Os01g0685500
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os01g0685500 |
|---|---|
| Description |
ATP-dependent DNA ligase family protein |
| Version |
NM_001050433.1 GI:115439236 GeneID:4324149 |
| Length |
6435 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0685500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:30017119..30023553 |
| Sequence Coding Region |
30017261..30017466,30017777..30017894,30019289..30019388,30019475..30019560,30019666..30019827 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:30017119..30023553 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:30017119..30023553 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ctcagaaagcttatttcatgttggtcaaaggttatatatacattgtttggtaatcggaaacgcccactattaagctgcaaaagcaattacacgctgcttgcttggtgtaaaaatgttttacatgcatatcaatatgaattatttgttgaatttatttacaatatcagaaaacttacggtgtttttctgcagcctattgaactgctcacttcggcaaagaagaaagtacatccacgacttgttccaggagaagccaggacattttgagttagctcagcaacttactgtagaagcagatgaagcttctgtggataattctaccactttggagagaatgaacacctttttcaaaatggcatgccagtcttcttgtgagggtattatgctgaaaatactggatgttgatgctggatattctgcttccaagcgctgtgattcatggttaaaggttaagcgtgactatgttggcttgggtgatagcctggacttggttccaattggtgcatggtatggaaatggtcggaaagctggatggtatagcccttttcttatggcgtgctacaaccctgaatacgaagagttccaaagtgtctgccgcgttatgtctggtttctcagatgagttctataaagagatgaaggagttctattctggcgacagaatactgcccaagaaacctgtttactacaaaacagacgagcttccggagttgtggttttctgcggaacaggtttgggaaatccgaggtgcagacctcacgctatcccctgttcaccatgcggctattggtctggtccatccgtcgcgtgggatctcagtgaggatgccgaggtacatacgctctcgtccagatcggagtccagaggattgtagcacggctactgatgttgctagcttgttcaaagctcagacccggaagatggaggtcagcagcgatggccaggacacaagtcactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>LRKLISCWSKVIYTLFGNRKRPLLSCKSNYTLLAWCKNVLHAYQ YELFVEFIYNIRKLTVFFCSLLNCSLRQRRKYIHDLFQEKPGHFELAQQLTVEADEAS VDNSTTLERMNTFFKMACQSSCEGIMLKILDVDAGYSASKRCDSWLKVKRDYVGLGDS LDLVPIGAWYGNGRKAGWYSPFLMACYNPEYEEFQSVCRVMSGFSDEFYKEMKEFYSG DRILPKKPVYYKTDELPELWFSAEQVWEIRGADLTLSPVHHAAIGLVHPSRGISVRMP RYIRSRPDRSPEDCSTATDVASLFKAQTRKMEVSSDGQDTSH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6088..6293#5660..5777#4166..4265#3994..4079#3727..3888#2220..2278#1879..2104#agaattactaacgggttgactcaatcactgaaattgtttaatggtagagcatttacctgtgagtacaagtatgttcattgctctctaagagattttaatcttttaacccccatggtatataaccacaccatgattgcattctgccagttttaaacctgaaatatccaccccccccacgcgcgcacacacacacaacccctagacacatgagttttccatgactccttagatggaggggaatgttaattcttgacggagtttctgccatgaagagccaatagctaggaaaaaaaatgcgccataaatttattattctgactctactctttcttaagcaaactaatggattatatttgaggaattatgacaaccgtggatcatgaaggaagaaagaatggatgagtagcttccctattctcatgctagttgttgagcttgaatttcataagaagtcgtctactcttcttagtaaaatctgaaatctatatctatgattaacataagaagttcaaaccttttcttgcatgaccccttatcaacttcttaaatatctccagtttgtaggaattttgacttagcaagcatatctttcctgccaaataattgcactctatttattaatgttgcttccaggtatgatggtcagcgagcccagattcacagatcaaatgatggatctgtgcaaatattttcaaggcaaatgaaagagtcaacctctcgatttcctgatctggttggcatgatcaaagagctgtgcagcatcgaagtatccagctttatacttgacgccgaggtaagttttgttcgtgaggaactcacatttgtttgtttcttcataatataacactccttcaccttaggcttgtgtttcttgtgcttgtgcattcaaaacaaggttgtgggaatcgataggaagaaaggaaacaaactgatgtcattccaagagctgtcttcaagagagagagggagcaagcactcctcaattgcaattcagaacataaaggtgatgccattattcttttatttacaaagtattgtgcttgttactttggaatcttgaacattattttcgggcaatatttttgcatgatgaattcctataattatagaatttcacaaggaaacataatcaaagaaatttgtactcaattgtttatgtttgtcaccaacaactttaattgaatgaacaagtccctttgcagttaccgggttttttcagtgcttattacttatcactaaaataatcagatatgtagttgacaaaatttcaacttctgtggtagatattcctacagttccacaaatacgtatattttttttgtggttcatagttcatagcatgaatcagttttcctagcatagaggatgttcatttgcactgaaatgcctgtgatgaaagttgaaagaaagtgtgtggatagacaaatagttagtggcagtacctattaggaatgcataatatgcttactaatccatcttttttttttgtaactgtgtcttttttatctgactatattttgactactttgcaggtagacatttgtgtgtttgtttttgatatcatgttctgcaatggacaaaggtaacactatggagtatttcatatacatagactacctatataatataatatcaaacttgacacttttttaaataagaaaaagacaaggaaagtacttttgcaaccacccctctctgatgggtcgatgtgagagcttattgctttactcacaaacataattttcttatggttgttagtttaatttagtttggctgtgccacgcttcaactaccaagctcgtgaccttctagttttaagtcatcagtgatttaatggtacacacaaatgagaaaaccttgtgcttagacggtaaatgactcagaaagcttatttcatgttggtcaaaggttatatatacattgtttggtaatcggaaacgcccactattaagctgcaaaagcaattacacgctgcttgcttggtgtaaaaatgttttacatgcatatcaatatgaattatttgttgaatttatttacaatatcagaaaacttacggtgtttttctgcagcctattgaactgctcacttcggcaaagaagaaagtgtatgtttcagtaccatcttaaagtacttgaaaaacatgtataaggcagggcatactttttgagtgaatcccttagaaaatgtgatagcacttctttctgcatttttcactgcagacatccacgacttgttccaggagaagccaggacattttgagttagctcagcaacttactgtaagttgtatccttttctgacttgcatttttatggatgtatttactgttctaaacattcgcttcttacttgacctaatgatatcgccttttacatcttgccataatatcatccttccttttcatttcatttccttctgttaattgaaattgcatgagattaatagctacgttgccatcttcttagcatttttccacttcgatgtgaaggtaaccggctttatgaattaaagaatcaggctataattttaaccaatcaatcaactagaatggacaacacaaaatcaaagcgcttgccttttcaagcaacgcaaatacaagatgcggaactaaccagttttaacattacctactcacaactaattcgttaacattaccactaccattcctgtgctccttcatgatagtatgatactcgaaacgttgcacctcttagtgtaaagcagcagattcatggtaactgttatgaatagcacttgtattcatcaaggcaaaatgattacaccggatattatccctatgttgtaccacacacttagcaatacgaacattccttttcatattttcttttgtttgaattttgccaggtaaatgcccagtttggtcccccgaatttccccctaggctaatttcctcccttgcgtttcaaattggcctcctagatccctcaaatttgtctatttgggccaaacatatcatttgggttgtcttgttccgcatcaaggtgcttatgtataatgattcctccctcatcataagcaaaagctggatattgccacaatgagagctgcacataatggttgaaaaaaagagactgggataaataaaatcaaggggagcgaaatagcaaatccaatttcaggatgtaagggtagaatagacatttgctcaagatgaatcagctacaagaacacataaaatcaaatttgactcaaatgtgtcaatgtgaattaccaataagtcctttggtctagcacagaaagctagaggacctagatggccctttctgagttgccaatgtgagttttggggggaacttcaaggaccaatcaatatctcaaaaaaaaaaaggaccaatcaagaattcacccatggttgccatcttttacactactatgagtaaaacaactagtcacatggcctgaaatgttggacttcagcatctccgctttgtaatggagtgcctagaaacaaaatgacataggtagcctggggtgttggggggcatgtaccaatgcaggacactgtagtgatgcttttgttatgttttcagggtaatgtctcaacatatactatatgcttctgctcagcttaaattttttagcatacttgttctagaataataacctactgcattttggttgacatcgcaaataactttggcctttatctctgtgcttgcttctttatcatatgttcatgcatggtacacatgaatcaattttacaggtagaagcagatgaagcttctgtggataattctaccactttggagagaatgaacacctttttcaaaatggcatgccagtcttcttgtgagggtattatgctgaaaatactggatgttgatgctggatattctgcttccaagcgctgtgattcatggttaaaggtgcaacctatgtattatactaaacaagtgcctgaatctgaatgtttttcattatatctgaaactataaaactatgcatcatgtattccatgtgtgttgttgcaggttaagcgtgactatgttggcttgggtgatagcctggacttggttccaattggtgcatggtatggaaatggtcggaaagctggatggtacgtttggttcctgtgcatataacctctcttttccccttaccatacttcttgccccaatgctcttctcttctctacatttacaggtatagcccttttcttatggcgtgctacaaccctgaatacgaagagttccaaagtgtctgccgcgttatgtctggtttctcagatgagttctataaagaggtatagatttggattcttggtttatcaaatcatgcaatacttttgcatagtagcatactagctttacaaattacatctttaagcacatcatgtccacacctgcttacatgcttgaatataatttttgggaagctatacaaatcgttgttcagtttcttgatattctgagtgatttgataaaatgacatgacaaattaaagaatgaaggtagttttgagaaaacaagtggaatgaaagttcttcagatattatcatattaggttaatatacaactaataatggaaattagactaacagtggagtgattgtatagctattcctataatgaaattgacttcactgagagctctctaggcggaggacgaaaaaaagatgaggtatggctcatgaattagcatgagagtcaacctagcaataatggaaaaaaatcttaattgcaccatattgtaccacacaatattaagcatgacaacaacccctcgtcacattccatcactaaaatttacctcaactaatgaagtttcagggatagccaaaggaggatagacataaataatctgcaaaacagatagtcctagcaaagatcgattaatagactatctttaaggtggataagacaaatagcaaagattgaatcagcctgttgctctgctgctgctgctggcctgccctgctacttgttggcccgccgactgccgcgccggctctggccctgatgcgccgcgctgcccaactgcagccacagcctgcagccgcccttgccgactgccgcaggtgcgcccaacggccagtggctggtggacttccgctgctcgactgctccgcctgtcgatgtgccacctcccgctcgcccatgctgtcgcctgtcgtcactcatcagctggacgccggctcgacgccgccaatcgcgcgagatggggaatcaatggagatggttagatggggaatttactagggtttaatagtcaacaagatggtgagatggggaaccaatatgggcctccaattcaacggcgagaggcccagcagcaagaacgccttcgcctgtcggccgtcgctcgctcgtctcgttgagtcatcgttctcccgagcggctacgccgcgctctgctctgccggcaggagggtagggggtactggcggatggcgcaaggtatggcgagcgccagacctcgccctaccgagtcctccgccactgtctctagcaaatgcggcttttatgtatttgtttgagatctctagtgaacatgtcacagaaaggataaattatgtgtccattgtggtttattgttttaaactcaacacagttcatatctatcatctggactttgtgttattctggaaattaatcttctgtgtatatatgccttgtgattttgtaatgttgagctacagatgaaggagttctattctggcgacagaatactgcccaagaaacctgtttactacaaaacagacgagcttccggagttgtggttttctgcggaacaggtttgggaaatccgaggtgcaggtaattacgcccctctggttaacatacatttagtagcaaattatagtgcataacccgtttgggaatgggctggaaccgtgccctgccaaataaggcattaataggatattcccgtggacagcatagataacttatgcatttgacttataataatgctatttatggattgatatttagttgtaaaatatttatgatttattctaggaacatataagcctttaaacttaaaaatgttttatctttttttgttgaaatccactgcaatgtatgggagtgtaaaatcacgatttgggtgtatcttcttttgcagacctcacgctatcccctgttcaccatgcggctattggtctggtccatccgtcgcgtgggatctcagtgaggatgccgaggtacatacgctctcgtccagatcggagtccagaggattgtagcacggctactgatgttgctagcttgttcaaagctcagacccggaagatggaggtcagcagcgatggccaggacacaagtcactaagccagagctgatccgaccccgctttacagtgtttttgtagatgtacagatgcagaatagtagcaagcaaacgcctttgttttccaccttctatactactgtgtaaataaatggcactagcttttcaacgtatttttcactag</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
