Os01g0592900
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0592900 |
|---|---|
| Description |
ATP-dependent helicase, DEAH-box family protein |
| Version |
NM_001049991.2 GI:297597114 GeneID:4326378 |
| Length |
12207 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0592900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:24831663..24843869 |
| Sequence Coding Region |
24833841..24833919,24834001..24834146,24834278..24834757,24834841..24834896,24836273..24836372 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:24831663..24843869 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcagtactgggctcccgcgagcagatgtgcatccacgaggaagtgagcaaactccggggaaggcaacaaaacaacgcctgccactacctctgcaagaaacggtggtgccgccatcacaactctgtcgctgaattcatgaggaacaacagtgagcttgggagtgaggcttgcgacattgaagacttggttaatattgggagaactaagggcccgtgtccatattacatctcccgggaactttccaagtcggttgatattctttttgctccatacaactatcttattgatccaggaaatcgacgttctttaaatggaataccatgggataatgcagtacttatatttgatgaagcacacaacttggagagtatatgtgcagatgctgcatcttttgacttgcttcccaataacctctcttcttgcattgcggaagctcaggaatgcatccaattgtgttcagcaaagaggacctttgaaaattctgctgataaacaatttgaccctgaaaattatgctattctcaaagcccttttaatggcacttgaaaagaaaattagtgaggtggtgattgattccaaggagctgggccatacaaaacctggcaattacatatatgagttcctctctgaactgaatattacttctgaaacatccaaaaagctaattgacacaattgatggtgcttctctattacttgaggaaggaaattctgctgaaactggacctgggatgaaggcgaaggctactgtctgtagattggaaacaatcagggacattcttgacataatttttagaggtggtggtcaaagccatgcaaagtattatcgttttcatgtgaatgaatgccaacaaaattctggagatgctcttaaagttttgggtaaggtatcaaggactcttagttggtggtgttttaacccagggcttgctatggaagagtttctcaagttgggtgtgcgctcgattatattaacatctggcactttatctcccttggattcacttgccctggaactaaacctggaatttccagttaggctagagaacccacatgtcattgcttcagatcaaatctgggttggagttgtgcctgtaggcccatcaggacatccacttaattcttcttaccggacgcgtgagactctgaaatacaaacaagaattgggtataactattgttaatttcgcccgcattgtaccagatggtctgcttgttttctttccgtcatattctatgatggataagtgtatcaactgctggaaagataggaaccatgaaaattcaagtgatgagcacacaatttggcaacgaatctgcaagcacaagcagccagttatagagcctaggcagtcatcgaactttccaaatgcaatcgaggattatgcagccaagctacgtgattcttctacaaccggggcaatattttttgcagtttgtcggggcaaagttagtgagggtcttgattttgctgaccgtgctggaagagctgtaatagttactggaatgcccttcgctaccccaactgatcctaaggttcggctcaagcgtgattatttggataagctgggttcagcatctaacaagaactcaaaggctttgacaggggaggaatggtatgtacaacaagcggcaagagctgtcaatcaggctgttggacgtgtcattagacatcgccatgactatggagcaattatttattgtgatgaaaggtttgtttggcaaaattatcaatctcagatgtcatattggctgcgaccttacataaaatgctataaaaagtatggggaagtagtccaagggttaacaagatttttccgagataaagtgtctattgattcttcaaagccaaatgagacagattttaatgataatattgtactgcttgcagacaaacataaacctcaggagactatatctgctttggctgtcaccacagcaaatgagaaccagagaactgcattatctgtgaatccaaccaccaaaagaagtaactatatcaagtttgcccagatcactcctgccaatcgctctaccctttctatgaaacatggctgttcatctacttcgcagctcttatactcaggagacaaactgtctacggatgctcaggttattgatttggctgctgatgtggcaacaagtcatcttgcaggatatagatttaagtccttaggacctaaaaaggctaaagtaatggttggatccaaagatgtttgttttgatgatggatctccaaaattgcaacataatgttgagtcaagagctttggctgggtgcttgggtgagcaatctacagcttcatcaaagaagagtaatattacacatgcacctggaaacagtggggctattcatgagaaatctggaggccaggaatctaatgcagggccagccttcttgaagctggctcgagaaaagctcagtactgcagagtacagagattttgttgaatatatgaaggccttaaaattgaaaaccatgcacataaaggactcacttgatgcaatagcaaaactgttttcgtctccagagcgactcccacttcttgaagggtttagggtttttgttcctaagaatcatctttcattatatgagcagcttgttcaaagctatactgtgccaaatacatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVLGSREQMCIHEEVSKLRGRQQNNACHYLCKKRWCRHHNSVA