Os01g0329800

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0329800

Description

YT521-B-like protein family protein

Version

NM_001049458.1 GI:115436329 GeneID:4326985

Length

5684 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0329800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:12867800..12873483

Sequence Coding Region

12869750..12869837,12869937..12870010,12870092..12870589,12871351..12871875,12871961..12872173
,12872394..12873122

Expression

GEO Profiles:Os01g0329800

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggagatgggaatgacgccagaacaaatctatggacaaaatgtgtatgttcctgcaactgcgaatccttatccgtatggttatacagaagttggatcacctacggaatggtataataaccaaagctctttaggatatgatggccaagacatctattttccgggttttcaaaccgaaggcacacagtgcatgtactatgctgcccctgacaatggatctggtcatccttcctacagcccttacccaataaattcttctttcatagtcgacggttcatatctgccccttgaatatgttggtgatgctgctgaccaaacatgccaaatagttccctcgccctattatgttccaactattcttccttatgcacatgataatgttctgggaaacacaaccgcacctcttcaccccccagtctatgttcctactttgccaagctatactgtaacatcaacaaatcatgcattaccctcagttcctcctgttgccacaaaaaatgatgtcattgcaaatccacctatacaatctactattgtcacctcaaagcaatttctggatcatgcgagtgatcccaaggttcaattgcgtaatccaattccactgaagaaagagctggcagatggctccatgatgcctgtcaaatatcctcacacttcacaggcattttcaaattttcctgagaggcgatctgctgccaagcattcgccacaggagaaattttctgtaaacaatggctctggttttgttgggtctaatgttcagaggtgggctgcagcagagaaatttgagcctaattcaaatttgagtggtcgtattggtagtgctagcccaaagatgaaattatcgaacgtggatggcttaggaggtgcggataaaccttgcggtcagaagtcttctgccataatcgcaaaatcctacacatcaaggctctctgttggtgatccagaagggactattgttatacgatgcaaccaatataacagtgatgatctccgagtggactatccctttgcaaagttctttgttatcaagtcaattggtgaagatgatgtccataaatcaatcaagtatggtgtatggtcaagttcttctagtggaaacagcaaactggacattgcattcaaggatgctaacaggatagctaagaggaattctaccaagtgccctgtttttctgttcttctccgtgaatggtagtgggctcttctgtggcatggctgagatggttggtcctgttgattttcataaggacatggacttttggtgtcaggataaatggactggcagctttccagtaagatggcacatcgtcaaagatgtacctaattataccttgcagcatattttgctgcagaacaatgaaaacaagcctgtcacacacagcagagatacacaggaaataccatatgttcctggaatatctatgctaaagatccttaaggctatcaaagtgaaggagtgtttgcttgatgatttcatgaaatatgaggaggatgaggcgagaagtaaacattatttcagaaggtccaagttgagccataatgctccggattttgttcctgtcgctcaacgaagaaaagacgtcactgatgttcggcagccaaaatcaggcaacgtactgatagacagaacaccggtgatacagaatatgtcagtgaagccacagggtagtaatgcgatcaagcctcaggatcaatgcctacaagttgttgaaaaacaagccagcgatgacgggaaagagaacagacatcaagagaaccgcaatgtcaggcaggctaatgataaagtggtgaaaactgggactaagcagccacaggcatcaacagttaagacaagtgtggatagtaaacaacagtactggaagaaggttgagttccctgggcaaaatcctaacagtgctgttcatggctcatcgaaagcacatgaaaagcatctaaacgaatcaaaagcacctgaaaagcattcaaatggtgctaactgtagctcggcaactgtcagtttgaagacagccagagaggaaactatcgttgccagagtcagttctcttgctatcagttatcagaattcctcagttgatgtcgtgaagattggctcgatgccagttttggttaacaaagctaatgtgtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEMGMTPEQIYGQNVYVPATANPYPYGYTEVGSPTEWYNNQSSL GYDGQDIYFPGFQTEGTQCMYYAAPDNGSGHPSYSPYPINSSFIVDGSYLPLEYVGDA ADQTCQIVPSPYYVPTILPYAHDNVLGNTTAPLHPPVYVPTLPSYTVTSTNHALPSVP