Os02g0739000
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0739000 |
|---|---|
| Description |
DEAD/DEAH box helicase, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001054600.1 GI:115448570 GeneID:4330670 |
| Length |
9281 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0739000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:31759632..31768912 |
| Sequence Coding Region |
31759657..31760178,31761108..31761283,31761747..31761860,31762214..31762322,31762406..31762492 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:31759632..31768912 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:31759632..31768912 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcactgcctcgccccccacttcctcctcttcctcccactctcctccgcctcccgccacgcgctcccccacaccccacccgctcctctcctcctcccctcccacccagcccaagcccaagcccaagcccgcgccggcccgctccgcctcccatccgcgcgctccccttcccgcgccgctgcccccgtctccgacgacgacgaggacgaggaggatgacgaagagatagacatccgcgacgacgcggacgtggacgaggagtacgacgacgacgacgacgaggagctggacgaggagagcggcggtgaggaggaggaggaggaggaaggggatgatggggtggaggagttggaggaggaggagggtgggcgggaggggaccgctgcgcggaggcggcggtcggaggagtacaagtcgcagcgggtggggaagctggtcgccgaggtgcgggagttcggggaggatatcatcgactacaacgagctcgcggggatctacgacttccccattgacaagtttcagcgcttggctatacaagcatttttgagaggctcatctgtcgtagtttctgcacctacaagtagtgggaagacactaattgcagaagctgcagctgttgcaacagtcgctagaggaagacgcctcttctacacaacaccgttaaaggccttatctaatcagaagttccgtgatttccggaatacgtttggtgatcataatgttggtcttcttacaggagattctgctattaacaaagatgctcagatcctgataatgacaacagagattctgcgtaacatgctgtatcaaagtgtcggtatggcagcatcagaaggtagattatttcaagttgatgttattgttttggacgaagtccattacttaagtgacatttcacgtggcactgtttgggaagaaactgtgatatattgtccaaaggaagtccagcttatatgcttatcagccactgttgcaaatcctgatgaattagctggctggattggtcagatccacggtaaaacagagttggtgacatcacacaaacgaccagttccacttacttggcacttctcaaagaagtttgcacttgtaccacttcttgatgggaaaggaaagaaaatgaataggaaattgcgaatgtctcacttccagaacctatcttctccaaaaagtgaattctattatgtgaaaggaaagaggaagcttagaacaactaaaaatgaacaaggtaacagaagccccttggacatctcaaaacaggttcagttgtcaaagcatgagctcaccaatatgcgccggtctcaagttccattaatacgtgatactttatcacaactttgggaaaatgacatgcttccagctatttggtttatttttagtagaagagggtgtgatgcagctgttgaatatcttgaagattgtagacttctgcatgattgcgaggctagtgaagttgagctggaacttaagaggttcaggatgcaataccctgatgctatccgggaaagtgctgtgaaaggactcttacgaggagttgctgcccatcatgctggttgcttgccactgtggaaatctttcattgaagaattatttcagcgtggccttgttaaagtagtctttgcaacagaaacccttgcagcagggattaacatgcctgctagaacatctgtgatttcttctctcagcaaaagaattgacgctgggcgccagctcttaaccccaaatgaattattccagatggcaggtcgtgctggacgaagagggattgatacagttgggcattctgttcttgttcagactacttatgaagggcctgaagaatgttgcgatgttatctttgctggacttgagccacttgtttcacaatttactgcatcatatgggatggttttgaatctccttgctggctcaaaagttactcataatcagaaagaatcggatgatattaaggttaagcgttctggaagaactttagaagaagctcgaaagttagttgagcaaagctttggtaactatgttgggagcaatgtaatggttgctgctaaagaagagcttgaaagaatacagagtgaaatacaatatctctcttcagaaattacagatgaatccattgaccgaaagtgtagggaagaattatctgaggaagactatgctgagatttcccttcttcaaaagaaattgaaggaagagaagcagatgagaaatgaactgaaaaaaaggatggaactagagagaatggtggcatggaaaactcggttggaagaatttgaaagtggtcaccttcctttcatgtgcttgcagtacaaagacaaagattcagttcagcatactattcctgctgttttcattggaagcctcagttcatttgcggatcaaaagattgtgagcttggtggaaaatgattctcctgttgctggcaagcagaaagttgacaatgaaggacagcaatattacccatcttattatgtagccttgagttcagacaactcatggtatctattcaccgaaaaatggattaaagctgtttacaagacaggtctacctgctgttccttcagcagagggaggccctctccctagagaaaccctgaagcagctccttttgcgtgaagatatgatgtgggataaaattgcaaaatcagaatatggttctttgttatgcatggatggatctctggacacatggtcgtggagtctcaatgttcccgtgcttaatagcctttcagaagatgatgaggtagaacgattctcccaggaacatcaagatgctgtagaatgtcataagcaacagagaaagaaagtttcacaattgaagaaaacaatcaggagtactaagggtttcaaagaatttcaaaagatcatcgacatgagaaactttacaaaagaaaagatcgagcgtttggaagctagatctcgtcgtttgactcggcggataagacaaattgaaccaactggttggaaggaatttttgcagattagcaaagtcatacaagaggctagagcattagatatcaatactcaggtaatctatccgttgggtgagacggcagcagccatacgaggggaaaacgagctctggcttgccatggttcttaggaacaaggtccttttggatctgaagccttctcaacttgcagcaatatgtggaagtttagtgtcagaagggatcaaacttcgtccctggaaaaacagcagttatgtatatgaaccatcttctgttgttactggtgttataaactacttagaagagcagagaaactcactcgtcgatctccaagagaagcacagtgtaaagataccctgcgaaatagatgcccagtttgctgggatggttgaagcctgggcatcagggttgacctggagggagataatgatggactcggcaatggatgatggagatttagcccgtctgctcagacgcacgattgatttactagcccagattccaaaattgccagatatagatccggttctccaaaagaacgcacaaattgcttgcaacatcatggaccgggtaccgataagtgagcttgctggctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MHCLAPHFLLFLPLSSASRHALPHTPPAPLLLPSHPAQAQAQAR AGPLRLPSARSPSRAAAPVSDDDEDEEDDEEIDIRDDADVDEEYDDDDDEELDEESGG EEEEEEEGDDGVEELEEEEGGREGTAARRRRSEEYKSQRVGKLVAEVREFGEDIIDYN ELAGIYDFPIDKFQRLAIQAFLRGSSVVVSAPTSSGKTLIAEAAAVATVARGRRLFYT TPLKALSNQKFRDFRNTFGDHNVGLLTGDSAINKDAQILIMTTEILRNMLYQSVGMAA SEGRLFQVDVIVLDEVHYLSDISRGTVWEETVIYCPKEVQLICLSATVANPDELAGWI GQIHGKTELVTSHKRPVPLTWHFSKKFALVPLLDGKGKKMNRKLRMSHFQNLSSPKSE FYYVKGKRKLRTTKNEQGNRSPLDISKQVQLSKHELTNMRRSQVPLIRDTLSQLWEND MLPAIWFIFSRRGCDAAVEYLEDCRLLHDCEASEVELELKRFRMQYPDAIRESAVKGL LRGVAAHHAGCLPLWKSFIEELFQRGLVKVVFATETLAAGINMPARTSVISSLSKRID AGRQLLTPNELFQMAGRAGRRGIDTVGHSVLVQTTYEGPEECCDVIFAGLEPLVSQFT ASYGMVLNLLAGSKVTHNQKESDDIKVKRSGRTLEEARKLVEQSFGNYVGSNVMVAAK EELERIQSEIQYLSSEITDESIDRKCREELSEEDYAEISLLQKKLKEEKQMRNELKKR MELERMVAWKTRLEEFESGHLPFMCLQYKDKDSVQHTIPAVFIGSLSSFADQKIVSLV ENDSPVAGKQKVDNEGQQYYPSYYVALSSDNSWYLFTEKWIKAVYKTGLPAVPSAEGG PLPRETLKQLLLREDMMWDKIAKSEYGSLLCMDGSLDTWSWSLNVPVLNSLSEDDEVE RFSQEHQDAVECHKQQRKKVSQLKKTIRSTKGFKEFQKIIDMRNFTKEKIERLEARSR