Os02g0463500

From RiceWiki
Revision as of 19:14, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os02g0463500

Description

Peptidase S10, serine carboxypeptidase family protein

Version

NM_001186019.1 GI:297721170 GeneID:9270332

Length

8983 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0463500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:16328178..16337160

Sequence Coding Region

16328266..16328352,16328454..16328499,16329554..16329667,16331777..16331784

Expression

GEO Profiles:Os02g0463500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:16328178..16337160 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:16328178..16337160 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>aatgcaattggagatcatgccttgcttgtcccattttctgcaactttagagtggctaaaaacattgaactataaggaaattgagaaatggcatccatggtttgtagagaaacaaattgcagggtattcagttcggtatgaaaataatatactatttgcaacaatcaagggagctggccatgtcccatcagattacctgccatttgaagtatttgttgcctatcaaagatggatagatggttctgattctttatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>NAIGDHALLVPFSATLEWLKTLNYKEIEKWHPWFVEKQIAGYSV RYENNILFATIKGAGHVPSDYLPFEVFVAYQRWIDGSDSL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>8809..8895#8662..8707#7494..7607#5377..5384#atttttacatgtctatcttttttgtgtgtagtacataaatgcaaataatgcgtctcttttctctcatcatagcctttcgatcggtagaagctagaatgccagagatggtgagggcgtcaacagccatctctgcgggaagagtcgtcgtcgtcgccggagcggcggcgttggtggttgtcttgctgtgcgcggcgccggcgccggcggccgtggaagctgtcccggccggcgccgaggtctccgagttcccggggttcgacggcgacctcccctccaagcactacgctgggtacgaattgaacaaggaatatattagatcagatttattgaataactagatcagatccttgttgctttactttgcttaattacgccgtgggtttaattttgttgttgcttcgcttttgctctcttgatgtgttagttagaagacgcgtgcccacgctcaccagttttctcctcatttatatatatctgctgttgttcttttgctctcttgatttgatttggtttgattatgaattaaggatttaaggtgttgaagtttacgaataatgaattgtaatataaactggacgcggatccggtgtagttttctttggtaataaggagtatggttacatgatcgagcatagccagctatatatatgcggccgtttgcagccgttttcagttcgataccaaattcatcaccaccccgttttggaaatcactaatttttttcctgaatttaaattattttgttgcggtcttttgtaaagagtgaccgatataagtgaccatgtagctctgtgaagtattagatttataagttaatggtttttttttcatttatatattcaatctccatgtcaatctattatatattgtcatttcgacataccttcttaatatttttttgagtaaagtgcattggcggtacttaaacttgtagggttgtgtcatataggttcctaaactctcaaaaatgtatatccaggttctagaacttgtcaaaatatatcatctaggtcccaaattgacacatcccctctatgatcctatgtggtgctgatgtggcaatgccacatggacgtgatgtgtcctttttttttcttctttcctttttctttttcattttcttttcattcttgtttttttcctttcttttgcacggatcacagagaaaaggagaagaaagggaaaaaaagagaagaaaaaaataaaaaggaaaaaaatgggtatcatttatcagtcaaaataatgccacgtcatgtctgtgtggcatgccacatcaacgccacataggatcatgaaggggttgtggcaatttgggacatagatgacacactatgacaagttctgtgatttggatatgcattctgagagtttagggacctaaatgacatacccatataagtttaaggaccgcccatacactttactcatattttttttacccaagttaagattttgagattgcacagcacaaattctaaaatgcattttttctaataacagagagagtatctgttatgtatcattctaacaattatgatatacattaactattaccattattaagcatccaatcgttttcctaaagcagtcattaactctgagtaattgttgtgcatggctaaagtaatgaagggcaggagggaagatcacctacaatgatttagaatatggaatgagaaagtattttgataaactaaattgaatgctaaaattaaagtaataaaacggagggtatcaaatttggtagtcttatatagggaacttagagcaagttttatagtggattgatagtcaactttaattttgtccacatcatcaactcattaattaaaatgtactccctccgttccaaaatataaggcacaaccactattaacccaaagacaagaaataattattaccacctcatagtttgaatcatcctaataaatagaatgcatgcaccctatcaaattagatatcttgatggtggaggatttaaataataatattttagtggaaaagaagtgctatttaatgacatgcatgtatgcgcgccttatattatgaaacaactttaaaaagtagttgtaccttatattatggaacggagggagtaatatacacaacacattacctctagcacccttgccccaatacaccatattaatttaattttatttgtttcctatcaattcattggcctcttgctctcttctctctttgaagttgctccttgcatgagatgcaactcattctctctctttatttatctcatccaccttatcatgtgagcttatatggcacttaggggaaagtgttcagaggcttataatactttctcttagctcttagctgtacatgatcttgaattcatcatgtttcatgagtttttttgtaccattagaaatgttggggtccatcgaagtgtatgttgtgtggcctcaattcattcgtgggccagttcgccctggggttaaacaacatcaatcatataaattgaaacagcatataaaaacccaaagaattttgaaaccatattaggcatcttaatccatattaaaaaaatatataaataattattttgtttgtttgacaggtacataactgttggacatcagccgctaaagagacatatgtattactattttgccacttccgaaaggaactcaaccactgaccctgtcatcatctggataaatggtggcccagcatgttcaggatttagtgcctttttgcattcaatcggtaaacatcatatttcagaattgtatgaagtgttacatgattatgccattagaaaaaaaacccactgttattctattgttgtagttgtagacgaatttgcaaagtataaacttttctaataatgatttttttactggacaacatatatgtagatttgtcgcattttactaatacaattatatatgtagatttgttgcattagtagtggacttataggccaacaaataagcatggaaaaactatgctaagagaaatagtatagtgagcattttgctagtaagatgcctatatacatatctaaatatacctgaggcaggtgcatattttttctactgattatgttctaattaatgaagcacacattatttacatatataactaaatttcacaaaaactatttttaggaccattgaaaatagagggacccatgattcatgccagagatgagccaaggaccaagttaaatcctttctcatggaccaaggtatgtggaattaagtttttagggttgaacacaaacgagtagagaagtgtttatatgtaggacaaacaagtgtattttagatagatgtacagtgtatgttcttacttacgtaattatgcctacaaagatctcaactacaagttttattgaacattttaatgaatgcagttcaattaaccttttcacaccgaagcccattaataatgcttactatttctcttaattacttacaaaggtaaattaatacactaactagcaagcaagtaaactcatgtttaccaagtccttgttggtattaactatatttgccatttccttttagttctgtcaggggattagatatatttgccatttccttttagttttgccaatttcaattctttttgtcatatgtcagtatgtagtttaatttgcttctacacttattaaaatacaaagttatattagtaaggtaaccacaaaatatgcccgcacatgggcttctcttaatatggaccctctcattgatcaatgtcatgatgcttcataaatcacacttgtactttaggacaccttaatagttaatttgtttgattaaagagtgatatcatgaaacatatagaaaatgggaggtatatggttattactccatgcattttttaaaatcagtgatttttacttaaactttctaccttacatttggaaacttatattaagaaaagtcaatagataataatattatagagtattacaatgacaattctaaaggtataagttttcacatggccattctaagtatctctggataggtgaaagtttagaaagtttgacatcactgattctaaggtgatacataaaaaaggaacgcaggcagtgcttttttagaaagtaatgacaaatcaacttcattcagtttgtatgctacttccatgtataatatatctaaatacaataattttagttcctggatattactgatgtgctcttgcttgtcccaaccacagatgtctagtgtccttttggttgactcaccagcaggagtgggctattcttattctgaaaatgaagatgactatgtaacaaatgatacaagcagagtattggacctgtatgattttttatcgaaggtctgtgatttctatgcatgttttgtaatggacataaatttctttcaaactactgaggtgattgtttttccagtggttttctgaatatcttgagtttctatcaaatcctttctacattgccggttgctcctatagtggcgtgatagtaccagttcttgcacaagaaattctgaagcgtaagtggcagcgcaaatcttttaaaatataaatattagatatgaaaacaatatgctctcaaagtgtttctatgtatttattaaccttccaagatatatgtcatgatgcatattgtttctcatttaccctttttgtttctaatgtattgaaatattttaggaaatgaagacaatggcagaataaagataaattttaaggtgatgtttcaaaacatattccaagcaattttagttgaaattgtatacagttcttttgtattttctatttaaattgtattctttattgattattttgatatatgtaactacatatttttaatttatgctttatgttttcaactaaaatacttctattttgtcttccagggttattcactgtgtaatccagctgttgatgtagaaattgaaaataacgcgtttgtaccttatgcatttcgaatgggattgatttcagatgaattatatcaggtatacttattttaaaatttgattttttttattttcatttcacatattcttttttcctgaggcatgcattcaaagtttcaaactcatcaagtaattggtttactttctttgggagcagaatttagttagtacgtgcaatgggaagtactggaataacaaaggcccatcttgtctagcaaacttggaacagtttcataaggtaaacaagatctgcaatgctacctatatatcacgttttgttctactattgccaagaaaattaccattgatgtgcagcaaatcagtggcattaacatggaacatattctttgtccaccatgtcgttatcaaatgggaataaccaaagaagccaatgaggaatatgattttggtcagatgtttgagctcctttccgaaagctccgagtatggtttagaatgcaatgtaagtaactaaggaccaatatgtgatgagatctgggacatgattttcaatatcaaaagtttattttagttgtagaatgtatacactggtttggaactcatggacacgtctcctgttttatgaacatattcaaaccacttatgttaaatttatattttagaatcaagaactggtcctcgagaaactctttgacacaaaatccagcagagaaaaactgcatgccaaaccggtacaatattctattttgttacaatagtttgtgatttttcttcaagtaatagtaaccgtatgaaccgggatccttcgtagttacactgccactgacatgcatgtgggctccgttctccatagggcccacgttttagtggcagttaccatataatgataaccacggaagatccgcatgatatttaatcatttttgacatgctatcttcttccgcagattgaaatattacaaaagtggaagagatgccccaactttatccaatacacaagagatattccaactttaacagagtatcacttaaatgtaacatccaaaggttacagagtgtttttatataggtatgtacattaaatgcaattggatacttctatattttcatggcactaattagggatgaaaacagatcgaatacggtcggaaactagctctatcatattcgttttcatattttttttcggaatcggaaacccagatataaaaatggaatcgaatattatcgaatacaaatacagagcgaatacgaagtgaaacgaatacggtgatgaatattaatcggaatataaaaacccctcactactcacaaacgattttttgctattgtgtttctaaaatcatgcgctatcatgttattgtgtttttactgctattattatactcaaaacttcaaataatattttgaagcagtaaataatttcagctgaaaaagtcatgaacataaaagttgtagaactcatcaagacatacaacttttattttggtcatttcttcatccgacaaagtgatagtaatattgttcacaaaatttacatctctctctaatagtttataaaaccaaatgagagatgtaaattttataaacaatgttactatcactttatcggatgaagaaatgaccaaaataaaagttatagatcttgatgagttatacaactttgttgttgatgatttttttcaattgaaatcatttagtatttgaaaatgttgtttgaagttgtcatattttcaaattcaaattcaaactgttcaaacaaagtcatatagaaaaatgaccaaaataaaagttatagatcttgataagttatacaactttgtttttgacaatttactacccgaaaaaaatatttgaatttcatatattttaaaattcaaattttatatagttcaatcaaactcggatggagaaatgacaaatataaaattggtacatctcaatgagttccataactttgttttttacaactttttcatatgagttcatttattatcataaaattcaattcgaagttcattttttccaagaagtctgatttgcctccgctttgggttgggctggcttatgggccttgtgtgtaagtcggatatctaatggaaaataccggataatatccgacggatatcacctatatcatattcgttttcataaccgaaaaaatatccgaattcgaaaatttccagatatatccgaccgaaactatccgaacccgaaaaaagatccggtcggacggaaattatccgaatcactttcaaccctagcacgaataggtatgtaggggtgtgtgtgtgtgtgttattgtagagtattatttattccatatatacaagctaatatgttcttgatattctgtgtagaaacaattgaaacatggtgctagaggacaacttttgtagcctaactcatcccaatagataaaaatttggaaaactaaaataatttttatagcatgatttatgctattgaatttgtttgttactgatcaaagttatatcataaagtgccacaaatatttactttttgagattagtttcttctagttatataatgtctgcttcttttactgaatataatatatgtgtttaattggaggagtttttccaatgcagtggagatcatgccttgcttgtcccattttctgcaactttagagtggctaaaaacattgaactataaggaaattgagaaatggcatccatggtttgtagagaaacaaattgcagggtaagtaaatctctacattcgaatagttattaagtatccaatcttggatatatttaaaataactaatatttctattctttaagcaaacagcaaattaatccaatggtcaagctaactattgtaattcatcatataaatcttggttattattcataaaaataatagaaaatttaattagtcaaggtgcaaaggatgcttgattaacatatgccttgatacaatgatcatatgtgtgaccactatataaacctctacatcgtacaagtgaaggaccaagtgcagacacatgtctacaaaacatttctattcctatgaataatgatgataagatacaaaaagcccaatttagaaaaaaagaaaacaattgttgtgttctcagctctagggcttcttacgattagtttgggctacatctcattgtcaagaaggaaccaaacctttcatgcttatgggcaatatttctttcatcattgctattgtagagtatcatgtcctaacccggcttacattataggcatggttaatatccttaaaataaaatccagaaccgagtcaacataaaaggtggtcacttaaaactaatttgaaagcagaaagagaaaaaaaaaactattgcatatttggtttgaattatattctaggttcccaaacacatggaggatttagattctgaaatgttaaggaaaaaatgatgaagaataatatgttcccattatccaaagaacgaaagagattataacaccgagcactccgaatcatcaatatatagttatacacgttattcctttgtagaattgccaataatatgagcgtgttagtcttcgcatgctctgtggtatgtgacagaagtgcaccatttttattctattttttgtgcactcagacaccatcagttgtcaatattaaatgtcaacatcttttttatgttatactaactctaaagttgtaaatcatctctttctcttatggaaaaaacacacttaagtattaagacattttagatagtaatttatgttatgattaagctaatttgcactttgttgattactaataggtattcagttcggtatgaaaataatatactatttgcaacaatcaaggtaacaatttctcatctttctatcaattgaacacagtatgattggtggaaatttggatgttgcatctctaagtcactattaatttcctacaattacttcagggagctggccatgtcccatcagattacctgccatttgaagtatttgttgcctatcaaagatggatagatggttctgattctttatagtagtttgactaatgttgtgtcatttgtacatgaataatcttaactcagtaccaatatacaatggtgatataacctctgttttgaggcc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0463500, RefSeq:Os02g0463500