Os01g0645200

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0645200

Description

Bile acid transporter family protein

Version

NM_001050236.1 GI:115438842 GeneID:4325917

Length

6831 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0645200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:27729414..27736244

Sequence Coding Region

27729709..27729823,27729918..27730029,27731376..27731499,27731624..27731665,27731760..27731873
,27731981..27732043,27732879..27733006,27734336..27734417,27734510..27734561
,27734653..27734750,27734983..27735144,27735622..27735711,27735838..27735915

Expression

GEO Profiles:Os01g0645200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcggcgtccaccacctgccctgctcgctccatggcgtccgtctcccgagccctccgcccgcggccgcacgccgctatcgcctccgccgccgtccgcacggctgctcgtctcgggggcggattggggatcgtttgttcgatgccaagctatggtaggaaggagaaggaagaatggggattgaccattgcgtccgcaccggcgaccactgctgctccggctctgagaagctgtcaactattgtgcaaggctgaagctaacatatccagtaatctgccagagagcattcctagtgaagcaaaccagtacgagaaaatagttgagctgcttaccactcttttccctgtctgggtcatattaggtaccattattggcatctacaagccatcgatggttacctggttggagactgatcttttcactgtgggcctaggattcctaatgctatcaatgggactaacattgaccttcgaagatttcaggagatgcatgaggaatccatggactgtgggtgtgggatttcttgcgcagtatttgatcaaacctatgctgggatttgctattgccatgaccttgaagttatctgctcctcttgcaactggtcttattttagtgtcatgttgccctggtggacaagcatcaaatgttgctacttatatatccaaaggaaatgtcgcactttcagttcttatgacaacttgttcgactattggtgctatagtgatgacaccactccttactaaactcctagctggtcaactggttcctgtcgatgctgcaggattggccatcagtacttttcaggttgttttactgccaactattgtcggagtcttggcgcatgagtattttcctaagtttactgagcgcattatatccataacaccattgattggggttctcctcaccactttgctttgtgctagtcctatcggacaagtctcagaggtgttgaaagctcaaggtggtcaacttataattcccgttgctctgctgcatgttgctgcctttgcacttgggtattggttatcaaaagtttcctcttttggggaatcaacttctaggactatctctattgaatgcgggatgcagagttctgcacttggatttttacttgcccaaaagcacttcacgaatccactcgtagctgttccatctgctgtcagtgttgtatgcatggcgcttggagggagtgctcttgcagttttttggaggaacagagggcttccagcaaatgacaaagacgatttcaaggaatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAASTTCPARSMASVSRALRPRPHAAIASAAVRTAARLGGGLGI VCSMPSYGRKEKEEWGLTIASAPATTAAPALRSCQLLCKAEANISSNLPESIPSEANQ YEKIVELLTTLFPVWVILGTIIGIYKPSMVTWLETDLFTVGLGFLMLSMGLTLTFEDF RRCMRNPWTVGVGFLAQYLIKPMLGFAIAMTLKLSAPLATGLILVSCCPGGQASNVAT YISKGNVALSVLMTTCSTIGAIVMTPLLTKLLAGQLVPVDAAGLAISTFQVVLLPTIV GVLAHEYFPKFTERIISITPLIGVLLTTLLCASPIGQVSEVLKAQGGQLIIPVALLHV AAFALGYWLSKVSSFGESTSRTISIECGMQSSALGFLLAQKHFTNPLVAVPSAVSVVC MALGGSALAVFWRNRGLPANDKDDFKE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>296..410#505..616#1963..2086#2211..2252#2347..2460#2568..2630#3466..3593#4923..5004#5097..5148#5240..5337#5570..5731#6209..6298#6425..6502#gggccaggggtgtcagcagcacggcggcggaggagcggagcaaggagggagggagccacctgatccacaggagcgccgcggccaagccgcccccgatgtgtggctctcccggcgcaccccgatttcctcgcccccacctcggtcctcgacgcgacaacgaccagtagcaccgccgcttctccgccgctcgctccgactccgagccttaaacccttctgccccccacttccgcgacctccggaactccaccagcagcagtcacgcacgtctctctctctcgccccgcgtcctccacatggcggcgtccaccacctgccctgctcgctccatggcgtccgtctcccgagccctccgcccgcggccgcacgccgctatcgcctccgccgccgtccgcacggctgctcgtctcggtacggcgctcgttggagcctgtttggaggagacttttgcttcttttttttttcccattccatccctctgagctggatgttggcttgtacgcagggggcggattggggatcgtttgttcgatgccaagctatggtaggaaggagaaggaagaatggggattgaccattgcgtccgcaccggcgaccactgctgctccggctctgaggtacgtgccgtatgagcacctcgtcgatgtttattgggtccggggaattgctttccttaggtcgtggattacccaattacagaagagatcagggtttgacttggtcaacacaaactgcgtttgttgagtgttcactagtcacgttgtgctaattggaagtaggtgctgcaacctttctctgctactttaaccaaaagtcccatctgaagctgcaaaggctgctgattgggggttcaacaactgcagcttattgtaaaaggagaatcctgaatatccttctggtgatgtgctccaaccaaggtcccatgtggtcacagaacttaaagtttttttttcattatgaacacttccctttggaagtataggtatcttaatgttatcatgaaaacacagtaacaactctaaaatactggctttagtcatttagtatgagtaatgcttttgaaggaagtaaaatgtaaactagaagggatgaaattgatgaactattcaataaccatatagaatgggtatgctgcatgtggtgaatttgaagtacatggtatacgctagcaactgatcaattctcaaatttcctctaaacattgctatagatgcaaaaaaaaaaaacttttaaaagagtgactttgtaagtaatcacggtggccaaaagttcttgctctaccattttcagctgtcccaactagattaactcagtggattagttgtgtgagttgtgtttactttagtcatgcaatctgttgaacttcattgtatgcttttaagcaaggtggcatgtgtgcctatccttctaagctttgcatttcgatgtttaagggaaaattcatcattaccttctatattttgagtatcttctggactatatttgcatgcctcagaacaagatagaaagtgaattgattggaacttctcatagtattatgttctgtctctgtagtcagtcgaagtatttgctgttctgtttagtgcaatcatgacccattcttcaatcccctaatctgattgttttcaccatttttctgttgcaccttatgttttagtgttatggcatttctaatctgtagttcagtagtttatatttgagaaaaaaagcccagtaccttttgcaattaaattttctactaattagaccaaaaatttcaaggcgtgatagctagcatacttgctttccttacaggccacatagttatatttttaaatagtgcaatttcatccacatgattaatgatcctacagatcagcaaaactatattgctggcctttcttgaataatctcattattaaacacttgttgctctgattttaattacttatggtaatgatgaaatgatctgttgtttcctcagaagctgtcaactattgtgcaaggctgaagctaacatatccagtaatctgccagagagcattcctagtgaagcaaaccagtacgagaaaatagttgagctgcttaccactcttttccctgtctgggtaagttgatttgggagcatttgaggattttatctgcccttttttagcttctagttctgttacatttggtggtttgtaaagcaaatattaaaaaatgtactaaggcagagctcaccttttgcaggtcatattaggtaccattattggcatctacaagccatcgatggtaaaatttctaacttgacaatacccattactgtctgtactcaacagcaaatgccacagaaactgactttatagttttcttggaaaactttcaggttacctggttggagactgatcttttcactgtgggcctaggattcctaatgctatcaatgggactaacattgaccttcgaagatttcaggagatgcatgaggaatccatggactgtatgtttctgctcctgaacgtcttctcttaaagaaatagtgattatttttctgtacttgaggcctccaacttgatataggtttactaatgcaattgcctgttgcaggtgggtgtgggatttcttgcgcagtatttgatcaaacctatgctgggatttgctattgccatggtaatgctaggccatgccttcctattatttctaatgaaagaacaaaaaaatgaaataaacacaatctgttattcctttgtttggatatgctgctatggcagctatgctaggctttcctttcatgcgaaacaggcttgttaaagattctcatgtaaactctgggaaatattaaattgaaaggttggtgccttgctcaaagaaataattgatttgacaagcccttccctgaaaagatgcacatgccattatgctacggtttcttttcatgagatttttcatgcaaatgttaattgtaattaaattaaaaaggttgatgtcttgattaaatcaataatcaataaactgatctgacaaagcaaccttaaagatttgaaggttcaagatcaacatcaaagatttttttaaaggttcaagattgttctctggtttcatttttaggaccttttcctttcatttcctgtgtcttggatactttgagcatgtcacgtatctcaagtttcttttgtttttccatttaattttacctttttcccttgtaaggtgatatctcatctcattgcaatttttatgtgaagaaagttaatctatgtagggtagccgatacaattttatcatatcaaatgtaaactctacccgttatctgcattctttgttttccattgctgtctatttgaatccatagaatacaatttcagtggtatagtgtttctctttggttattgcaaaaaaagtttgaacctaaaattccttctagtgcattttttttcactaagatatctgcacaaatttgacgtctatatttaggtgcaacctaatatggatgtttattttacagaccttgaagttatctgctcctcttgcaactggtcttattttagtgtcatgttgccctggtggacaagcatcaaatgttgctacttatatatccaaaggaaatgtcgcactttcagttcttatgacaacgtaagcttcagatttgcttgagaagaaatttctttggtgcttgttctgatctacttgttatacatgtaccttcatctttcttgaggttctttatccctaattagagtgacagcctttataattgatttctgttgtgctcttatcattctgttatcatggtaaattacccgtttttttcttggaagacacattttcatgctagccagtctcaaaaatattgaatacattggtttagattgtttgtatgtgttaccagtttcgcaagttttaaccggcatatttatttgatgccaacacttttgtattgtctgtactcgcatgcgtagaaaatatctgcatatcatggttacacactcaacaagctttctattgagacatcaaatttggacacactatttacgattccaaagatttagttcacagattgcttttagcatgccaattcaatttgacatgcttccagccatgaagcgtttaaagaatgttactaccttgtaccttttctagtaggttttcatggcaggcttcatacataaactctttttttggatgataggaccatgttccaaaactattatagtttgatgtaattattatctgaatgaatgttgacacaattttgtttagtcgtgtaagcaaaacaacctaatatgcatggcttgattggacaaagtatagtttaagggctggaattgagggcatacggtgctattttgcctatgtgctattattctgctattttgttgtgccatttgattttaatacagaaaccacttaggatgtgttcaattgtgctggttcgtaactcattctccccgcacggaaaatgaggtagctcatgattaaggctgcgttcgacaccgatggttcagaacctctctccggcatgaaaaaagggatgactcattagcacataattaattaagtattagctaaaaaaactttaaatttgattaatatgatttttgaaaactattttcctaaagaatttttttctgaaaaacacatcgtttagcaggttaggaagcatgcgcacggagaacgagagagtagaagttgggaaaggtgagtatagaacacaccctaattaagtattagcttaaaaaaaacttgaaaaatggattaatatgattttttaaagcaacttttctatagaatttttttgcgaaatacgcaccgtttagcaattcaggaagcgtgagcgcggaaaaagagggagtagaagttgggaaagtgcagtatagaacacaccct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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0645200, RefSeq:Os01g0645200