RLTRRIRQIEPTGWKEFLQISKVIQEARALDINTQVIYPLGETAAAIRGENELWLAMV LRNKVLLDLKPSQLAAICGSLVSEGIKLRPWKNSSYVYEPSSVVTGVINYLEEQRNSL VDLQEKHSVKIPCEIDAQFAGMVEAWASGLTWREIMMDSAMDDGDLARLLRRTIDLLA QIPKLPDIDPVLQKNAQIACNIMDRVPISELAG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>26..547#1477..1652#2116..2229#2583..2691#2775..2861#3262..3380#3562..3739#3874..4473#4560..4838#5428..5634#5900..6244#6661..6897#7470..7690#8593..8692#8779..8925#9024..9122#gcgagaaccaccacaccctcccgccatgcactgcctcgccccccacttcctcctcttcctcccactctcctccgcctcccgccacgcgctcccccacaccccacccgctcctctcctcctcccctcccacccagcccaagcccaagcccaagcccgcgccggcccgctccgcctcccatccgcgcgctccccttcccgcgccgctgcccccgtctccgacgacgacgaggacgaggaggatgacgaagagatagacatccgcgacgacgcggacgtggacgaggagtacgacgacgacgacgacgaggagctggacgaggagagcggcggtgaggaggaggaggaggaggaaggggatgatggggtggaggagttggaggaggaggagggtgggcgggaggggaccgctgcgcggaggcggcggtcggaggagtacaagtcgcagcgggtggggaagctggtcgccgaggtgcgggagttcggggaggatatcatcgactacaacgagctcgcggggatctacgacttccccattgacaagtttcaggtggagtagtttctaatcctgatgaactaattatgagcgtatagagtgggtaatggctctggattttacgtggtgcgtttgattgcttggggcgctgaaacggttgggatttgagctagcagcgatatgttgctctgtatatgttaagttccgtgtaggtttctcctgtttgaggctacattggagatatctgacgactctgcaacggtgaaatcggattctggccatttcccccgggggggggggggggggctgtctcgtttgagtgatgattggtataagtagttctggtgtatatggtatcgtggaactaacaagtaaagtcatgattcgttgtaaataaattttctgtactggctagtaatccactgtcgtatgcaattgaggtttatctgagtccttgtttgtgcgtttatttagatggtaggattgtggtcgattccttttttctggaatacgcaaaaggattgtggtcgattcctgttatacattgtgtcttatcattggtctggtttgatgatattatttatgagctacttgtaaagctgttttgcacaacagataaaacaaagatttccatgtcttgattattagcgacgctctagtgctctctacttgtagtattctactgctgttgaaatgtttgtgttaaaattgattttaaaaatgttagaatatccattgggtactaaaacaggaagggataaaagggtagctttggttttctgccaacaaatctacctcttcaccattggtaacaggaagacatttggaaaattgatgctaatcttttatgttgcacgaggtcaccggatattgaacagttttttccaaattctagcaacttgctacttgttgtcctgagtgtcacctcatgttgtacaacccactacttttcattttcttacctgtttcctgtcttctctcagcgcttggctatacaagcatttttgagaggctcatctgtcgtagtttctgcacctacaagtagtgggaagacactaattgcagaagctgcagctgttgcaacagtcgctagaggaagacgcctcttctacacaacaccgttaaaggccttatctaatcagaagttccgtgatttccggtaaaatgctacttttgtatgcccctcttttcagttaacgagtaaaatctgtaagatatacttttcatgtcacattagttgtttttatcttaaatagcatgcccatgcccccaatcaatacacaaccttggaagttgctctcctttatacttagcaacattgtggcaaatactgaaatggccaacttaaattttaccatattccttgactgtcataagaagcaaaaaacaggtaaatgtacttaccttttctctttcaaagttacgtgctggacagttgaaagctgaaagtttatgcaatgctggttcactttagcataaacatgattgatttctgttgaacttgtggcaagttggagaacttcagatcagttgtgctgttgtattattagatatttttcctaggtggccagtttctgattagtagatttattttgacacatcgctgctgtaaattatttcaggaatacgtttggtgatcataatgttggtcttcttacaggagattctgctattaacaaagatgctcagatcctgataatgacaacagagattctgcgtaacatgctgtatcaaaggtatttcacagaagaaggatatatagtgtgatttgtgtgtactgctacgagtaattcaccctgcagaatttggcagtctgcctcttccactgtcgctagtgatgcattccgtgacagggactgttcacagtatactataattcaacactatgtatatccatgggcaatgtctcccaagtcatgcatgcgtgtttaagaatatctatgatttttattacagccacctatatagtttcccaaggaagtttttctctgagattcagcctataatggtagttaattacagatcgcaactgatgttgcctgtcctgtttctattgaaagaaaaatgatgtcttgtatttggactgcagtgtcggtatggcagcatcagaaggtagattatttcaagttgatgttattgttttggacgaagtccattacttaagtgacatttcacgtggcactgtttgggaagaaactgtatgctatctcattactctctaattcatcatgtgtgtcatattggtcattttaattaaataaacatttttttatatctttaggtgatatattgtccaaaggaagtccagcttatatgcttatcagccactgttgcaaatcctgatgaattagctggctggattggtcaggtaattgtacttttgacgtctcttttgcatcatcttaattttctttgccgttatgctttctgcaactatgttaataaactgtattgcatttcttttggacttccagcagtatgacagattgacaggtgtaagaatttctctcttcctactttagaattgttgtttggattttcttatacaatgaaataggattaaaatgattaaaataaattatggcgattggtataagaaaacatgctcaaacatgcacatacccatattcatgcatatgttatgaccatctgtgtgctcatccatattcaaagttgtgtacccatacattttggaatccctttatttcttttaagtattggtgctattttgtatgtgcggaactattatgaagtctgttccttcacagatccacggtaaaacagagttggtgacatcacacaaacgaccagttccacttacttggcacttctcaaagaagtttgcacttgtaccacttcttgatgggaaaggaaagaaaatgaataggtttttccttgttcttgttggcaacttggcattatatacttcagatcatttgttaatttatgtgcatagaaatattcattacttattttccatgatggtgcaattgtttttgtgtccatgcacattggttctggtgtacttgggccaaatcatatatatcttttgcattcaatccatacaggaaattgcgaatgtctcacttccagaacctatcttctccaaaaagtgaattctattatgtgaaaggaaagaggaagcttagaacaactaaaaatgaacaaggtaacagaagccccttggacatctcaaaacaggttcagttgtcaaagcatgagctcaccaatatgcgccggtctcaagtatgaaccacaatctcttttaaactctttaagatgtgtatccttgcacaataactttaaattttcacgtggtcatatatatatttttgttaggactaatgattgtcatttcttgtttgccttttgcaatgcaggttccattaatacgtgatactttatcacaactttgggaaaatgacatgcttccagctatttggtttatttttagtagaagagggtgtgatgcagctgttgaatatcttgaagattgtagacttctgcatgattgcgaggctagtgaagttgagctggaacttaagaggttcaggatgcaataccctgatgctatccgggaaagtgctgtgaaaggactcttacgaggagttgctgcccatcatgctggttgcttgccactgtggaaatctttcattgaagaattatttcagcgtggccttgttaaagtagtctttgcaacagaaacccttgcagcagggattaacatgcctgctagaacatctgtgatttcttctctcagcaaaagaattgacgctgggcgccagctcttaaccccaaatgaattattccagatggcaggtcgtgctggacgaagagggattgatacagttgggcattctgttcttgttcagactacttatgaagggcctgaagaatgttgcgatgttatctttgctggacttgagccacttgtttcacaatttactgcatcatatgggatggttttgaatctccttgctgtatgtatcttactttaatgcttcatcatatttttcctgttttgttcattatccctttatctcatgcattaaaatatactatgcagggctcaaaagttactcataatcagaaagaatcggatgatattaaggttaagcgttctggaagaactttagaagaagctcgaaagttagttgagcaaagctttggtaactatgttgggagcaatgtaatggttgctgctaaagaagagcttgaaagaatacagagtgaaatacaatatctctcttcagaaattacagatgaatccattgaccgaaagtgtagggaagaattatctgaggaagactatgctgagat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