Os01g0913400
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os01g0913400 |
|---|---|
| Description |
Protein prenyltransferase domain containing protein |
| Version |
NM_001051706.1 GI:115441782 GeneID:4324323 |
| Length |
3935 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0913400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:41571468..41575402 |
| Sequence Coding Region |
41572973..41574855,41574961..41575029,41575154..41575340 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:41571468..41575402 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:41571468..41575402 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggctcgtgcgctgctctcccgcctccgcttcgctcctctcagccaccaccaccaccgccacctcggccgcgctctctccgccgccgccaccgccgatccaccacccgacgagtcgccccctcctcctccgcatcctccaccgccaccgacgccgccctccaactcgaagctcttcgtcgccgggttgtcgtggtccgcggacgagcggtcgctgacggacgccttctcctccttcggcaccgtcaccgaagatggtgtgcgcggtaggtgttcgatgaaacggctcggaggaggaagtgggtgttccgctcgcgcgcgacctcgccaaatgttcgatgaaatgcctgttagggatttggtcgcatgctcggctgcaatctaccggcatgcgaagagcgggttgtttggcgaggctgtcaggctgtttgttggtatgatgagggtgggggtgagccccaactcgttcacattggttggtgctttaatagcagctgctgggatgggcaacttggtgcttgctgagtgcatccatgggtgggctatgaagagcctgttggaatccaatccttttgttcggaccgcattgcttgattcctatgcgaaatgtggacgtcctacgaaggcctgggcattgtttggtgaaatgagggatcctggtatagttacttggaatgcattgatttctggtctagtgcacaacgatctgtttgaggaagcattgctggttttcaagaggttgctgttttcatttggaccagttcataatgttgtgactatgattagcattgctcaggcttctgctggttgtggtgaccttggattgtgtgagagtgcacatgcttattcagtcaagattgggcttgattcagatgtctcagtgacaaactcaatcttgggtatgtacttgagctttggtagtcttgcgattggaagagagattttcaaaaagatcgctgttaatgatgttgtttcttggacgatgatgatgggtttccttcttgaggaagcccaggctattgaagttatacatatgtttgttcagatgaggttgagtggcatagtgcctgatagggtagcattggttacagtggcgcaagcttgtgcacatctgggtgatggaaggataggaaagttggttcataacgagattgtaatctgtgggttcagtggtgagcttcctgcagttaactcgttaatcacaatgtattctaaatgtgaggatttaagttctgcaagactgttgtttgatggtacaatggagaaaagcttggtttcatggacggcaatggtgtcagcgtatatagaaaatggatatgccctagaagggatgtatctctttgcgaagatgaggcatgaaggttcctttatgattgattctgtgacactggtcaccttattgcttgcttgctatgaggttgctaagtttgaactatgtattcaacttcatgcatattgttacaaatcgggtttgtgtctgtacaaacctgttcttaataccctcattgcagtttatggtaagtgtggatatgcgactttagcgcataaagtgtttgatgagatgatttctcggaatgctgtctcatggaatactatgattttatcctatggtgtaaatggccaaggagagaaagcagtatcacttttcaatgaaatggagaaatctagcgaggatcaagacagtgtgacttatttgaacacattgctagcatgtagccactctggactggtggatgatgggatgctcgtctttagaagaatggttaatgacaagggaataattccatgcccagagcatgtcggatgcatagttgatatgttggcaagagctggccgcttggaggaagcagcaggagtggctagcttgactcacaataaattaggagcaaatgcttggaaggctttgatgggaggagggcatttgcatggtgacatgaaatttactaaagttgctgcaaagaaggtgctcaccacggaatcatttgattatgggcatgttgtgttactttctaatgcttatgcatcatctggcaaatatagagctgctgaatctgtcagatcctgttatgcaaagcgaattacaaggaaaactttagggcttagttccattgagatagtgccgtacagcagaagatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAARALLSRLRFAPLSHHHHRHLGRALSAAATADPPPDESPPPP