Os01g0338200

From RiceWiki
Revision as of 18:50, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os01g0338200

Description

Mov34/MPN/PAD-1 family protein

Version

NM_001049478.1 GI:115436369 GeneID:4326798

Length

8883 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0338200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:13439029..13447911

Sequence Coding Region

13439134..13439259,13439502..13439566,13439650..13439743,13439882..13440052,13440138..13440244
,13441112..13441217,13441320..13441366,13443209..13443527,13443697..13443786
,13443875..13443937,13444083..13444157,13445159..13445221,13446706..13446758
,13447467..13447641

Expression

GEO Profiles:Os01g0338200

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:13439029..13447911 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008394:13439029..13447911 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggggccgccgcagcaggccaggggcggcggcatcgacatcgaggcgtgcgcgcgcccgatcgccgtcgaccaccgcatcaagctcccctactacttccgcatcgccgggaacctcctccgccaggctaagatatatcgagacgagaataatctcgtcgacctgtatgtcatcctcctgcgttactcgagcttggtttgcgagacgattccaaagcaccgtgactaccatacattcaagttgagagaagtggatttcttcaggcttgctccacataatcaatctaaactaattgaagtgctcagtgagcttgagtcactgaagccagttgtgcagcggcaaatcactgagcataacagagcaagaggaggtgccatcgaatccaatagtataaatggaaccattgctgtaaataatataacaaaacagcatatgacaaatccttatacatatcagccatttgtaggaagcaacaatggatcatttgaaagacctgtccctggtgggaatcatcaaatggcaccattaatgagtgctcaacctgatagactgacccgcaaacaacttgcaaatctccctttccctaaagaagaaacattagctagacactctatattgggacctaatgggcttcatgggcaatggactgggcctgttactgcaatcaaggttcagtatccaagcaatcttgatataataaaaagcgatgtgtctagtttatttccatctgtcttgaaccaagatggtcagaatggtcccagtacaatatccacagatagcactcaaattgagaatgatgatatgaaatctgttctgtcccttgatgatggtcgatggtctaagctggcagaggaatgcgcctctgtaccttctgttagtctggaagaagaattatcccaattgagtatcaaacagccttcacctcctccagtcttggcagagttagagcgcaggccaattgctccatcagaagttgcagatccaacaccaggacttgctgtctcagaaaccgggcgttatcagaacttacatgttccggtaaagttgatggaatgttttctaagggttgctgaggcaaacactaagagaagtttagaaacatgtggagttcttgctggtaccctgaaaaagagaaccttttatgtgactgccttgataattccaaagcagaaatctacatctgattcatgtgaagcgacaaatgaagatgaattatttgatgttcaggacaagggctcgcttttcactcttggttggattcacacacatccaacacagtcctgcttcctgtcttccattgatctccataatcattattcttatcaggtgatgttacctgaagcaattgcaatagttatggcacctactgacacaagaagaaaacatggtatatttcatctctctgatcctggcggtatgggtgtgatccatgattgcccggagagaggattccatcctcataaggcccctctagatggttcaccaatttatgagcattgctcccatgtgtatatgaaccccgatgtaaagtttgatgtgattgaccttcgataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGPPQQARGGGIDIEACARPIAVDHRIKLPYYFRIAGNLLRQAK IYRDENNLVDLYVILLRYSSLVCETIPKHRDYHTFKLREVDFFRLAPHNQSKLIEVLS ELESLKPVVQRQITEHNRARGGAIESNSINGTIAVNNITKQHMTNPYTYQPFVGSNNG SFERPVPGGNHQMAPLMSAQPDRLTRKQLANLPFPKEETLARHSILGPNGLHGQWTGP VTAIKVQYPSNLDIIKSDVSSLFPSVLNQDGQNGPSTISTDSTQIENDDMKSVLSLDD GRWSKLAEECASVPSVSLEEELSQLSIKQPSPPPVLAELERRPIAPSEVADPTPGLAV SETGRYQNLHVPVKLMECFLRVAEANTKRSLETCGVLAGTLKKRTFYVTALIIPKQKS TSDSCEATNEDELFDVQDKGSLFTLGWIHTHPTQSCFLSSIDLHNHYSYQVMLPEAIA IVMAPTDTRRKHGIFHLSDPGGMGVIHDCPERGFHPHKAPLDGSPIYEHCSHVYMNPD