BGIOSGA028293
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028293 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028293, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28436 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028293-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028293-PA |
| Length |
8747 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:9880555..9889301 |
| Sequence Coding Region |
9880555..9881983,9887770..9889301 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:9880555..9889301 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:9880555..9889301 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAAACCATGCTCTCTCTTCTCACACATGCCCTCCTCTTGCAAACAGTCACCTCTCAGACCATCAATGGAGATGATCTCTCAGCACTCTTGTCATTCAAATCCCTCATAAGGGATGACCCAAGAGAGGTGATGTCATCTTGGGACACCGCTGGCAATGCTACAAACATGCCAGCACCTGTCATCTGCCAATGGACTGGTGTTTCCTGCAACAATCGCCGGCATCCAGGTCGCGTAACCACTCTCCGTCTGAGTGGCGCTGGCCTAGTCGGCACCATCTCCCCTCAGCTCGGCAACCTGACCCACCTCCGTGTCCTTGATCTGTCAGCCAACAGCCTCGATGGTGATATCCCAGCTAGCCTTGGTGGTTGTCGAAAGCTTCGTACATTGAACTTGAGCACGAACCACCTGTCAGGTTCAATCCCTGATGATCTTGGTCAGTCATCAAAGCTTGCCATTTTCGATGTCAGCCACAACAATCTTACTGGTAATGTTCCCAAGTCATTCTCCAACCTCACAACACTTATGAAGTTTATCATAGAGACGAACTTCATTGATGGCAAAGATTTGAGTTGGATGGGTAACCTCACATCATTGACACACTTCGTTCTTGAAGGGAACCGTTTCACTGGTAACATCCCTGAATCTTTTGGTAAAATGGCTAATCTTATTTACTTTAATGTCAAAGATAATCAGTTGGAAGGCCATGTTCCTCTACCGATCTTCAATATTTCTTCCATTAGATTCTTGGATCTTGGTTTCAACAGACTGTCAGGATCACTTCCACTCGATATTGGTTTTAAGCTTCCCAGGATAAAAATTTTTAGCACTATTGCTAACCATTTTGAGGGCATAATACCACCGACCTTCTCAAACGCATCTGCTCTCGAATCCTTGCAACTTCGTGGAAACAAATATCACGGCATGATTCCTAGGGAAATTGGCATCCATGGTAACCTGAAGTTCTTTGCGTTAGGAGACAATGTGCTCCAAGCCACACGGCCTAGTGATTTGGAATTTTTTACATCATTGACCAATTGTAGCAGCTTGCAAATGCTAGATGTTGGCCAGAACAACCTTGTTGGTGCAATGCCAATTAACATTGCAAACCTGAGCAGAGAGCTCTCATGGATTGACCTAAGTGGCAACCAATTAATTGGGACCATACCTGCAGATTTGTGGAAGTTTAAACTTACATCTCTCAACCTGTCATATAATCTCTTCACAGGAACTTTACCTCATGATATTGGCTGGCTTACAAGAATCAATTCTATCTATGTATCACATAATAGAATCACTGGGCAGATTCCACAATCATTAGGCAATGCCTCACAGTTGAGCTCTCTCACTTTGTCAAATAATTTTCTGGATGGCAGCATTCCATCAAGCCTTGGCAATCTCACAAAACTTCAATACTTGGATCTTTCCGCCACCTCCCAGTCTATCAGTGGAGATGACCTCTCGGCACTTCTGTCATTCAAATCCCTCATAACAAGCGACCCAAGGCAGGTGCTATCCTCTTGGGACACTGCCAACAATGGTACCAACATGGCATCATTTGTCTTCTGCCAATGGACTGGTGTTTCCTGCAACGATCGCCGGCATCCAGGTCGTGTTACCGCTCTCTGTCTTAGTGACATCAACCTAGTTGGCACCATCTCCCCACAGCTTGGCAACCTGACCCTCCTCCGTGTCCTGGATCTATCAGCCAACAGTCTAGATGGTCAAATCCCATCTAGCCTTGGTGGTTGCCCAAAGCTCCGTGCCATGAACTTGAGCATAAATCACCTGTCAGGTACCATACCTGATGACCTTGGTCAGTTATCGAAGCTTGCCATTTTTGACGTCGGCCACAACAATCTTGCTGGTGATATTCCCAAGTCATTCTCCAACCTCACATCACTCTTGAAGTTTATCATCGAGAGGAACTTCATCCATGGCCAAGATTTGAGCTGGATGGGTAACCTGACATCATTGACACACTTTGTTCTTAAAGGGAACCACTTCACTGGTAACATCCCTGAAGCTTTTGGTAAGATGGCTAACCTTATTTACTTTAGCGTCCTAGATAATCAGTTGGAAGGCCATGTTCCTCTACCGATCTTCAATTTTTCTTCCATTAGATTCTTGGATCTTGGCTTCAACAGACTGTCAGGATCACTTCCACTTGATATCGGTGTTAAGCTTCCTAGGATAAAACGTTTTAACACACTAGTCAACCATTTCGAGGGCATAATACCACCCACCTTCTCAAATGCATCTGCTCTTGAATCCTTGCTTCTTCGTGGAAACAAATATCATGGCACGATTCCTAGGGAAATTGGCATCCATGGTAACCTCAAGTTCTTCGCATTAGGACACAATGTGCTCCAAGCCACACGGCCTAGTGATTGGGAATTTTTGACATCATTGACCAATTGTAGCAGCTTGCAAATGCTAGATGTTGGCCAGAACAACCTTGTTGGTGCAATGCCAGTTAACATTGCAAACCTGAGCAATGAGCTGTCATGGATTGACCTAAGTGGCAACCAAATAAATGGGACCATACCTTCAGATTTGTGGAAGTTTAAACTTACATCTCTCAACTTGTCATATAATCTCTTCACCGGAACCTTACCTTTTGATATTGGCCAGCTTCCAAGAATCAATTCTATCTATATATCATATAATAGAATCACTGGGCAGATACCACAATCATTAGGCAATGTCTCACAGTTGAGCTCTCTCACTTTGTCACCTAATTTTCTGGATGGCAGCATTCCAACAAAGCTTGGCAATCTCACAAAACTTCCATACTTGGATCTTTCCGGTAACGCCTTGATGGGCCAATCCCACAAGAAATACTTGGCATACCTTCCCTTACCAAATTCTCAGGCTCTCCAACAATGCTCTAAGTGGCTCTATTCCAAGACAGATTGGGCTCTTGAACAGCCTTGTCAAAATGGATCTCTCATTGAATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>METMLSLLTHALLLQTVTSQTINGDDLSALLSFKSLIRDDPREVMSSWDTAGNATNMPAPVICQWTGVSCNNRRHPGRVTTLRLSGAGLVGTISPQLGNLTHLRVLDLSANSLDGDIPASLGGCRKLRTLNLSTNHLSGSIPDDLGQSSKLAIFDVSHNNLTGNVPKSFSNLTTLMKFIIETNFIDGKDLSWMGNLTSLTHFVLEGNRFTGNIPESFGKMANLIYFNVKDNQLEGHVPLPIFNISSIRFLDLGFNRLSGSLPLDIGFKLPRIKIFSTIANHFEGIIPPTFSNASALESLQLRGNKYHGMIPREIGIHGNLKFFALGDNVLQATRPSDLEFFTSLTNCSSLQMLDVGQNNLVGAMPINIANLSRELSWIDLSGNQLIGTIPADLWKFKLTSLNLSYNLFTGTLPHDIGWLTRINSIYVSHNRITGQIPQSLGNASQLSSLTLSNNFLDGSIPSSLGNLTKLQYLDLSATSQSISGDDLSALLSFKSLITSDPRQVLSSWDTANNGTNMASFVFCQWTGVSCNDRRHPGRVTALCLSDINLVGTISPQLGNLTLLRVLDLSANSLDGQIPSSLGGCPKLRAMNLSINHLSGTIPDDLGQLSKLAIFDVGHNNLAGDIPKSFSNLTSLLKFIIERNFIHGQDLSWMGNLTSLTHFVLKGNHFTGNIPEAFGKMANLIYFSVLDNQLEGHVPLPIFNFSSIRFLDLGFNRLSGSLPLDIGVKLPRIKRFNTLVNHFEGIIPPTFSNASALESLLLRGNKYHGTIPREIGIHGNLKFFALGHNVLQATRPSDWEFLTSLTNCSSLQMLDVGQNNLVGAMPVNIANLSNELSWIDLSGNQINGTIPSDLWKFKLTSLNLSYNLFTGTLPFDIGQLPRINSIYISYNRITGQIPQSLGNVSQLSSLTLSPNFLDGSIPTKLGNLTKLPYLDLSGNALMGQSHKKYLAYLPLPNSQALQQCSKWLYSKTDWALEQPCQNGSLIE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..1429#7216..8747#ATGGAAACCATGCTCTCTCTTCTCACACATGCCCTCCTCTTGCAAACAGTCACCTCTCAGACCATCAATGGAGATGATCTCTCAGCACTCTTGTCATTCAAATCCCTCATAAGGGATGACCCAAGAGAGGTGATGTCATCTTGGGACACCGCTGGCAATGCTACAAACATGCCAGCACCTGTCATCTGCCAATGGACTGGTGTTTCCTGCAACAATCGCCGGCATCCAGGTCGCGTAACCACTCTCCGTCTGAGTGGCGCTGGCCTAGTCGGCACCATCTCCCCTCAGCTCGGCAACCTGACCCACCTCCGTGTCCTTGATCTGTCAGCCAACAGCCTCGATGGTGATATCCCAGCTAGCCTTGGTGGTTGTCGAAAGCTTCGTACATTGAACTTGAGCACGAACCACCTGTCAGGTTCAATCCCTGATGATCTTGGTCAGTCATCAAAGCTTGCCATTTTCGATGTCAGCCACAACAATCTTACTGGTAATGTTCCCAAGTCATTCTCCAACCTCACAACACTTATGAAGTTTATCATAGAGACGAACTTCATTGATGGCAAAGATTTGAGTTGGATGGGTAACCTCACATCATTGACACACTTCGTTCTTGAAGGGAACCGTTTCACTGGTAACATCCCTGAATCTTTTGGTAAAATGGCTAATCTTATTTACTTTAATGTCAAAGATAATCAGTTGGAAGGCCATGTTCCTCTACCGATCTTCAATATTTCTTCCATTAGATTCTTGGATCTTGGTTTCAACAGACTGTCAGGATCACTTCCACTCGATATTGGTTTTAAGCTTCCCAGGATAAAAATTTTTAGCACTATTGCTAACCATTTTGAGGGCATAATACCACCGACCTTCTCAAACGCATCTGCTCTCGAATCCTTGCAACTTCGTGGAAACAAATATCACGGCATGATTCCTAGGGAAATTGGCATCCATGGTAACCTGAAGTTCTTTGCGTTAGGAGACAATGTGCTCCAAGCCACACGGCCTAGTGATTTGGAATTTTTTACATCATTGACCAATTGTAGCAGCTTGCAAATGCTAGATGTTGGCCAGAACAACCTTGTTGGTGCAATGCCAATTAACATTGCAAACCTGAGCAGAGAGCTCTCATGGATTGACCTAAGTGGCAACCAATTAATTGGGACCATACCTGCAGATTTGTGGAAGTTTAAACTTACATCTCTCAACCTGTCATATAATCTCTTCACAGGAACTTTACCTCATGATATTGGCTGGCTTACAAGAATCAATTCTATCTATGTATCACATAATAGAATCACTGGGCAGATTCCACAATCATTAGGCAATGCCTCACAGTTGAGCTCTCTCACTTTGTCAAATAATTTTCTGGATGGCAGCATTCCATCAAGCCTTGGCAATCTCACAAAACTTCAATACTTGGATCTTTCCGGTAACGCCTTGATGGGCCAAATCCCACAAGAAATACTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACGACGACATCCGCCAGAACAAATCATTGGTAATATAGGTGAGCGGACTACAAGGTCTAAGGTAGCGACTCATGATGTTTGCGCAAATTCTGCATTTGTTGCTTCTTTTGAACCCAAAGATGTGTCACATGCATTAACTGATGAATCGTGGATTAACGCCATGCATAAAGAACTTGAAAATTTTGAGAGAAACAAAGTTTGGACTTTAGTTGAACCACCTTCTGGACATAATATTATTGGAACAAAGTGTGTTTTCAAAAATAAACAAAATGAGGATGGTTTGATTGTTTGAAATAAAGCTAGACTTGTTGCTCAAGGTTTTACTCAAGTGGAGGGTTTGGATTTTGATGAAACTTTTGCTCCTGTTGCTAGAATTGAGGCAATTAGACTTTTGTTGTCTTTTGCTGCTTCAAAAGATTTTAAATGTATGAAATAGATGTAAAAAGTGATTTTCTAAATGGTTTTATACAGGAAGAAGTTTATGTCAAACAACCACCAGGTTTTGAGAATCCTGATTTTCCCAACCATGTTTTTAAATTGTCTAAAGCTTTGTATGTTTTGAAACAAGCACCTAGAGCATGGTATGATAGGCTTAAGAACTTTTTGCTTGCAAAAGGTTTTACTATGGGAAAGGTTGACAAAACGCTTTTTATTCTTAAGCATGGTGATAATCAACTTTTCATTCAAATTTATGTGGATGATATCATCTTTGGTTGTTCGACTCACGCTTTGCTTGTGGAGTTTGCTAAGACTATGCGCAGGGAATTTGAGATGAGCATGATGGGTGAGTTATTGTACTTTTTGGGGTTGCAAATTAAGCAAACACCACAAGGTACATTTGTGCATCAAACGAAGTATACGAAGGATCTTTTGAGACGGTTCAAGATGGAGAGTTGCAAGCCAATTTCAACACCGATTGGTTCTACAGCTGTGTTGGATCCTAATGAAGATGGTGAAGCTGTTGATCAAAAGGAGTATAGAAGTATGATTGGATCTTTGTTGTATCTAACTGCTTCTAGGCCAGACATACAATTTGCTGTGTGTTTGTGTGCACGCTTTCAAGCTTCTCCTCGTGCTTCACATCGTCAAGCGGTCAAGCGAATAATGAGGTATTTGAATCATACACTTGAGTTTGGAATTTGGTATTCTACTTCATCTTCTATATGCTTAAGTGGATATTCCGATGCTGATTTTGGGGTTGTAGAATTGATAGGAAAAGTACTAGTGAAACATGTCATTTTCTTTGTACATCATTAATTGCATGGTCTTCTAGGAAACAATTTAGTGTTGCTCAATCAACTGTTGAATCTGAGTATGTTGCTGCTGCTAGTTGTTGTTCACAGATTCTTTGGCTTTTTATCTACTTTGAAAGATTATGGTCTTACTTTTGAGAAAGTACCTCTCTTTTGTGATAATACTAGTGCTATTAACATTGCTAAGAATCCTATTCAACACTCATGCACAAAGCACATTGATATTCGTTTTCACTTTTTTGAGGGATCATGTTGAGAAGGGAGATGTTGAATTGCAGTTTTTTGACACAAAGTTGTAACTTGCTGATATTTTCACTAAACCTTTGGATTCTAATCGTTTTGCTTTTCTTCATGGTGAGTTGGGAATAATTCATCCTTTTGGCATGTTTTGAGGGGGAGTTTGAACCTCATGGTTTTGTCAAGCAAAAATATGACATTGAGAAAAATTGCGAAAAGAGAGCTTTGTTTATACATATGGTATTTTCTTGTGCATGCTAGCAATACTTTGAAGGTTTATTTGTCTCCACCATAGCTTGTATGTATTCTAGTCTTTTCATGAGATTTAAATTTTGCTTTTAAAGGAGATGATGCATGACATTTAAATTCTATACTTGAATTAAGCAAATATGCAATATTGATGCTAGCATATGGTTTGATTTGTAAATGCTCTATATATATGCTTTATTGAATTGTTATTCCTCAAATAGCTTTAATTGCTCAATGGGAAAAGAGAATAAAAATATGAAAAAAAAAACATGAATACCGAATCCATAGAAACAGTCTTGACGATAAGGATGTATTCGATGTGAGCAAAATAATGGGTGCCGAATCCCTGGAAATAGTCTTGACGACAGGGACGTACCCGGAATAAAAGAAAAAAAATAAGCAAAAGGCTCAAGAAAAAGAAAAGGTTAAAAATTCTCTTTGGTTGTTTTATGCTAAAGGTTATTTGAGAAAGAGTGATAAATGCAATAGGTATATGCGTTTAGTGTTTATTTTTCAACCTATGTGCTTGTTAAGATGTTGCATTATAAATCGTATGAAATCATGAATTTTGATTATTGATTCAAGCTTAATTATAAAATCTTTGGTTCATGTTTATACTTTAATGCATGCTTGCTATATTATAGATGGGTTCATCTTCTTTTTATTACAACACATGACTTGATATGCTATATGTATGCTAAGCTTGACATAATTCCTATGCTTGATGAAATCATTGTCAAAAGGGGGAAAAGCAAGGTGAAAATTTTTGGAGAAGCAAATGAGTTGAGAAGAGCATTTTGTTTTTGGTTCGATTGGGAATTTCTTTCTTTTCAAAAGTGAGAGAAGTTTTCTTTTGGATTTTCGAGCACGATGTGTACTTTTTGTACGAAGTGTGCTTTTTACCACTTTTGTTTTTATTTTTCCAAACACCAAAACATTTTTGATGGGTTTGCCAATGTGTTCATCAAGGGGGAGATTGTAAAATCAAAGGTATTTTTGATTGTTATTTTGTGATGAACAATTGGCATCAGAGATTAATGGTTTTGATATTTGGAATTTACTCACGAAGTGGTTTTCGGGATGATTGGATTTCACAGGTGAATCTATAGGTACTGCTAGATGTGGTTCGGTCAGACCGGGCATGTGCTGCCGGTCAGACCGGCGTGTATCACGCGGTCAGATCGGCGCAGCCCGTGGTCTGACCAGCCGACTCTGTGTCGGTTTCGTTTTTGGGTTGTTTGTTTGGATATCCGTGATTGTTTCATGATTATGGCTTCTAGATGGATACTATACGTATGTAATACTGTTGTTTGCTACTAATGAGTCAAGTTGGAGATAGCTTGGTCTCGGAATATGGTTTCTTTGTTTATTTCATGTGTAGGTGACTTGATATCTCGGGAGAGTATTTGCGGTGATAGACCAGGAGTCGGCTTGGGGATAAGACGACGTCCGTGGTGGTCAGAGATCATGCGGGATACTAAGGGTAGAGTTCAATGCACGTGGTTGGTGAAGATTCCATATGGCATACGATGGAGGTATTGTGTGCGCCTGGGATGCGGAGTCGAATTTAGAAGGAGTCCAAATTTGGTATGATTGGTTATGTAAAGTTTGTTTCTTGTACTAGAGGGTTTTCTAAGGTGTTTAAGACTTCTAGTATGAGTTTGGTTCGTGGCTTTAGGCTGCCTACCTCGGGTATAAATAGAGGGGG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|
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