Os02g0183700

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Structured Information

Gene Name	Os02g0183700
Description	Zinc finger, CCHC-type domain containing protein
Version	NM_001185903.1 GI:297720938 GeneID:9272464
Length	10767 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os02g0183700, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 2
Location	Chromosome 2:4658133..4668899
Sequence Coding Region	4658133..4658150,4658269..4658301,4658436..4658462,4658808..4658873,4658954..4659076 ,4659562..4659629,4659703..4659766,4659994..4660135,4660218..4660306 ,4660574..4660637,4660870..4661021,4661124..4661261,4661742..4661867 ,4661971..4662183,4662343..4662426,4662583..4662742,4662993..4663126 ,4664047..4664136,4664313..4664471,4665528..4665611,4666170..4666289 ,4667730..4668586,4668668..4668899
Expression	GEO Profiles:Os02g0183700
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008395:4658133..4668899 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008395:4658133..4668899 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggcagccttcagatgtgttccgccatgcctcgggagcaatatccttgatccgggtaggggttttctttcggacaagtgcttcaactgccgcgaggttggtcatcgggtagcaacgtgtccggttgttcctccccgcccgcagcgtgctcgaccggttgccaccgggaatccaccacgctccttgtcaaagctgcgagggaagtgcttcaattgtctggcagctgatcaccgccacttctcctcagcttcacagagggctgtccctgttgcctactcttcacagagtgcagggggataccagtcgatgttgatcacgttcaatgccgacgcgatttctacagctttgatttctcaagctattagcgagaagctttgtatcccacctgccgagttccgggtggagattcttccaaagatgacaaatgacaatgttggtgccgagtcccgggtggaggttcttccaaagatgacaaatgacaatgttggtgtccccaataaggtggttttggggtgccatttgccagatggtcaggaagtgccctcttctccacccgagggagatttggagaagcttacagcagcgccccttccttcagttgtatcgcccctttctccgagcgcacctaacacagccgtcgcattgactgtttcaacatcccatgggagtgttccttcatctctcaatgaaggacatggggtatctagcaagatagctgcaccaaaggaagagcatgttactccaactatggaccctccatctaggtgtgagcatcttcctcttgaggttgcaccaagcaacctggtgacagataaagcagagctacttgagatcacaaaagctccagcggtgaagaataggttggccaaaagagtgcggcaaaagattatcactgccacctctcgaagaagtgtccctctaccttcaaacatgaagaaaaggcgactcctcattgaccaaatgaaaacatatgtactcatgaagaagctaggcattatcacaaaggatgaggaggtggatgaagacactatggataggtgcattgcgttcctaaaagaggcatacccgggacactatgttcagcttgctggtaccgatcttgttgttgctgttgatgatgatggtttcttcaaagacaagatctccgaatttaatggtctacttgtcacagacaaagaaaccaacaaatatgtaatcaatgctgtaaagtgtaggttcatcagagttgaaaggattagagatcagttgctggaatgtaataaggagacatactgggtgcctgattacgttaaggaaaagagattccataactggcttgaaggggctagagactgggctgttagccgaactagattctggggcactcctcttcctctatggatcagtcaagacggagaagaaataattgttatggactctgttgataaactcgaaaagttgtctggtgtcaagattagtgatcttcaccgacaccatatagatggcatcacagttccctctcagagaggggaagagtttggggcgttgaaacgcgttgatgaggtttttgattgctggtttgagagtggatccatgccatatgcctacattcattacccatttgagaatcgcgaactgtttgaaaagaattttcccggagatttcatagccgaagggttggaccaaactcgtggatggttctatactctcatggtcctgtccacagctttgtttgggaaacctgcatttaaaaatcttatatgcaacggtctggtcttggctgaggatggcaagaaaatgagcaaaagtaaaaataattacccttcacccatggaagtcattgataattatggagcggatgccctgaggctatatgtaataaattctcctgtcgtccgtgcggagtccctacgattcaacaaaaatggtgtccatggtgtggtgaaagatgtcttcctcccatggtataatgcttatagatttcttgttcaaaatgctaagaggcttgaagttgagggtcttgctgtattttcaccaatcaatcaagctattcttctgaggtcatctaatgtgctagatcactggatacagtccgctactgaaagtctagttagttttgttcgacaggagatggatgcatataggctttacacggttgtcccttatttagtaaagtacattgacaaccttaccaacatatatgtgcgtttcaatcgcaagcgtctgaaaggtcgtactggagaagatgactgcaggatttctctttcaacactttaccatgcgcttgtaacaacttgtgttgtgatggctccgtttactcccttcttcactgaagttctgtaccagaacttaagaaaggtgtccagcaaatcagaaaagagcattcatttctgcaatttcccttcctcaactgggcagatagatgagcgtgttgagcacagtgtcaacaggatgatgaccatcgttgatcttgctcgaaatattcgggagcggcataacagacctttgaaaacaccattaaggcatgctcattatacaactatactatttacacaatttcttgttttatgggagatggtagttgtgcatcctgacaatgattttcttgaagacataactggaaagctgaaagagtatgtcaaggaggagatgaatgtcaagatggtcactgcttgtagcgatcccttagtgtattcatctttacgtgctgaacctaacttcagtgtgttaggcaaaagattaggaaaagacatgggcaaaatatcaaatgaggtgaagaagatgactcaggatcagatcctaacatttgaggaaagtggcgaaatattttttggcagtcatctcttgacgttggaagatattaaggtttttcgagaattcaagcgccccgcaaatgtgtcagagaaggaaattgatgctgcaggagatggcgatgttttggttatcttggatctccaagttgatcaatcattgtttgaagctggagttgttcgtgaggttgtgaacaaaattcagaagttgaaaaagactgctcagctgagactgaccgacccagttgatgtttactacagttcacaggatagcagtgatagctctctcgaaaagattttgcaatcgcaggatcaatatattagagatgcacttggttcccctcttacctcgaaggcacaggcacaacccaatgtggaagtaatctgtgaggaggcctacaacgaaacagtgaagcttgttcatccttttatcaagattgaagatttcccgtga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MAAFRCVPPCLGSNILDPGRGFLSDKCFNCREVGHRVATCPVVP PRPQRARPVATGNPPRSLSKLRGKCFNCLAADHRHFSSASQRAVPVAYSSQSAGGYQS MLITFNADAISTALISQAISEKLCIPPAEFRVEILPKMTNDNVGAESRVEVLPKMTND NVGVPNKVVLGCHLPDGQEVPSSPPEGDLEKLTAAPLPSVVSPLSPSAPNTAVALTVS TSHGSVPSSLNEGHGVSSKIAAPKEEHVTPTMDPPSRCEHLPLEVAPSNLVTDKAELL EITKAPAVKNRLAKRVRQKIITATSRRSVPLPSNMKKRRLLIDQMKTYVLMKKLGIIT KDEEVDEDTMDRCIAFLKEAYPGHYVQLAGTDLVVAVDDDGFFKDKISEFNGLLVTDK ETNKYVINAVKCRFIRVERIRDQLLECNKETYWVPDYVKEKRFHNWLEGARDWAVSRT RFWGTPLPLWISQDGEEIIVMDSVDKLEKLSGVKISDLHRHHIDGITVPSQRGEEFGA LKRVDEVFDCWFESGSMPYAYIHYPFENRELFEKNFPGDFIAEGLDQTRGWFYTLMVL STALFGKPAFKNLICNGLVLAEDGKKMSKSKNNYPSPMEVIDNYGADALRLYVINSPV VRAESLRFNKNGVHGVVKDVFLPWYNAYRFLVQNAKRLEVEGLAVFSPINQAILLRSS NVLDHWIQSATESLVSFVRQEMDAYRLYTVVPYLVKYIDNLTNIYVRFNRKRLKGRTG EDDCRISLSTLYHALVTTCVVMAPFTPFFTEVLYQNLRKVSSKSEKSIHFCNFPSSTG QIDERVEHSVNRMMTIVDLARNIRERHNRPLKTPLRHAHYTTILFTQFLVLWEMVVVH PDNDFLEDITGKLKEYVKEEMNVKMVTACSDPLVYSSLRAEPNFSVLGKRLGKDMGKI