Os01g0909200

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Structured Information

Gene Name	Os01g0909200
Description	DEAD/DEAH box helicase, N-terminal domain containing protein
Version	NM_001051683.1 GI:115441736 GeneID:4324864
Length	10546 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os01g0909200, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 1
Location	Chromosome 1:41351529..41362074
Sequence Coding Region	41351933..41352152,41352244..41352355,41352487..41352670,41352765..41353091,41353368..41353649 ,41353736..41354209,41354318..41354527,41354612..41354835,41355091..41355188 ,41355267..41355757,41355837..41356108,41356854..41357110,41357260..41357478 ,41357595..41357755,41357837..41358029,41358116..41358221,41358535..41358709 ,41358992..41359144,41359251..41359382,41359708..41359771,41360099..41360169 ,41360273..41360406,41360985..41361099,41361175..41361355,41361452..41361552
Expression	GEO Profiles:Os01g0909200
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008394:41351529..41362074 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008394:41351529..41362074 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgaaccctttaaagaggtcattggaatcatcttctcaggaacatgaagcaggcaaacagaaactgcagaagagagagtgtcaagatttcactcccagaagatatcagcttgatgtctatgaggttgcaatgcggagaaacacgattgcgatgcttgacacaggagccgggaagacaatgattgctgtgatgcttatcaaggagttcggaaagataaacagaacaaagaatgctggaaaagtcatcatatttcttgcaccaacagttcaacttgttacacagcaatgcgaggtgattgaaatccacacagattttgaggtagaacaatactatggtgcaaagggggttgatcaatggacaggtcctagatggcaagagcaaatctcaaaataccaggtcatggtcatgacaccacaggtgttcctacaagctttacgcaatgctttcttaatcttggacatggttagtctcatgatatttgatgaatgccatcatgcaactggaaaccacccttatacaagaataatgaaggagttctatcacaaatcagaacataagccaagtgtgtttggtatgacagcatcacctgttataagaaaaggtatctcttctcatttggattgtgaaggtcagttctgtgaattggagaacctgttagatgctaagatctacacagtttcagatagagaagagatagagttttgtgttccttctgcaaaagaaatgtgcaggtactatgactcgaaaccagtttgttttgaagatttgagtgaagaattgggagttttatgttccaagtatgatgcattgataacagagttgcagaataagcgaagcgacatgtataaagatgctgatgatataacaaaagaatcaaagagacgcctttctaaatctatagcaaaaatttgctactgccttgatgatgttggtcttatttgtgcaagtgaggccacaaaaatctgcattgaaaggggccaggagaaaggttggctgaaggaagtagttgatgccacagatcagcaaactgatgcaaatggatcacgcctatttgcagaaaattcagcgcttcatatgaagttctttgaggaagccttgcatttaattgacaaacgcctccaacaaggtatcgacatgcttctaaactcagaaagtggatgtgttgaagcagcaaagacgggctatatttccccaaagctctatgaactcatccagatctttcactcttttagtaactctcgtcatgctcgatgcctcatttttgttgatcgaaagatcactgctagagtcattgaccggatgattaagaaaattggccaccttgcacatttcacagtttcttttcttactggagggagatcttcggtggatgctctgacacccaaaatgcagaaggatacattggattcatttcgctctggaaaggtgaacttactatttactacagatgttgctgaagagggtatccatgtcccagaatgctcttgtgtaatacgatttgatttgccaaggacaacacgtagctatgtgcagtcacgtggacgagcacgccaggaagactctcagtacattctcatgattgaacgggggaacgtgaagcaaaatgatttgatatctgcaattgtgagaagtgagacttcaatggttaagattgcttcaagcagagagtctggaaatctgtcgcctggttttgttcccaatgaagaaataaacgaataccatgtaggcacaacaggagcgaaagtaactgctgattcaagcatcagtattgtctaccgatactgtgagaagcttccgcaggataagtgctactccccaaaacctacatttgagttcactcatcatgatgatggatatgtgtgtacattagcattaccaccaagtgctgtgcttcaaattctggtgggcccaaaagcaagaaacatgcacaaagcaaaacagctcgtttgccttgatgcatgtaagaagttgcatgagctaggagcacttgatgaccacctttgtctatctgttgaagatccagttccagaaattgtaagcaaaaataagggtactggtataggtacaaccaaacggaaggagctacatggtacaacaagaattcatgcttggtctggcaattgggtgtcaaagaaaactgcactcaagcttcaaagctacaaaatgaattttgtttgtgaccaagctggtcagatttactctgaatttgttctgttaattgatgcaactttaccggatgaagtcgctactttggagattgacctatatttgcacgacaagatggtcaaaacttcagtttcttcttgtggacttcttgagttggatgctcaacagatggaacaagcaaagttgtttcaagggcttctcttcaatggtttgtttggaaagctgtttactagatcaaaagtacctaatgctccgagggaattcattcttaataaagaggatacatttgtgtggaacactgcgagtgtatatttgcttttaccaacaaatccttcttttgactccaacgtttgtattaattggagtgtcattgatgcggcagctacggcagttaaacttatgagaaggatttattctgagaataaaagagaattacttggaatatttgattctgaccaaaatgttggagatttaattcatttagctaacaagtcgtgtaaggctaacagcctcaaagatatggtagttctagcagttcacactgggaagatatatactgctcttgatattactgaattatctggcgatagcgcttttgatggtgcatctgataagaaagaatgtaaattccggacattcgcagaatatttcaaaaagaagtatggcatagtacttcgccacccctcacagccactactagttttgaagcctagtcataatcctcacaaccttctttcctcgaagttcagggatgaaggtaatgttgtggagaatatgagtaatggcacaccagttgtaaataaaacaagcaaccgtgtccacatgcctcctgagttgctgattccccttgatttacctgtggaaattttgagatcattctatttgtttccggctttgatgtatcggattgagtcattaacgttagctagtcaactaagaagtgaaattggatacagcgattctaatatatcaagtttcctgattctggaagctattacaacgcttaggtgctctgaggatttctctatggagcgtctagaattattgggagactctgtattgaagtatgcagtgagttgtcatcttttcctgaaatttcctaataaggatgaggggcagctatcatccataaggtgccatatgatttgtaatgccacactttataagcttggaattgaacgcaatgtacagggttacgtacgtgatgctgcatttgatcctcgtcgatggctagcaccaggacagctctctattcgtccatctccttgtgaatgccctgtaaaatctgaggttgtaactgacgatattcatatcattgatgacaaggctattgttctaggcaaggcgtgtgacaagggacacagatggatgtgttccaaaaccattgctgattgtgttgaggctattattggggcatattatgcagggggtggtttaagagcagccatggcagttctcaaatggttgggcatcggggctgaaattgaagaagacttgattgtgcaggccatattgagtgcttctgtgcagacttatcttccaaaagacaatgtatttgaaatgcttgaagcaaaactaggctattctttctcggtgaaaggtcttttggtagaggctctgactcacccatcacagcaggagttaggtgcaaaatactgctacgagcgcctagagttcctcggtgatgcggtcttagacattctgttaacaagatatcttttcaatagtcataaagacactaatgagggggagttgacagacttacgttctgcatcagtcaataatgaaaactttgcacaagttgcagtaaagcacaacttccatcactttctccagcattcttctgggcttctgttagaccaaattactgaatatgtgaataggttggaaggttcatccatggacaaagttgaactgttatcagatggactcccaaaagggcctaaagtccttggtgatattgtagaaagtattgcaggtgcaattcttttagacaccaaacttgatttggatgtagtctggggtatttttgaaccccttctttccccaattgtcacacctgagaatctggagttacctccatacagagagcttatcgaatggtgtggcaaacatgggtattttgtaggaattaactgtagagatcaaggagacacagtagtggctactcttgatgtacagctcaaagaggtgcttcttgtgaggcaaggttttagcaagaaaagaaaagatgcgaaagcgcatgcatcttccttactgctcaaagatctcgaggaaaaaggactaataatcccaaagaatgcaagcaagacagaacaatttgaaaagcattgtggcagcactaatcccttcaacaatttgcatgtcgatgcaatggatacacagactccaaaaccaaccaaggaaaaaaacgcagctgattcaaggaacatttctgatcccctgcttggtaaaccattgcacgtgattgtgaaaacgagtaaaggaggaccacgcattgcattatatgagttgtgtaaaaagttgcaatggccaatgcctacaatggaatctgagaaagtacaaccaagctttagcagcgtgtgctcctcccctggtggttcctctcagaaagctaccccccaagcgttcgctttcgcttcaaccattacattgcatataccaaatgctgatgtgatcagcctcacaggagatggccgtgcagataagaagagctcacaggattctgctgccctgttcttgctctatgagcttcagcggcgaggtactttgcaactccaggaggtgtga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MNPLKRSLESSSQEHEAGKQKLQKRECQDFTPRRYQLDVYEVAM RRNTIAMLDTGAGKTMIAVMLIKEFGKINRTKNAGKVIIFLAPTVQLVTQQCEVIEIH TDFEVEQYYGAKGVDQWTGPRWQEQISKYQVMVMTPQVFLQALRNAFLILDMVSLMIF DECHHATGNHPYTRIMKEFYHKSEHKPSVFGMTASPVIRKGISSHLDCEGQFCELENL LDAKIYTVSDREEIEFCVPSAKEMCRYYDSKPVCFEDLSEELGVLCSKYDALITELQN KRSDMYKDADDITKESKRRLSKSIAKICYCLDDVGLICASEATKICIERGQEKGWLKE VVDATDQQTDANGSRLFAENSALHMKFFEEALHLIDKRLQQGIDMLLNSESGCVEAAK TGYISPKLYELIQIFHSFSNSRHARCLIFVDRKITARVIDRMIKKIGHLAHFTVSFLT GGRSSVDALTPKMQKDTLDSFRSGKVNLLFTTDVAEEGIHVPECSCVIRFDLPRTTRS YVQSRGRARQEDSQYILMIERGNVKQNDLISAIVRSETSMVKIASSRESGNLSPGFVP NEEINEYHVGTTGAKVTADSSISIVYRYCEKLPQDKCYSPKPTFEFTHHDDGYVCTLA LPPSAVLQILVGPKARNMHKAKQLVCLDACKKLHELGALDDHLCLSVEDPVPEIVSKN KGTGIGTTKRKELHGTTRIHAWSGNWVSKKTALKLQSYKMNFVCDQAGQIYSEFVLLI DATLPDEVATLEIDLYLHDKMVKTSVSSCGLLELDAQQMEQAKLFQGLLFNGLFGKLF TRSKVPNAPREFILNKEDTFVWNTASVYLLLPTNPSFDSNVCINWSVIDAAATAVKLM RRIYSENKRELLGIFDSDQNVGDLIHLANKSCKANSLKDMVVLAVHTGKIYTALDITE LSGDSAFDGASDKKECKFRTFAEYFKKKYGIVLRHPSQPLLVLKPSHNPHNLLSSKFR DEGNVVENMSNGTPVVNKTSNRVHMPPELLIPLDLPVEILRSFYLFPALMYRIESLTL ASQLRSEIGYSDSNISSFLILEAITTLRCSEDFSMERLELLGDSVLKYAVSCHLFLKF PNKDEGQLSSIRCHMICNATLYKLGIERNVQGYVRDAAFDPRRWLAPGQLSIRPSPCE CPVKSEVVTDDIHIIDDKAIVLGKACDKGHRWMCSKTIADCVEAIIGAYYAGGGLRAA MAVLKWLGIGAEIEEDLIVQAILSASVQTYLPKDNVFEMLEAKLGYSFSVKGLLVEAL THPSQQELGAKYCYERLEFLGDAVLDILLTRYLFNSHKDTNEGELTDLRSASVNNENF AQVAVKHNFHHFLQHSSGLLLDQITEYVNRLEGSSMDKVELLSDGLPKGPKVLGDIVE SIAGAILLDTKLDLDVVWGIFEPLLSPIVTPENLELPPYRELIEWCGKHGYFVGINCR DQGDTVVATLDVQLKEVLLVRQGFSKKRKDAKAHASSLLLKDLEEKGLIIPKNASKTE QFEKHCGSTNPFNNLHVDAMDTQTPKPTKEKNAADSRNISDPLLGKPLHVIVKTSKGG PRIALYELCKKLQWPMPTMESEKVQPSFSSVCSSPGGSSQKATPQAFAFASTITLHIP NADVISLTGDGRADKKSSQDSAALFLLYELQRRGTLQLQEV</aaseq>
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