Os01g0180600
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0180600 |
|---|---|
| Description |
Similar to MutS homolog 7 (Fragment) |
| Version |
NM_001048743.1 GI:115434899 GeneID:4325353 |
| Length |
9959 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0180600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:4233573..4243531 |
| Sequence Coding Region |
4233769..4234239,4234712..4234839,4235329..4235425,4235519..4235905,4236045..4236230 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:4233573..4243531 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:4233573..4243531 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcagccgcggcggcggcagcagcagcagcagtcgatcctctccttcctccagaagaagccggcggcggcggcgggggaggagggcgcgacgcccgagaggcccccgcggcctcccgccgcgtcggtcgcggggatcatggagaggctcgtgcggccgccgcggcagcagcagcaggggagagaccaggatgcttcccaggctagacatgtggagcagagagccttacctgtgaaaaatcaaactacttcaaatgagtgctcaagtgcattgttcttagaatcttgcaatgctggagataacaaagcagccatgttgattgcagaagaaggttcgaatatgactcctttgcaggagcccctgaagtccttatggccttccaaagatgactttgttagagcaagcacactgtccccggaacttggtttatatcaaaatcttccaccgcattgtccaaagaagttaccctttgagtcttccaataataactgcattggagctaattcatcatttgaagagtttgacgtacaaactcctcaggatacttcaaaaacagtcttctggagatcttctcgtggagctgatacacctttaacagaatctgattcagatcaaactcctttgcagcatccatcaaagttctcatttgtatctcctaatggtgaatatgtccggggcgctacactgtttgcacttgattccaattatactcctagacgagaatcctcagagaagcttagttctgggccttcagaccttccatacattaaagcaacaaaattatttacagaatttgattcaaatggaacaccatcacagaaccatctgaaaaagttatcctcagtgcctaagaatgacaaacgcattggagcaggtgctgaactattttcggaatttgatccgagtcccctgaaaccagaaacaccagtgatgcgagcagtaattcctcgtctgaagcgggttcaagaagatcaacgtgtgactaccaacgactcatgctctcctttctggggtccaaacaagaaggtgaaaccagctcagtgttctccagttgagaataaggtccatgatgaaatggctgaaagtgcacgcagcaagtttgagtggctgaatccttcgaatatcagagatgcaaatagaaggcggctggcagacccactttatgataagacaactctttttattccacctgatgcattgagaaagatgtctacatctcaaaagcaatattggaatattaagtgcaagtatatggatgttgttttgtttttcaaagtgggaaaattctatgagctctatgaggtggatgctgagattggccaaaaggaacttgactggaaaatgactatcagtggggtgggaaagtgccggcaggttggcatttcagaaagtgggatagatgttgccgttgaaaagcttttagctcgagggtataaagttggcagaattgaacaaatggaatctgcagaccaagccaaatctagaggatcaaattcggttattctaagaaaattggttcatgtatccacaccatcaacagtaggggacagcaacattggggctgatgctgttcaccttctttcactcaaagagattacactagcttcaaatggttcccgggtctatggatttgcatttttagattatgctgcacttaaaatttgggtgggttcagtccatgatgatgatacatttgcagctttgggggctctgctggtgcaggtctctccgaaagaaataatctatgaaacctcaggcctttcaaaagaaactcatagattaattaagaaatatgcttcagcaggttctgtgaaaatgcagctgaccccactatatgggttatatttctctgacgtttcagaaattcaaacgttaatagattctagaggatactttaaagcgtcaacaagttcatggttatctgcattgaattcttcagtgaataaagatgcagttatttgtgcactcggtggacttgtgagccatttaactagacttatgctagaggatgctctgaaaaacggggaggtcttagcctaccatgtatacagaacatgtctaagaatggatggtcagactcttgtgaaccttgagattttcagcaacaactttgatggtggttcatcaggtaccttatataagcacctcaatcactgcataactccatgcggtaagcggcttctaagaagatggatttgccacccactaaaagatattgatgctatcaatgaaaggctcgacattgttgagggcttcattcaaaattgtgggctaggatctgttacactagagcatctacgtaaagtccctgatctcgagaggttactaggacgagtaaaatccactgttggtttatcatctgcggttctgttgccctttgttggagaaaagatattaaaaagaaggataaaaacgtttggcatgcttgtcaagggcctccgtgttggaattgacttactagacatcctacaaagacaagatcatggcatctcagcattgtcaaaggctgtggatattccaacattgagctcccttggtgaattaattcatcattttgaagaggcaatagatgatgattttccaagataccaggatcatagtgtcaaagacgatgatgcaaacactttggctatgctagtggatcttttagttggaaaagcttctgaatggtctctagtgatcaatgctctgagcactatcgatgtgcttaggtcctttgcagccatggcattgtcgtcatttggcacaacgtgcagaccgaacattctgctgaaaggaaaagcgcctgtacttcagatgaagggtttatggcatccttatgcttttgcagaaagtgtaaatgggttggtaccaaatgatctatctcttggtcagaatttatctggccaaaatcgctttgcattgttgttgactggtccaaatatgggcgggaaatctacaataatgcgtgccacctgcctagctattgtgcttgcccagctcggctgttatgttccctgtcagtcatgcgagttgacacttgcagatgccatatttacacggattggtgcaatggatcggattatgtctggagaaagtacctttcttgtcgaatgcactgagactgcatctattcttgagaatgcaaccgaggattctctcgtcttgcttgatgagcttggcagaggaactagcacatttgatggatatgcaattgcatatgcagtattccgacaccttgtcgaagcggtccgatgccgtctgctcttcgcaactcactaccatcctctcaccaaggagttcgcctctcacccccacgtcacccttcagcacatggcctgcatgctgaagccaagaaacggcggcgacggcggcgagaaggagctcaccttcctctaccggctcacctcgggcgcctgcccggagagctacggcctgcaggtcgccaccatggcagggctcccgaggtcgatcgtggagagggcgtcggccgccggcgagatgatgaggtcgaagatcgccgggaacttcaggtcgagcgaggagcgtgcggagttctcgaccctccatgaggagtgggtgaggacgatcgtggcgatcggcggcgtgaaggacgcgcacctggacgaggacaccatggacacgctgttctgcgtcttccatgagctgaaggctcacttcaggaaacggaggtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQPRRRQQQQQSILSFLQKKPAAAAGEEGATPERPPRPPAASVA GIMERLVRPPRQQQQGRDQDASQARHVEQRALPVKNQTTSNECSSALFLESCNAGDNK AAMLIAEEGSNMTPLQEPLKSLWPSKDDFVRASTLSPELGLYQNLPPHCPKKLPFESS NNNCIGANSSFEEFDVQTPQDTSKTVFWRSSRGADTPLTESDSDQTPLQHPSKFSFVS PNGEYVRGATLFALDSNYTPRRESSEKLSSGPSDLPYIKATKLFTEFDSNGTPSQNHL KKLSSVPKNDKRIGAGAELFSEFDPSPLKPETPVMRAVIPRLKRVQEDQRVTTNDSCS PFWGPNKKVKPAQCSPVENKVHDEMAESARSKFEWLNPSNIRDANRRRLADPLYDKTT LFIPPDALRKMSTSQKQYWNIKCKYMDVVLFFKVGKFYELYEVDAEIGQKELDWKMTI SGVGKCRQVGISESGIDVAVEKLLARGYKVGRIEQMESADQAKSRGSNSVILRKLVHV STPSTVGDSNIGADAVHLLSLKEITLASNGSRVYGFAFLDYAALKIWVGSVHDDDTFA ALGALLVQVSPKEIIYETSGLSKETHRLIKKYASAGSVKMQLTPLYGLYFSDVSEIQT LIDSRGYFKASTSSWLSALNSSVNKDAVICALGGLVSHLTRLMLEDALKNGEVLAYHV YRTCLRMDGQTLVNLEIFSNNFDGGSSGTLYKHLNHCITPCGKRLLRRWICHPLKDID AINERLDIVEGFIQNCGLGSVTLEHLRKVPDLERLLGRVKSTVGLSSAVLLPFVGEKI LKRRIKTFGMLVKGLRVGIDLLDILQRQDHGISALSKAVDIPTLSSLGELIHHFEEAI DDDFPRYQDHSVKDDDANTLAMLVDLLVGKASEWSLVINALSTIDVLRSFAAMALSSF GTTCRPNILLKGKAPVLQMKGLWHPYAFAESVNGLVPNDLSLGQNLSGQNRFALLLTG PNMGGKSTIMRATCLAIVLAQLGCYVPCQSCELTLADAIFTRIGAMDRIMSGESTFLV ECTETASILENATEDSLVLLDELGRGTSTFDGYAIAYAVFRHLVEAVRCRLLFATHYH PLTKEFASHPHVTLQHMACMLKPRNGGDGGEKELTFLYRLTSGACPESYGLQVATMAG LPRSIVERASAAGEMMRSKIAGNFRSSEERAEFSTLHEEWVRTIVAIGGVKDAHLDED TMDTLFCVFHELKAHFRKRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
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