Os03g0378200

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0378200

Description

GWT1 family protein

Version

NM_001056766.1 GI:115453260 GeneID:4332969

Length

6609 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0378200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:15497615..15504223

Sequence Coding Region

15497795..15497838,15497924..15497987,15498065..15498098,15498546..15498676,15498893..15498966
,15499107..15499185,15499292..15499381,15499639..15499712,15500555..15500642
,15500892..15501018,15501102..15501206,15501684..15501807,15501889..15501940
,15503150..15503194,15503765..15503863,15504010..15504162

Expression

GEO Profiles:Os03g0378200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggacgacgagcccatcaacgcgcacaagctcctcaaggagcagttcgtcagcaacttgacggggtcttccctgctggagatcgccgcgctctccaccgtggttccggctgtggtcgttctgaggaaatggagctgcggagataatactaggaagaattcattgaagaaaaatgatgatgcccttcctggtcataaaggttttgtgcattacttctctacactggctatagattacctcagtattgtattgccagttcttctgattttcacagttttagctgaatgggcttgtgcttgtgcactttctcttgtaatgctgatatctatcctcaccatgtttaagaggtctcgatctcatctcaaagctggaccaaatgagctgcctttgctccgagcagatatatcatcatacagagtatctgtggttctagtaacatgcctgtgcatattagcagtggacttcaaaatcttccctagacgttatgccaaggctgaaacatatggttgtggcatcatggatctcggagtagggtcttttgtagtggctaatgcactggtatctagacaagcacgaaactttactgcaatgacctggaataaagcactgatgtctataagccctctaatatttcttggttttgctcgtctcatatcgacatcaggtgttgattatcaggttcatgtaggagaatatggcgtgcactggaacttctttttcacccttgcagcaatttcgatccttacgtccgttatcaggatccatcctaagtattgtggattagctggtctgcttgtgcttacaggattccaaacgtggctctcttttgggttgaatgagtatctcatttctaatgaaagaaacggtggtatcatcagtcagaataaggaaggtgtttatagcatatttggttactggggtatgtacctgattggtgtttccttgggttacaatctattcttcgacaatagttcaaaaggcaagagtaggagcagtcaagtggtaaaagtttgggttcttgctgcatctttttggattatggcaatcattcttgacagctatgttgaaagagtttctcgacgaatgtgcaactttgcttatgttatgcttgtatttggacagaattttcaggttatatctattctcacactagctgggtttatttcatatgaaaagaacctggttcttgaagatgcattcaatcaaaatatgcttggttcattccttctggcaaacatcctaactggtgtagtaaatctctcagttgacacactctctgcctcttccggcaccgccttcatgattttgttagtatactcctttactctatgcatgattgctgctttagctcagttttgcggtattaggatgaaattttggtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDDEPINAHKLLKEQFVSNLTGSSLLEIAALSTVVPAVVVLRKW SCGDNTRKNSLKKNDDALPGHKGFVHYFSTLAIDYLSIVLPVLLIFTVLAEWACACAL SLVMLISILTMFKRSRSHLKAGPNELPLLRADISSYRVSVVLVTCLCILAVDFKIFPR RYAKAETYGCGIMDLGVGSFVVANALVSRQARNFTAMTWNKALMSISPLIFLGFARLI STSGVDYQVHVGEYGVHWNFFFTLAAISILTSVIRIHPKYCGLAGLLVLTGFQTWLSF GLNEYLISNERNGGIISQNKEGVYSIFGYWGMYLIGVSLGYNLFFDNSSKGKSRSSQV VKVWVLAASFWIMAIILDSYVERVSRRMCNFAYVMLVFGQNFQVISILTLAGFISYEK NLVLEDAFNQNMLGSFLLANILTGVVNLSVDTLSASSGTAFMILLVYSFTLCMIAALA QFCGIRMKFW</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>181..224#310..373#451..484#932..1062#1279..1352#1493..1571#1678..1767#2025..2098#2941..3028#3278..3404#3488..3592#4070..4193#4275..4326#5536..5580#6151..6249#6396..6548#ctcctccttcggtttctcttctcggcttctcgccttcttttccgccgtcgcgcgcgatccagttcagttcagatccccccccctctccctctcccccggcgcagttgcgctgcttcccctctcctccactccgccgccgccgccgcgaggcgaccaccgcccctcgagcaggcgccaccaatggacgacgagcccatcaacgcgcacaagctcctcaaggagcagtgagtcccaaaatgtcccccaaaccccccctgaaaacctctcgctggtacgcctcctaagaaccgtcctcttcgcctcgcgcaggttcgtcagcaacttgacggggtcttccctgctggagatcgccgcgctctccaccgtggttccggtgagttgcttagttacccccgctgaagtaggttagttggtgctgtggtttgacccctttttttttgggttgtgcaggctgtggtcgttctgaggaaatggagctgcggaggtcagttcgctacagattttgtggaatttttgacccgtttgatctattagtgcgattgtttagctgatcgatttgtacaagaaatagacgagcgagttgttgatatcatttagaagtgtggtataagattaccagtatgctgcattcttgcacatttagcatttggttcagatatgccattgcgagattgaaccagaaagttgacaggttgaattttttgcgtaatctcagcatgtagttttgataaatttaactcgattatgtgaaattttaccatgctctactccagtttttgattatgctgtggtgcccccatctgatgttatggatgttatgttcatggattttcgaattttaacatcattgatcaataacacgagcttcttttactgttcagagtagatctggaaagtgattgcttcttcccttatttttgtcttgttttagataatactaggaagaattcattgaagaaaaatgatgatgcccttcctggtcataaaggttttgtgcattacttctctacactggctatagattacctcagtattgtattgccagttcttctgattttcacagtaagtattctttcataggacttggagattacattgtagcagtgttcaactatagaaatcataaaatatgtagagaaccaagcattggaacacaatgcataaacttttaaccaactattgttatttgcttattgcaaatgttataatgaggtttaacacttcttagagaaaaaaagttaaatagcaatcttttgattattccttggtttgttacaggttttagctgaatgggcttgtgcttgtgcactttctcttgtaatgctgatatctatcctcaccatgtttaagaggtaccatatctgagttcttacacctgtttttcttgccacattctctctaatttctattacaattctagtcgaccaccctatttcctttatgcaacaaaatccatgctgattagaaactaatgcattccctatattctaaggtctcgatctcatctcaaagctggaccaaatgagctgcctttgctccgagcagatatatcatcatacagagtatctgtggtacgtaaaagttgattaattggaaaaatactactcatttaattacttctcagtactatatatccaacagaactattgaagttaatggtgatggggtgttttgaaggttctagtaacatgcctgtgcatattagcagtggacttcaaaatcttccctagacgttatgccaaggctgaaacatatggttgtggcatcgtaagttgtatctttcatctttttcattggttgtattttagttctttactgtctcaaagcatttttaatgaatcatgaacttgtttttgcaaaagtagacactggctgcaaattgtgcatccactctgttacctattctgcatgcttgtgatttggattatttgtgtttcccatcatgtttgaaacttaaaaagtttctgtgttttcttccccattcaatgacatgatactaaggtatctgcctcattgtccaacagatggatctcggagtagggtcttttgtagtggctaatgcactggtatctagacaagcacgaaactttactgcaatgtaagtccttaactacatatgatctcatatggctaagaaatctagggttttggttttcatcacagtgactttcagttctgaagttggccaaatataggcggagaaagtagattccatgtcttacgacagataatcttactcttctttggttataatattaggcaggttagagattgttgtttgttaggaactgtaggtaaaaaggaatatcatggtttagatatatcacatgttatataaatgatataaagaacatatatttattccgctggctttatctattgaaagtaggaacttctagtttagaaacctagaaggtacaggtacaaagcaagtcaacttcaccagttcgagctatctataaaaaaattagcttggtctgctgagttagttcagaattggcacactgaagataaattatgctgatctccacaattcttatatttgtatatctggagacaagtcagaaaagtaataacgtcaagttgaagctaagattgacttgatcacttttcacccacaaaagctttattatccatcaaatttctgcacctgctctgttttattgtaggacgatatcttttttaaatccttcccatttatttctctctccaaataataaaccatcctgagaaagtgacatgttgacaattcatcccacctttgtctaatataatcactaaaaccttatttagactctattttaatgtttgactttcgcagacatcattgtttgaatatttgaattttctctggatagtaagagtatattctgattgagaggtctgcaaatagtcactagtatgctgtgtcttacaatgcaacttcatgtgtgtccttaggacctggaataaagcactgatgtctataagccctctaatatttcttggttttgctcgtctcatatcgacatcaggtgttgattatcaggtatttttattcataaccatgtcaattacctaaattatgccttcgccacaatttgccatatgcattgacattaaatttacttcgtaattatgcacaatcctcaaactttgctttccttatccagcattttcaattaccatgtgattattttctcttgttgacttgttctagataccgtatatgtactgcacaaaacaaaaatgtactgctgtcttcctaaagatgcatattctatttctcattttctaggttcatgtaggagaatatggcgtgcactggaacttctttttcacccttgcagcaatttcgatccttacgtccgttatcaggatccatcctaagtattgtggattagctggtctgcttgtgcttacaggtactaaagattcatttgaatagtttattttcaaatgtgctacagcctccttttcatgtaccagatatttcatttgttttcaggattccaaacgtggctctcttttgggttgaatgagtatctcatttctaatgaaagaaacggtggtatcatcagtcagaataaggaaggtgtttatagcatatttggtaagtatactaatgcaacaaaacctctttcgtattaccaggaacactcacctctaatgtaacacttaaacaacccaattgtactactcacatcaacttgagttcacaaaattttccaatgctatttgtcatgaaaagttttgatgtcagtctgttatttatctgttatttctttgcttaaggtgccaataaataatcagcctccaacttgttggtggataattcaggcatacatgaaggtgtctgcacagcatatttctagccctttttctttgtttctattcacttatggatttcttaatatccatgcttattatatacatcttttgtattgccttgctgacctttatatgctgattgcatgtaactttttgatcctttttatacccgaatgtcataaatttgcatgcacctgattcttttttgaaaaagttgtggtgatgtgatgcaatctgattgattcatcccttttaacaggttactggggtatgtacctgattggtgtttccttgggttacaatctattcttcgacaatagttcaaaaggcaagagtaggagcagtcaagtggtaaaagtttgggttcttgctgcatctttttggtaagaaacaattttttcatgcattattcccagttataacctttcttcatttttaacaattcctcccatgccatgttacaggattatggcaatcattcttgacagctatgttgaaagagtttctcgacgaatggtaggatattaattgattacatgctttcttaagaaacaaaaaatctagactagcattagattgacaaatataagaaaccagatagttgtgcattttaatagtagtttatagtatattgagcagagttttattctattgaactgagtacccttgttatgatagttaaagagtatgctgtgatgaaatggaccagcatagcttagaaaattaaccgcatctaaagtgcatagttcctgatccgattactttgctgaccctgaggcaaatacctgacctctttggttcattggttcatactggtgaaccaaactaaatatgggtagttccaacggaaatttcctgttgttttgtttgcctccattatctgggagcagctacaaaaatttggtagcaccaaccaaatctaacataatacttccttcgtcccaaaatataggcctttttgaggtaggcaccgatattaagaaagtaggtagagatgattggagtgt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External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0378200, RefSeq:Os03g0378200