BGIOSGA027109
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027109 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027109, complete gene. |
| LocusTag |
P0488B06.37 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027109-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027109-PA |
| Length |
8098 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:17525881..17533978 |
| Sequence Coding Region |
17533763..17533978,17533209..17533302,17532186..17532374,17532028..17532087,17531782..17531943 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:17525881..17533978 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:17525881..17533978 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCTGATATCCAGTTAGGGTGCCACACTATAAGGTCCCATGGAACCAGTGTGGCAAGACTCCACATGTATGACTGGATAATACTTCTCTTTCTTGCTGTTGTTGATGGGCTGCTAAACATAATTGAGCCTTTTCACCGCTTTGTTGGACGTGACATGATGACAGACTTGAGATATCCACTAAAGGGCAACACAATTCCATTTTGGGCCGTTCCAAAGTTTGATAATGTCACTACAAATGTCATATGCCATGGAGAAAAGAGTGTTATCAAGGAAGGCCACAAGAGCTTTCCAAGTGGGCATTCTTCATGGTCTTTTGCTGGTCTAGGTTTTCTTGCGTGGTACTTGGCTGTTAAACTTAAGGCTTTTGATCGCAAAGGCCACATTGCAAAGTTATGCATAGTATTTCTGCCTCTACTTGTTGCGTCCCTTGTGGCAGTCTCTCGAGTTGATGATTACTGGCATCACTGGCAAGACGTATTTGCAGGTGGCATTATAGGTCTTACGGTTTCTTCGTTTTGTTATCTGCAGTTCTTCCCATATCCATTTGATGCTGATGCTGTATGGCCCCATGCATACTTCCAACAGCTAGCTGACACACAAAGCAACGGCATTGCAAACTCATACAACATGGGACCAACAGACATTGAGATTGCTGACGAAGGCCATGGTGCCATTTCCCTGAGAGACACCAGTCCTATTTTAGACACGATGGAGTCTGCATCGTCTCCATCCATCCATTCGCTTTCGCGGCCGCGCGGCAAGCCGGGGAATGCGACGCTGCGGGCGACTCCGGCGCCGAGATCCCAGGGCATAATGGCTGATACCCAGTTAGGTTGCCATACTATAGGATCTCATGGCATTAAAGTGGCAAAATTCCATTTGTATGATTGGATGATACTTATCTTTCTAGCTGTTGTTTATGGGCTGTTCAACATAATTGAGCCTTTTCACCGCTTCGTTGGAAGTGACATGCTGACAGACTTGAGATATCCACTGAAGGGCAATACAGTTCCATTTTGGGCTGTTCCACTGATTGCAATTGTGCTGCCCTGGGCCATCTTTGGTGGAATTTACTTCAAAAAGAAAAATGTCTATGATTTGCACCATGGCATTCTGGGGATTCTATATTCGGTGCTTATAACTGCTGTGATTACTGATGCAATTAAGAATGGTGTTGGTCGCCCACGCCCAGATTTCTTTTGGCGTTGTTTCCCTGATGGAAAGCCTAATTTCAATAATGTCACTGGTGATGTCATATGCCATGGAGAAAGGAGTGTCATCAAGGAAGGCTACAAGAGCTTCCCAAGTGGGCATTCTTCAGGGGCTTTTGCTGGTCTGGGTTTTCTTGCGTGGTACTTAGCAGGCAAACTTAAAGCTTTTAATCGTGAAGGGCATATTGCAAAACTATGCCTAGTCTTTCTGCCTCTACTTGTTGCATCACTTGTGGCAGTCTCTCGGGTTGACGATTACTGGCATCACTGGCAAGATGTATTTGCAGGCGGCATTATAGGTCTCACAGTTGCTTCGTTTTGTTACCTGCAATTTTTCCCATATCCATTTGATGCTGATGCTATATGGCCTCATGCTCACTTCCAACAGCTAGCCGAGTCACGAAGCAACGGTAATGAAAACTCACACAACATGGGATGGACAGAGACCGACGCTTTCCATGAAGGCGCTGGTGCTGTTGCGCTGAGAGACACAAGCCTGGTTCTAGACTCGATGGAGTCTGGCAGGAGGTTTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPDIQLGCHTIRSHGTSVARLHMYDWIILLFLAVVDGLLNIIEPFHRFVGRDMMTDLRYPLKGNTIPFWAVPKFDNVTTNVICHGEKSVIKEGHKSFPSGHSSWSFAGLGFLAWYLAVKLKAFDRKGHIAKLCIVFLPLLVASLVAVSRVDDYWHHWQDVFAGGIIGLTVSSFCYLQFFPYPFDADAVWPHAYFQQLADTQSNGIANSYNMGPTDIEIADEGHGAISLRDTSPILDTMESASSPSIHSLSRPRGKPGNATLRATPAPRSQGIMADTQLGCHTIGSHGIKVAKFHLYDWMILIFLAVVYGLFNIIEPFHRFVGSDMLTDLRYPLKGNTVPFWAVPLIAIVLPWAIFGGIYFKKKNVYDLHHGILGILYSVLITAVITDAIKNGVGRPRPDFFWRCFPDGKPNFNNVTGDVICHGERSVIKEGYKSFPSGHSSGAFAGLGFLAWYLAGKLKAFNREGHIAKLCLVFLPLLVASLVAVSRVDDYWHHWQDVFAGGIIGLTVASFCYLQFFPYPFDADAIWPHAHFQQLAESRSNGNENSHNMGWTETDAFHEGAGAVALRDTSLVLDSMESGRRF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..216#677..770#1605..1793#1892..1951#2036..2197#4262..4350#5747..5968#6075..6162#6246..6355#6648..6741#7498..7686#7777..7836#7923..8098#ATGCCTGATATCCAGTTAGGGTGCCACACTATAAGGTCCCATGGAACCAGTGTGGCAAGACTCCACATGTATGACTGGATAATACTTCTCTTTCTTGCTGTTGTTGATGGGCTGCTAAACATAATTGAGCCTTTTCACCGCTTTGTTGGACGTGACATGATGACAGACTTGAGATATCCACTAAAGGGCAACACAATTCCATTTTGGGCCGTTCCAGTATGTTCTCGTTATGCCAGATAAAATTTTCTTATGGTTTCATCTATCGTTTGAGGCATGCAATTCTTTCTTGACTTGCAGCTTATTGCAATTGTGCTGCCCTGGGTTGTCTTTGGTGGAATTTACTTCAAAAAGAAAAATGTCTATGATTTACACCATGGCATACTGGGTATACGATGCTCTCATTTGTAGATATCTATTGAAGTTACATCTTTGGTTCATGCTGAACCATATAATTTAACCATAGAGTTTGTGCAGGGATTCTATATTCGGTACTTATAACTGCTGTGATTACTGATGCAATTAAGGATGGTGTTGGTCGTCCTCGCCCAGATTTCTTTTGGCGTTGTTTCCCTGATGGAATACCTGTAATCTCCTTGTGCTAGTGTCCTGATCTCAGATATTAAACTTCATGTAGTCTGCAGGTTATATTGAAGTAACAAATCGTTTCATTTTTCAGAAGTTTGATAATGTCACTACAAATGTCATATGCCATGGAGAAAAGAGTGTTATCAAGGAAGGCCACAAGAGCTTTCCAAGTGGGCATTCTTCATGTAAGATATGCAACGCATCGGTACTTTTAAGTTTTGAAGTACCGTTGTATGTTTCTGAGTTGATATCGAGCTTTACATGCCTTGCAACATGCATTTTTTACATCTGTTTCTCCACATTCTCTACATACATTTCCAAGGATTTTTCTCCAATTTTTTCTTTTGCAACAGTTCCGAGTATTTTAGTAGTTGCCTCAGCCTTCATGTAGGGCATTGTTCGGAGTACTGCTCTCCAATCTGATGTGCTCCTGGTAACTATGCAGGACATTTATGAATAAATGAAATTCTTGACTAGTTTAAATTCAATGCTATATTCTCTTGGTAACTATGTAGGACATTTATTGAAAAATTGAATTTATTCATGTTGGTACCCTTAACACCTATATGTTGTATCTATGATTAAGACTCCGAGGCTATCAAATAAATGGTGTAGCTCATCTTTTTCTTATAATTGTTTATACTTCCTCCTGTACAGAAAAATGTGTTTCTGGACATCCTCATGATATCTGACATACAACTTTGACCACTGATTTTATAGTAAATTATTTGTATAATCAGATTAAAGTATAGTGCTATAAAATTGTCAAACAAATCTATGAATATAGTTTTCATTTATCTAATAATAATTAAAGAGATTTGATGTTGAAGTTTTGAAAGTTTTGCTAGAGGGGTGTTCAAAACGCTTTTCATGACCAGAGGAGAGGGAGTATATAATTTTTTCCTGGCATGTAGCACCATATACAGTTTGTTCTCCATATATTTTCGAATTTCATTACTTGGTGGATCTGTTGTCTGTAATCTGACGTATGTGTTGTGGTTCTCACTCACCTTCTGCAGGGTCTTTTGCTGGTCTAGGTTTTCTTGCGTGGTACTTGGCTGTTAAACTTAAGGCTTTTGATCGCAAAGGCCACATTGCAAAGTTATGCATAGTATTTCTGCCTCTACTTGTTGCGTCCCTTGTGGCAGTCTCTCGAGTTGATGATTACTGGCATCACTGGCAAGACGTATTTGCAGGTGGCATTATAGGTTTGTTATTTTGAAGCCTTTCTCTCAACCATTTAGAACACTCTCGTTGTCAGAAAGTATGCATGGATCTCGTCTCATTCTTCTTTCCCCTTTTTCAGGTCTTACGGTTTCTTCGTTTTGTTATCTGCAGTTCTTCCCATATCCATTTGATGCTGATGGTACGTTTCCCTTCTGATATAGATGATATGTTGGACCTTGATCGACATATTTTACAGTATATTCATGTTCCTTTGCATTTGCAGCTGTATGGCCCCATGCATACTTCCAACAGCTAGCTGACACACAAAGCAACGGCATTGCAAACTCATACAACATGGGACCAACAGACATTGAGATTGCTGACGAAGGCCATGGTGCCATTTCCCTGAGAGACACCAGTCCTATTTTAGACACGATGGAGTCTGGTAGGAGAGGCTGAAACATGCGGCGACAAGTATCTTGATGTTGTGTGGATTCTTCGCCTTTCTGAGTTTTAAGTTCTACAACATGACTAGTTCGTACGGTTCCCCCATTTCCATGTACATTGCGCAAGAATAGGTAGAGTTTTGCCAGGTAGAATTGTGCTTGTCATCTCAGGTGATCGTCTCATCATTGAGAGTTCCTTGCAACTCGGTGCTGGCCGTTATATGCTGACTTAAACTCGTTGTGGGTGTTGGCTGTAAATTACAGTGGGAGTTTGCACTCTAATCATATTCCACAGTCCTCTTTGTTACCCTGCTGATGTACCTATCCTACGCTCTGGTTGTGCTGAAATTGGTCCCAATGTAAATTACAAATGTTGCTGATTTGTCTGATCCAGTTTATTGCAGTTTTAGTTGCTCCATTGTGTAAATGCTCATAGTTATTTTTTGTTTTGTTTTTGAAGGCTGCTCATAGTTATTGTATTGTATTGAAGCAAGATATTGGTTACAAAACAGAACAAATGAGGTGCGGTTTGGAGGGTCAATTTGTCTTGATTTTTACATGAGCATATTGGTTTCCTTGAAATCTGAGAATGTGATACCTGACTTCCACATTTCCATAACATCTACTAGTTATACGAGGAAGAAAATTGACCATCATAGGATTTCCAATCATGAAATAGAAAAAGTAAAGATTATAATGCCATATCACTATACTCCCTCCGTCCCAAAAAATGTTACTCCCTCCGTCCGAAATAATGCTAACCTAGGTGGGGAGGTAAAATCTCCATCCCAAAAAGTGCTAACCTAGGTGGGGACGTGATTTTACCTAGGACGACGAATTTGGATAACCTTTTATCTAGATTCGTTGTTCTAAGTGGAATCACATCCAACCTAGGTTTTTGAGATGGAGGGAGTATTTGTTACAAAACTTTTGAAGTGCAAGACTGAGGTATTTGGTTAGCTTTCCCAACTCACCTCTCTCGTTAACTGTCCACACGCTTTCTAAACCGCTCAACGGTGTGATTTTTTTTAAAAAAATTTCTATACAAAAGTTGCTTTATAAAATCATATAGATCAATTTTTTTAAAAAAACTGATACTTAATTAATTACACGCTAATGAACAGCTTTATTTTATATGTTTGAGTTGCCAACTCCCACTAAAGAACACAGCCTAAAGTTGTTTTAAGACTACCGAAATTCGATACGATCTATTCCTATGAAACAAATGATGCATATATGAAAAAAATTCTAAGATTTAAATTATACTATAACCCTATAAAAATTATTAAAACCGAATAAGCCTTACTCCTATTGCTTAGGATCTTATTCACTCTTAGTACCAGCGAATCCATTAGACTGGAAGGGGAAACTATTTCGATCCCTCGAGGGGATGCCTCCTTGTTTTGTTAAAAAAAGTTATGAAAAATTCTGAAAAAATTAGGTCCAAACTCAAATCACACGTTGAGATATAAAAAGGACAAATTTAGCGCAGGAATAGTAACGTACTATTTACATCTAAATTTGTCATTTTTGTTTCTCGATGTGTTAGTCGAATTTAAACTTGAATAGATATCACGAATCTCAACATTTTCAATTTTTTCGTAATTCTTCACAACTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGCAGTTTTGCACTATTCACGTTCAACGTTTGATCTCGTCTTATTTGAAATTTTTTTTATGATTAGTATTTTTATTGCTATTAGATGATAAAACATGAATAGTACTTTATGTGTGACTAAATATTTTCAATTTTTTCACAAATTTTTTAAATAAGACGGACGGTCAAACGTTGGGCACAAATATCCACAGCTGCACTTATTTTGGTACGGAGATAATATTTATGTCAAACTTTTTAAAAAAATCCACTCCCGACTAGAAGTCCTGTCCAAACAAGGCCTTTTAAGAAGAGAGAATGGCTTTTATCATATTCGGCGGTGGACACGTGTCCATCAGAGAAGAGAAGGACTTTTCTCCCCTCATCTTCTGCTGCGGGATGCTGCTTCCGCGTTGCCTCCTCTCTCCTGCACTCCTGCTGCTACTCAGCATCGTCTCCATCCATCCATTCGCTTTCGCGGCCGCGCGGCAAGCCGGGGAATGCGACGCTGCGGGCGACTCCGGCGCCGAGATCCCAGGTGAGCACCCTGTGCAGTCTGCAGCACGCATTTTCTTCTTCTTTTTTACATTCTCATTTCCAATCTATTTCATGTATGGATTCTCAGATTAGATTCTCCTGCCGACCACTTGGGTTGGGGGGGTGACCGTGTTCTTTACTTCTTGATTTTATTTTTCTTTATCTGGCAGAACTGTAACATATCTCGTCGGTGCGAGCTGGAGGAGGAGGAGCCATTGGTATCTCGCCAGCGGGGCAGTGAGCCTGTCAGTTATTCTTTTCTTCCTGTGAAATTCATTAGAAAGAACCTGTTGTGCTCTCCGTGTGGAGTTCTCGATAATTTGAGATTTTTTTTTCTTAGTTTTTCCCTTTCCAAAGATTGTTAAGGTGCTTTAGGGGTAGTTTGTACTTCATTATGTTGTTACTTTTGTTTTATTAATAACATGATAAGGCTTTTGTTTAGATCTGTTATCATTTTTTAGTGATATGAGGTTTGGACTTATGTGGGGTGGTCAACTCTA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