Os02g0672200

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Structured Information

Gene Name	Os02g0672200
Description	Similar to AGO1 homologous protein
Version	NM_001054239.1 GI:115447848 GeneID:4330281
Length	11558 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os02g0672200, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 2
Location	Chromosome 2:28217036..28228593
Sequence Coding Region	28217346..28217560,28217660..28217691,28217788..28217882,28217982..28218055,28218168..28218303 ,28218383..28218446,28218524..28218586,28218668..28218810,28218934..28219071 ,28219160..28219281,28219361..28219526,28219644..28219766,28219977..28220048 ,28220141..28220248,28220849..28220965,28221095..28221233,28221342..28221448 ,28221535..28221644,28222260..28222393,28222474..28222623,28222697..28222917 ,28223015..28223694,28228365..28228404
Expression	GEO Profiles:Os02g0672200
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008395:28217036..28228593 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008395:28217036..28228593 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggccttccagttggacaacgggtactactcccatcaagctttagccatgatgagaaagaaaaaaactgaaccccgtaatgctggggaaagttctggaactcaacaagccactggagctcctggacggggtccttcacagcgacctgagagagctcaacagcatggaggtggtggttggcaacctgccaatcctcaatatgctcaacaagctggtcgtggtggtggacaacaccagggacgtggtggacgttaccagggtcgtggagggccaacatcacatcaaccaggtggtggtccggttgaatatcaagcacatgagtactatggccgtggtgtccaacggcaaggaggaatgccacaacacaggagtggcagtggtggacatggagttcctgccagtccatcaagaacagttcccgagctgcaccaagcctcacaagaccagtaccaagctacggtggttgcaccatcaccatcaagaactggcccatcttcgctgcctgttgaggccagcagcgaagaagtccaacatcagtttcaggaacttgccatccagggtcaaagccccactagccaggccattcaaccagcaccaccatcgagcaaatcagtgagatttccaatgcgccctggcaagggtacatttggtgataggtgcatcgtgaaagccaaccatttctttgctgaattgcctgacaaagaccttcaccagtatgatgtgtctataactcctgaggttccttcacgtggtgtcaatcgtgctgtcattggagaaattgtaacacaatataggcagtctcatttgggtggccgtcttccagtctatgatggaaggaagagcttatacacagctggtccattaccatttacttctaggacctttgacgttattctgcaggatgaggaagagagccttgctgttgggcaaggtgcacagaggcgtgagagaccatttaaggtcgtgatcaaatttgctgcacgcgctgatctccaccatttagccatgtttttagctggaaggcaagcggatgctcctcaagaagctcttcaagttcttgacattgttctacgtgaattgcctactgcaaggtactctccagttgcaaggtcattttattcgcctaacttaggaaggcgccaacaacttggcgagggcctggaaagttggcgtggtttttaccaaagcatacgacccacgcagatgggactttctctgaatattgatatgtcatcgacagcattcattgagcctctacctgtgattgactttgttgcacagcttttgaacagagacatctcagttagaccattatctgatgctgatcgtgtgaagatcaagaaggccctaaggggtgtaaaggttgaggtcacacatagaggcaatatgcgcaggaagtatcgcatttctggccttacctcgcaagcaacacgagagttgtcttttcccattgataatcatggtactgtgaagacggtggtgcaatacttccaggagacatatggatttaacattaagcacacaactttgccttgcttgcaagtgggcaatcaacaaaggccaaattatctaccaatggaggtctgtaagattgtggagggacagcgttactcaaaaagactaaatgagaagcagataactgctcttcttaaagtgacctgccagcgccctcaagagcgtgagctggacattttgcagactgtgcatcacaatgcataccatcaggatccatatgcacaggagtttggcataaggatcgatgagcgacttgcatctgttgaagctcgtgttctaccacccccctggcttaagtaccacgatagtggcagagagaaggatgtcttgccaagaattggccaatggaatatgatgaataagaaaatggtcaatggtggtagagttaacaactggacatgcatcaatttttctcgtcatgtccaagataatgctgctaggagtttctgtcgcgagcttgctattatgtgccaaatatctgggatggacttctcaattgatcctgtggttcctctagtgactgcaagacctgaacatgtggaaagagcgctcaaggcacgctatcaagaggccatgaatatactgaaaccacagggcggggagcttgacctgctgattgcaatattgcctgacaataatggttctctttatggcgatctcaaaaggatatgtgagactgatcttggattggtctcgcaatgctgtcttacgaagcatgtttttaagatgagcaaacagtatttagcaaacgttgcccttaaaatcaatgttaaggtgggaggaagaaatacagtacttgttgatgctttgacaaggaggattccccttgtgagtgataggccaacgatcatttttggtgctgatgttacacatccccatcctggagaagattctagcccttccattgcagctgttgttgcttctcaagactggcctgaggtcaccaaatatgccggattagtgagtgcacaggcccatcgtcaggaattgatacaggatctttttaaagtatggaaagatcctcaaagaggaactgtaagtggtggaatgatcagagagcttctcatttctttcaagagggcaactggacagaaaccccagaggattatattttacagggatggtgtcagtgaaggacagttttatcaggttctgttttatgagcttgatgccattagaaaggcatgtgcatctttggaagccgattatcagccacccgttacctttgtggtggtccagaagcgtcatcacacaaggctgtttgctaataaccacaaggaccagcgcactgttgacagaagtggaaatatactaccaggcaccgtggttgattcaaagatatgccatcctactgagtttgatttctacctgtgtagccatgcgggcattcagggaacaagtcgccctgcacattatcatgttctgtgggatgagaacaagttcactgctgatggtttgcaaactctgacaaacaacttgtgctacacctatgcaaggtgcacccgttccgtatcaatcgttcctcctgcatattatgcccatctcgcggcatttcgagctcgattttacatggagccggatacttcagatagtgggtcgatggcgagcggtgcccatacccgtggcggtggcccccttcctggtgcacgcagcactaagcctgctgggaatgttgctgtaaggccgcttcctgatctgaaggaaaatgtcaaacgtgtcatgttctactgctaa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MAFQLDNGYYSHQALAMMRKKKTEPRNAGESSGTQQATGAPGRG PSQRPERAQQHGGGGWQPANPQYAQQAGRGGGQHQGRGGRYQGRGGPTSHQPGGGPVE YQAHEYYGRGVQRQGGMPQHRSGSGGHGVPASPSRTVPELHQASQDQYQATVVAPSPS RTGPSSLPVEASSEEVQHQFQELAIQGQSPTSQAIQPAPPSSKSVRFPMRPGKGTFGD RCIVKANHFFAELPDKDLHQYDVSITPEVPSRGVNRAVIGEIVTQYRQSHLGGRLPVY DGRKSLYTAGPLPFTSRTFDVILQDEEESLAVGQGAQRRERPFKVVIKFAARADLHHL AMFLAGRQADAPQEALQVLDIVLRELPTARYSPVARSFYSPNLGRRQQLGEGLESWRG FYQSIRPTQMGLSLNIDMSSTAFIEPLPVIDFVAQLLNRDISVRPLSDADRVKIKKAL RGVKVEVTHRGNMRRKYRISGLTSQATRELSFPIDNHGTVKTVVQYFQETYGFNIKHT TLPCLQVGNQQRPNYLPMEVCKIVEGQRYSKRLNEKQITALLKVTCQRPQERELDILQ TVHHNAYHQDPYAQEFGIRIDERLASVEARVLPPPWLKYHDSGREKDVLPRIGQWNMM NKKMVNGGRVNNWTCINFSRHVQDNAARSFCRELAIMCQISGMDFSIDPVVPLVTARP EHVERALKARYQEAMNILKPQGGELDLLIAILPDNNGSLYGDLKRICETDLGLVSQCC LTKHVFKMSKQYLANVALKINVKVGGRNTVLVDALTRRIPLVSDRPTIIFGADVTHPH PGEDSSPSIAAVVASQDWPEVTKYAGLVSAQAHRQELIQDLFKVWKDPQRGTVSGGMI RELLISFKRATGQKPQRIIFYRDGVSEGQFYQVLFYELDAIRKACASLEADYQPPVTF