Os03g0646800

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0646800

Description

RNA polymerase, beta subunit family protein

Version

NM_001057305.1 GI:115454338 GeneID:4333571

Length

8428 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0646800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:25793826..25802253

Sequence Coding Region

25796054..25796085,25800202..25800241,25800321..25800374,25800453..25800596,25800688..25800987
,25801171..25801593,25801707..25801820

Expression

GEO Profiles:Os03g0646800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:25793826..25802253 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>tgtatcatacagagttatgaaaaaaggacatgcaaagaggagtttggccgtccaaatagggagaatactatgggaatgcgtcatgggtcatatgataaactagatgatgatggacttgcaccaccaggtacaagggtatctggtgaagatgtcattattgggaagacatctcctattccacaagatgatgcccaagggcaagctactagatacacaaagcgtgatcacagtacttcgctgcgccacagtgaaagtgggatggtggatcaggttctcctaacaacaaatgctgatggtttaagatttgttaaggttagaatgcgatcagttcgtataccacagattggggataagtttagtagtaggcatggtcagaaaggaactgtgggaatgacttatacacaagaggacatgccatggactattgaaggcatcacacctgatattattgtgaatccacatgctattccatcccgtatgactattggtcaactgattgagtgtattatgggtaaagttgctgctcacatgggaaaagaaggagatgcaactcctttcactgatgttactgtggataacatcagcaaagcacttcataaatgtggttatcagatgcgtggattcgagaccatgtacaacggtcacactggaagaaaattaactgccatgattttccttggtcctacttattaccagagacttaagcacatggtggatgacaagattcactctagaggccgtggtcctgtgcagatacttaccagacaacctgcagaggggcgctcacgcgatggtggtctccggtttggagagatggagagggactgtatgattgctcatggcgctgcatttttccttaaggaaaggttatttgaccagagtgatgcgtacagagtccatgtatgcgagaagtgtgggcttattgctattgctaatctcaagaagaattcctttgagtgcagagggtgcaagaacaaaaccgacattgtccaagtgcatataccctacgcgtgtaagcttctgttccaggagcttatggcgatggccatcgctcccaggatgctcactcaggataacaaaactgggaaggatcagaagaaacgttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>CIIQSYEKRTCKEEFGRPNRENTMGMRHGSYDKLDDDGLAPPGT RVSGEDVIIGKTSPIPQDDAQGQATRYTKRDHSTSLRHSESGMVDQVLLTTNADGLRF VKVRMRSVRIPQIGDKFSSRHGQKGTVGMTYTQEDMPWTIEGITPDIIVNPHAIPSRM TIGQLIECIMGKVAAHMGKEGDATPFTDVTVDNISKALHKCGYQMRGFETMYNGHTGR KLTAMIFLGPTYYQRLKHMVDDKIHSRGRGPVQILTRQPAEGRSRDGGLRFGEMERDC MIAHGAAFFLKERLFDQSDAYRVHVCEKCGLIAIANLKKNSFECRGCKNKTDIVQVHI PYACKLLFQELMAMAIAPRMLTQDNKTGKDQKKR</aaseq>

Gene Sequence

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External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0646800, RefSeq:Os03g0646800