SNEVKKMTQDQILTFEESGEIFFGSHLLTLEDIKVFREFKRPANVSEKEIDAAGDGDV LVILDLQVDQSLFEAGVVREVVNKIQKLKKTAQLRLTDPVDVYYSSQDSSDSSLEKIL QSQDQYIRDALGSPLTSKAQAQPNVEVICEEAYNETVKLVHPFIKIEDFP</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>10750..10767#10599..10631#10438..10464#10027..10092#9824..9946#9271..9338#9134..9197#8765..8906#8594..8682#8263..8326#7879..8030#7639..7776#7033..7158#6717..6929#6474..6557#6158..6317#5774..5907#4764..4853#4429..4587#3289..3372#2611..2730#314..1170#1..232#atggcagccttcagatgtgttccgccatgcctcgggagcaatatccttgatccgggtaggggttttctttcggacaagtgcttcaactgccgcgaggttggtcatcgggtagcaacgtgtccggttgttcctccccgcccgcagcgtgctcgaccggttgccaccgggaatccaccacgctccttgtcaaagctgcgagggaagtgcttcaattgtctggcagctgatcaccgtgtcgcggcttgcactcatcctccccgttgcctttgttgttggggataaggccatttcgctcggtggtgcccttcttcaggccacttctcctcagcttcacagagggctgtccctgttgcctactcttcacagagtgcagggggataccagtcgatgttgatcacgttcaatgccgacgcgatttctacagctttgatttctcaagctattagcgagaagctttgtatcccacctgccgagttccgggtggagattcttccaaagatgacaaatgacaatgttggtgccgagtcccgggtggaggttcttccaaagatgacaaatgacaatgttggtgtccccaataaggtggttttggggtgccatttgccagatggtcaggaagtgccctcttctccacccgagggagatttggagaagcttacagcagcgccccttccttcagttgtatcgcccctttctccgagcgcacctaacacagccgtcgcattgactgtttcaacatcccatgggagtgttccttcatctctcaatgaaggacatggggtatctagcaagatagctgcaccaaaggaagagcatgttactccaactatggaccctccatctaggtgtgagcatcttcctcttgaggttgcaccaagcaacctggtgacagataaagcagagctacttgagatcacaaaagctccagcggtgaagaataggttggccaaaagagtgcggcaaaagattatcactgccacctctcgaagaagtgtccctctaccttcaaacatgaagaaaaggcgactcctcattgaccaaatgaaaacatatgtactcatgaagaagctaggcattatcacaaaggatgaggaggtggatgaagacactatggataggtgcattgcgttcctaaaagaggcatacccgggacactatgttcagcttgctgtaatcttatttgggctacacaacgtggctcgtgttccaggaccttaacctagattcatattagtttggtcagatgcgtgacttgtttaggtgttttaggtgttttgggtgctttggtgtgacttgtttaggtgttgggtgttttaggtgttttgggtgctttggtgtttgcaggtgtttagtgtagctttggggaatgtattatagatgttttggctgctttggtgtttgcaggtgtttagtgtagctttggagaatgtattatagatgttttggctgctttggtatttcaggtgtctagtgtagctttgggtaatgatcttgaggtgcttgtaggatggtgttttcagtgggaaccctttcttgggtcgatgtgtatctcttctttatcaatgaaatgaagcagtttctgcctttgtttttttttataaaaaaaagagcataaacttgaaaggcatagggatagccttcacattaaattatgaaatgcataagcattatctatttgctgtagtaaaaagtgataaatatgggccctacaatacttttttttttcaaatgactcttacaatgataggttcatgtgatcttgctgaccatgcacaaggttttagcagaaatattggcagagggtgaaaagtaacaatctaatcagcagttaaggttcgaattgaaaggtttttttactctatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctgctcatcttggaatatttgtttgttgatgttagtgaactttggcaaaagggggtgttggtgaattctgggggagggatgtgtgggtgggtggggaggtgtgtgcatgtgcgtgtgaaccatctacattactactatgggttgcaaggatatggtctgtgactgagtccaccttgagttgagtatctttaactttagtgcctttttgttttatgttgtgtattgacattgttgccctgctgcattctttttctttccttttctttttgggaaatatgcaaaaggttttgcatatcagcaggttagaaaggttcgcctacaaagatcagatgcttgaaggccgaagccaacaattggaaaaccaatcaaacatgaaagaaattaggtttacactcttgcaacacgaattagcatcctagagagcaaaatctctactgtgcgtattcttctttatatggtgcataatgaaataccttattgtatcatgttactaatttggttagcatgggttatttgatttcaaaatttgcacttgtactctttaacctgaagtatcaaaatggattttaactactctgtgaacaaaaggatggctcctaattcaggttttcattgttgtacccaacaataatcaccatggttttaaatcattagctactgtatgtgctagtaaaactcacttaactgattgtttctttcaaatgcagggtaccgatcttgttgttgctgttgatgatgatggtttcttcaaagacaagatctccgaatttaatggtctacttgtcacagacaaagaaaccaacaaatatgtaatcaatgctgtaaaggtaagtgttttcaaatgttcagttgccggtaacttatgctaactgtaagcagtaaatttgcattcagcttgttcagaaaaaaatcatgcgtttttttacttgatgttttgtatgctgaaattgtatgctacatgtaatattcagaaaaaaggaagacttgttagtcacggaagcgttatacataagtatccatactgttggagatctaatacacctctcatatatcgggcagttccaagctggtaggtattttctgctggtgtaaatttggaccatatactagcacattcttctgctggctttaaattgagctgtagtactctgatattcctgctccaataaaagtttttttttggcatgtttattcttaaaaaaacgccgaatgcttatctgaaggtttttaatttgattgaaaaattgaatatagggctttgaattgaaatatactgatagaaaatacatttccattttttttcacatttgggttacttctcttaccttttgtttataccttttgatgtaactcagaggaatgtagcctaaagatctttgttgtagtgtaggttcatcagagttgaaaggattagagatcagttgctggaatgtaataaggagacatactgggtgcctgattacgttaaggtatgctgaactttgtgttttaatattggctttcattatttgtattgttaacatctttgttatataaatgtgaccaaaggaaaaccctgtagtcaagtgttgtgctactcgagtgggctaccacctttgatgctagcctttctctcatgtaatctgtgtgactcctttcaaccttataaacattggcaggcagttattttccagcccagaaaaaagggtggaagacacgtagcaggaaatcttatattgtaaattctgaaagagctaaaatcaaatattgttcctagcttagcatgcttgttgaacgagttgtttgtccttaattcttaacttggctctttcttggatacagagacaattttcaaaaccacttgctccttcactgatatttccaatgacaatcaattagtagaaaatttcatccaaaacatttttaaaactcaaatttggccttttagccagaatttttatttttttgggtgctgggccctgattactcaaatttaaatgtaaaatgttccatctttttggcaagttagattggactgataaatatttttagaaccaacataaaaaagctaatgctgttttcccctgatgcaaaccatgaagttcagtacttcaatgctcattttcaaaggtgtgtttagttttgctctttgctgatacttggttgatttctattctgatgctttcatggtgtaattctgtagtactaaatttgtaggtacaggacattggttgtgctaacatattatgtatggatggacgctctactgctacttcattcatgcatatgtgcaaccaaatcatttctcatatcagagtttgcacgtgactttttgtcatgcgttttcagattgcacgtttaagactttccatgtggtttcttgccggtgtttatgctgaaatgtttcttgttacttccgagaagctcttgtgagagatttagtttgtagtaactaggaaaccacttaagatttttaataaattgttgcaaattgattttgtgtttcttttacctagatttgtggttcttgacaattcataatgcaggaaaagagattccataactggcttgaaggggctagagactgggctgttagccgaactagattctggggcactcctcttcctctatggatcagtcaagacggagaagaaataattgttatggactctgttgataaactcgaaaagttgtctggtgtcaaggttaattatctttgttatgagagttttttcccctttgctggtcaactaacgccggtccactataattttaatttgagagtagtactatttttttttcatatttcttgagttccaaaatttacatagcacttgac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External Link(s)	NCBI Gene:Os02g0183700, RefSeq:Os02g0183700