAGAAGGCTTGATAACCTAACGAAAGATGACAGAATGCAGATTACAATGATCTCAACTTGGGCTACTGAGCTGTACTTGGACAAGATTAATCGCCTCCTGTTGGAAGATGGCACAGGAGCCACGTCAAATGCTGTAGCAGATTCTAAAGACTCGGAATATCGTTCAATAGTAAATGAATTCCGTGCTTTTCTAAGTGATAGCAAAGATGTATTAGATGAGGCAACAACAATGAGACTGTTGGAAAGTTATGGGAGAGTGGATGAGCTGGTTTATTTTGCTGGTTTAAAGGAGCAACATGAAATTGTGGTTCATCATTACATTCAGCAAGGAGAAGCAAGAAAGGCATTGGAAGTTCTTCAGCGACATAATGTTCTAGTAGACCTTGTGTATAAATTTGCTCCAGATTTAATCATGTTAGATGCTTATGAAACTGTTGAATCATGGATGATGGCAAGAAATAAGTTGAATCCAGGGAAGCTTATACCGGCAATGATGCGTTATGTGAGCGAACCACATGCCAAGAATGAAACACATGAAGTTATCAAGTACTTGGAATTCTGTGTAAAAGATTTGAACAATGAGGATCCTGGAGTGCATAATTTGTTGCTCTCACTGTATGCCAAGAAGGACGATGAGTCTCAGCTTTTGCAATTCTTGGACACTAAGTTTGGTAAAGGACAGACAAATGGCCCTGAGTTCTTTTACGACCCCAAATATGCTCTGCGTCTATGTCTTCAAGAGAAGAGAATGCGTGCTTGTGTTCGTATTTACAGCATGATGTCCATGCATGAAGAAGCTGTTGCACTTGCATTAACGGTGGACTTAGAGCTTGCAAAAGCAGAAGCAGATAAAGTTGAAGATGATGAAGAACTTAGAAAGAAGCTGTGGCTTAAGGTTGCAAAGCATGTCATTGAGCAAGAGAAAGGAGTCAAGAGGGAGAACATAAAGAAAGCTATAGAATTCCTATCAGAGACTAACAACTTGTTGAAGATTGAGGATATCCTGCCATTTTTCCCAGACTTCGTATTGATCGATGACTTTAAAGAGGAAATATGCAAATCTCTCAAGGACTATGACAGCCAAATCGATCAGCTGAAACAGGAGATGGATGATGCTACTCGTGGGGCAGACAACATCAGAAGTGATATTGGTGCCCTTGCTCAGAGATACACTGTAATTGATCGTGAGGAGGAATGTGGGGTGTGCAAGCGCAAAATATTGACTGCTGGAGGACTGCACCAGGCTGAAAAAATACTGGACCTCCAAAAGCGGCTTAGCCTAATGGACAGGAAAACAGCAAAGGAAAATGGCGGAAACATGAATGGTGAATCTATTATCAGTGCGACACCAATTGACAAGTTGAGGTCCCAGCTGGATGATGCTGTAGCGAGCGAGTGCCCCTTCTGCGGCGATCTGATGATCAAGGAGATTTCATTGCCTTTCATTCTCCCTGAAGAGTCTGATGAAAAGGCTTCGTGGGAAATTAAACCGCAACCAACGGGTCAGAAAATTCTTCCAATGACCATGTCTATATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDAAAAAFAPGGQLFSVDPLERHAARGHGVVTSMAAGSDVIVLGTSRGWLVRHDFSFEDAHDLDLGTGRSGEHSVHRVFLDPGGKHCVATVVHPGGAETYYHHARWPRPKLLPRLRNVLVNAVAWNRQTITEASTKEVILGTEDGQIFEIAVDEADKKEKYVKSLFTLSELQEGIKGLQMETAVVGNATRFYVMAVTPTRLYSFTGIGSLETVFASYSDRAIHFMELPGDIPNSELHFFIKQRRAKHFGWLSGAGIYHGELNFGAQHSSTSGDENFVENKGFFDYSKLGESGIKPRSFALSEFHFLLLIRDKIKVVNRISQQIVEELIVDSSPEVTKGIIGLCSDASTGLFYAYDENSIFQISSSDEGRDMWQVYLDMKEYATALSHCRNSFQRDQVYLVQADTAFNTKEYYIAASFYAKMNYILSFEEISLKFISVGEQDALRTFLLRRLDNLTKDDRMQITMISTWATELYLDKINRLLLEDGTGATSNAVADSKDSEYRSIVNEFRAFLSDSKDVLDEATTMRLLESYGRVDELVYFAGLKEQHEIVVHHYIQQGEARKALEVLQRHNVLVDLVYKFAPDLIMLDAYETVESWMMARNKLNPGKLIPAMMRYVSEPHAKNETHEVIKYLEFCVKDLNNEDPGVHNLLLSLYAKKDDESQLLQFLDTKFGKGQTNGPEFFYDPKYALRLCLQEKRMRACVRIYSMMSMHEEAVALALTVDLELAKAEADKVEDDEELRKKLWLKVAKHVIEQEKGVKRENIKKAIEFLSETNNLLKIEDILPFFPDFVLIDDFKEEICKSLKDYDSQIDQLKQEMDDATRGADNIRSDIGALAQRYTVIDREEECGVCKRKILTAGGLHQAEKILDLQKRLSLMDRKTAKENGGNMNGESIISATPIDKLRSQLDDAVASECPFCGDLMIKEISLPFILPEESDEKASWEIKPQPTGQKILPMTMSI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..184#268..480#596..735#841..936#1338..1405#1801..1902#2751..2889#3017..3157#3242..3361#3500..3556#3659..3718#4124..4231#5099..5259#5718..5796#6393..6455#6621..6754#7110..7215#7508..7696#7859..8086#8291..8446#8754..8795#9015..9131#9208..9384#ATGGACGCCGCCGCCGCCGCCTTCGCCCCCGGCGGGCAGCTCTTCTCCGTCGATCCCCTCGAGCGGCACGCGGCGAGGGGCCATGGCGTGGTCACCTCCATGGCGGCCGGCAGCGACGTCATCGTCCTCGGCACCTCCCGCGGATGGCTCGTCCGCCACGACTTCTCCTTCGAGGACGCCCATGGCACGTCCTCCCCTTCTCGCCCTCTCAGCCGCCATCTTCGCCGCCGCCTCGCGCTTCCGCTGATCGCTCCTCTGCTGCTGCAGATCTCGACCTCGGGACCGGCCGCTCCGGCGAGCACTCCGTGCACCGCGTCTTCCTCGACCCCGGCGGGAAGCACTGCGTCGCCACGGTGGTCCACCCGGGGGGCGCCGAGACGTACTACCACCACGCCAGGTGGCCGCGCCCCAAGCTGCTCCCCCGCCTCCGCAACGTCCTCGTCAATGCCGTCGCGTGGAACCGCCAAACCATCACCGAAGGTGAGCTAATACTACTGCATATACTGTTCCTCGATCGAATTGTGTCTCGATTCCGGCAGTCCGTGCTGTGTATTTGTTCTTGATTGTGGAGTTGTTTGTGGTTTCGGTGCTGTAGCGTCGACCAAGGAGGTGATCCTGGGGACAGAGGATGGGCAGATCTTCGAGATTGCAGTAGACGAGGCCGACAAGAAGGAGAAGTATGTGAAGTCGCTCTTTACGCTCTCTGAGCTGCAGGAGGGCATCAAGGGCCTGCAGGTTCGAGTTTGTTGCCAGAGGCCATCGAGGGCTGCGGTTCTGTACTTGTGTTGTGTTGGTGTTATTTGGTTGGAATGAGCGTGATGGAGGAATTTGGTTGTGCAGATGGAAACCGCCGTGGTTGGGAACGCCACAAGGTTCTATGTGATGGCTGTCACACCAACACGGTTGTACTCATTCACGGGCATCGGTTCATTAGAAGTAAGTACAATTGCTCAATTTTATCAGCTCCAAATTTCGGAGACATACACCATTATAGAATGTAATGGGAGCAATCTAGATCGAATTTAGTGAAAAGAAAGACCCAGATTTTTCACTTCGGATATCAAAGTCCTCATGGACGGTGTTTCTTGATTTAATAACGTGACTCAGTAACCTTGAAAGTGCTATACTACGCGAAGTCAGTATGCCTCTTTTCTTACAGAGAGATATGCGTGATTAGAACAGCTTGTGATGCCTTTTGCCATTTTAGAGAGCAGCATTGCATGCCAACAGTTTCTATAGAAGATTTTCTCTTGGTTTCCAGAATTTCAGCCCTACAAGATTTATTTGTTTACTCATTTTTTCTTGATGTAATATCTAATAACAACTATATTGCACAGACTGTTTTTGCTAGCTATTCTGATCGTGCGATACACTTTATGGAGCTCCCAGGAGATATTCCAAATAGGTGAGTATAAGGGCAAGTGCTATGGTAGATGTGACTACCACCTCCAAATTTATCTATTTTATTCACTCATAAACTAAGAGGCAATCCATACAATGTATCACCTCTAGTACACAAATACCAATATATCTAATACTCTCACATCCTTCTTGAAATTTGTGTGGAGGTTGCCTCTTGATTTAGGGGTGGCTCATCATCTCTCTCCTCACTTCTCTCCTTCACATCATCACTCAATCCAATGTGGCATTCTTAGGGGCAACATATGGGTCATTATAGTACTTGCCCTAACTTTATGTGATTTATACAGTACTATACAGTGGTAACTACAGTTTGTGCCACCCACTAGAATACTTTCTTTTAGTGAGCTTATGACAATGTATCCATTGCATGGAATCCAGTGAATTACATTTCTTTATCAAGCAAAGAAGGGCTAAGCATTTTGGATGGCTTTCTGGAGCTGGAATTTACCATGGTGAACTGAATTTTGGAGCTCAACACAGGTGAACTGTAGTTTTTGGATTTAAGTTGATTCCATCATGTAACATGTAACTGAAGTGGATTATTAACTTATGTTTTCTTTGTTATCTAATCCAAATGTCATTGAACTGCTAAGCTGCTAGCATTCTCTTAGTGGGCATATTTTTCTAATAGACTGAACCTTGGTGTGCCTTTTGACCTTATAAGAAATGTGGCAAGTAATGTAATCCCCCACTCCTAAACATAAGTTCTTTAGGGAAATGTAAAGTAGCTACTTTGGCCTCAGGAAAAACAATAATAGTTTTCTCATCAAGATAATCAAATTGTCATCTTACTAATAATATAAATATAAAGTGTGGTAGAATGATGATAGTCATACAAGAATTAATGATCAATGTTATGCCTTCAAGAACTTGATGTCAATCATGTCACTGGATATTATCTATGAACAGAACTATAGGACTACATGAGTACCTTAGAAGATTATATCTAATGAATGTTCAGGGTTTTATATATTGCAAACCTTATGCACTTCAAACTTGATAATTCTCTGCTAGCTGTTTGAGCTTCTCTTTAGAGACATGCATGCCAATCTCGCTGAGCCAGGTGTTGGCACTGGCACACTGCATGTGTGCACCTTCTTACTTAAGTGTATTTTGATGATTATATATAAAAGAACTACTTTTACAGTTTTATGAAGTTCGGCTCCATGAACTCTTAGGATCTTAATATGACACTGTTTTTTCTTTCCTTTGGGATAACTTGCAGCACTTCTTTTATTAGTTTGTCTCCCATTCTATAATAATAACCATATAATTACTTTTTTCTGTATTTTCTATAGTAATTTGTTAAACTAAATTTAGTTTTGCAGCTCTACAAGTGGGGATGAGAACTTTGTCGAAAATAAAGGTTTTTTTGACTACTCAAAATTGGGAGAATCTGGTATCAAGCCAAGGTCATTTGCATTGTCTGAATTCCATTTTCTGCTTCTCATCAGGGACAAGATTAAGGTACAATTCTTTTTAAAAAATCTATACTGTTTTCACTGTGATTCATTTTGCTTTCTGTCACTATTTTGTCTTCCCTGTTGTTTTATGTATTCCTTTACAAAGCAAAAGCATAACCTGTGATTTTTAGGTAGTGAACAGAATCAGCCAGCAAATAGTGGAGGAACTTATAGTCGATAGTTCACCAGAAGTTACAAAAGGAATAATTGGACTTTGTAGTGATGCATCAACTGGGCTTTTCTATGCATACGATGAAAATTCTATATTCCAGGTTAGAGACTATCTGATTCTTGCTTTGATGTAATAATTGCCTTCAGAGTCCAGAATTGTGTTGCTGATGAAGCTATATATTTAGATTTCATCATCTGATGAGGGTCGTGATATGTGGCAAGTATACCTGGACATGAAAGAATATGCTACGGCACTGTCACATTGTCGTAACTCCTTCCAGAGGGACCAAGTCTATCTAGTGCAGGTGATGTTTATTTGCACTTCGATCCCATGCACTACTTTTTTCTCCTTTATTATTTTTCCCTCTATGATAAGCTGGACCTTTTTTGTTTTGTGATGATCAATGACTTCTGTTATTGTATAAATATCTTCTCTTTTGTAGGCTGATACTGCATTCAATACAAAAGAGTACTATATAGCAGCTTCCTTCTATGCAAAGGTTAAACCCACACTGTTTAATTCTGTTCCTTATTTTTTTTAAAAAAAAGATTTTGTTGTCCTGTTCATGTTGATACTAAAAAAAATATTCTCTTGGTTTCAGATGAATTATATCCTATCATTTGAGGAGATCAGCTTAAAATTTATATCTGTTGGTGAGCAGGTAGTTTAGTCTGAACTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTGTGAGGAGTCTGAACTTTCTAATATGGTATATTATTGCATGTTTGTGTAAGATCTATCTTTCTAAAATACTCATCTGCCATTTGATATTGTCAAGAGCTTCTCTGAGATATCTTTGCTTATTGATGTATTCAATTGTTTTTTTTTTCCCTGATCTTTGTCACTGATGCAAAGTTCAAGTGTTGCTAGTTCCAAGATTGATAATTTGAAATATAATATAATGCCGTTAACATTGTGAAAACATAGAGGAAATGTTCTGTCATGCTTTGGTATAATCTAAGATTCATTCTAGTGTAACTATTTACATGATACATGAGAATATTGTGATTTTATTTATGAAATAATTATCTTCCTCAACTTGACAGGATGCTCTCAGGACTTTCTTGTTGAGAAGGCTTGATAACCTAACGAAAGATGACAGAATGCAGATTACAATGATCTCAACTTGGGCTACTGAGCTGTACTTGGACAAGGTACCAATTGTTTGTTTTTCAACCTTCTAAACTAATATAACAGTCTTCATGACAAGAAGGCTGGTGTCCTATTTTCATTGTTTGTACATATCCTTTTTTTCCTGCTCTTAATACAAAGATACACAGTCCTCTGTATTGTTGAGAAAAAGGTAATATCAGGGCCGGCCCTAGGGGGGGTCAGGCCGTGCGGCCGCCCGAGGCCCCCAAAATCTAGGGGACCCCTATGCACATACAGTATATATACTATGTATTGTATAATTCTAGTCCACGTGCCATGGATCTATATTAAGTTAGATAGCTGAATAGCCTAATACAGAAAATGAAATTTAGTCCATCGTTAGGCCTGTTTTAGCGAAGCCGAATCAATCTTCATTTGACTCCCGTCGCTTTGCCTTGATCACATCACGCCACTCACGTCATGCCGCCTCGATCACGTCACGCCGCTCGTTGCTCCTGCGCTCTCGGTGACTTCTCGGCGTCTCGCAAATGAAAACAGCAAGTTGGCAAATCGC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