EFMRNNSELGSEACDIEDLVNIGRTKGPCPYYISRELSKSVDILFAPYNYLIDPGNRR SLNGIPWDNAVLIFDEAHNLESICADAASFDLLPNNLSSCIAEAQECIQLCSAKRTFE NSADKQFDPENYAILKALLMALEKKISEVVIDSKELGHTKPGNYIYEFLSELNITSET SKKLIDTIDGASLLLEEGNSAETGPGMKAKATVCRLETIRDILDIIFRGGGQSHAKYY RFHVNECQQNSGDALKVLGKVSRTLSWWCFNPGLAMEEFLKLGVRSIILTSGTLSPLD SLALELNLEFPVRLENPHVIASDQIWVGVVPVGPSGHPLNSSYRTRETLKYKQELGIT IVNFARIVPDGLLVFFPSYSMMDKCINCWKDRNHENSSDEHTIWQRICKHKQPVIEPR QSSNFPNAIEDYAAKLRDSSTTGAIFFAVCRGKVSEGLDFADRAGRAVIVTGMPFATP TDPKVRLKRDYLDKLGSASNKNSKALTGEEWYVQQAARAVNQAVGRVIRHRHDYGAII YCDERFVWQNYQSQMSYWLRPYIKCYKKYGEVVQGLTRFFRDKVSIDSSKPNETDFND NIVLLADKHKPQETISALAVTTANENQRTALSVNPTTKRSNYIKFAQITPANRSTLSM KHGCSSTSQLLYSGDKLSTDAQVIDLAADVATSHLAGYRFKSLGPKKAKVMVGSKDVC FDDGSPKLQHNVESRALAGCLGEQSTASSKKSNITHAPGNSGAIHEKSGGQESNAGPA FLKLAREKLSTAEYRDFVEYMKALKLKTMHIKDSLDAIAKLFSSPERLPLLEGFRVFV PKNHLSLYEQLVQSYTVPNT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9951..10029#9724..9869#9113..9592#8974..9029#7498..7597#7370..7427#6857..6972#6161..6220#5752..5838#5149..5217#4962..5069#4794..4885#4548..4702#4048..4189#3429..3480#2770..2894#2390..2566#2091..2253#1743..1893#1561..1642#810..942#agggcgccgcctcctcttcttccctcgcaagcttcccccccccccccccccccccaaaatccccgatttcccgcccactccgtcccctccccctccgcctccggcggccgccgccgccgcaatgccggtgtacaggatccgcggcgtcgacgtcgacttcccctacgacgcctacgactgccagatcacatacatggaccgcgtcctcgaatccctccagcaggtaaccccccaatcccctccgattcccccccgtcggcgcggaatcggaaacccttcgattccattcgatttgagtgatgggggcgagctcgccggatcgatccgacaggggaaaaacgcgctgctggagagccccacggggacggggaagacgctgtgcctcctctgctcggcgctcgcgtggcgccgcacctttggggagtttctgcgtggaggcggaggcggcgggggcgggggcgggggcgggggcgggggcgggagccagcagccgccgtatgggagccagccttctgggagccagcactcggggggttcggcgtcgcagtcgtctcggtaccccgtgatcatctacgcctcacggactcacagccagctccggcaggtcatcaaggagctcaaggccaccagttacaggtgaagcccgatggcgagcaaattacgcttatctgtcagttgtttttatctaagctaactgcgccggatgtatgctgttctgtaattccatttgaatgtctttgtcttggaggtctggagtaatggagttagtgccctcgcactattaactcgttcagttttgtaggccaaaaatggcagtactgggctcccgcgagcagatgtgcatccacgaggaagtgagcaaactccggggaaggcaacaaaacaacgcctgccactacctctgcaagaaacggtggtgccgccatcacaactctgtcgctggtaattgcaataggatccttgttacatataaccataaaatttatctctgcacataaagttaaagccatggtaaatccatgcacacccacacacattaggcatttctgtatcataggcccatttgattcgtacaagaagtttattgtcaatgccacaatcaacaacttgaatgcttgagtcatataagttatccttcaagtcagatgttactgccgcgctgatgcttctgtagtactacccgtgatgacaaaaaaacatatcacccttgaatgcacagtcaaactatatttattttggcgagaactgctgtctaaatgtataaaatgtagttctgatattggaaaatggtatgagtaaatttgatgtggaagaactaccgtgatattttacaaagttttcgaatagacaatggtcaactttagtggttaaagggacatcttgcttttccttcataaaagggacaccttgttgactttgaaaattcaaaacaacttatttttgttgtcaaaggaagtatctccctatgttcccatgctggcctgtccatgttaggtattttgttgtagtttcttttaaacaattcttttacagattaaccatatgttgcttatcctgtagaattcatgaggaacaacagtgagcttgggagtgaggcttgcgacattgaagacttggttaatattgggagaactaagggcccgtaagtttcatatttcatctgccctaacttgcacaccacatgcacacaacagaacgcctacagattttgctgactacaattgttttattttccattttaggtgtccatattacatctcccgggaactttccaagtcggttgatattctttttgctccatacaactatcttattgatccaggaaatcgacgttctttaaatggaataccatgggataatgcagtacttatatttgatgaagcacacaacttggtatggaaatacatgctccagtcctttgttcaatctacaactatctgaatatctgtttgctttagtgttaaaactctctttatgcttaagacttgagttaaatgaaccaatctcaatattatatacataagtttcattcaatatatgtctggttatagttctgtttgttttgaatttaccattacccttttatgcaggagagtatatgtgcagatgctgcatcttttgacttgcttcccaataacctctcttcttgcattgcggaagctcaggaatgcatccaattgtgttcagcaaagaggacctttgaaaattctgctgataaacaatttgaccctgaaaattatgctattctcaaaggtgaaccatatttcttcttacagcagcaaatcatacctgtatccatattcttagttagaaagtgtttacctatgttaatgattcggactgtgagatttcgtactgtaatagactaataatcgaactttttccccagcccttttaatggcacttgaaaagaaaattagtgaggtggtgattgattccaaggagctgggccatacaaaacctggcaattacatatatgagttcctctctgaactgaatattacttctgaaacatccaaaaagctaattgacacaattgatggtgcttctctattacttgaggaaggtaatcaatttttccaggtttcttctttccactgaaatgtactattccattttctcgatctgaatagttactttaagctttcattatttttctagctctaagtgttaccttagttgaacatattgaatttctgataactattgataattgtttgccggttcatgcaaagcagttgagtgtctgtatttttcctgcacacttaggaaattctgctgaaactggacctgggatgaaggcgaaggctactgtctgtagattggaaacaatcagggacattcttgacataatttttagaggtggtggtcaaagccatgcaaagtattatcgtgtaagtttctctaccttagataagttctgctgctttcttctgtcatttaatgtttgcagcaaccatgcacaataatatatgatatatacatctctctctctctctccccccccctcttcctgacttccattgtccctgtttagaagacaggaaattttctcaatttcttgaactgttacctccaaaattcctgtgttccaagtagggcttcagttttttcatcctaggggtgcaagcgggccgacccgcgagtttaaataaataataatttatgggttttcgcgtcgcggcccggcttgccgcatctaaatatacaagtggatcaatttataaacccatttataagtcaaattcatagttaacctgctagtcaaaccggcgggttacacactatttttgcctataagcgggttcgcgggtaaacccacttgcacccctatttcatcctacctcttttcacactttactgtataagcttgcatactctgctggaattttatgcttttacaattgcactcattcttttcattccagtttcatgtgaatgaatgccaacaaaattctggagatgctcttaaagttttgggtaagttcactcgtattatggtcactcgttatttaaatctggttcaatgtttgcatggctctgtagctgatgcccatatcttcttttggtactaataattcatacttatctaataatattcatccaaatgctctcatgctgtcacctgacaattgtttttttcatatccgtagtgtaagcatatttttttatagatttgtatccaattaatggtggcagaagctgcaagatctgccttcaggagttgtgtccaagctgacctcatttagttgcatcaatattgtacaactatctcttaatggtggaatttacaagatctgcttttaagatttgtctccaagcctgcagcatttagttgcatacttgcatcaatattatatgtataatccatgagcaagagttaattgctctttaacttccattgtttgtattcgttcttctctatttccatacgcttaactcgactcctgatacaattccctgtaacccgaaatatttaaaagttaacatttgagtcagtaattgtttacttatatacttaattctctagattttcttatattgcaggtaaggtatcaaggactcttagttggtggtgttttaacccagggcttgctatggaagagtttctcaagttgggtgtgcgctcgattatattaacatctggcactttatctcccttggattcacttgccctggaactaaacctgtaagaacaaagaagtctaaattttacttttatttttacttaattatcagctcactcaaattttatatgtactccctccgctccaaaatataaacatctgtacgtttttttagcaaaaactaaggtagatggaaaaaaaatctcttttagtcacagtggtcaaaatttgaattgtttagattctcttcccaagcatctcattggctgaaaatgtatatagatttccgtgcatttgaatcagtgccccagaaatgcttatattgtggtacaaattttgaatactagaaatgcttatattttggaacagagggagtttttgactattgaatgttgaggtcatatgttttcatgaatccagggaatttccagttaggctagagaacccacatgtcattgcttcagatcaaatctgggttggagttgtgcctgtaggcccatcaggacatccacttaattcttcttaccggacgcgtgagactctgaaatacaaacaagaattgggtataactattggtaggcagttgagaacacctaacagtatgcagctgtttgtattttgaaatacct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