PHPPPPPTPPSNSKLFVAGLSWSADERSLTDAFSSFGTVTEDGVRGRCSMKRLGGGSG CSARARPRQMFDEMPVRDLVACSAAIYRHAKSGLFGEAVRLFVGMMRVGVSPNSFTLV GALIAAAGMGNLVLAECIHGWAMKSLLESNPFVRTALLDSYAKCGRPTKAWALFGEMR DPGIVTWNALISGLVHNDLFEEALLVFKRLLFSFGPVHNVVTMISIAQASAGCGDLGL CESAHAYSVKIGLDSDVSVTNSILGMYLSFGSLAIGREIFKKIAVNDVVSWTMMMGFL LEEAQAIEVIHMFVQMRLSGIVPDRVALVTVAQACAHLGDGRIGKLVHNEIVICGFSG ELPAVNSLITMYSKCEDLSSARLLFDGTMEKSLVSWTAMVSAYIENGYALEGMYLFAK MRHEGSFMIDSVTLVTLLLACYEVAKFELCIQLHAYCYKSGLCLYKPVLNTLIAVYGK CGYATLAHKVFDEMISRNAVSWNTMILSYGVNGQGEKAVSLFNEMEKSSEDQDSVTYL NTLLACSHSGLVDDGMLVFRRMVNDKGIIPCPEHVGCIVDMLARAGRLEEAAGVASLT HNKLGANAWKALMGGGHLHGDMKFTKVAAKKVLTTESFDYGHVVLLSNAYASSGKYRA AESVRSCYAKRITRKTLGLSSIEIVPYSRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>548..2430#374..442#63..249#atcgcggcgccgccgtgctcgcgattaacccagccgtcgcagctgcagtctccgccgccgccatggcggctcgtgcgctgctctcccgcctccgcttcgctcctctcagccaccaccaccaccgccacctcggccgcgctctctccgccgccgccaccgccgatccaccacccgacgagtcgccccctcctcctccgcatcctccaccgccaccgacgccgccctccaactcgaagctcttcgtcgccggtaaagcctctgctctcccgcctccgtttccttccccgcaatccaatccccactctgttccatggttctcaccttgttgctttgctacgctttctctctcgcgcgattgcgcgcgcgggcgtagggttgtcgtggtccgcggacgagcggtcgctgacggacgccttctcctccttcggcaccgtcaccgaaggtaatccccgaatcgcgaccttttgtcacttgaaacagtttcgtttcagggtctagagaataacctattgagtggttgtcggtgggggactgggggagggttcagatggtgtgcgcggtaggtgttcgatgaaacggctcggaggaggaagtgggtgttccgctcgcgcgcgacctcgccaaatgttcgatgaaatgcctgttagggatttggtcgcatgctcggctgcaatctaccggcatgcgaagagcgggttgtttggcgaggctgtcaggctgtttgttggtatgatgagggtgggggtgagccccaactcgttcacattggttggtgctttaatagcagctgctgggatgggcaacttggtgcttgctgagtgcatccatgggtgggctatgaagagcctgttggaatccaatccttttgttcggaccgcattgcttgattcctatgcgaaatgtggacgtcctacgaaggcctgggcattgtttggtgaaatgagggatcctggtatagttacttggaatgcattgatttctggtctagtgcacaacgatctgtttgaggaagcattgctggttttcaagaggttgctgttttcatttggaccagttcataatgttgtgactatgattagcattgctcaggcttctgctggttgtggtgaccttggattgtgtgagagtgcacatgcttattcagtcaagattgggcttgattcagatgtctcagtgacaaactcaatcttgggtatgtacttgagctttggtagtcttgcgattggaagagagattttcaaaaagatcgctgttaatgatgttgtttcttggacgatgatgatgggtttccttcttgaggaagcccaggctattgaagttatacatatgtttgttcagatgaggttgagtggcatagtgcctgatagggtagcattggttacagtggcgcaagcttgtgcacatctgggtgatggaaggataggaaagttggttcataacgagattgtaatctgtgggttcagtggtgagcttcctgcagttaactcgttaatcacaatgtattctaaatgtgaggatttaagttctgcaagactgttgtttgatggtacaatggagaaaagcttggtttcatggacggcaatggtgtcagcgtatatagaaaatggatatgccctagaagggatgtatctctttgcgaagatgaggcatgaaggttcctttatgattgattctgtgacactggtcaccttattgcttgcttgctatgaggttgctaagtttgaactatgtattcaacttcatgcatattgttacaaatcgggtttgtgtctgtacaaacctgttcttaataccctcattgcagtttatggtaagtgtggatatgcgactttagcgcataaagtgtttgatgagatgatttctcggaatgctgtctcatggaatactatgattttatcctatggtgtaaatggccaaggagagaaagcagtatcacttttcaatgaaatggagaaatctagcgaggatcaagacagtgtgacttatttgaacacattgctagcatgtagccactctggactggtggatgatgggatgctcgtctttagaagaatggttaatgacaagggaataattccatgcccagagcatgtcggatgcatagttgatatgttggcaagagctggccgcttggaggaagcagcaggagtggctagcttgactcacaataaattaggagcaaatgcttggaaggctttgatgggaggagggcatttgcatggtgacatgaaatttactaaagttgctgcaaagaaggtgctcaccacggaatcatttgattatgggcatgttgtgttactttctaatgcttatgcatcatctggcaaatatagagctgctgaatctgtcagatcctgttatgcaaagcgaattacaaggaaaactttagggcttagttccattgagatagtgccgtacagcagaagatagtagaacaactcttacctagggaagagagaagatacatcaaacaattagtattcactgtctgtctgtctcaagctattggaatctatctcaggcataagttgagtattcactttcaggttgccaagtctcctgtggaaaaagtaaagcatcaagcatgattttcaaatgcaagttgatgaaatagatgattgccttggacctttttctttaaaagaaaaatatgccttggtctatggaacatgaccaacgatatcacatctcaactcactattgctccaggaatctctaacacgtgaatatggattctaatggtactgacacactaaggtctaaggcagcttgtttagtgcatactcatttttcattacttcctttttttcatttgtctttttttttcctttttaaaagttgccttggagtttttacggtgatcctccatctgaccttatgccctcatctggattgtgcatgttgactttcctacatgctaggacaacaacatactattgatagtaaaaagaattggtgatagagcctgtaaataccagctgtggcagtttttttttttaaaaaaaaatgagcagtatattggggctgctgggtgtgcacctctacatatgtgcaagtgttgctttgcacttccatttcatttggcagcctggcagtccctattaatcagccactttaaaatttatcttggatgtttgttcaaggatctagtagcgttgtcccacttttctgccttaaaggtgttaacgtttcatgctcccaccaacagatatagttcacaaatgttgacactcgatagataatcatagaggaaagctatatttgtttcatgacatatatatctaccaagtactaacacttctcttcaatcaatgaacatttgtctgctctgtaagtctaaattatcccacatatttgtatagatgctgccattcatgtcttttcatgcgtatgccccagtgtcaatggctattgcttctgtttgaagcaggttcatatgtggcgtgattatttatcacctatcatatagttttattctgaaagatgacatctcaatatgcatatgccatggaattatctggtggaggcatattggtgtttgcctggtataagatgtgtgtggcaacatgtgttttgctattgtttattctatttaccccacaaattgcaatgcttaatcccttccttacatattcattacgctggtattagtgaacagaattatatgaagactatttgatgatgcagtgagaataatgtatgacaaaaactctggaaggtcaagaggttttgggtttgtgcacttctcaaacgagtatgaagctaagtgcgccaaggatgctatggatggaaaggtactgtttgatgaagagaaatgtctaacagattgtaatattaactgtttcagtgaaaaataaacaggaaaataaacatggtctttctttttattctacaggtaatgctaggacgaccattgcggataagttttgctcttg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
