Os01g0665300
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0665300 |
|---|---|
| Description |
NLI interacting factor domain containing protein |
| Version |
NM_001050330.1 GI:115439030 GeneID:4326854 |
| Length |
5118 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0665300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:28934551..28939668 |
| Sequence Coding Region |
28934770..28934949,28935140..28935477,28935571..28936014,28937319..28937424,28937989..28938083 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:28934551..28939668 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccagcactgaggatgaagaggaactttgacgatgatgtttttagggatgagtttgattccaaacccacaaaatctatgaagatctcacattttcaagtcagcgaactagagcagtcagctgtgttgaacttgccttataaagatccccacgatgagctggatttgacaactcagttagctggccaggacattatgatcatggaagctgctagtttggatgatgctcttggaggagcatctttgctcaaggatttaatatctgaggtggcagtttcaccaaatatggagaatgatatgttagttaattatgaagacatcagatctcagttaaatgtagtaaattattttgacaaagatgaagatgcaaattctgcatcatataatagctgtaccgttaattgtcatgaagaaagctggggctcgaatgagggttgcagtctgttggacatttataatcctgatgatgctttctctttcctattggatacgccctctgagtttctgggtagttttactgcattatatgatgaagttgtaccaattgattcattggtgaatataagtggccgatgtggagtattcccacttactgagagcactacagaagccagtattggtaatgagccatgcagatctgagggggatatgctatttagtaactcagaggtgttagagtggctcaatccacatctggctgaggaggatttgcctaatctcgttgattttactgagctgaactcacatgctgtatcaaaggagcaaggggccaggaaggtcactcttgtacttgatttggacgaaacccttgttcattcgaccacagagcagtgtgatgactatgactttacctttccagtgttctttgatatgaaggagcatatggtttatgtgaggaagagaccacatctccacatgttcctccaaaaaatggctgagatgtttgaggttgttatattcacagccagccaaagtgtttatgcagatcagctgcttgacatcttggatccagagaaaaaactgttctctaggcgttatttccgggagtcatgtgtatttacaaacactagctacacgaaggatctgacagttgttggagttgaccttgctaaagttgtcataattgacaacactccgcaggttttccagttgcaagtgaataatggtatacccatagagagttggtttagcgacgactctgatgaggcattacctcagctgattccgttcctggagacccttgcttctgcggatgatgtccgacccataattgccaagaagtttggcgacaaaaaggatattgctgagattttccaataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPALRMKRNFDDDVFRDEFDSKPTKSMKISHFQVSELEQSAVLN LPYKDPHDELDLTTQLAGQDIMIMEAASLDDALGGASLLKDLISEVAVSPNMENDMLV NYEDIRSQLNVVNYFDKDEDANSASYNSCTVNCHEESWGSNEGCSLLDIYNPDDAFSF LLDTPSEFLGSFTALYDEVVPIDSLVNISGRCGVFPLTESTTEASIGNEPCRSEGDML FSNSEVLEWLNPHLAEEDLPNLVDFTELNSHAVSKEQGARKVTLVLDLDETLVHSTTE QCDDYDFTFPVFFDMKEHMVYVRKRPHLHMFLQKMAEMFEVVIFTASQSVYADQLLDI LDPEKKLFSRRYFRESCVFTNTSYTKDLTVVGVDLAKVVIIDNTPQVFQLQVNNGIPI ESWFSDDSDEALPQLIPFLETLASADDVRPIIAKKFGDKKDIAEIFQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4720..4899#4192..4529#3655..4098#2245..2350#1586..1680#1123..1279#tctctctccccccttctccgtctgcgttgtgctgcgcgagcccccggaggcgaggcgactccgcgtcgccttcccccccgagcgcgcggccggcgagaagggcgggaggcgcgggcggcgaggtgctcctcttctctctctgtgtctctcgtcggcgacctcgcgcggtagcctcctctccggtggtggtcgcgcgcgcgcggacggtcgacgagggaggtttggagggtgggggcgcgactcggggttgaattcgctcgagctgactcactccaggtaagaattgaacagcgattcgtgtttccgagcagaattgagtgaattggttggagcggttccgctgatttacggcggtgatctgggtgctctctgttcgtgatttcggggtttgtttgatgagatttcagcgtttttctttttctaattaggagatgttagtttggtagggaggttgcggtaattcgttgagatggctgccacgttgtgaattttcctttctagggtttgggtcttcgcgttggtcctaccgtgatcccacctggttgtccctcaatttcgttgcttccttggctctactgacgctttattactgccgatctagccgtagaaaattatctttctgcaatagtaccgtagctgtacaaatgatctcgtctaaagcttctgctctacttcattttctatatgcagcatgtttgctaatctttttatgttgcaagtacaaatctgttgattaaggcatgattagtaggttaatacgtctactgctatgcgattacttgcgtaactgaagaaaggaattaatttaaccattttaacggttgcacctcctttgctgttaaaagaactaaaggagtctgcttttgaggaagcaactgagtgcttgtagaaggcgtgattgaatagtaaaaactgtcttaagaaagctagatcttttctcaacggcaggcttttcttgttataggttgtactaaatgtttacgttccttcatgagttcattttaaggctgtgtctatcgaccatatatattgagatctcatatatatttctaaggtgtattctccaacttttgtatttgttctgcagagggttttatagtttcaagcacaacgctgctcaagatgccagcactgaggatgaagaggaactttgacgatgatgtttttagggatgagtttgattccaaacccacaaaatctatgaagatctcacattttcaagtcagcgaactagagcagtcagctgtgttgaacttgccttataaagatccccacgatggtaagtgactgcaggcagctctgtgggagttaaggctgattttttactgatgtggagtttctttcaactttcccttaaaatatatgtaatttagctgtactgtttattacagttctcttgaacaggaactgtgtgtgcctaatgttgcattcggaagctattttttataggtagataatttaacaactcatgtttgttaagttggttttacttagctatttggaaaatgtgtttaaattgtgcattgttagtgatcaaaggttagtgagggtgtgcatatttcattgattctatttcctttttcagagctggatttgacaactcagttagctggccaggacattatgatcatggaagctgctagtttggatgatgctcttggaggagcatctttgctcaaggtgtggcatcatcatctgatcatatattattataattattattgtcgcactttacttttgtgttcaaccgtttggcttcaatacttccatttcattattataagtttcctcttgtacttcagtttgtctctccaaactaattagtccaatgaacttctgattacaaatgagtaaccactaacttctgagttctgattatggagatataactattgcaatttctttccaaagttcattgcactaatcagtttggggagacaaactgaaatgcaagaggaaacttattataattaaatggaagtattgaagccaagaggaaactgatttgtcatttgaccttgcacttccaactagtttcagttaatgatttgttataaagggcagaaggcattgtgtttgtttcttatttgtgttatgaactaacatttgtaggctaggtatatagcttcattattttggtgtcttctctcctattttatgtctcagcactctatatcagaatcattattattctgttattttatagaatcttctgcaatgtaatgtttccatgttgatttacaggatttaatatctgaggtggcagtttcaccaaatatggagaatgatatgttagttaattatgaagacatcagatctcagttaaatgtagtaaattattttgacaaaggtaaggagcaaccctttcaccttaagtgacttaggatatatatccattaagcgaagtagcaagattaattttgctatgcgctaggtatttacacttccatgtgcgctttgcattttcatattgcaattagcaaagcatttacaatgtgatgccatagattctaagttatctgaaaaccaatcttaccaagaatagaattaaaaacaagatttctttgctagtaatgactggaatattcctttgttacttttaaattatattggactttttggtcatcagtctttatttaatgcatgattctgatcattctttgtgtatacacttttgaaaatgtgtaaaaatatgtatgctacattagcatctggtgttgcaaatttaatatgattatttctgtgcggtcaagctatacagtatacactgaattgctgatagggaattgtatataaatgatccaaatttcagaagttctactgcaagaatgccacattaatctatttatgtccacaaactggacactgtttttgtctttgtgccaacttatcacaaattctgattttgcttggctggaggatttctgatcttttaatttcattgcatctcttgctccaaaaacgatgtgccacatatgtagtttttagctgagatagcaatgcaatcatttcaattccccctagttcgaaaacctttttgtcataatgccatgtcagtctctcaacattatatcgttgaacaaacctaggatgtttgcttaaattgataacttgagatgagcttttgctgtacatgctatctttggcctctgtataaaatcatgatatgcaatatatacttgtccattctattgtggaaagagaaaggtgtgcgctggcgctatatgcaaatgatcataccagaaattcatggtgactgattgtctaggcattttgattggtattgaatctgaataatatgtgatagtggcaaatccatcaaatatatcaccagattaaacccacaagattatcattttttttgtgatagtggcaaatctattaaatatatcatgaactgcttctcttgaaagttgtccattcatctacctattgccaacggacgaattgctaattcttgcagttgtggggcagtaactgataagcatgatttgaattgtgttccttattttgtaatagctccttgaggagaaaatgtagaaatatttatttgggacatgcttatgttgaacatttagttattactactcaaaagcaagtttcagtttgtaaatgtgcgtacttatttataattatgcatggtattttttgcagatgaagatgcaaattctgcatcatataatagctgtaccgttaattgtcatgaagaaagctggggctcgaatgagggttgcagtctgttggacatttataatcctgatgatgctttctctttcctattggatacgccctctgagtttctgggtagttttactgcattatatgatgaagttgtaccaattgattcattggtgaatataagtggccgatgtggagtattcccacttactgagagcactacagaagccagtattggtaatgagccatgcagatctgagggggatatgctatttagtaactcagaggtgttagagtggctcaatccacatctggctgaggaggatttgcctaatctcgttgattttactgagctgaactcacatgctgtatcaaaggagcaaggggccaggaaggtcactcttgtacttgatttggacggtatgttgctggttttaaaagatttattattttttaggactctattgatgtttcccagagaataatatattgttatttttccttcctgtgcagaaacccttgttcattcgaccacagagcagtgtgatgactatgactttacctttccagtgttctttgatatgaaggagcatatggtttatgtgaggaagagaccacatctccacatgttcctccaaaaaatggctgagatgtttgaggttgttatattcacagccagccaaagtgtttatgcagatcagctgcttgacatcttggatccagagaaaaaactgttctctaggcgttatttccgggagtcatgtgtatttacaaacactagctacacgaaggatctgacagttgttggagttgaccttgctaaagttgtcataattgacaacactccgcaggtaaactgctgataacttgttctgcgctaatgcacttcgtgttctaaatgttgtcacttatgtttttaagaaggttcagtgttaaagtgtcctggacctacatctctgaatttttgaaatctcccattcatcaactatcgcatgaagtatccgatgagcacctgaatactaatttccatgtttcattcaggttttccagttgcaagtgaataatggtatacccatagagagttggtttagcgacgactctgatgaggcattacctcagctgattccgttcctggagacccttgcttctgcggatgatgtccgacccataattgccaagaagtttggcgacaaaaaggatattgctgagattttccaataaatgttagggatagctttttgt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|
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