Os03g0213400

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Structured Information

Gene Name	Os03g0213400
Description	Similar to RNA helicase
Version	NM_001055897.1 GI:115451522 GeneID:4332045
Length	11234 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os03g0213400, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 3
Location	Chromosome 3:5947476..5958709
Sequence Coding Region	5947847..5947930,5948660..5948791,5949327..5949476,5950382..5950552,5950682..5950849 ,5950981..5951076,5951619..5951681,5951791..5951956,5952049..5952116 ,5952488..5952631,5952723..5952878,5952953..5953018,5953171..5953362 ,5953444..5953593,5954409..5954499,5955083..5955171,5955363..5955425 ,5955540..5955665,5955744..5955833,5955901..5956023,5956345..5956461 ,5956546..5956746,5957485..5957565,5957739..5957819,5957925..5958026 ,5958106..5958330,5958413..5958568,5958640..5958708
Expression	GEO Profiles:Os03g0213400
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008396:5947476..5958709 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008396:5947476..5958709 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>ttttaccttcagtactccagtgttgaggcttacaatgagatgcttcggcgtcacatgaatgagagtgaggtgattaatatggtggcccattcctctgagtttgagaatattgtagtaagagaagaagaacaggatgaattagaatccctttttaagaatgcatgcccacatgatattaagggggggccaactgacaaacatgggaaaatttcaattctcatacaggtttacatatcgcgtgctccaattgatagctcctctttgcactctgatgctcaatacattagtcaaagcttggctcgcattatgagggcattatttgagatttgtctgcgccgagggtggtctcagatgacatccttattattagagttctgcaagggtgttgaccgcaaaatatggcccgaacaacatccacttaggcagtttgacagagacctttctcatgagatatgtaaaagacttgaggaaaaacatgttgatctggatcgtctttatgagatggaagaaaatgatatcggagctcttattcggttttctcatctaggaaaggtggttaaacaatatgttggatactttccatatgtcaacttatctgctactgtgagcccaatcaccaggactgttcttaaagtggaccttcttataactcctgaatttttgtggagagatcgtcatcatggcatgtcgctacgatggtggattattgttgaggattctgaaaatgatactatttatcattcagagttgttcacactaatgaagaaggcaagaggagcacctacaaagatttcttttaatgtaccgatctttgaacctcatccaccacagtactacatacgggccatatcagattcctggttaggagcagagtcactgtttactgtttcttttcataaccttaccttgccacagacacaaataacacacactgaacttttggacctgaagcctcttccattgagtgctcttggcaacaagacgtatcaagatctatacagattttcccatttcaacccgatacaaacacaggcttttcacgtcctctatcacagcgacaataacgtactcttgggagctccaactgggagtggcaagacgatttctgcagaactagcaatgcttcatcttttcaacacacaaccagacatgaaggtagtttacattgctccattaaaggctatagtacgggaaagaatgaatgattggagacaacgtcttgttactcagcttgggaagaagatggttgagatgactggcgacttcactccagatatgatggccctattatcagcggacatcataatttctacccctgaaaagtgggatgggattagtcgtagttggcatagtagaagttatgttatgaaggttgggctcatgatattagatgagatacaccttcttggagctgaccgtggccctattctcgaggtcattgtatcaagaatgcgatacatatcatcacaaacagaacgttcaattcggtttgttggtttatcaacagcattagccaatgctcgtgatttagctgattggttgggcgtgagagatgatggtctattcaatttcaagcccagcgtgaggcctgtacctcttgaagtgcatatccagggatatcctgggaagttctactgtccaagaatgaatagcatgaataaaccagcatatgcagcaatatgtactcattcaccagacaaaccagttctgatttttgtatcatctcgtcggcagactagacttactgctcttgatctcatccagcttgctgcatcagatgaaaaaccaaggcagttcctaagcatggcagataactctctcgacatgattctttcacaagtctctgacaccaatttgagacatactctgcaatttggaataggtctgcatcatgcaggtctaaatgatagagatagatccttggtcgaggaactcttttcaaacaacaagattcaggtactggtatgtactagcacactggcttggggtgttaatcttccagctcacctggtcataattaagggaaccgaatactacgatggcaaaacaaaaagatacatcgattatgatatcacggatattctgcaaatgatgggtcgggcaggtcgaccacaatatgaccaacatggcaaagctgttattcttgttcatgaaccaaaaaaaagcttttataagaagttcctgtatgaaccattccctgttgaaagtaatctaagggagcacttgcatgatcacataaatgcggagattgtttccggcactatcagtaataaagaggaggcgatcatttatcttacttggacatacctgtaccgaagactggttgttaacccagcttactatggattggaagatactgaaacgtacaccttgaattgctacctctcaaggctagtggaaacaacatttgaagatcttgaggacagtggatgcataaaagtggatgatcactctgtaaagtacttgattttgggaaagatagcgtcacagtattaccttagttaccttacagtctcaatgttcgggacaaatataggccccaacacatcattagaggcatttgtgcacatactgtcagcttctgcagaatttgatgagcttcctgtacgccacaatgaggataacttgaaccgaaccctgtgtggaaaagtcccgtactcagttgatcagcaacaccttgatgacccacatgttaaagcaaacttactctttcaggcacacttttccagagcagaattaccaattagtgactatgtcactgatttgaaatcggttcttgatcagagcatacgtattatacaggctatgattgacatatgtgccaatagtggatggctttcaagcgcattgacttgtatgcatcttctacaaatgatcatacagggtctctggtttgagagagattcatctctctggatgctaccatccatgaatgataatcttctagatcatctgaagggcagaggagtttcaacaattccagccttactaggtctctctcgtgaagaattacataggttgcttcaaccattttctgcttctgagttgtaccaggatctgcagcatttcccttgtgtggatgtaaaacttaagcttcagaatgaagataaggaccagtccaggcctccaattttaagcattagattgcaaatgaaagatgcgcgccgttcaacatcaagagcgttttcccctagatttcccaaggcaaaacaagaagcttggtggctggtccttgggaacattagaagttcagagctctatggtctgaaaagaattaattttatggatcgggtggttaacactcggatggaattgccagcaatgtttgatatacaggagacgaagctaattttggtgtcggattcctaccttgggtttgatcaggagtactcacttgggcatcttgcaaagggtgtgtga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>FYLQYSSVEAYNEMLRRHMNESEVINMVAHSSEFENIVVREEEQ DELESLFKNACPHDIKGGPTDKHGKISILIQVYISRAPIDSSSLHSDAQYISQSLARI MRALFEICLRRGWSQMTSLLLEFCKGVDRKIWPEQHPLRQFDRDLSHEICKRLEEKHV DLDRLYEMEENDIGALIRFSHLGKVVKQYVGYFPYVNLSATVSPITRTVLKVDLLITP EFLWRDRHHGMSLRWWIIVEDSENDTIYHSELFTLMKKARGAPTKISFNVPIFEPHPP QYYIRAISDSWLGAESLFTVSFHNLTLPQTQITHTELLDLKPLPLSALGNKTYQDLYR FSHFNPIQTQAFHVLYHSDNNVLLGAPTGSGKTISAELAMLHLFNTQPDMKVVYIAPL KAIVRERMNDWRQRLVTQLGKKMVEMTGDFTPDMMALLSADIIISTPEKWDGISRSWH SRSYVMKVGLMILDEIHLLGADRGPILEVIVSRMRYISSQTERSIRFVGLSTALANAR DLADWLGVRDDGLFNFKPSVRPVPLEVHIQGYPGKFYCPRMNSMNKPAYAAICTHSPD KPVLIFVSSRRQTRLTALDLIQLAASDEKPRQFLSMADNSLDMILSQVSDTNLRHTLQ FGIGLHHAGLNDRDRSLVEELFSNNKIQVLVCTSTLAWGVNLPAHLVIIKGTEYYDGK TKRYIDYDITDILQMMGRAGRPQYDQHGKAVILVHEPKKSFYKKFLYEPFPVESNLRE HLHDHINAEIVSGTISNKEEAIIYLTWTYLYRRLVVNPAYYGLEDTETYTLNCYLSRL VETTFEDLEDSGCIKVDDHSVKYLILGKIASQYYLSYLTVSMFGTNIGPNTSLEAFVH