Os01g0691600
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0691600 |
|---|---|
| Description |
Similar to DNA repair helicase XPB2 (EC 3.6.1.-) (XPB homolog 2) (ERCC3 homolog 2) (RAD25 homolog 2) (AtXPB2) |
| Version |
NM_001050471.1 GI:115439312 GeneID:4325640 |
| Length |
8162 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0691600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:30301430..30309591 |
| Sequence Coding Region |
30301539..30301554,30301661..30301771,30301899..30302067,30303429..30303651,30303736..30303792 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:30301430..30309591 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MAGGDGDRARAPKRHKSSAPSRSIDETAELDYTDDVDDDVRDAD REVKKRDFTKLELKPDHANRPLWACADGRIFLETFSPLYKQAYDFLIAIAEPVCRPES MHEYNLTPHSLYAAVSVGLETSTIISVMSKLSKTKLPREIIDFIHASTANYGKVKLVL KKNRYFVESPFPEVLKTLLKDDIICRARISPEDSVGAPSFTISKTAGEMASGHEDLLD GMELAAATEDKETHSFEIDPSQVENVKQRCLPNALNFPMLEEYDFRNDTVNPDLEMEL KPQARPRPYQEKSLSKMFGNGRARSGIIVLPCGAGKSLVGVSAACRIKKSCLCLATNA VSVDQWAFQFKLWSTIKDEHISRFTSDNKEKFRGMAGVVVTTYNMVAFGGKRSEDSEK IIEEIRNREWGLLLMDEVHVVPAHMFRKVISITKSHCKLGLTATLVREDERITDLNFL IGPKLYEANWLDLVKGGFIANVQCAEVWCPMTKEFFAEYLKKENSKKKQVLYAMNPNK FRACEFLIRFHEQQRGDKIIVFADNLFALTSYAMKLRKPMIYGSTSHVERTRILHQFK NSSDVNTIFLSKVQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>110..125#232..342#470..638#2000..2222#2307..2363#2877..3020#3098..3178#4185..4272#4738..5075#5170..5245#5333..5526#6005..6168#6239..6320#ggcgacgagaagacgaaactgccccgtgcgccgccaacatctcccctctccggctaccgccgccaccgcgccgccgcgctcctcgctcctcgctccagggcttccggccatggccggcggcgacggtgaggaagcaaaccctaagcggcaccatccccggcaccggcgcccccccgttctgtcctatataccgcatctcccttacaccgttcccccctctcccctctgcaggcgatcgcgcccgcgcgccgaagcggcacaagtcctcggcgccgtcgaggtcgattgacgagaccgccgaactggactacaccgatgacgtcgatgacgacgtccgcgatggtaacaccgcgcgctcgaatccgccctaaactcaccgcccctcccccaatgtatgagggtttgcacggaacattgaactgattggggatttttgttttgtgggggttggaactttgattcggtgcagccgatagggaggtgaagaagagggacttcaccaagctagagctgaagccggatcacgcgaacaggccgctctgggcctgcgccgatggccgcatcttcctggagacgttttcgcccctatacaaacaagcctacgatttcttgatcgctattgcggagcctgtttgcaggtcaacttcagtcacctctagcctcaacattaaccttagtaccttaattgcatagtaggtttggactttcctgagactgaaattgcatccaccaagtggagtttagtccaaatctcaatatcttatacacttagaagccactaagttattgttaattctctcttatcttgtgaagtcacatcatctcaactgtttttagtttttttttcctttttgtggtttatcaaaggttcagattgtgctcaagcacaaagcaaaacctcctagctacaaaacaaaccacctcacatttcatgtttagcattttggtatgcaaatttcctgcagcattcatggggttccatctatgtggttgatttcccccaaaattagcatggtttcagcattcatgttggaataggcttgtttttgtcatgcagtgaaacagaagttgaatttagtgatattatcttcattgagagctgtggggatcatatcatattctgagggtttcactactttatcttttagggactttggtactgccatgtgattactcaatttgattttctgtgaaccacttggatataatttgtttagaataggttaatttgtttggaatttgaggggaaaaccaatggtttgtaatggaactaaccatgtattacttgaaaatggtgagcacagctatgtgataggcatatcattgtgccattagattgtttgaatagatttaatatgccccatgtggctatctagaacctagaaagtatactgacatatataagttgcaaccaagttgatgaccccagcatgacttcaagagagcataaccattccgttgttactgtcaaagtaaattctagccttctaggattctttagtttgagtgatgggatggtgggttaaggagattattagtcctttttttcttaagttaagatgggactgagtttgacctgaagtctttctgcaaaacaaaatgatgcctatactccgatggacgagatgatcaaattggtcgtcttttttatttgaacttcttttgaaatactacctccgttttttaatagatgacgccgttgactttttctcacatgtttgaccattcgtcttattcaaaaaatttacgtaattataatttattttgttatgagttgttttatcactcatagtactttaagtgtgatttatatctcatacatttgcataaattttttgaataagacgaatggtcaaacatgtgagaaaaagtcaacggcgtcatctattaaaaaatggagggagtatatgtgcatggttgagtgcctgaaatgtattactttgtcaaagggtttctgattttccgttaaactatttgattttgacctttggtggtgcaggccagaatccatgcacgagtacaatctaacaccccactcactatatgctgcggtctcagttgggcttgagactagcactataatcagtgtcatgagcaagctctccaagactaaactgcctcgtgaaataattgattttatccatgcatcaactgccaattatggtaaagtgaagcttgttctgaagaagaatcgatattttgtggagtctccattccctgaggtcataccatacttccgtgattaaaaaatattcttttttgtctattattttctatttatgtgagctgcgatatctcatctccaggttttgaagacgcttctgaaagatgatatcatttgcagagcacggatatctcctgaggttattcatctgttttgtgcacttgaatagaattcttatggcaatatactagtagcaaagtcgtgccttcctacccattatcttatgcgagctctagtctgtctggtgttactacattgtctgcgtgaaaccatcgtgtaacttctatcaatgcaagctgatttctatgttgttatctaaggccctgtttgattcagcttaggattattataatctggattattaggagtaagctgaaacaaacaagtagattattatgatagattattataatctgtaagccatattactataatctaataatctcctctggaggagctttttccagattattgggtggctaaagacccactaccctcagatgccttcaataatctagagaaacaaacaactcgcagcttattttatgttagcttattataatctagcttagagtaatccaatttaataatctagattacaataattttaagctgaaacaaacagggcctaagtccattctaatttatccaggattccgttggggcaccttcatttactattagcaaaacagctggtgaaatggctagtggccatgaggacttattagatggaatggaactggctgctgcaactgaagacaaggaaacacattcttttgaaattgatccttctcaggtcatgcatttacttcaattagaatctcacgaaaaattttcggtgatggagactgatgtttaattcatgtcatgcaggttgagaatgtgaagcagcgttgcttgccaaatgcactgaacttccccatgctggaggagtacgattttagaaacgacacagtaagttctttgcatatcaagagacatgcataatttttagtccgtataatcatattgtccatgcaattggtctgtattgaaccagagaaaaccacaatgggggctgacccaactttgcctcgtcaaaattttaaaaaacaatttttacctttgcacccatggaatttctcccaccaccacttctgctatacaagatattgtacataccaattcaatgggggctagttctttttttgctacaccaaacataaatgctataagcaaaacaaaaacttctaagcaatagaagtgtttatttactgtattgttatctctagacattgcacagcgatgtattaatagagaagatccaacttcatatatatggataatgaaaagtaagcttttagattgcagaatcacagatgttcaggcttagtttggtggtgctgaaaacaactaacacatgttttctgatgtatatagtgcagctaaacatattattctaaaagaagggtagtccaatattgaaatcaaagaatgattcgaaatctggagcatcggaacacatctttaggagcccagcagaatgagcatatatacctcagaaatgaattccatgtcaaaatcaattaatatttttggtacattacatgacagctctcattagtgtatactgtaaaaaaactctcattagtgtgcaaagcctttttttttaattaaatccatatataagagtaagagaaaaaacagttcattaagctttgcttagagcattttctgttttttagcatttcgtttttggtaaaacttgtatatccaacacagcacaactagatacgacatcgttgaccctatttccacttgaaaactgtggtattcttaagaatcaaaatatatttacttcttatgttagtaggaaccttacagtattaccattttgtggttatgcagctgtttaggggcatgaccatgtacatatatttgctatattattcagaattaaaatctgatgtcttaattgtaggtgaatccagatttggagatggaattaaagccccaggcacgcccaaggccatatcaagaaaagagcctcagcaagatgtttgggaatggtaactttattatgcaatttgcacatgaatattgaatttgtaaatttgaacaactggtaaataactgcaaaccgatatgaagtttgggaacgttaattttcaaatgactttgagtctttaagtatgctgtttccttgccggttttacctaatcacgtactgattcacatccagatctaatgacagaacaaacgcgtagtgttacagtaataagaaaattagaatatcctagtaaaaatgttgtcagtattgtttgaagtgtaggaactaaagggatgtggtggggaactgtgtttaccaagagtgaaaactaaaattgctagtggcagtcctcttgcttgtgtcgttaattagcaatttattcccttcatttgctatttttcacttcaaattttcattaacttacaaggacttaacagattatatgcttctttcctcattgaatattttttttatgattttacaggcagagcaaggtcaggcattattgtgttaccttgtggtgctggcaagtccttggttggtgtatctgctgcatgtcgtatcaagaagagttgtctatgtttggccacaaatgc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