Os03g0565600

From RiceWiki
Revision as of 19:38, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os03g0565600

Description

Protein of unknown function DUF1084 family protein

Version

NM_001186569.1 GI:297722268 GeneID:9271241

Length

5513 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0565600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:21180948..21186460

Sequence Coding Region

21181209..21181301,21181375..21181452

Expression

GEO Profiles:Os03g0565600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:21180948..21186460 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:21180948..21186460 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>gtggcgatgtcatcatttgatcctgatctatctcttgaggttttggatcatccaatactggatttcttttactatatgttaacggagatactgccctctgctcttgtcctattcatcctccgtaagcttccaccgaaacgagtatcagcacagtaccaccctattcgttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>VAMSSFDPDLSLEVLDHPILDFFYYMLTEILPSALVLFILRKLP PKRVSAQYHPIR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5160..5252#5009..5086#tttcgagacggagacgccgcctgcctaatctcctcgactcgatctttccttcccaggaggcggaggagggaggaggaagaggagctatcgcctctctcgctgacgcccgcaccacgacacggcgatagagacagaggtgggagatcggagatgaggaagctggtcccctcgccgtccctgccgacggcgacggcgctcgcgggtacgccggagatggctgccgtggcgctggcgctggcgctgcggggttggtgggaggaggtgaacgggtcgccggcgtggcaggacggcgccttcttctccctctccgccgcctacgcgctcgtctccgccgtcgcgctggtaacccccctcgtgtaaccctaaccccccccccccccccgggggggcgaatcgcctaatccccatctcatggcggggcttgtggataagtttgactgcttgatctggacatttgatgtgtcaggttacgggtagggatgcccgtttggttaattatttgggcggtatctgtgtcattagattctgatgcattcacagttgctttcctacactgcgtttcgtgtttgtgtgtggccgtttctcaccaagcttatattgctataccatatataccttattgcagattggaactagttcaatattcctcccgattatgcgtatgttcacactagcatgtgattctagttagtgaatggtggaatcatggtagtttcctattgttttgattgagcatttcgactgcaactgcataagcatcatttataaaacctaaaggttttatggattccttcaattaactgtaaaaatcctttgctatggatacaatgcatacaaattttacatgtgcatagtgtcttacatttgtatgcccttccacctccttcgttttaaatcacatgccacttgaatgttttggaataacgtggagaaacatgttttatgtacattcaagctaccataggcaccacaacctttccttttctttgattagaagtatctaaaagaaatagttaatcaatacaaataaagatcttggaggacaattgccaagaaaaaaaactgacttattgccatgttaattccaagatgaggggaaaagaggtatgaactatgtgtccctttgtagtattgtgacatgaccacagcttcatgttgtttgtcatccaaatgaaaaaaaaaatacaaaaggccaaattgtgttggcttgaaacagtttattattagtttttttttggttggggaggggtgggggggcgcaaaataaattaatctccagctgaaaatattaatgggattttatgttttgctgttgttatgttttgcatttcatgctgcataatactgtgcgcgctccactgacttggattattcttgttcttctctaggagggaatactgctttggtattgttatgcactcgtgttttagtccaagaagctcatatggcactgcattgtgcaggactctttttctcacacggtcacacattaagtttcctttgactttagttggttaggtgaatatgtatatgtttcgtgagataatagttggttaagtgaatatgtatatgtttcgtgagataaaggcagatggtttttccatttcttaatccttttgagttcagttggttcaatgaaaatgtttatgctgtcttgtggagtatacatttcatgtgatctaagcagatggctttttcatttcaaagagatcctacacttactgaaaagtgaggagactgctattgctatcttcctatagttacatttttttgcactaatgttttctaaagagtgaagtgcacgagcggtctctaaacttgtgcgggtgtgtcatctaggtccctaaactctcaaaatgcattttcgtgtcctcgaacttgttttggggtgtcatataggttcaaatgagctccaaccccttccatgcgctgatgtggcatgccacgatagttcatacgtgttagttggacccacgtgtcagtcacatagaaaaaaatataagtagaaaaacatattttctcctctctaccttagaatttttatcttttttttctgtctacctaagaggagaaaatatggtttttaattttattttttatatatgcttgacatgtggattccactaacacggaggtgtcaccgtggcattgccacgtcagcgcatcgagtgggttagaacccgtttggacctatataacacacatggcaagttaagggacctaaaaatgcattttaggagttcagggacctagatgacacactggcacaagtttagagaccgcccatgtacttcactcttttctaaattgtgcaatcaaccttgtacgaaccttgttttgtcattattgatgtggagtgttacctatataacatttatgtatttggctgggaacatgttaggatttatttggacagcggaataaagtttagttccatttatgtatatatcaacatgtcattgatgtggtaattgacattattttattattatcttatggtgattttacctttaattgaacttccaagatgatgagtggccacaatttctttccttttgaaggttcaattgatcagaattcagttgcgagtgcctgaatttggttggactacccagaaggttttccatctgatgaactttgttgtaaacggaggtaatgttgtgctcctttgttttgtttgatgtcttcagatcaacttttatttactatatgtgccatcttgcagttcgtgctgtcgtgtttggatttcatgctcaagtgttcctttttcaaacaaaagtaagaaccattcacttaagctgatgagtctaaaagttttgagtttttttttctcggtattataatatatagtatatgaattgattttggactaacactcttgtgtaaattatatttctacttcacgacacctagctttgtttgtggacttttcaatggatttcctaatttttaatgtttgtgttctagctggattgctcatcagaactctttatgtttaaataggtgtatactttggtgttattggatcttcctggtcttctatttttctcgacatacacgctacttgtgctgttctgggcagaaatataccatcaggttttaactatgtcttttatagtttcatgttccttttaatttttaatccatgaaatgattgtgtttttttacttatttgttaatttgtttatatatctaataggctaagaatcttcccactgacaagctaaggattatatacatggcagttaatggtgttatatatgtaatccaggttggtgcttacatactcaaattattgtactacctctgtcccacaataagcgcaattctatagtactacttgttccaccagtcatctctcattcaaatttctctctatcttgccctcaactactcttcactcccaaatcccaaccatcccccattcaatagggggtacctgggtcattttccctccctcttaatttaccccactcctaaaactgcagttattttggacggaggtacttatattcttcatatgatttttccatgataattgttctactaagttaaccatgaaagtaatatgcacagtcaattgcattcatcttgtatcctgcgtatttaatgtatctgagttgttgcttggttgatcattctgtaaccgtaaaacatatctaatggaatatttgtgcaggtttgtatttggatataccttgggacaaatgatagtcctctgctagagcctgtgagcaaaatttttatatcaggtatgttctgtcctttcctctgttcgataagttgtctaatcattttgtcagctgtatagctcgctgattattctttcttcatttgcagttgtctcattcttagctcttttgggattcttaatttatggtggaaggtattttgttcaattgatattgcatttttcctttcaataagttgttcattttgatgatatatgtatatatttttcttttgtttaggctatttttcatgctgaggcgttttccgattgaatcaaagggccgcagaaagaagctctatgaggtcgttacacttatttttagcatgcaatatatgcacatttgctctcctgtttattaaagttgttgttgaagatagattctgtactcttgctttgtgtactatgttcgtgaaagattagttctacttgaattctgaaacatagaatttttcatttacaaacactgaaaccatgtgaaacttcaacatttaacttgaatgctgaaacattgtacattataatgaatgctgatgagaaaaatgtttgtagatttagatgtatgactgaccttgttcaagtgcatgctaactctgtgtatgtttaattgtttcaggttgggactgtgacagcaatttgcttcacatgtttcttgataagatgcattgtggtgagtgtatttgatcccttttggcatgcaaatatttattgttaatagtacatcagacatacagtcacaaaagttatcactctatttaatgtccacatatcttatcttacccccacatttctttgatattttattttgtgttatgtatataattttatatttgtattaatgcaaagtaatgtcaaatttaacgaattaaattgttattaatgatgattaaatttgattatatcagaaatttcagacatgccaaaagtatacataataaaattatctcagtttttttttcttgtagttcagtttgattatgcacatgtctgattcccaaatgcaataaattgtcatctgattggttcagttcgattatgtcatctgattgcctttttttttactcgaaaacagcaggagaggctcctactgtattttctatttaaaagatccatacctttagcctttaagcctttagcagttgcagttcaatatgaggcacctttagcctttagcatccatagttcaaagatcctgcacaaaggggtgctgtcatattcccatttatcattatttttcccataaattcataactatacatcgcattaatacggtgataggtggcgatgtcatcatttgatcctgatctatctcttgaggttttggatcatccaatactggatttcttttactatatggtaagtaccatcaaaagctcattgtccctaattctgccccttgtatattctaatacattatttcctgctacagttaacggagatactgccctctgctcttgtcctattcatcctccgtaagcttccaccgaaacgagtatcagcacagtaccaccctattcgttagaagggctggttttgtcgtcacaagcattccaaaaacttgtttcagagcgagaattgtgatatttgagctgagcttcaagtagttttgatgggtcatctatgtcatgcttctgatgtggaagaggtttttttgtcctctcctgacccatttttctgggctttatatttcttgagaccagaatattatcagatgatttatactttgttctgcctaacaaaacttaccgttgggagttaattacatcagtaacttataaatttg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0565600, RefSeq:Os03g0565600