ILSASAEFDELPVRHNEDNLNRTLCGKVPYSVDQQHLDDPHVKANLLFQAHFSRAELP ISDYVTDLKSVLDQSIRIIQAMIDICANSGWLSSALTCMHLLQMIIQGLWFERDSSLW MLPSMNDNLLDHLKGRGVSTIPALLGLSREELHRLLQPFSASELYQDLQHFPCVDVKL KLQNEDKDQSRPPILSIRLQMKDARRSTSRAFSPRFPKAKQEAWWLVLGNIRSSELYG LKRINFMDRVVNTRMELPAMFDIQETKLILVSDSYLGFDQEYSLGHLAKGV</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>10780..10863#9919..10050#9234..9383#8158..8328#7861..8028#7634..7729#7029..7091#6754..6919#6594..6661#6079..6222#5832..5987#5692..5757#5348..5539#5117..5266#4211..4301#3539..3627#3285..3347#3045..3170#2877..2966#2687..2809#2249..2365#1964..2164#1145..1225#891..971#684..785#380..604#142..297#2..70#cttttaccttcagtactccagtgttgaggcttacaatgagatgcttcggcgtcacatgaatgagagtgaggtaaggttttatctctttttgtttggttgatgcttgtgaggttgtactaatcattctggatactgcctcaggtgattaatatggtggcccattcctctgagtttgagaatattgtagtaagagaagaagaacaggatgaattagaatccctttttaagaatgcatgcccacatgatattaagggggggccaactgacaaacatgggaaaatttcaattctcatacaggtatctattggataactactgtttttccaatgtcttgagcctaacaactttctttaaccaatcactggtatcaattttgcaggtttacatatcgcgtgctccaattgatagctcctctttgcactctgatgctcaatacattagtcaaagcttggctcgcattatgagggcattatttgagatttgtctgcgccgagggtggtctcagatgacatccttattattagagttctgcaagggtgttgaccgcaaaatatggcccgaacaacatccacttaggcagtttgacagagacctttctcatgaggtttgttatctgctacagctgaccaataatttacatttttatgtgtttgctaatattttttatgtgttctctgaattagatatgtaaaagacttgaggaaaaacatgttgatctggatcgtctttatgagatggaagaaaatgatatcggagctcttattcggttttctcatctaggaaaggtatgcccttacttaagaagtggtacctgtaacttgcaaggttgatttgaataccgcaatcgctgaagagtactgactaatgaaatttacattcttttgctgaaggtggttaaacaatatgttggatactttccatatgtcaacttatctgctactgtgagcccaatcaccaggactgttcttaaagtaagggctactgtgacctgtaattatttcttttcttaataaaatttctagctgtgggggcctcctctactgtggtcttggtaacaaaataagtaagggctaatgctaattgattaatctgaaagaaataccaaattagttgattatttatgccttcatctcttgctttgtaggtggaccttcttataactcctgaatttttgtggagagatcgtcatcatggcatgtcgctacgatggtggattattgttgaggtttattactttgcatatattattttgatgctcctgccgctacatcattttagagttgtagcataacatatcttccaccattttgattgtcttattgcttcgatgaaatattctcttatagtcttgttagagatcgctttttttgttgactctgttcagtactgtatgaagtatggaactatggataatgcacctctttttttagtatgaatgttttgaggattccaactatattggacagtgatattgattcgtggatagcaaattagtaactccagagacagttataaatctcaccatcttcctcagcaaccttgtccatcaactgtatcactcatgcggttatactaaaagctaacacagtgttgtgggccacgacaaatatcaaataaatgtatcataaattctgagtgtaagaaatgcaaaattattattttgaaagaaactaaaacgctatagatgtagtcacttaggatctacagataatgcaatcctttttccccgcaaaagatcctacaaattcacagaagggtgatagtatagagtgctagaggctagtattatcaccaccaactcttgtttttaagtggtagaggatatacgaagcatgtatattcccttttatatgtttttaatttgatcctgtagaactctatctatatttatgtcatgcattaatgtatttaccaccaagtgatttaggaaaatgcgttggtaacattcagttttattttccaggattctgaaaatgatactatttatcattcagagttgttcacactaatgaagaaggcaagaggagcacctacaaagatttcttttaatgtaccgatctttgaacctcatccaccacagtactacatacgggccatatcagattcctggttaggagcagagtcactgtttactgtttcttttcataaccttaccttgccacaggtgaattcgacgatgtcttgctgtagttctataatgttttcttttgacttatcatatactgaagttttcaggtgttctttacagacacaaataacacacactgaacttttggacctgaagcctcttccattgagtgctcttggcaacaagacgtatcaagatctatacagattttcccatttcaacccgatacaaacacaggttcgattgaaaatcaaattatcttgcgttttagttgtccatgttacatctgcatgttataaagatgactgtaattacactgcataacctttctatttggctggaagtggaagacttcattatgaaaggctcataaaatcaagaatcaagaaaaaactttgattaaaaaaagaatcaagaaaaaacaaccagaagctcatgctgtgaatttcttttactatataatggccaatgcatatatctgttaatgcatgcagactccacttgaattttcttttttatatgtttgctttttataatctgatgttatctttttttcaggcttttcacgtcctctatcacagcgacaataacgtactcttgggagctccaactgggagtggcaagacgatttctgcagaactagcaatgcttcatcttttcaacacacaaccagacatgaaggttagttcattaaatacttacaatgagctaagattgtttctggaattgattttcaacaccctttcaggtagtttacattgctccattaaaggctatagtacgggaaagaatgaatgattggagacaacgtcttgttactcagcttgggaagaagatggtaaagggcaatctgttcttctaattttccaatacaccaatatatatataacttatctcaagtaatgtgctttggcaggttgagatgactggcgacttcactccagatatgatggccctattatcagcggacatcataatttctacccctgaaaagtgggatgggattagtcgtagttggcatagtagaagttatgttatgaaggtatgagtttttcactttctacattagctttaactatttgctgatttgtaattttgctttactttgtgataaataacacttctattaagtatatcttgttaagcctgttaataggttgggctcatgatattagatgagatacaccttcttggagctgaccgtggccctattctcgaggtatcatttctggaagtcaaagacatgcaacacatgttatggtccataagtaacttcatttactttaactctatctcagggcaacataatttattgtcttctgcattcatcttaatcccatctattcatgctgtgcttgtttttcaaagttatctttttgccaattgtttaccatgatgattttttttcaggtcattgtatcaagaatgcgatacatatcatcacaaacagaacgttcaattcggtttgttggtttatcaacagcattagccaatgctcggtatgttactaagggaaactttggcatgcaatcctcttatcccctatcacataggaataccttctacatgactagttctatatagatctgtatgctgtccacaaccttctatacatgtatttttgctccatggattgcagaagtctagtcacatcaactgttatgagtggttactgccttacttgtggttgatggtattgttaaccctggttgttggagtcctgatcatgatcaatgttacattgattttgattttgattttgatttttgtgttagattggtgtgaattttaagctcttgaaaattttattagtgcctccatccaaaaatataatttctagcgttcaaaatttgcctcaaaatatagcaacttctccacctactccctcatctcatgcaatcacaaccgatctctaattaaatttccccaccatcctcatctcaaccaatcacagccctctcctcatttaatttcacctacttccttaatacccgtgcagaactccaaaaaggttgtattgactgtgcacttgtgcactattttcctttggctgacatctttccatttgtcatggtacttcagtgatttagctgattggttgggcgtgagagatgatggtctattcaatttcaagcccagcgtgaggcctgtacctcttgaagtgcatatccaggtaagtaggattttcacattaactgaagctcctattctggctcaaaaagagctaacacagacttttttttagcacagccatttgccccattgtattgctaactttacctggaaaatgcatcaagctgttgttttcaatatatgtacacacacacacatgcacatttctcttacaatggattagtatttgttttgatgtattcttgaatggttcttaagaaaagagaaaagactaaaaagagggtacaactaggtccatgttgcattttgctcaagcaggtcactacatttgatttttagtgagcaaacctaatgagggtggtgtgaaatgcttgtaagtcgtaagtaatgctttgcacctcttctagttgcttaacgg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External Link(s)	NCBI Gene:Os03g0213400, RefSeq:Os03g0213400