VVVQKRHHTRLFANNHKDQRTVDRSGNILPGTVVDSKICHPTEFDFYLCSHAGIQGTS RPAHYHVLWDENKFTADGLQTLTNNLCYTYARCTRSVSIVPPAYYAHLAAFRARFYME PDTSDSGSMASGAHTRGGGPLPGARSTKPAGNVAVRPLPDLKENVKRVMFYC</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>11034..11248#10903..10934#10712..10806#10539..10612#10291..10426#10148..10211#10008..10070#9784..9926#9523..9660#9313..9434#9068..9233#8828..8950#8546..8617#8346..8453#7629..7745#7361..7499#7146..7252#6950..7059#6201..6334#5971..6120#5677..5897#4900..5579#190..229#aattatttctttgttctcctcctcctgattcgtcgtccgtccctaggaagcaaaaggagaaagtttccactctgtctgcgggatatatcatatatatctcaatcgatccgccattggcgatcgacgaagtgatcaggggctagctcctttgcgctgcggctttgaccgcggtgtcgaagcttcttgcacatggccttccagttggacaacgggtactactcccatcaaggtacgcacgcattcccgcttttagttgcctctccgatcgcgatcgctgtttcttcctcgatcctcgcttcttcagttcttcttcttcctatttgattcttcttcccttctttgcttctgtgaacacagtttttgcctgtcgatcgaactgtacgtacgtgagatgcccattagactgttgcggttggtgttagtgctacagttactaaatagtctcccgtgcatgttgtaacaaagcagttgttttccaacctgttcccctgtcgctggtggatgcagctcccccttttgtcgttcttgatcttgatttgacgtgcaccgggatacggccaaattaggggggcggcctgggccgggagacggattgagaggatcggctgatcgatcaggttagggataatgattgctagcacaggctcttctgccgtcgaatgttcgatcggcggagctgggttaatctggaccgggagtgtcgacatgctgccgttctggcgttctctcggtgagtccagcaaaccttcgcactgccagaacattagccaatcaaatcaatgaacaggagaacgaatttgacagatgaacaatatgcttgcaacttcgatgagaaggattaggaaaaatgaaatgtaccaaatacgacaggtgagcaggaaatttgactcgcgatttggcagataagccaaggacaataatagtggaataaccaatgggaagacaaagcttgtttctaatccacgtgaaaccgaaatagccacggaggttggtggggcccgcgcgatcttgtttaacggaagccacactgaccgaggaagggccccgcgggccaggtcgtgggtgccgcaccaggtgcgtgcggtgggggccttgcaggtggaccccacctgacacgtttcgaggctttagcggtccaggttttttttttccatcagtgggccgaagccgcctctggcccactggctagctgctgacatgtagggaggcgtcagcgggccggcccactccccacttggcatctttcgatgtgtactccattttccttttatttttccctacattatatgtgtactgctcctagtacgcatttcctttaacaacgattattataacacaaccaaatctactagaagcagctgtctatatgtatggacggtttaccagtaaacctggcgattgcttgttcttccttgtgcatagatcaaaccggttgcataaacagatagactagtctaacatgtgcagattgacttgcacatctcaagaaaagtatatcttctacgaggcctcaaaaaaagtttaaccaggagtaaaaaccatccataaaaaagtaccactacgtactggatgacttgaagtagtacgtgttagtacaacagtacatggcagttgtggtcttgagattttcatgtttgtacttcaaacttgtatacgtcgcattcgcttctatacgatgctggagtgactggttttatcctccgaaagctcttgaccatggacttgttgtccttatagacttgataggctacactgtcggcttccacagcaacgtttaggtcaagtttgagagcggattctctacttattataaagataaattattactttttaaataggcttagcaaacagtttattaacgagttatctaaataatggaaaggaagaaaatatttttgggaaaacatatgtttaaacgcgtggaacaaacagtctaataaaatagcgaaaataacagtctaaaatcgtgctttactagcatcgtggctcaatgttataccaagtacctatgcacgttttggtccttgaagttttcaattttacctttttttaagataatagactagatatagttaaaacactcaacttccgctattaaagtgtttaaaaattcaaggacgtttcgctcttaataccaaatcaaaatttgataagtcttaacaaaaatataaaattttggtagtatctattatacataccctccgatccattgttgggtctaactttcatacaagaagtactagaagagtttaactagaataaccttttcgatagatgtatttattttgaaatacgagggtgtagaagcgaacaaattcaagggattaatatcaccaacaatcatcctattttattcccaaaattgatttcgagagatttcagtgaaaaaatccgatccaacagatccaaaaagcactgcagtagttttggattttctatccccatatatcttgctatgtggatttaaaggtaagagagcaactccccatctctagttggtgtgtttctctctccttccccatggattttgagggtgagagagcgactctcaatctctggtacgtgtgcgagcgctgaaaatttatgttgggagcatgctgggtgtggaatgaaaaaaacagaaatttctattggtagtttaacaaaagatccacttttaattttgggattaaatttaggctatctttgagctttttcactccctatttagtttaggaaactaaaaaaatcaaattttgggtatagattatcgctaatgtgctggtgctcttagaaatctatttaggaaagcaattaagattataaaacggatgtttctccttatcaattaccattcggtttttcagactccttaaaatacggaggaaaacagggagaagattgacacgaaaataaagcagaaaggataaaagtgtctccacacgcagcccacgagtgcacgaccgacctcgcccaaaaccgctctcccgtcaccctcgtcctcaccccggttcgctcgcccctcgcctcccctacccctagtccccttcgccgcgcacgcgcacccgcacccgcaccgagccctcgacccccctccgcagccgccgcctccttcctcggctccgctaccgctaggcgctcgcccgccgccgccgcccgtcttcctccatcggcccggcgcgccgcgtcgtgcccgcgctcgtccgcaccggctcttgcgccggcgccggcgccgacgaagggggagagtcaccggttccagcgctctaatcgttcccctacccagcaatccctgtcgggccatccgtctcgatttgtaaggtaggtgccccgaggtaggtgccccgcgtgagtgagacgtgttagtgttggggttgatctgcaatatcctgtaatttgtttgttggttgatgcgatgttgttatatgctattgctacctgatttcctttgtttgttggttgatgcgatgttgttctatgctattgctacctgatttacctcgatgtttacaatgcagattgttatacacgatctgtagtatttatttggaaaagaacctaatcaatgcaatccttccgatatatacctaatccttcgttaaacatagtatttatttggaaaagaacctaatcaatgcaatccttctgatatatacctaatccttcgttaaacatagtatttaggatgcaaagatgatgctggataagcaaccatatatgcaatccatccgatatatacttcgttaaacatagtatttaggatgcaaagaaagatgatgctggataagcaaccatatatgcaatccatccgatatatataaacatagtacttaagttaaagatgcaagatacaagatgatgctggcgtggtctgaaaatggaaaacctaatactttgtataaacatagtacttacatgcaagatgatgctggcgtggtctgaaagtggaaaacctaatactttgtataaacatagtacttacaggcaagatgatgctggcgtggtctgaaagtggaaaacctaatgagtacttaagatgcaagatgatgctgcacccatttatttttcttttcttttgcatttccctattatttacttttcttcctcagcaaaattacttccactacattgctcatcaaacttccatttcatttccaagttcccatctctcccatttcccaaaattactcccacttgatcacgcatgtcatatttgtttgtggctttctaacattgtcaagggatttccaagttcccatctctcccatttccctattatttacttttcttctttagcaaaattactcccacttgatcatgcatgtcatatttgtgtggctttctaacattgtcaagggaattaggatgatgtgacttgtttaattaccttgtcgaatttcgtcctattcagtattcacaatgattctcgctcactttctctgactttttagcatgctgacctgagtattgactactgtcgatcactgcatctcatgtggaaaaagaaaaaagtttatcttgttgcttgtaactcctctttttcttttaatgcatgaatctgggagcagctgcactttgtaaagatactttgaatttttgggggtatttggggacataacaaagatagtatcattaatatggtggcaaagactatgtaatattatgtgctgtaccgccgttgcctgaaagattataaaccatgttgtaattcaggtcattcaatgtggcagatg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External Link(s)	NCBI Gene:Os02g0672200, RefSeq:Os02g0672200