VKFDVIDLR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>106..231#474..538#622..715#854..1024#1110..1216#2084..2189#2292..2338#4181..4499#4669..4758#4847..4909#5055..5129#6131..6193#7678..7730#8439..8613#ttcctaaccccaacccccgcctcgcccgcccgattccccgccgccgccgccgccgccgccgcggagctcgccggagaagcggcactcgcagaggagtggcccgccatggggccgccgcagcaggccaggggcggcggcatcgacatcgaggcgtgcgcgcgcccgatcgccgtcgaccaccgcatcaagctcccctactacttccgcatcgccgggaacctcctccgccaggtcaggcccgcccccgtggtgaatccctcccgggacgccagatccctcctcctggtcgatgagagcgcctgccgactttggtagatcaatttgcgcgatttcgctgtagcacgctgattgtggttgggggctgtcgggattcgatgaattggggattgtttcgttacgcgattagcgtcgattcttttggttccggtaccgaattgtgttaatgctgggtgcttcgatgtggttttgcgcaggctaagatatatcgagacgagaataatctcgtcgacctgtatgtcatcctcctgcgttactcgaggtgggttggtagctgaattatcttgatattttttttgttctagtgaagttccggggtcacaccaaacgtatgtattgttgcagcttggtttgcgagacgattccaaagcaccgtgactaccatacattcaagttgagagaagtggatttcttcaggcttgctccacataatcaatctgtaattcctctcgctttactactgtgtatatatatggttttaagttgtctagtggatcccagttgattgtttttaattatggataacgatgttctttgctctatcagctgtctctaagtaactgtcattttgtcatagaaactaattgaagtgctcagtgagcttgagtcactgaagccagttgtgcagcggcaaatcactgagcataacagagcaagaggaggtgccatcgaatccaatagtataaatggaaccattgctgtaaataatataacaaaacagcatatgacaaatccttatacatatcaggtatatatatataagcctgttatggttattctctctcattatggtcagcttctaagtgcttgttctggtttactttcttgttcagccatttgtaggaagcaacaatggatcatttgaaagacctgtccctggtgggaatcatcaaatggcaccattaatgagtgctcaacctgatagactgacccgcaaacagtatgtgtatatttcagtcatatttatatgtatgttttgggtgtttcatctgtcttaaataaaaagtagacatttattacttttcatattgatactgtgagctattaattaaggaaaggaaactcaatagacatgtttattagcttacctaaaacatcatagaacttgattgactcaattaggtaagatttaagaccaaaattttgcttgtaggtaagagaccattcatgtgccctaaattaaattgggtgttcaagaatttcactatttttttcaacaaaaatagcagattcctttggaatatgttggttctcctccacaccaaacatgctcatagttcataatgtgcaacaggtcacagatctaagtcttcagttaggagatatttagaaatcaatcactagttgtacagtacagtcttttttaatataaaaaataacatttttcttgcatgaaccagctgtatttatcacttgattttttcgatgggctacaattgtataacagtataaatcgatgaacataaattctatactgcatccagggtatttggtaatcgttgattccgcgcatgccatagttgtaaatgtaaagctgtgaaacatcattacatggcaatagaaaatattaaagaaggccagttggttcgcagcatcggttaaagttagtcaacttatagaagagttatagcaagaatgttacttttatttgcatgcttttgattaagtgttttctttattcctatttgactctcttgtcaatgtatttcctggaaaaatagacaaattcattatttatccctgacatatttgtagccatttgtgctagtagactaaaaacttatcatttgccgtctattttaaacagacttgcaaatctccctttccctaaagaagaaacattagctagacactctatattgggacctaatgggcttcatgggcaatggactgggcctgttactgcaatcaaggtacggttattttcctcattctctgaatgtgtttgcttgaaaaaaaattaaccatagagaagacatccatagtcttattgatttccttattgcttgttgcaggttcagtatccaagcaatcttgatataataaaaagcgatgtgtctaggtgagaatttagatgcttacagcttaatatctctaaagtgattatattttctacttgtctctttcttcttccaaaccctgtgttgaacttctttcaagtcggaaaagtttatcttactaattatcttcatagcttaccagctccataaacttcatttgaacttcagtgtttcttggaacttctgtaagaattaaattgcttctaaaaaaatagtacacaactacaaagatccattaaaacagaagttacaaaaaactgtaaaaaacaaccatacaaaaaaaaagtaaaacagattgaatattcagtaatgtcttttcgtggagttttactatcttatattttttttgtttttattggtggaattcatctatatttttttattattgtatgatatttatattttttactgccttctgtgtactaatattttaattctaaaaaaattacgttgtctctttgacagaacttttgttgatcacataggtatcccagaacatttatctcagttattttctaatagccctacagtttttttttgagtgagttgcactttgggccaccttttattaccgaagtttcacttcaaaccaccctttaaccaatcttttcactttggactaggtatttttccctttcttgcacattggatcaccataatgcttttgtctagccatgtccaacctctcctccggcagaagatgtgacctacacctaaacaggggagatcatcggcatgaaggtgccgatgagcttgaggctgttaatatgctcgcgaagaaagtttgggtggtccaaaatgcaaagaaggcaaaaatacctagtccaaagtgaaaatattaggtaaagggtggcccaaagtgaaactttggtaatgaaaggtggagtgaattgcaatctgggccatatattttattacccaagtttcactctggaccacccttaaaccaatcttttcactttcgaccgggtaatttcaccatttttttggtttagaccaccctaaacaattccttcagcgcccatcaacaatctcaatcaaatcggtttcgatacatcggtgaacttcatcgtctatatgcaggccatatcttcaccagaatagagggtaaacatgaatagtaaagagagttgggtggttcaaactggaaatatggcaaagttacccgatccaaagtgaaaatattagtttaggggtggtccaaagtgaaactttggcaataaaaggtggcccaaactgtaatttactctaaaaggtagtctaaagtacagttcgctctttttcttttgtgggtaggaacccggttattttataatccattttttaaagtttgtcaataattaattcagcaatatatgagtatattggtgcctggcaactgaagttctgctgataaatttaattcacatatggaaataattctagattaacctaattttgtacttactattagtatattgtaagaaaaattaatggtaattgttcaattccagaggctttgcaaggtgaaaagatgccttgtattttatatagagcgatgttttctttcaggcattttgtcagttacacaaaagcttaaagcattttcttgaaataattttagtgatgacgtgctacatacgtatagaaccacctgacagaaatgtcaaatggctctactaaatagatatattttgaaaggaggaaacatccaaatttgaaagcagaagtgcttattcacattgttgcaatagtagggattgcagctggacattaatcatatttgtatggaaattagttcatactctcagctgaaaactttatgtttcttatcatgtgacattagcactgtcttgcttatgcagtttatttccatctgtcttgaaccaagatggtcagaatggtcccagtacaatatccacagatagcactcaaattgagaatgatgatatgaaatctgttctgtcccttgatgatggtcgatggtctaagctggcagaggaatgcgcctctgtaccttctgttagtctggaagaagaattatcccaattgagtatcaaacagccttcacctcctccagtcttggcagagttagagcgcaggccaattgctccatcagaagttgcagatccaacaccaggacttgctgtctcagaaaccgggcgttatcagaacttacatgttgtaagttgagatatgcactatcctttgaaagttgaaactataatattgttctggacctacagctttacactaagcacttgagtagtgttcttctatctgcattttatttgcatgtattgttactattgacataatttcactgatgatttcaatgctactttcttattagccggtaaagttgatggaatgttttctaagggttgctgaggcaaacactaagagaagtttagaaacatgtggagttcttgctggtaccctggtatgtacattccccaaagaaaataagaagagtgatttgactggactgcttaactggactacttaaattttgttatattttcctgtagaaaaagagaaccttttatgtgactgccttgataattccaaagcagaaatctacatctgattcagtaagttataaatattctatgttactatctcggtcgacatatttgttccatgcttcatagtttcagttatacatgttactgaatgagtatataattatgacacttcaagagacaactgagttacatggctttctttattttacagtgtgaagcgacaaatgaagatgaattatttgatgttcaggacaagggctcgcttttcactcttggttggattcacgtaagtctggttcaatgaaactttgataccattgatgccttttgttgtttgctcaacagctcaagtcaatagggtacatctactgtaataataccttaaattggtaccagcacttattttactatatttgatataaagatatcacttcatcagtgaagatgaacatctttacattagtaatccaacttgatagcttctttaaaaaaatattgaagatgagctccttctctgccatgtaaaagagcctaatctcttctttaacactgggaatgaaaatgtgatatcaaattcttcagttggcatgtcagtgggttgttttttgaaacttgttggtagaatactcgattgcccatattcaagaggggcattcttggtacatgcttaaagttgtcattcctgttatcaagcttgagttttcagcatctattagcagtttaggattcagattttgtcttcttcagttcttctttggacatatacgacattggaattcaactattgtgcacggcattacatagtactacctctggtttttaatagatgatgccattgaattttttacacgcgtttggccatttgtcttgttcaaagaaattacataattattatttattctgttgtgacttggtttatcgttaaagatactttaagcatgattttcattttcgcatattcgcacaatttttaaataagatgaatggtgaaatgtgtgacaaaaagttaaccgcgccatctattaaaaaccggagggagtacattgttaagtgtcagaaaatgctgccaaaatatcattcatttttcatgcacaaatagggcagttctatgactgtgtcaatatttatgagcggtttcagtagataaaactgaattacacatctcatgcaacgtttttttttgttttctttgattagaacaactgtgagtataatttgttgggcctgctttcttgcgttaaaatattctgtttcttctgacatcatttttctgttctttttttccagacacatccaacacagtcctgcttcctgtcttccattgatctccataatcattattcttatcaggtaatatttgtcagattggatctcacatagcattaccacttggggctgcaatttctattgaagtaatttatgttgtcttgcctacactttattgtgatattaatcttataactgttttctcattgatttctatgaggaaaacaccaaacaaatgcatgtcctagagtaattgtcaggatgtttcccagtagtgaaattataaatgtctgcaatgcactgatcacccttagaccaggagctgaaaaagaatgtctatgttacccacatatggggatacggatacgcgatatgtagatacggagatacggcgttctctaaaaaaacatggatataggaatcatctatacatgtagaaaataatatgactcgtgcaaggaaatcagaatattgtaataccagtgacagccttcaaaaaagtatcagtaataaacagtacatcatgtcttcctctctaacttttctctatcttctccaataactcaaacttacctccacaatccactgaatggcatgggtagcatgttagtttgcccttgctttgctggcccattagttcctctatgaatttgcagctacatatcaaccgcacattagctaatccgaaattcatcagctctaaactacatagcacttgtactaagaaaatagaaaaggggaacaagaaagttggaagggccaacaactcaaagcctcactggggatgaatgaagttagtggctggtgacggtggcgtttgtggtggcgatggaggatggcagtgggggcagtgctacgctccacggcggcggcagtgctgcaccactgcatatttggcatctggcgctacacctggcttccatcgacagcggcactgcatttggcttctgttgtcaacaacgacactgtgttccgcttccattgacggcggtcttgaacgagaacaacaagggcctcacattgtgaatggttgccaggatgaagcgatgcatagttttcgtttccgggaggaattgggatatgtatcggggaagtatcctgatttgttttatttacatggaaacaatgaaaatcactgatacatacggtatacgtatcatttggaccctatccaatgcacgcatccgtatcctttcgtgtatctgatacgaatacgtggctttttggcgtatccaggtaacacaggaatctgttcatgacatgtgcaatttacccagtgctcatggcaaagttttgtgctatctgttgattttcttcagaatattattgcatacccagacatggttagatccaatatgatatgatggtttcatttctatgtattctcgtgttcaattaattactagagtagcatgcgccctgctaatttgcttagtatgtactggctggtaaattgaacgacattgtttctatgtcagaattttctgcctgaaatcatttcatgaaagaaaaaaaacattattttctatttgttcatgtgtttgctaattgatcttttataccaacaggtgatgttacctgaagcaattgcaatagttatggcacctactgacacaagaaggtatgtgatttgctctgtgacgtttacttgtgcatttggcagccagttgagtcaattcttttatactccctccgtcccaaaatataagcatttttggatttcgacacagtcctcgagatgctactttgaccaacaatatctataaaaataagatgttttaaataaaaagatttacatgttatgatagtttgattaatattataaatctagtaacatcagttttacatgattgttctcttttatttcttttgctattaatagttaacgttaaaaatagttgacttggcactatgctaaaaatggttatattttgggacggagagagtagtttgcttcttgggatgctaattttgaagcatttgtagtttgcatctttcaacttaggtcaaatgtgcaatctgttgcatctctgaccgagtagtacaatttcgtgcttacaatttcctcaataacatcggaacgtctttgtttttacgttctctagcagtacatatctctagcagtacattgttaagccactcgctgcagtttctttttaccctataagattgatgaaaattttttgaagcggaattaatagtctacataatgtttgcttgtctgcttgtgcttgctagcttgtgattgtctgcttgtgctagcttgaaccatgttgaatatggactgtgcattagatgatcatgtgatcttgaatgtgttgttgaacagaaaacatggtatatttcatctctctgatcctggcggtatgggtgtgatccatgattgcccggagagaggattccatcctcataaggcccctctagatggttcaccaatttatgagcattgctcccatgtgtatatgaaccccgatgtaaagtttgatgtgattgaccttcgataatggtgagaactccatccgcgaaagactggcagctgaacaagttggctgcctttatttttttaactgtgctgaagaatctcgaataccgatgtaagtgattgtacatagctatttgcatgtatagagttccgttgaaatgaatatcttcggtatctatggggaatttatgaatttattgtatttcattatactcacttagctctcaagatatacgcttgtaagacgaggtggaaatgttcaatctcatttttatgccaagtcaattgttgt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0338200, RefSeq:Os01g0338200