Os01g0148100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0148100

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001048553.1 GI:115434519 GeneID:4325213

Length

9519 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0148100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:2612672..2622190

Sequence Coding Region

2613958..2614236,2614325..2614398,2615846..2616098,2616179..2616249,2616878..2617042
,2617867..2617947,2618047..2618272

Expression

GEO Profiles:Os01g0148100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:2612672..2622190 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgaagggcgacagggtgcggagggggaaggaggaggcgcttggcgccggcgggggtcagctctgccctgagtgcgggtacgagtaccccaacgccaaccccaaccctaggctccgccgatcccacagcaagaactgccgccgaaagatgaagatgcccgtggtggccgaggaggctggcgtggctgtgcacaagcggcggcgtggcttggccgtggagaacgccagtcggggaggaggaggagacaaggtggtgcacgaaggctcttctgagcaaggatgctcggcgaaagctaaggaaatttcagctgagccaaaactgatggccgatgatccaatgtcatcacatgagaaacatatgatatgccatcgtcactataagctctaccctaccaaggttgcaccacaatgcaatgatttgtcttttggaccatttttgggtcttcgtaggaaggccatgattgtgactaaaggcattaaagtgatgtcaggagaaacacttgattataagccagaaggaggccgaatcatgttcttatttgaggctggagttgtggatgaactgcatgctagtgccatcagagaccctattggtatatatttgaaggacaaaaatgagacaatgtgcattggctccataaccaaggcgcaacccagggcacggctctggttgatgctatcagaagaaatgaagctatttcacaattctgagaggaggtcggtgtacttcaatggatatgagttttatcctatgtataagcgcttgcatccattggagacatacagaaaactatgggttgtggaagtgaaaccatttgaagatgcttcttttaatcctgtagaggatgagaggaaatattatctattgaaggtcttttcaactgcgattcctaaagaagaaattgatgtacatgttcgatctaacaaggaagttaaaaggcttggggttatttcatcttatgacacttcattctcctgtaaattggactttgaagaccagtttactctatcacatacttcacaagaagaggatgtggtattctatggatacacacttcgtcacgtacaatatcctttcttttacctttattatcataatatttgtagttacagatttattcatgaaggcttaggctacaattcaacatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MKGDRVRRGKEEALGAGGGQLCPECGYEYPNANPNPRLRRSHSK NCRRKMKMPVVAEEAGVAVHKRRRGLAVENASRGGGGDKVVHEGSSEQGCSAKAKEIS AEPKLMADDPMSSHEKHMICHRHYKLYPTKVAPQCNDLSFGPFLGLRRKAMIVTKGIK VMSGETLDYKPEGGRIMFLFEAGVVDELHASAIRDPIGIYLKDKNETMCIGSITKAQP RARLWLMLSEEMKLFHNSERRSVYFNGYEFYPMYKRLHPLETYRKLWVVEVKPFEDAS FNPVEDERKYYLLKVFSTAIPKEEIDVHVRSNKEVKRLGVISSYDTSFSCKLDFEDQF TLSHTSQEEDVVFYGYTLRHVQYPFFYLYYHNICSYRFIHEGLGYNST</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7955..8233#7793..7866#6093..6345#5942..6012#5149..5313#4244..4324#3919..4144#tcgattcccctctcccctcactttctctctctctctctctctcgacgcgagcagatcagatgtgccgccgccgccgccgccgggcgagccggctggccgccatggagctgagctgcgacgcgcatctgcgattcgggccgccctcctcttcttcgccgaagtaaataatgcaaagatgagaatatgagtctagctagaggtgaggaactccgaactcccgatcgacctagctacccccctttaatcgatgcagaggcgcgcgctaagctgcaatttgatttcatttatttcatgcagtactagatacatatgtactcctgtatatttgatgaccaaatcaacttcgcatcgaggccgggttgcatacctagctaatatcaccgactagatctctctccttaattagtgctgcacttattatcatatcagattaatgaggggtttggtttgccaattaattaagttgatgaaaagaaatttacttatcgattcttaattcattagcgatgacctcccaattcccattagtatgctcttgagcctcttgactggaatcaagtagcagtacccaagcaactaatgatgaagatcgatctcatgggttagctagaaagaaagctcagaagttccggtatataatatccaacagtactagctcccctgcacccaaaagaagtggttcgtttaagtggtcatttggtcggcaaaagatgctaaccaccttaaccttgtatattggttgtgcgcttcatttggattttgccgttgtaagagtagttttcgtgatataagtgttactggtttggttgtgcgcgtactagttatgcacatacagggaatgttcttagacggttgtatcacctttgtataattggttgagtttaataaaaactttcattatctaaaaatatgtgtcaccgacatctagtacaagcatatcatcgatgttgggttaaccaaactatagcattttatttgtacctaattaggttattaccaattttcttttaaatccatttgtccgggctctatgataagaacacattgcattcaaagcttttctttagaagttcccaataatataatataccatacattattttggtcttcaacttttttccctcatcattacaatacccaagtccaatttggatggcaagggcactttgctttttcccaaaagtatatcatatactatctccatcccatatcatagctatctctgctattcacacatgcattaatcaccatctcaacgaatgtaaatatacgcttgaaaataccatatatcattgtacacatgaggattttgcataaatctagggttgtgaaacagtttaccccaaagagatagtatgttggtttttcttttttttttaaaaaaaaaggatagatcctcttgagccaggtgtacagaactattaagttaaggaaatactagtgcaatttgaaacaaacacttacaattgttattctagttttactaaatgaaacataatttgtgaggatttcttatgtggctccatatgaaccgagcatgatttaatagaggattattaatagtagtttagatcaactaaagttcacatttattattttttaaatatatttgaacaatataaatgaaatataaaactagcaataacctagcgagtttgtttgcggttatgccaagcggggcaatgagaaagtagggtgaatatataatttagggctcctttggattataggattttcataggaacaatgaagaattatactcatgaattttgtttgggacataagattttgagttttcaaattcttacacaattaatttatcgtattcctcaattccataggattataagcataggctcctttggaaatattgtttctttttttaaatactgggctggatttttaggaggggtagtttttacaagtgaggaactacaatggcggggagaaggacgatgacttcacttttcaagtagtacagataaataattatctccattctttctacatgtttgtgcattattacctttttttcatcaaaatcattaaaaaacaactacatgaaagtaattttcataacaaattaccgataccattttcagatattaaatattaacatatttttatattgtttgtgagttcagatttctaggtttgactacactcattataaaaactttatctattttagaactgacctcaaaattcctgttgtatttcatttatgtgggattcaacatattatataatattttagaactgacctcgaacttcatctatatacactgacgtcaaaattcctatttttttctataagctattcgtgtccaaatgaatgaattcaataattcgtgtcgtatttcatttatgtgggattcaacatactatataataattcgtgtgttttattcgaattcccatgttccaaaacacccacaaacaatattgaatttacatattattgcagtggcattgcctagcatgtactacatccgtcccaaaatatagcaacttaggaccggattaaacacatcctactaatacaaatctggattgccagtctaggttcacagttctaggctgctgagttcaaaaggaggggttaggaacccaacccttcaacatgtaaaacgaagcatggattagcgtatgattaattaagtattagcttaaaataacttaaaaattggattaatatgattttttttaaaaaagcaaccttcctatagatctttctttttataaaaaacacaatttaacagttcgagaaacttgcacgtgaaaaaacaagggaatagaagttgggaagatgtagtaaagaacacaccttagtatgcgtctaatcctgtcctgaatacaatattttggaacggagagagtagtaatgatatatcatgctgaagtagttgatgaagctgatggatgatagaagagaagatcttttcaattggcaaagctagtggggtatatatgctggcacactgctaattactacaactaggggtgaaaacagtcatagaaatttccaaccgattgacgctcgttttctactttaactagccaagcaatgtgaaaatggttactgacgaatactaaaacggtaaaaaaaaacgtaaacaattttgctatataccgtccgtttccaaattttgttgtattcttatgcaaattacctcttttatagtatactccctctgtcccataatataagggattttgaatataagggattttgattttttgcttgttttgtttgaccattcatgttattaaaatttttttggaattatcatttattttatttgtgacttacttattatccaaagtactttaagcacaacttttcattttttatatttgcacaaattttctaaataagacgagtggtcgaaccgtacgagcaaaaagtcaaaatcccttatattatgggacatagggagtagtatttaccgtgtttctatttgtttctttatttgactcatagtttagagtcccaccaattcctcaacaaaatctctaatttgagttgtcgagcacttggtttgaatggagacaatttacagtttatatagtgtaatcttgaatttattttgtcacattatatagttattatgcaaaattaaatgtaagactttacagttcagtgttttttacctttattatcagtatttgagtgcttacgccgtacagtcccgtttctgatttttttatgccatttttatttctgcctttctacatccctaaccctatgtatacaagtagcatatactcttcttctcataatagtagtataagattttgtgtggatgtagaaagtaaaaaaaaaaaaaaaccaaatcccgacgcgcattaacgcatctctctcgttttggtgagcagcggcggccactggcggtggcgagtcgagcagcagctgccatgaagggcgacagggtgcggagggggaaggaggaggcgcttggcgccggcgggggtcagctctgccctgagtgcgggtacgagtaccccaacgccaaccccaaccctaggctccgccgatcccacagcaagaactgccgccgaaagatgaagatgcccgtggtggccgaggaggctggcgtggctgtgcacaagcggcggcgtggcttggccgtggagaacgccagtgagtgtggttctttgctcgggatttctttgggatattgatggtttcgagttcttgggtttttacggcgatgcctttgcgtgcgctgtatgtatacaggtcggggaggaggaggagacaaggtggtgcacgaaggctcttctgagcaaggatgctcggcgaaagctaaggaaatttcaggtatagatctcatctttgcttgcttatttccctccttgctttgattgtccactaccctatgttatagtttccttaaacaaggggtttgcagcagttgcagcttatgttgattttactggttgcctcctgatgacttgttagaaaccaacactagattacggtggtttctgtaaactaatttgcaatattggatagcttgcttctgctagctgtgacatgaattggggaatttgggagaggagcggggctcagacgtttcagttaatttggtcgggcgtcttgctaagagatttgtttgttcttacccaaagaaaaaaaaaggggcttagtggaagctgcagtctgttgtgttggtttttgtatgagctaaggcttgttcttttgctcttgttttcagggattcatattgttgattttacacctacttgtaagctatttactacaagatttttcgtatacttaagaactcacgatatttcgtcaagctagaaagtatccatgttatgctctaggtagaagcaatgcgttactggcatatggtgcacaattgttacaccggaaaagctttagtgatccttccatgct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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0148100, RefSeq:Os01g0148100