Os01g0369000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0369000

Description

Similar to Cullin-1

Version

NM_001049583.1 GI:115436579 GeneID:4325735

Length

8562 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0369000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:15362557..15371118

Sequence Coding Region

15363159..15363260,15363630..15363797,15364691..15364909,15364983..15365126,15365238..15365520
,15365616..15365671,15365747..15365896,15365979..15366065,15366143..15366178
,15366426..15366488,15366567..15366647,15366733..15366822,15367029..15367106
,15367190..15367393,15367468..15367515,15367628..15367813,15370590..15370689
,15370787..15370926

Expression

GEO Profiles:Os01g0369000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgacccacgagcggaagacgatcgatctggagcaggggtgggagttcatgcagaagggcatcaccaagctgaagaacatcctcgaggggaagcccgaaccccagttcagctccgaggactacatgatgctctacacgacgatttacaacatgtgcacgcagaagccgccgcacgactactcgcagcagctctacgagaagtaccgcgagtccttcgaggagtacatcacgtccatggtcttaccttcattaagagagaaacatgatgagtttatgctgagagagctagtaaaacggtggtcaaaccataaagtgatggttcggtggctatcacgcttcttccattatcttgatcggtactttatttcaaggaggtccctaccacaactaagtgaagttgggcttagctgtttccgggatctggtatatcaagagatcaaaggaaaagtaaaaagtgcggtgatatccttgatagatcaagaacgtgagggtgaacaaattgatagggccctgttaaagaatgttctggatatatttgttgagattggcttgactagcatggactactacgaaaatgattttgaagatttcttgctcaaagatactgcagactattactctataaaagcccagacctggattcttgaggactcttgtccagattacatgttaaaggcagaggagtgtctgaaaagggagaaagagcgagttgctcattatttgcactccagtagtgaacagaagttgttggagaaagtgcaacatgagttgctaactcaatacgcaagtcagctcctggagaaggagcattctggatgccatgcattgcttcgtgatgacaaggttgatgatctctctagaatgtacaggctcttttccagaataactcgtggtttagaacctgtttctcaaatatttaagcagcatgttactaatgagggcactgccttagtgaagcaagccgaagatgctgctagtaataagaagccagagaagaaggagatagttggtttacaggaacaggtttttgtccggaaaatcattgagcttcatgacaagtatgtagcttatgttacggattgttttcaggggcacactctcttccataaggcacttaaggaggcttttgaagttttttgcaacaaaggtgtttctggcagttcaagtgctgaattactagctaccttctgtgacaatatcttaaagaaaggcggtagtgaaaagcttagtgatgaagcaattgaagatacccttgagaaggttgtaaggttacttgcctacattagtgacaaggacttgtttgctgagttctatagaaagaagcttgcaaggagattgctttttgacaagagtgctaatgatgaacatgagagaagcatccttaccaagctaaagcaacaatgtggagggcagttcacttccaaaatggagggcatggttactgatctcactgtggcaagagatcaccaggctaaatttgaagagttcataagcacacactcagagttgaatcctggaatagccttagctgttactgtcctcacaacaggattttggccaagttacaaatcttttgatataaatctacctgcagaaatggtgaaatgtgtagaggttttcaaggagttttaccaaacaagaacaaaacacaggaaacttacctggatttattcactgggaacctgtaatattaatgctaaatttgaggccaaaactattgagctcattgttacaacttatcaggctgcattgctgctgctgtttaatggagttgatagactcagctattctgagattgtgacacagttaaatctctcagatgatgatgttgttcgattgctccattctctatcttgtgcaaaatacaagattcttagcaaagaaccaaataatagatctatttcaccaaatgatgtcttcgagttcaactcaaagtttactgacaagctgcgaagattaaagatacctcttcctccagttgatgagaagaagaaagtagttgaagatgttgataaggatcgcagatacgcaattgatgcatcaattgtgcgtattatgaagagtcgcaaagtattgggtcatcagcaacttgtgatggaatgtgtggagcagcttggacgcatgtttaagcctgacttcaaggcaataaagaagcgaattgaggatcttatcacaagggattacttggagagggataaagacaacccaaatgtgtacagatacttggcttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATHERKTIDLEQGWEFMQKGITKLKNILEGKPEPQFSSEDYMM LYTTIYNMCTQKPPHDYSQQLYEKYRESFEEYITSMVLPSLREKHDEFMLRELVKRWS NHKVMVRWLSRFFHYLDRYFISRRSLPQLSEVGLSCFRDLVYQEIKGKVKSAVISLID QEREGEQIDRALLKNVLDIFVEIGLTSMDYYENDFEDFLLKDTADYYSIKAQTWILED SCPDYMLKAEECLKREKERVAHYLHSSSEQKLLEKVQHELLTQYASQLLEKEHSGCHA LLRDDKVDDLSRMYRLFSRITRGLEPVSQIFKQHVTNEGTALVKQAEDAASNKKPEKK EIVGLQEQVFVRKIIELHDKYVAYVTDCFQGHTLFHKALKEAFEVFCNKGVSGSSSAE LLATFCDNILKKGGSEKLSDEAIEDTLEKVVRLLAYISDKDLFAEFYRKKLARRLLFD KSANDEHERSILTKLKQQCGGQFTSKMEGMVTDLTVARDHQAKFEEFISTHSELNPGI ALAVTVLTTGFWPSYKSFDINLPAEMVKCVEVFKEFYQTRTKHRKLTWIYSLGTCNIN AKFEAKTIELIVTTYQAALLLLFNGVDRLSYSEIVTQLNLSDDDVVRLLHSLSCAKYK ILSKEPNNRSISPNDVFEFNSKFTDKLRRLKIPLPPVDEKKKVVEDVDKDRRYAIDAS IVRIMKSRKVLGHQQLVMECVEQLGRMFKPDFKAIKKRIEDLITRDYLERDKDNPNVY RYLA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7859..7960#7322..7489#6210..6428#5993..6136#5599..5881#5448..5503#5223..5372#5054..5140#4941..4976#4631..4693#4472..4552#4297..4386#4013..4090#3726..3929#3604..3651#3306..3491#430..529#193..332#atcccccctcctcctcccctcttcgcctccgtccacctcgcgtgcggcgggagggaacccaccgacctcgttcccctccccccacgtacacgacagcgaagagccccccccaagctagggctccccggcggatcctcggcggggtgggtctcgcgccgcccttcccccgattcggcggcggcgccggccgcgatggcgacccacgagcggaagacgatcgatctggagcaggggtgggagttcatgcagaagggcatcaccaagctgaagaacatcctcgaggggaagcccgaaccccagttcagctccgaggactacatgatgctctacacgtgcgtgtgcccgccctcctcgatttctctcccgatttattcgatttttttcttccccgcgcgctgatctgatttagggttcgtctccgtgctccaggacgatttacaacatgtgcacgcagaagccgccgcacgactactcgcagcagctctacgagaagtaccgcgagtccttcgaggagtacatcacgtccatggtgagcggctgttgggttcctcccttcattgactagctcgattaatgcgctcctgtgttgaattttctaacgcagatgggttagggatagcgttgaaattatgccaatcatgtcgtatgtaccaatggactaatagcacacgcattgagagtttatagctgtttacatagagaagatagattcgatgccgaaagatgctgctctaattttgatcattgtcgatactttggagcaatcgagatattttttgttggcttcttctgataggtagataattgtactttcttaactaaggaggaccgcactaagtactgcagtattacttcatgtttttttgaatatagcttactgcgttttgcttattatttggtcactgtgctcttagatgctgtctgctaaaagtactttagtttgtactgcctgtgtccactatacaattttttttgatttgcttggagagcatgagttgctcaatttagcatgattttattcagtgcatttggatttgatcttactggaagtaggctactaacatcatcactacagaagtactccaattcactgcctgtgcatttatataaacttcgcgatttacttagagagcattgattattcaatttgggatgattttcttcagcacatttggatttgttgttacccagagcagactagcatcatttttaccgaaaaggctcatgccctgctttactgaaagcttcaaaggttcaacaaaatagcatcatattgagttttgttttctgaattggaatccctttatgttgaaatgattgttctttcatgattttgtcccttttcatcatggcagcatgtactgtgcaaccacactttattgtgtaatcactttctgtttgggcgccaaatcgacatgagaagttttgagaaatactgaatttgcaaggcatatgttcctttcaactatgaattgtgattgtaggatcaattgagcaaccactgtgggtagaatgctagatgcctggatgcatattactgttgtttctttatcctccctcagtcccttgtattgacctttacttctttcccaataaattattatccacaaaaggatcaatttctttagtaaatgtaccttgcaccaggttgcatcatgaaatcggaggaaaacctcatgaaatttgagtgaagccttatgaaacttgatgaatcttgaccatgtttgacaaagtttcatttagggcttatggcatttcttgggatatatattagttcgatgatgtaatctggtgcgaaatgtgtgccacacctcatgcaaagtgaaatacggtgcttaccgtgctttacttggtgcaaaatgcagtttattcatttttgttcaaagctaatctttgattttgttacctgttgattgcatgatgtgtcataaacacttcgaagatattgtgatttgaactgtttatggtttaatgtcacatctttcatatctgagagaatttacataatgaccatatgcatatctattacactctccctcactcattttgcattggatcattttaatgctgagcaaagtgctcctcaagtcctcatgtaattcaccagaaaaaatgcttttcaatgttctgaattgtgccgcgtctattgtctaatatgttaactttgtttttcaaggtgtaagtttttcgaggtcataacttgcttgctaagcatcgattacttgatttagtgatgctggaacagttgctgctgctgaaatctgtccatactacatccattccatttgaaatatcggtttccttttccctttgcatcaacaggacctttatagtatcatcctggcatatagatatgcatatgtttctaggatgtatgtgttcattgctatttagtgtgcagcgacttgtattaaatatgtaaatatgctaattgctatttgttgttgataagttaagtatatctcaaatatatggttgatcatataattgatacaacattttctataactagatattgcaatgcatacgattctatggtcgggaccctggttccccgccatattgaggatctgtatatgaagtcctgagcttagttgctccctgtcctgtttcccttcctatttggagaaagtctatttctcgtccctcaatttttgactcagtttagttttgtacctcaattgcaaaacagggttaaatatgtcccactcccacaattctgaaaaccgggtaaaagttgcccctccaccatgtttggtgatagtttggacccaaatagatagtggggcccatttgtcatagagtgtcatggctgattgtgtaagattcaccattctccagtccatttcccaaatagatagtggggccccacctgctgagtcaaaatcactataggatagggcagtgggataagttttgtttggttttgagagttgatgggcagcttttatatggttttatagttgagggatgaaattaaaacgtgtgaagtgttgagagatgaaaacagactttttccatcctattatgataggattgagatcctctgacttacttctctctaacgtggtcactgacatgtgcgccctctactcagcggtcccacttgtcaataactcaaagttagaggatcctcttccattatgatatagttcattagtagttctagctaattatcatgcactacaaattcaatgaagtttaattactcttcatcatttgcatgttgcctatctcagatcttcttttgtattgttcacttcttttggaagataagtcctttatttggtttcaatattttgtaggtcttaccttcattaagagagaaacatgatgagtttatgctgagagagctagtaaaacggtggtcaaaccataaagtgatggttcggtggctatcacgcttcttccattatcttgatcggtactttatttcaaggaggtccctaccacaactaagtgaagttgggcttagctgtttccgggatctggtaacactacttgcttgattactcatgattctcgttttttatgcaatacaacttgcatttctttgcttgatgactatatctagaatttaatcagttttatttattgtaacaggtatatcaagagatcaaaggaaaagtaaaaagtgcggtgatatccttggtgagtcattgtatcttgtgatgctatctttttttattgtgtatggctggtgatagacatactttctcgaacagatagatcaagaacgtgagggtgaacaaattgatagggccctgttaaagaatgttctggatatatttgttgagattggcttgactagcatggactactacgaaaatgattttgaagatttcttgctcaaagatactgcagactattactctataaaagcccagacctggattcttgaggactcttgtccagattacatgttaaaggtattctcaagaatgtttcatgaacatccctatctgtaggtaagcataatatatattttttctaatggttgtttgtttcataggcagaggagtgtctgaaaagggagaaagagcgagttgctcattatttgcactccagtagtgaacagaagttgttggaggttagtgaattgtctgctgttgcttctactccacagtccacattttagagcatactttttgatatttaatctacgtttgctaagtgcatacacaccacatgtccatatacaatttataattgtatgttcagaaatcagaatatatttttttcctgatagagcattatgtataattcactttctccggtatgacatgattttcacagaaagtgcaacatgagttgctaactcaatacgcaagtcagctcctggagaaggagcattctggatgccatgcattgcttcgtgatgacaaggtttcttggagaagctccacgtctctcaacagtttatcaggaacaaatgaagtctgctaacatagcatcttctgttttactccaggttgatgatctctctagaatgtacaggctcttttccagaataactcgtggtttagaacctgtttctcaaatatttaagcaggtattttgtttttcagaagagagtggtttatttcttaaatctattttgatgatgtaatggaatgttgcttctgtgtagcatgttactaatgagggcactgccttagtgaagcaagccgaagatgctgctagtaataagaaggtgcacagtctatatattaacttttgtttgtattaatgttgtcttagtacattcatcttattgtgtacttggggtggtatcaattggttaggatatttaatcaattagctagactttgtactcaactcttgctggtaacatatgtagtgatatttactctgctgatctgtacatatagctctgcactccgccaaacactttggatttgcacttgaagtaattttgctttttctttgttatactgcagccagagaagaaggagatagttggtttacaggaacaggttttgtttcaataactttttatatattctttcgtggctctacacttgtttcaattactcactgtttgttatcttaggtttttgtccggaaaatcattgagcttcatgacaagtatgtagcttatgttacggattgttttcaggggcacactctcttccataaggtttgctatttgatatgctcacaccattattgtcataatgatatcaaaatattggatcatgttctgtatcctgtttatgcaggcacttaaggaggcttttgaagttttttgcaacaaaggtgtttctggcagttcaagtgctgaattactagctaccttctgtgacaatatcttaaagaaaggcggtagtgaaaagcttagtgatgaagcaattgaagatacccttgagaaggtacaaccatcaatttgttatgtttgatctattagtgtcattagtaagtcctaatcttgaatgggtgattaccaggttgtaaggttacttgcctacattagtgacaaggacttgtttgctgagttctataggtaagctgttattatcttgcatgcttattctttttgtctttaaattcttgcgcatggattcatgcagttgttaacctctggggctaaatttgcagaaagaagcttgcaaggagattgctttttgacaagagtgctaatgatgaacatgagagaagcatccttaccaagctaaagcaacaatgtggagggcagttcacttccaaaatggagggcatggttactgatctcactgtggcaagagatcaccaggctaaatttgaagagttcataagcacacactcagagttgaatcctggaatagccttagctgttactgtcctcacaacaggattttggccaagttacaaatcttttgatataaatctacctgcagaaatggtaagtttgccttgaggcttttaaaaggccggagtttgccttattttgcataaaatttgtggttggcattctgctctacacacagtgattgttttatttttttatttttaggtgaaatgtgtagaggttttcaaggagttttaccaaacaagaacaaaacacaggaaacttacctggatttattcactgggaacctgtaatattaatgctaaatttgaggccaaaactattgagctcattgttacaacttatcaggtagttcgaaatcacattatccacttccctcttgtattatgacttctgaaatgcctttcacttttgttggtaggctgcattgctgctgctgtttaatggagttgatagactcagctattctgagattgtgacacagttaaatctctcagatgatgatgttgttcgattgctccattctctatcttgtgcaaaatacaagattcttagcaaagaaccaaataatagatctatttcaccaaatgatgtcttcgagttcaactcaaagtttactgacaagctgcgaagattaaaggtatcttcaatttatttgttttataggtttgataatttacttctggcaacattggttatgtagcttcggaagtttgtatttttagttttatacccctcaaatttttgggttcattttattaccaaggtcacaccgttgcatcttttaaccaattcaatgatgctgagaccacctgttgttatctttgatcatgtggcctcatccgatcagacagcaaggttggctacccaaccaagaagccaacacaggcttgaattagtctccatatgctcagccattaaattgtacacaagcaagctgcacaccaacaaaagagaatggaaactatggcaatgtaagatgtagaatgtggcagtgctggcaaaggcatcattggcaggtgccagtaagcggccgctagccaatatgggtgcatgctaaggatgatgggttttgcgtcctcagttctggataaagttaaagaaaaatgaaaaaaaaaaactccctccgtcccaaattataggacgtcctctttttaaggaaaatcaaacttggtaatttttttttactaataatcatactaatcatatatatgctacatattatgcatgttatatcactagattcatatttgttggaaacataacatggtataaattaatggtcaaagtatgtcattgaagaccatgtaaaaaaatataggccttataattttggatggagggagtactaaggaatatgtatagagtggtaaagaaaatcagcagtgagatcttctgacggcaataaagtgaacccatattcagtggtataatatgaaagcgtgaacttctgatgttgcataatcaattatgcttgtacttttctgatttctctggttcaatgtattatctttgtgtttgtgctgtttttagatacctcttcctccagttgatgagaagaagaaagtagttgaagatgttgataaggatcgcagatacgcaattgatgcatcaattgtgcgtattatgaagagtcgcaaagtattgggtcatcagcaacttgtgatggaatgtgtggagcagcttggacgcatgtttaaggtacgagttatttcttcaagaaagttcttgcacttgttagtgaaagcattttaaacacactccatttatgtaagtgctgggctcaatccattatgttcttttaaggtcatggtgttcctacgaaattcttggtacaactcattaattgtactttgttgatgtagagtttgttgattgccttgatgggctagcaccgttttgttcagttagacttggaccaccgtcttgttggtgtttccttattctgaaatatactataattattaaatataatgaatctgacatccgggaaatgtgtaaagcacttgtttgctcgaaactcctttgatgtcttcaccatcacaagtttttttctcttttccgttgcagcctgacttcaaggcaataaagaagcgaattgaggatcttatcacaagggattacttggagagggataaagacaacccaaatgtgtacagatacttggcttgatgggttttctgctggtggacggatacttgccggagcctgacttctgtgccctgcggtgctgcatttacgaatgggaaaatgataaaagtcgtcttgtggtacaacaccactggctgctttgagttttcaggcaatggttggtctgtcaaaaactcagcagagtccgccaggacaaagatttgctgctgggacttcgcaaggttctcctaaatgttgtaatcttatactaggtgatgccttatttgttacttttctgcatatcatatagttttgttgattttcaatatgttgtctagaatctagataaatggagggatactatgagttagcgatccaaccgtgccctactctcaagtcacaaagcagtaagatggccatctctgctgtaatatttattgtgtatgatgtcgtagatatgctggaagcactaatgataatggtgcattgcttcgccccacatcgtggtttattgtacaagttgagctactttgttaagtactatttgtgcttgtaattttgcaagtttgcggtacttttttttttggcataaaatgttgattaagccgtgacccccaataaagtgttattagatcccttatttc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0369000, RefSeq:Os01g0369000