PVATKNDVIANPPIQSTIVTSKQFLDHASDPKVQLRNPIPLKKELADGSMMPVKYPHT SQAFSNFPERRSAAKHSPQEKFSVNNGSGFVGSNVQRWAAAEKFEPNSNLSGRIGSAS PKMKLSNVDGLGGADKPCGQKSSAIIAKSYTSRLSVGDPEGTIVIRCNQYNSDDLRVD YPFAKFFVIKSIGEDDVHKSIKYGVWSSSSSGNSKLDIAFKDANRIAKRNSTKCPVFL FFSVNGSGLFCGMAEMVGPVDFHKDMDFWCQDKWTGSFPVRWHIVKDVPNYTLQHILL QNNENKPVTHSRDTQEIPYVPGISMLKILKAIKVKECLLDDFMKYEEDEARSKHYFRR SKLSHNAPDFVPVAQRRKDVTDVRQPKSGNVLIDRTPVIQNMSVKPQGSNAIKPQDQC LQVVEKQASDDGKENRHQENRNVRQANDKVVKTGTKQPQASTVKTSVDSKQQYWKKVE FPGQNPNSAVHGSSKAHEKHLNESKAPEKHSNGANCSSATVSLKTAREETIVARVSSL AISYQNSSVDVVKIGSMPVLVNKANV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1951..2038#2138..2211#2293..2790#3552..4076#4162..4374#4595..5323#acctcctcgaccccgccggcgtccgctcctcctcctcgccgtcctccgccgccgccgcctcctccgtcgaccccgctcgcccagacccgcttaccgccttccccccctcccctctcccctcctccgcccacacggccgttgcgcacccttcgccccctccgcgcgctcttcctcccccaaggttggcgccgcctccctccgctccgtgcggtcaaggaatttccccgtgattgctgccgcagcagcgccgcgtgaaggttagtatcgcgttttttttaattttattttgactatctcaccgtagatgctcggggaaacgcggcgccatcgtttgttcggctggctatttgatctagtcggttaggtttacgctttgttgggattatgcgtggtccactgtttgttcatgtaattgtttgtgtttatgtttttattatgtaatttgcagcttaaacatgtaaaaccaaataacccttctcctgtaggaacatggagaggaactgccaatttgccatgctattgtgaattcttgatttaggtttcgttctcgttgcatcgatttttcattattctgcagggttcctctataactgttgacttagtttctctttaggtccggaaaggtagttgtgtgaatatggattgtcaaatttatcaggcattgggtttagttcatcattttagtatttgttactctctagaacgacctcaatttttccttcgcctctgcaattaggacatgcatgattgtcagttattgagccaagcttgggcttggtatttgaaggtcagcatttcctgtgccctgtttagtgtttcaacatatgtggtaattgcaccttgcatgctaatgagagaccaacaaataggcaaaggatgcagggacaatcaacccatctgtcaaccctttatcaagtttgagatgccctgtgccatttatgatattagtattgtttggtaaattcggtgatgaaactttgtcatggtagattcatacaacataataagacgatcgctagtttctcttctgacatgcagagagtgtctcaattaaaggccagcattgctgtacttagctgctctgtatcaaacagtagttctaaatccacttcctcatttatatttttgatagggatatgcagatattgattggctattagattactgttcttgcattgttgagtttccccttctgttcttgatttgctacgctgttgttctttgcttagaatcatcagttgactttgcaccatgctttgaccacctctacattgttcgcctctcaaatgttccatgtgatgaattcacatgcatcactagttagttgtagtatataagttatgaaatcattgaattttctttgaagggctgggctttgtgacatgatgctacttgccctttcgcttcatggttttggttagtgcaatgttgatgttatctgtataccttaggatagttgaagccaaaatgagctgaaattatgattataaaatcttgatgttaagtattctatgtgcaaagatctttcactggacttgacttttccaggttaccaaacttagtacaatctctcattgatgtgtattgtcatcttattgttaagtctgatcacaactatattttctatacacctattttgagaaggcaaaaacatttgtattgtcaagttaatttttatcatagtaacagtaattggaatttttatattccttttctatgtttgtctgcttgttgattaacttgctgcaatatatgcttcttcactggtttatttttgtaactgtaaaataacaattagttagacacgatggggcatgaatgttgttgcattttatgcagtattgctatgttagtttcataattttcagtatgtgtgaagctgttcataacatctctaaagttctgaacactgcagtaaaacaagtgacttgtttccaaaccgtgaattgtatggagatgggaatgacgccagaacaaatctatggacaaaatgtgtatgttcctgcaactgcgaatccttatccgtatggttatacaggtaaaaacatgaactggcagcttgctttcgtccacatgttatctgttgtgctttatttctctttatgctgtcgggtcgtaatacatttattgaatgcagaagttggatcacctacggaatggtataataaccaaagctctttaggatatgatggccaagacatctattttccggttagtacacatgacaggttttctctatactttccctttcctaatgagcatttttacctagtttgtttgattacttcgcagggttttcaaaccgaaggcacacagtgcatgtactatgctgcccctgacaatggatctggtcatccttcctacagcccttacccaataaattcttctttcatagtcgacggttcatatctgccccttgaatatgttggtgatgctgctgaccaaacatgccaaatagttccctcgccctattatgttccaactattcttccttatgcacatgataatgttctgggaaacacaaccgcacctcttcaccccccagtctatgttcctactttgccaagctatactgtaacatcaacaaatcatgcattaccctcagttcctcctgttgccacaaaaaatgatgtcattgcaaatccacctatacaatctactattgtcacctcaaagcaatttctggatcatgcgagtgatcccaaggttcaattgcgtaatccaattccactgaagaaagagctggcagatggctccatgatgcctgtcaaatatcctcacacttcacaggtaggcaaatccacatgtccttgcaggtcttctgttagctggagtgctctcttttgtcagttgctatgcagtactaggccatgtcttctgtatgttaattcaaaacaattataggatttaacattgtcttatgacatgaaaaagtttagaacaatgtgtgagtagtgcctttgaatctgtacttattgttctagtaggcgatggcactatattgtgatattgtggccacagcatagttctatctcaatttaatatatactaccaaacttatttctaattgatcaggttcctttttttttctgaaagtcaacccgttaaataataatactacaaagatttgcatactgaaagatgatattcaatatgatgctgacatatgtggtcatatttttgttaccagtggtgtggggatattgtggtaactgcacttggcagatattttgatgttataccatagaatggttatattttgtaactgcaaatatagtgtgccctatgatgcatttcaaacttactttgggtattcctggagttctttaatgtttttgtgtagaacaagcttttgtaccaatttgaaatctattcatgactagtctatttattatttcgttttgtaaagagaaaaatcctgaaaggttgtttgcctttcaacgcttgctgtaaaagttcatattttttctttctgtgtgattaattgcttatgtttgcagaaatttcttatctctctttctgagctgacaaatcttgtgctaaatgatcaggcattttcaaattttcctgagaggcgatctgctgccaagcattcgccacaggagaaattttctgtaaacaatggctctggttttgttgggtctaatgttcagaggtgggctgcagcagagaaatttgagcctaattcaaatttgagtggtcgtattggtagtgctagcccaaagatgaaattatcgaacgtggatggcttaggaggtgcggataaaccttgcggtcagaagtcttctgccataatcgcaaaatcctacacatcaaggctctctgttggtgatccagaagggactattgttatacgatgcaaccaatataacagtgatgatctccgagtggactatccctttgcaaagttctttgttatcaagtcaattggtgaagatgatgtccataaatcaatcaagtatggtgtatggtcaagttcttctagtggaaacagcaaactggacattgcattcaaggatgctaacaggatagctaagaggaattctaccaagtgccctgtttttctgttcttctccgtaagtacctctaatgtattcaaactacatttattcagtgttgtctgtgattaaaatattaattctgggatttcttgtttatcaggtgaatggtagtgggctcttctgtggcatggctgagatggttggtcctgttgattttcataaggacatggacttttggtgtcaggataaatggactggcagctttccagtaagatggcacatcgtcaaagatgtacctaattataccttgcagcatattttgctgcagaacaatgaaaacaagcctgtcacacacagcagagatacacaggaagtaagcattcatgacaaactactctagatgtaacattttgcttaatatgcttcctcgaattagtttggatctatgaatgccagtgaatttcatttgtaatgttctataaaaaaatgttctgtttgtcaagtagtttgttagtaatttgatcattgaagcatgacttgttttaaaccttggtttcatctcacatctttgttgctcaatatttgaattgcagataccatatgttcctggaatatctatgctaaagatccttaaggctatcaaagtgaaggagtgtttgcttgatgatttcatgaaatatgaggaggatgaggcgagaagtaaacattatttcagaaggtccaagttgagccataatgctccggattttgttcctgtcgctcaacgaagaaaagacgtcactgatgttcggcagccaaaatcaggcaacgtactgatagacagaacaccggtgatacagaatatgtcagtgaagccacagggtagtaatgcgatcaagcctcaggatcaatgcctacaagttgttgaaaaacaagccag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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0329800, RefSeq:Os01g0329800