Os04g0425100
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0425100 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, FYVE/PHD-type domain containing protein |
| Version |
NM_001059337.2 GI:297602726 GeneID:4335850 |
| Length |
9017 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0425100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:21023953..21032969 |
| Sequence Coding Region |
21026638..21027584,21028623..21028683,21028765..21028877,21029656..21029746,21030187..21030234 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:21023953..21032969 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgactccaaaatggagtgaatgctcttcaaatagttatagagaattatcttcaaaggaaaatggagaagggaaatcatccataacagaagcagtgccttcatctacaagctattttggttcaccagctgtcaacagaatgtgttctctatctgcacaaaagaaggatggcaatgtctataaaaggaggaagatggagaaggattcaacttcccttacagcaaatgaagaatttaaagaaatgacagctcaaaactgcacttctgaagatcactcttcattactgctacctgttacttcagatgcaatggtttcaaattcaacggcacctatccttgaacatgatgagcctgctggagttccgctggtgccaagatctggtgtgaatgatagatcttcagtatctagtatgctgccacctttcatgatgtttgataaaaaggatgctactgaatgttcctcgtcaaatattggttctacagaaccaatgacaggcttcacatcggcaagggatctttgcattgccatactgagggaagatggactcataactgaatctcgaactaaaatcaaggcagaggaattgactggttatgatgccaacttactgttccaatgcaaaacttgtgggaaatcagaccatccattaaagatgcttatatgtgattcttgcgaagcagcgttccatctgtcttgttgcatccctcgtgttcatgaggtaccaactgatgaatggtattgtctgccatgcttcaggaagaaaccaaagagtcagtatggcaagctgtcagagggaaaggtcaaatcttcagggaatatcaaccaaaggcctcatggcatgagtcatatagagtacatgttaaaagataccaaaccatatgttactggggttcgaattggtatagactttcaagcagaagtgccagaatggtcttgtcctacttccagtggtgatgtttattgcgaggagccctctgaatttgattctgctgacctcactaaactgaactggtcaaaaactaatactcagtatagatcttcaatcggtaattggatacaatgctgtgagatcttgagtgaaggagattctgataagccagtcgtctgcggcaaatggagacgggcacctctatttgttgttcagtcagatgattgggactgctcctgttgtctaccttgggatccagctcacgctgattgtgctgttccgcaggaattgggtacggatgaagttctagggcagctgaagtacgtgaggatggtgaagaatcggctggttgatcgaaatcacaagcctgctaacgttcaaggatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTPKWSECSSNSYRELSSKENGEGKSSITEAVPSSTSYFGSPAV NRMCSLSAQKKDGNVYKRRKMEKDSTSLTANEEFKEMTAQNCTSEDHSSLLLPVTSDA MVSNSTAPILEHDEPAGVPLVPRSGVNDRSSVSSMLPPFMMFDKKDATECSSSNIGST EPMTGFTSARDLCIAILREDGLITESRTKIKAEELTGYDANLLFQCKTCGKSDHPLKM LICDSCEAAFHLSCCIPRVHEVPTDEWYCLPCFRKKPKSQYGKLSEGKVKSSGNINQR PHGMSHIEYMLKDTKPYVTGVRIGIDFQAEVPEWSCPTSSGDVYCEEPSEFDSADLTK LNWSKTNTQYRSSIGNWIQCCEILSEGDSDKPVVCGKWRRAPLFVVQSDDWDCSCCLP WDPAHADCAVPQELGTDEVLGQLKYVRMVKNRLVDRNHKPANVQG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2686..3632#4671..4731#4813..4925#5704..5794#6235..6282#8382..8435#gtgtatcgccatttcgcccagcttcccggccttccttgtccatctcccttttctctcctcctcctcgcgtgctccccgcgccgcctgcgccgatctctccgtcccgctgccggcggcgccgcgcccccacccctgctgctgctgctgctgcttccgcggcatcctcgcggagctccccctccgctgccgccgatccccgtccctcgtagcaccggggtgctggcgtcgtccgccctgctgctgctgctgccgctgcttcttcttctcccgccgcatcctcctcctcgccggtgagccacccgtgcgcgcatcccttccttccttcgcatccggtctcgatctggaagagttttgctcttcgtattaaccttagtcattactattaatcagtttgtttggggaaaaaatatttggggggagggggtggttcaaactgccccacgttaggtctgcccttttgtgctttgtatgtatgtatctcaatgacattgtgttggcagttttgctatctgttagatgactgagaactgtaataaagaaaaaatttagtcgaatttgcacaccgtcgaaaccatgtgggggatgtgtaagatttgtgctctagttgtcctctttagcggcatcctgcggtagggggatggtggcggcggcggcaccggattagggttcatggtggggggattgggggagggggtctttgggcttatagcgatggctggagcggtggtggccgtggtggggtgttgaggcgacacctcggccttggaagaggatgagggcgagttccggtgatggcagtgagggaagattctcagataggctaagaggggtgggtgggtggttccggaggttcaagctggaggagacaggggaataaatgggatgagggaggctctcaatggagttgaggagagggcaatgagatagtggcgatcgagggtggcctggtagggagggagtggtggcacggaggggctgaagattgggaggatgaggtggcaaaagaatgagagaaagagtaagggctaagtttgtgaaggctgcacgtctttgaacaatcgtggccatcaaaaagtgagttcagttgaccaatgaatagacaacccctacgttgattcaattgcatttggtaatttttgtgctctaatttgaatgtgaaaaattagtaccatgctgcaaaaaaagagaggaaaatatggttggaacattaaacttgattctcgtagcactggtgaagtggtaaggcaagtgcaggataagttcctcttgcattgcctctgctttgcatatataagtaccagaggtgagggggatgggacgggagtaagttcacccccgaatcctacgcggcagtgtttccatctcacacgaatctacgccgccatcgacccctctgcctcacgattggcatcctcacgattggcatcctctgtctcagcatcacctgatccggcccatactagtcaccagccaagtacacccacccaaaatatgtgaaatggtgagagtattgtttacatctgacccacccaaaaatccttgttctatccccctccccccctcgcttcttcactttctttctctttatcctccgtcttcaccctactttgtactatcccacacaggcccctcttgcgctaatttaaccattttgcttatcaaaaccagattagagtctgttccaggaaaataatctgaaacgttgggcctccgtgtatacctgagtgtgcataccccgctcattatactaaggctgtcccactagccagcagaaagtacagagtgaaatatttaccccatttcatagcccttaaatctagcaggtagactcgattatttgattttgtcctctgcctaagacttccaccttggcccgagtctcatttggttgcactgcaaaaactactacctggttctgagcagcatctgtgccaattttggtttgatgtgtttatgagactgtcaagtattgatttacatcatggcataaaataattctagctatttaagtcattaacatgtaatattgtgtgactatagtttttttttttctgtggaggaattgggatggtgttttttgcagctacctagtcatcttctttggagttctagtgtcaatggggacattgaaagttattttatttgcaccaggaattctgtgtgtgaatgaattatatgaaccccattatttgttcctggctcccatattagcatgtgaatatgtgatagtttgtagcttgcactcttatgtaatagggtctttcgaaaatttcagtaaaactcgtaaagcatttgttcaaagcttctgattttgtgaaaatttcagaaattgttgtagttgtgagaagttaagttatttggtagatcaaatctgttaacattcccttggtgctaaactgttatcttgctagaagtaattcttattttctgggccatatcttttacaacagattagatactttaccagttctttttgcattgttctttctaatttattatctgggaacttactcacaggaattgaaataaaggattaccacattaaggttgagggtcagctcgtaaagcaaattttcagcaacacactggtataatctatatgtatgagaagtaccttttatttgcagtgcaaatatatctttggcaccacaatttatgttgcttgtggtgacatgtggttaacagatgactccaaaatggagtgaatgctcttcaaatagttatagagaattatcttcaaaggaaaatggagaagggaaatcatccataacagaagcagtgccttcatctacaagctattttggttcaccagctgtcaacagaatgtgttctctatctgcacaaaagaaggatggcaatgtctataaaaggaggaagatggagaaggattcaacttcccttacagcaaatgaagaatttaaagaaatgacagctcaaaactgcacttctgaagatcactcttcattactgctacctgttacttcagatgcaatggtttcaaattcaacggcacctatccttgaacatgatgagcctgctggagttccgctggtgccaagatctggtgtgaatgatagatcttcagtatctagtatgctgccacctttcatgatgtttgataaaaaggatgctactgaatgttcctcgtcaaatattggttctacagaaccaatgacaggcttcacatcggcaagggatctttgcattgccatactgagggaagatggactcataactgaatctcgaactaaaatcaaggcagaggaattgactggttatgatgccaacttactgttccaatgcaaaacttgtgggaaatcagaccatccattaaagatgcttatatgtgattcttgcgaagcagcgttccatctgtcttgttgcatccctcgtgttcatgaggtaccaactgatgaatggtattgtctgccatgcttcaggaagaaaccaaagagtcagtatggcaagctgtcagagggaaaggtcaaatcttcagggaatatcaaccaaaggcctcatggcatgagtcatatagagtacatgttaaaagataccaaaccatatgttactggggttcgaattggtatagactttcaagcagaagtgccagaatggtcttgtcctacttccaggtgtgtcatataattgcttttagtgttgacatttgcattaagaaagatggtagatatagtaaacatgcaaattttttatgacaagcttaatatctagaagcagcttttttacatggaaacaaagatgatttaacttttgtttttgttctagtcatgacaatctgaagtgctgtaagatacagtcttcctaatccatgaattgaatatgatgctaaatcatcattatgtgagattgattactatatttttgtaatgatctaatgctagttgtttatcattctgaagaggaatattttttcttattggacaaaaaaatgcttgtgattttagtctggaaactaagttgctcctttcctttgcaacatgcttttaacggtatttactagtaatattgatgtttattgctactaaaaatcatgagagttcacttaaataattgaacaaatggaagaactgccacatacctgggacaacagcaaacattttaaaaatccttatcttattcttttgaaaacattaagtaatcagggctggattgatcacttggggttgtctttgatcatgacatgtttgttggacagagactgattgtgctgttgttgcaaaaaatttggttcaccacagtttcgaactaactttgtacaatgactttgttttgatctagagaagtctttgacatgcatatgatatcaaatcatttcaaacattaagtatgttgtaacatccataatgtgccatctgcttggactaatatgaattatgaaatagttcaatcttcatgcatttatgtataagctccacatacatggttgctgttctaccttgttaatacagtgttttctcctcaaaagttaaggctttacctttttaattcttgttattaatagaattttcagttttcgcattaccatgaataataaatcgtacttagagccatagagatatagtgtattatttgttgcattactggcaccagattagtgtagcttacattctcgttatgtcagcatgtttgtcttgttattccttttcttgtagtggtgatgtttattgcgaggagccctctgaatttgattctgctgacctcactaaactgaacgtaagatttttaccttccagttaaaaccatttccagtatccccctcacaaagtttcttaagctagttccttgtttatacagtggtcaaaaactaatactcagtatagatcttcaatcggtaattggatacaatgctgtgagatcttgagtgaaggagattctgataagccagtcgtctgcggcaaatgg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