Os04g0295400
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0295400 |
|---|---|
| Description |
Jacalin-related lectin domain containing protein |
| Version |
NM_001058934.1 GI:115457597 GeneID:4335407 |
| Length |
6280 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0295400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:13037321..13043600 |
| Sequence Coding Region |
13037446..13037448,13037542..13037742,13039792..13040040 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:13037321..13043600 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgagcatgatagttaccaagtttggtccatggggaggaccaggcggagattatagagacgttcaggtggctccttatcggctcgttcgcctaacaatccgcagcggagacaccgtcgacgggatctccttcacctacatcggcaacgatggtctcgtgtaccacatgggtcattggggttccgatggtggtgttccgcatgagattcatctcggccttatggactttgtgatggaaatctctggcacaacgggcatgtgggtcagtggaatgagtaacgtcctacgatcactcaagatcaccaccttgaaaaggacttatgggccatacggcaaccctaaagctgggatcccttttagcttctcagttgatggcagtgatcggatcactggctttttcgtacgcgctggctttataaccgatgcaattggagtctatgttcgtcactgctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSMIVTKFGPWGGPGGDYRDVQVAPYRLVRLTIRSGDTVDGISF TYIGNDGLVYHMGHWGSDGGVPHEIHLGLMDFVMEISGTTGMWVSGMSNVLRSLKITT LKRTYGPYGNPKAGIPFSFSVDGSDRITGFFVRAGFITDAIGVYVRHC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>126..128#222..422#2472..2720#ctcaaaacccaagtatacacatcttagctagtacaaatatgaactgtttctaatcttcctggttactctagtgcagcaagctatacatttgcgaacttaagaagaagttagctacatcagtcaaaatggtgtgttatcctcttcctccctctaaagattttatcaacattttccacattcaaaactgtaacaacataccgatctgtctgtggatgatttagagcatgatagttaccaagtttggtccatggggaggaccaggcggagattatagagacgttcaggtggctccttatcggctcgttcgcctaacaatccgcagcggagacaccgtcgacgggatctccttcacctacatcggcaacgatggtctcgtgtaccacatgggtcattggggttccgatggtggtgttccgcatgaggtaaagtctaccactgatactcctctcttcctctatctctttctttctatgtctatgtagctgtggtttgcatctccaatatttatatataaagttataactagatggtactccatgtgttgctgccgaaattcatacaaaatgattagcttgaaattgtgttggatgatttttttataggtaatgttatggatgaggcgacaatataatggtgcatagaaagtgccataattctcttaggtagcccaagcaaagcgttgcacactgtattagtagtactattatagtaacatatccgaacaaggtttagaaggatccagtacagctacaaacatctccgaatgaggttaagttttgcactgggctctgaaggaccgatgttgatattgatgttagatacaagctaggaaggtagcccgcgcagttgagctggcatcttatttaaactatcatattttttgtggttaggattttgagtattatgactttaatttgtctgtcgatgaaagaatttgaaggttcctttatactacatgattgaaaaaatatataggtcagaaatagtttagaaatgcatgagtaaaatagagtaaacaaattttggaccgaggacagaaataacatgaattttaaaatttgttaacccacatagatcaaatcatcatctatcattgcgtaaataaactgcaattaaccagacaacctttgcattagcagcttgattgtctccatcccatgcgaagggaaaaaaacatgcgcatgcatcttatttcaattttattaattttattgtcatagacatatgctgcaactttttatatgcaccatgcatggatacctcgcaagcaatatgatttagggataagtagatagtgatagtgaggatatacctcctaagttagaattgatcaagtatattgtatactacatattaagcgttttagtatctaagtaataaatttaaggccgagttctaaagagcttattggattggctactcgcttatttatagtgagcacacttcccaaacggctaaacgtgtaatattttatatttttctcataatttctattattttctcaatttattatagtatcaggtagtagtttaagagtcttcgtatggtgtttaatggacttaaactttcctatgttttttttggcatggtattggttggttatgaatttttccttcagaattactataatatattcatgcaaatcaaaggatagtatagatatgcaatcgataggaagcacactatttcttcctacaatccaaaggagctttgaattttaattttaaatcccaaatataattttgagctgaattcaaactttttaatggtgtattgctttttggatgttacaaaagaaaacaaaactaaagagatgaacgtggggcctgtgtgggtacttatgtaatgtacttatgtgcacctagaagtggggattttaagagataaatttaattggtagtttttttaggtagatgtaatggataaacaatggatctaccacaataaataaaaaccaacggttaaatacatttttcttagaatttatatgatttattacaacgccacgtggtggcttataagtgtttgtagatatgctatgaggcgggaaagaagcgttcgtagggatgatatgtggcagcttactagcgtacgtaagaagtttaatgaactttcaatatataatagatagatatatagatagatatataggtagattgtcaagaatagaaaaaattgaactgagcataaaacctgtaaatatgaaatttacactctggaaaacaagttaaaattttaatttgaatgttttatgaaaaaaatatagcggcatatataagtattgatagtcctttagtcaaaacttgtgaattttttaagttatgaaaccgtttttttctttaatttgtgacatgttcatgcatggcaatgggcaaaatccgatgatttatagtggatagaggtttgaaaccagatgaattaattagacatgtactatccaattatgtaatccatgtaaattgtacctgcagattcatctcggccttatggactttgtgatggaaatctctggcacaacgggcatgtgggtcagtggaatgagtaacgtcctacgatcactcaagatcaccaccttgaaaaggacttatgggccatacggcaaccctaaagctgggatcccttttagcttctcagttgatggcagtgatcggatcactggctttttcgtacgcgctggctttataaccgatgcaattggagtctatgttcgtcactgctagagttttaggctagaaaaaatacccatgctttacaacgggtgaaggttattttattgttatatgatttagttaaggtgaaattcactgtgggaattcacttggatatatatttttctaaaaaatcatgagctgcaattaagagtccgatcatcttaagttagtatgtgagttttttttaagaaatatattatacgactccttccgtatttccaaaagcgaacgggcttaaaacccgactcaaatacggatctatattttcaaaataaaatgaacttaaaaaccaactctatatatagatgacataccaaagcaaaaatatcttcaaattttatattactatagataatgaaatgaatctcgatctttgccgcactgaaaagctacagccgctgctagctacatagttatccacattttcaaagataagttttttactcgattaatttctcagtgcctctagccgggtgggtgccggaagtagtttctacccatgtagtgatgtagacataccagcatgcaaggacaatattggttctccaacaattatagttcaatagatttaagtgaaatgtaataaacagtgcgacaatatattaagtgaagtattggattagacatattagtcgtcaacctgtgagttgcacatgtggaaatatttaaatcaaattgaatcatacatgtggttaaatgcattgttattttttccctaaaaatgattttatcatgatcgcagctcaaaaaacgggtgttcccaacattacaatgattagaaaaaaagataatatacaagcactatgagtatttggattagtgggatccatacacacataagtaatactcactctcattgtctatgaccacagttgacaccttcccatataataacaatgatgccgagtagtgagtaggagagatactcaataggatagcttaccagtccctccccaagatacgccggtcaaactacacaaggtggtgtatacataccacagataagtcgatctataagggctatcccataactatctcaagtgttcaaaacgcatacttgtgctcgactaattccgatcccagcaaaagaactagcctcccacttttagcttaattaaccaagttatcgaaatatggtgcaagaaggataatttaagaaaaactagagacatatagccaacttatatgcatatggtagactggcgtaatagtaaaagttcagtggactaggggtaggcccctaggtcaactagacttatactaaacatgcagactgactaggggtaggcccctagttcaaaccatcctgaagaagttaacaactagtgatatttgcaatcatatgacaatattgcattgcacaaaaggagatacaatcattttgtcttcatcgctcatgttagtttgatcgttgtgtctggtaggagaactaatgcatactatggtatcttgtgtaagatgcgcatttatggaagtacacttgcaccatcaaaaaacttacttacttgaaatgattttccttgtctgatcacatgtgactgatctagttatgatgcctacttggtcatatatgaccacgatcactctgatactcctgatgatgctctaaccattatatttggcatctcaatggaactcttcgtttgcttatttttgaaaagtcgtgaggcctcaataggcaaaatacaagaagaatcagatcaaaattaaggaaattgcaaaaaaaaaaaggtagtgcgatcaactgatgtagagtcctttccgtcttgaatgtcatacaaatgatctgaatattcggaaccatcttcacagctgacacatagagttcagttgggccacctgaccagtggctcaattgataccattaccatttgttaaaagcgaaatttaacaagattcacatggatttggagttggatatcgatgcggaatcaaaggagattgaatcttaccaaattcgaaatgcgcatcggctggaaacatagttggaaacggattgagccgatatggcaggtagccaatacagcttgacttgggctcggtttgggtttagattggaataactgatattgccgtatagagattgagctcgcctaaggcaattgtatctattaattaggatatttatgtcggtttaaattagagatatgataagagtttgccatgtggacttgttcgtattttatctttaggaaagcttgagtcgtgtccgtaatggacaagttttgtactcagggtatcaatat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