Os01g0506200
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0506200 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001049684.1 GI:115436837 GeneID:4324040 |
| Length |
14564 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0506200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:19269235..19283798 |
| Sequence Coding Region |
19269644..19269760,19270416..19270487,19272812..19272881,19273877..19273991,19274091..19274148 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:19269235..19283798 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgagcagcgaggccggcggcgctgcggcgagctctgcctccgcgcccccgccgccgcggaggacgcccctggagaggaccgcggacgcggcggaggagttgtatcgcctccgcgacaccttcttcccccgagaccccgtcgagaaggccgcggccctccgcgccctcgccgacgacgccctcgccgtcctcgactccctcccgccagagcaaaggaaaacaccgcaacaacgtgctgtttatgaattcttgaggggaaaaatattggatgttttccctgattatcataaggaggctgaagatcatttatccaaagcagtaaagttgaatccatctcttgtagatgcatggctgtgtttgggtaactgcatatggaagaaaggggacctggattcagcaatgaactgcttttcattagcattaagcaagggggcagacaagaaaatactatgccagctctcaatgcttgaaagaagtatggctcaaggtagtgaaggccaagcacagctagtggaagagagcattaagcatgcaaaagaagctgtaatgcttgacatcagagatggaaattcttggtataatctgggtaatgcatatctgacaagctttttcgtgagtggatcctgggatcacatgaagcttcatcattcagtcaaagcctatcaaaatgctgaaaaggatgagactacgaaatgtaatccagacctctactataattgtgccacagctgacaaatacctagagaactatgaaagagcacttcgtggatttgaagctgcagctttaaaagatcctggtcttggtgctgatacagaagttcagaagatcatcagtctccttgataagctagatagtgcaatgaagggacaattacgatccaagagattagcatcatcagtgtcttctttgagtgaagtcaacataaaatcatctcacaagaaagcaaccataggcatcctatcagagggtttgaacaagacagttgctgtgttggggaaagtcattcttttgataagacacgacaacattgctccaatgtattatttaacatgcgacttggatcagtcttatttcatactctcagtctatggtctacggaatgaagcaattaaagaaggtgatcgagtggcattgttggatccttactacagaattctggatatatcttggaaagaacagcgctatcagttcaaatcaatccgtgtggactttccagaacagattcttgttaatgaaaaagctccaccacctcatcatgttgtacgagcttcaatccatgcacacaataaaccatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSEAGGAAASSASAPPPPRRTPLERTADAAEELYRLRDTFFPR DPVEKAAALRALADDALAVLDSLPPEQRKTPQQRAVYEFLRGKILDVFPDYHKEAEDH LSKAVKLNPSLVDAWLCLGNCIWKKGDLDSAMNCFSLALSKGADKKILCQLSMLERSM AQGSEGQAQLVEESIKHAKEAVMLDIRDGNSWYNLGNAYLTSFFVSGSWDHMKLHHSV KAYQNAEKDETTKCNPDLYYNCATADKYLENYERALRGFEAAALKDPGLGADTEVQKI ISLLDKLDSAMKGQLRSKRLASSVSSLSEVNIKSSHKKATIGILSEGLNKTVAVLGKV ILLIRHDNIAPMYYLTCDLDQSYFILSVYGLRNEAIKEGDRVALLDPYYRILDISWKE QRYQFKSIRVDFPEQILVNEKAPPPHHVVRASIHAHNKP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>14039..14155#13312..13383#10918..10987#9808..9922#9651..9708#8521..8658#8358..8411#6460..6554#3991..4080#2321..2378#2132..2242#1935..2044#328..535#gctttccgccggcgccgatctccatcctactagcggaggtggcgccggcgttctcctgctcccgccgcatcatcgctcaccggtgagcatcctaatccatcccatccggcctcggcctcggcctcgaatttcgtctcctcgcccgccgctttgtgccgaatccccatcctgcgagcagaggtggcgcccggcgtctgaatattttgctccttcctcctaccccgtttcaagcctttgcggcccttgcgcctctccccttgccggccggccccgctcagtcggttgcctcggactcagatcccactcgcatcgccatcctagaaaccgatgagcagcgaggccggcggcgctgcggcgagctctgcctccgcgcccccgccgccgcggaggacgcccctggagaggaccgcggacgcggcggaggagttgtatcgcctccgcgacaccttcttcccccgagaccccgtcgagaaggccgcggccctccgcgccctcgccgacgacgccctcgccgtcctcgactccctcccgccaggtaccttcaagtcgcggtctccatggccagactatttcttcgattagtagcactgcgcagtagtgctgagtgctattgaaatggattcggtttgtgatggtttcgctccaattggattccgctagcatgtagcttgaatatcagaaatgaaatgtagaagccgttacatgtactgagcgtgttgcaacttgtaagctctgatgtttttattgattgcgcatgctccattggtgcggagatgatttattagatactaatgcaattttttatgcattgcaccatctctctactgttgatgctaagttattggtgtgctgcctaatatgttgtgtattactataattaggtattgtatcccgaattcagtaccatgctctaggatggatgtcaacagtgtctgtgttggatttgatgctggctagtctgtctttctaaacatctgtactccagaattttggtgcccgcataatgtctgttccagcattcatcaataggaaattctgctgcgaaacgcaggcatatataatcttattgttgtgcatgtatagctgtaaactttcatgtttgtgagttggtacagtactcattttatgtccaaatgcctgcatggttccacctatgctgccttacgtatgttatcatgagaacaaggggaactaccattgctgtggcacaacaaactatgtaaagcattaacaagtcaagtattatgcactatgatgttcttgacaatttctgaattctaatacacaaatgccttgaattatgatatccaaattcttggccccgatcttctgtggtaagagaaatttttggggaattgctgacagcagcctctcaatatctaaacaacagcaatgaccaaacctatttagatggttggatcacatctgattatacatattctattcacttggggtcccaacatgatactccctccgtttcaggttataagatattttgattttggtcaaagtcaaactgcttcaagtttgactaataagtttatagaaaaaatagtaatattttcgacacaagataaatttattataaaaatatatttaattattaatttaataaaaataatttagtaatgtaaatattattatatatttgtctataaacttagtcaaacttgaagcagtttgactttgaccaaagccaaaacatcttataacctgaaacagagggtgtatttccgcgcttttcttttctgtaagttgggacatgcaacaggtatcatcagatagtttgtgctttgatgagttgctaagttcgattgtaaccttttgggacattcaattccttttttctgttggctacttgttatctaggtgatcgatcattctgtatgttcatttcatgctcttttcagtatatttttttctttaacttccagagcaaaggaaaacaccgcaacaacgtgctgtttatgaattcttgaggggaaaaatattggatgttttccctgattatcataaggaggctgaagatcatttatccaaagcagtatgtagcagaagactacacattaccttgtatatgatgtctatcggttagaaacttaaacaaacattgttctactggatatattaggtaaagttgaatccatctcttgtagatgcatggctgtgtttgggtaactgcatatggaagaaaggggacctggattcagcaatgaactgcttttcattagcattaagcaaggtacatttttacctgtaagtagctactatgttttttttttcatgtgtccaaattctctagcataatatcatttttcagggggcagacaagaaaatactatgccagctctcaatgcttgaaagaagtatggctcaaggtgagattctcctcatatagtaacttctcacttctcagctcatagtattttatggaattaattccccccacagcatataaattatgatacagtgttatgtcactgatgaactaatcatacttttttgtacacaagaacaaaattctgagtatgtgtttcaaccagctcaagtgttttagtctgagctttaggtttaatgaactaattgctgctcatgtcaaaattatgtttgaactatttaatagatcaacaagaaacaccacacaagacaggagaggttggggggggggggtcagatagggaggttgagcaatcttctgtgggtgagatcgacccttatggccattccacaactcatctgtttctgatgaataatatacttgaactctggtatgttctgtccaaaattgtaaggcacaaatcttcaagtactattatcaatattgaaatattggtccattgcaaactagatccccggcatgcttaaaatatgtgcttctcacttctcggtggagtgttagggcatctctttataaacagacacgagctttgctcgttagcctagcttgaccttggctcgaattgattcttctgttgaaatcagaatctcttactccttagatgaaatattatttagctagaccaaattttgagatttcataagcagctcatgaacatcaataatcagattccttagatgaaatattattttaccaacactaaagacaacgtgagtttgcacacggggctaaactaatcgaaacaaaacctaaagaaagaggggatcattgccttggtaaaataaagggccagaaggtcggtggcggcagccagtacatgcacaccgagccattcaactcaattacatgatatgtgggcccaggataaatcagctagatgatgtgacatggactgggcttgagacttgatccttggtctcgtagaaaaaaaaaaggagttgtgcctgcagatttcacctgaactcgtgtgtttgacctgctcctgtgcatgcatatacggcttggcctgattgcattgaaccatagcgcacaggcagctggtacttggctgttcctgtacatgcatgccttgtttgtatatatatatacacttcactctgttgtgtcttctcttctttgatcttgaataacatctctaaatgtgaaacacaagacaggcaaagtattattagcaatctattcttatgcaaataaatatttatccttatgaacagattttcccgataattaaataacatagaagtggagccaatcttttctttcccagggcattaaaagtgatttgggcaggcacatggaaagagaggggacgacatatgtcagcagaagtactatgtaaaaaaaaagagatagagatggcagacccaataccatcacacacttatctcgatgcagatccaatgtccaaaaatttgactagtttcaacacaaaactgtcaacaaattatagcaaacattgtgtactaaatgctaatattgaatgtccgagtccctagtccctactataaaaaatgtactacgccacttgactatatctgtacagcattttcctcatcttgttgcaccccatttatgcagagttctcttttcaggtagtgaaggccaagcacagctagtggaagagagcattaagcatgcaaaagaagctgtaatgcttgacatcagagatggaaattcttggtgtaagaatcttttcattcaaaataatagttgcatatgttctgtttccttggtgtcacataccacggtgacatgccggcgttcccttgttgcttgattcaaccagagtttagattcatattttgtggcatggtgtaatcaataaatgttttaaccctgaatttgattttgtttagtaagattccaaaacagccagttgtgatagacctgttatgggttagggttggtaaacaccgcctgggggattgccgggcggcgacggcttctagggatgagaagggatataggttgggggagactaattctgattcatttctcaattagaatgatgatgcaatccatccttatataggtggaggaaaggacctagtctaatcctatccaacagactcttaactaactgagctactgtaatactgtaccgctccctggggactcgactcctcagcccactgcccatgacatagacatttatctagtttcaaacaagaaatgcgttctcatatcattatataccccaaagcttgtcttgccttttttgtaagctgttgcatgaacatcagaggagccggaatattcaggaactatatttgctgacagcgtttcgtgtacagattggttattgtgcttgtggaggagaattttaaattgcctggtggcacatgcacgcttttgatcaaagcttggctaacccactctagttatttttgcgatatgcattcttgttttcaatgcgcacaaccctcgggtgaaatggaacg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