Os04g0490600

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os04g0490600

Description

Nucleotide-sugar transporter family protein

Version

NM_001059700.1 GI:115459129 GeneID:4336243

Length

6162 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0490600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:24913996..24920157

Sequence Coding Region

24915638..24915649,24915780..24915850,24916454..24916523,24916708..24916785,24916901..24917023
,24917547..24917606,24917733..24917777,24918245..24918322,24918607..24918663
,24918932..24919048,24919165..24919335

Expression

GEO Profiles:Os04g0490600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:24913996..24920157 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcagaggaacggagtgatggaatgcagtgtatgccactccaaggtggtggctccgagccccaggagtgtgtcgagggcatatgacaagcaccgcagcaagatatcgtccaagtaccgcgcgcttaacttccttcttgtgtcaggggactgcattttggttggcctccagcctattctagtatttatgtccaaggttgatgggaagtttcagttcagtcctatcagtgtcaactttttgacagaggttacaaaagttatatttgctattgtaatgctaataatccagtctagaaaacaaaaggttggggagaagccacttctgtcactttcaacctttgtacaggcagcacgtaataatgcactcttagctgttcctgctctcctatatgccatcaacaactacctaaagttcatcatgcagttatacttcagccctgcaactgtgaagatgctaagcaacctgaaggtactcgtcatagctatcctcctaaaattcataatgagaaggaaattctctataattcagtgggaagcccttgctctgttgcttattggaatcagtgtcaatcaactaagctccatacctgatggaaccaaatcttttggtcttgcagtcaccactattgcatacatatatacacttatatttgttactgtcccatcacttgcctcagtctacaatgagtatgctttgaaaagccagttcgacacaagcatctatcttcagaatttgtttctatatggttatggtgcaattttcaacttccttggcatcctggggactgtcatatttcaagggccacaatgtttctcatttgtaacaatgctgcacaaggcattctctcttcattcttctttaagtatgcagacacaattttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MQRNGVMECSVCHSKVVAPSPRSVSRAYDKHRSKISSKYRALNF LLVSGDCILVGLQPILVFMSKVDGKFQFSPISVNFLTEVTKVIFAIVMLIIQSRKQKV GEKPLLSLSTFVQAARNNALLAVPALLYAINNYLKFIMQLYFSPATVKMLSNLKVLVI AILLKFIMRRKFSIIQWEALALLLIGISVNQLSSIPDGTKSFGLAVTTIAYIYTLIFV TVPSLASVYNEYALKSQFDTSIYLQNLFLYGYGAIFNFLGILGTVIFQGPQCFSFVTM LHKAFSLHSSLSMQTQF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>4509..4520#4308..4378#3635..3704#3373..3450#3135..3257#2552..2611#2381..2425#1836..1913#1495..1551#1110..1226#823..993#aaaagagaaagaaagaaacgtgaataaaatacacgcgaagcgcacgccccgccttcgccgtcctcctgctcctctccctcttccaccttcctcccgccggaacttgacgaaatctgggaagcgagccaaggaggagggggaggagaaccccgccgccaccgcccgatctccccgtgcggcgccgggcgggggggtgcggagcgggagcctcgaccgcgccgatccggacaggggccaccagattcgccccgcgcgtgtgccggcgccgagcgcccaggcggcgttagatcccgccgcccggcccccccaccctcccccgtggtacggtcgctgatacgaggtcctctcggatctctccgtcgttcaagctcacctgtgattgtgctacttttttttttggttgttgttgtgtgtggtgctgattgtgtgatctagtatatagaagcacgcgcttgctgcatttggtcgtgatttattttggatgtttattggcgaagttagcttctagtgatctgatatggattatctagctgattgggtgatttgaagtttagtgctggtatttgtagtttacttcggttgatgctgtcggctatgatgtgttttggtgagatgggctgggtagcggtgctacacatgaatttgcgagattatgtgaatttagagagaaatgtgttcagttttcatcgattagtttgcttagttcacaaatgtatttttttgctgcaggcatgcaaagggatcagaggccacggctatagagtgatacatatatcttgctgctgtgcttttggggcctccggtcctgcttagttagaggagatgcagaggaacggagtgatggaatgcagtgtatgccactccaaggtggtggctccgagccccaggagtgtgtcgagggcatatgacaagcaccgcagcaagatatcgtccaagtaccgcgcgcttaacttccttcttgtgtcaggggactgcattttggttggcctccaggtactccactctacttgaaagtgtttgacttcaatgccaatatgctgccaaattattggacatatctgattgccaaccttttcaaaccatgctaattttttactttgtatatgcagcctattctagtatttatgtccaaggttgatgggaagtttcagttcagtcctatcagtgtcaactttttgacagaggttacaaaagttatatttgctattgtaatgctaataatccaggttagttctagctgatccgtgctttctacaagtgtttttttttaaatgttccatctcttgttagcatgcatgatccttctatgtaatatcaatgttttgcacacataatttctggaatggctaatcaaagcatttgttttgcacacataattcaccattttcagtagaccaacagtgtagtcatggatttactattggcagccttcctggctcttgtagtcttgttgttttagtatttcgccctaatgttgttatttgtgtttgacagtctagaaaacaaaaggttggggagaagccacttctgtcactttcaacctttgtacaggtgatttatcttgtcaatgctagcacagcatgcactctttgttgactgtgctcaacatgcacacagattagatatatgacttatgtttatagtgttaaccacaaattgtttttgtctatttgtttttaattccttagaagaagctcatttgtagtttttattccttaatgacttgccttcagctttcctttatttatttataactttatgcatcaaattgctctaattccagctttctagttatggcaacttatcatttgattcttgaatccttctctttttaggcagcacgtaataatgcactcttagctgttcctgctctcctatatgccatcaacaactacctaaagttcatcatgcaggtaaatgttcattgaactttatgaaatcttgttttcctgcagtgtatcagtattttatgcttatgttaaatacatgtgtttcaagggaaatacaatgctgtgaaataatgctgaaaaggagtttatagcatatgatgataagctaatgttcaaaaagatataattattcagctactagtaaactatttagaaacttttagttaatatgaatgcaaaagagatggccttaagtgtttctcaaggcctcttgaactgtttaattgtcattgcaacttgtccaatcatttgagttagttaatatgaattttaatacttatcaatgtttccaagccattgcagtaggaatctatctaatgagagaccaatgatgttttaagatttttttctagagttcggatttggagtcttccaatctgatatagcttttggtcttggttttaatttaatctgctgtactgcacatgcagttatacttcagccctgcaactgtgaagatgctaagcaacctgaaggtaccctctttcgccatttttcccatgctttattcatgtggttttgcaagatgcgagtgtgtattttccctatgtttggcaagaagcaagatttactaatatcatattcttttattcctgatcaaggtactcgtcatagctatcctcctaaaattcataatgagaaggaaattctctataattcaggtgagactgagattagtattgtggtccttttattcctgaatcttccttgtggaaaaaaaaaacacaattagccattacatgttaaactgcacagtgcatgcagtctctataattcagctaagaatttctctcatttagatgttttttcctattaggctattggtttgttattgtgaatatagtgcatgcagtttccatgttttactactgctaggattttagaaatcaataggcaccattcgcctcttttctcaaggtttttgccttgccttttgctgactatatttttgaatttttcacaaactctgttagtaccaatgcagaatcgtaactagcaatgatggttgagtagttgacacttttagatgcagtgccaaattaattaaaaatggacttgaagtctagaatggtacaacaacttaaactgaatcaaatcctagggaaaatgtagagcaattatatgttcttcaaatgtttccaacaatgctgatctatgaccctgttctttttttatggctatcagtgggaagcccttgctctgttgcttattggaatcagtgtcaatcaactaagctccatacctgatggaaccaaatcttttggtcttgcagtcaccactattgcatacatatatacacttatatttgtaagttttactcacctacatagtatcttgatctgtgtagttttcactattttttcagccacctgaacaaattttgaatcgagatgttcatatttatgttcatttgagattgtaggttactgtcccatcacttgcctcagtctacaatgagtatgctttgaaaagccagttcgacacaagcatctatcttcaggtgatttgcactaaaaaagtttgccttacaactctttcaaattacttataacacacgcatataatactgaaaacaataaactgataagatctagtcccttggtttttgatgcttacctgttcacattttttttccttgacttctctctcccttcattcacactaactcttggcacaacatgcagaatttgtttctatatggttatggtgcaattttcaacttccttggcatcctggggactgtcatatttcaaggtaagcaacttagattctaaggtgatgaatatgctgttatgcattataatgtatttcagtatttgaaagtcaacatgtggggtgacttaggcctgatggaaaatggcatgcatgcaatattctcattagtatttcaggtgttgcaaacaacagatgtggtacccgaggactcttgtgtcttttgtgttgcaaagcaaaggaaattggatgtctgtttagagcttggtatatggttgaatatgtactttgaaatcagtgcgtcttttcatcctgcaaatttttatagcgctaccagtcagaaactgaaaatcatgcactgtagcatgttttgttattatatttaaagtaccgttcaagaggggaacccatatagcctatgcatgcatcacctcttccaagcagccagacgggcattactttgtatttcgtgtttaatactctgtgtctcacaaactgtcgagttggccaaatcttactaccttccattagtgtcgtaccgtgtcttatgttttgttttggactattggctatatgtctatgatataactttgccccattgtttgcagggccagagagttttgacatccttcgaggtcattcaagggccacaatgtttctcatttgtaacaatgctgcacaaggcattctctcttcattcttctttaagtatgcaggtaaaggatggtatacctgatttactctcttacacaatcttgagtttccaattctttgtttctgtgtttcagttacatgatgttatgatttcccatgctttagtaacaattgactaaaatcgtaatgcagacacaattttgaagaagtattcatcaaccgtggccacaatatttaccggtctagcatctgctgcatttttgggacataccttgacagttaactttctcctaggcatctcaatagtgtttatttcgatgcaccaggtgattttttattgtctattctttagcctactacttattgtgtcttagttgaacatatgtaagtggctaagtgctgttcttgttcagtttttctccccactggcaaaggtcaaagatgacaaaccagctggagcattagaaccggaagatgcacagaatcataggtaaacatcgcttgtcccttgcatttatacttcatattaatgacatttgaagtgaaagtgtcatgattttatgaaatatttcagaacatctaatctcataaaacaattttgtgtggcaggtcatccgactcttcttttgtaaatatgactgctggcgctgctgatgatgtaagtgactcattgttttgttgaataaaaccaagaatgacaactttatttctcatggacttatctcttgtgctgactatgttttcaggcaagccatcttactgcaaccgatgagagaaaaccattgttgcctatttagccttctgtttgaggtgaatctcacacacttttctcatggacaaatatgttgctgtgtcatttcagtgtttgttggatgaaaatgtcactttgttacaactgtaagctatctgtcagtgaaactgcattcgcaaggaactgcttacgatcagtttctgtattactgttagcgttagttacctcagattgaaattcaaaacatgggttgggtgggtgaggggtcacctattagaaagtttagactatgatggtaggaggtgattttatagacctggttgcggcaacctgcagctgccatcagtgagactgacagagacagttgatgatttggtgttatgtactattgtcagtagcttctcttttgcttagagtagagatggatgttagagcagatgcttgtgactttgaaggcaaggagtgcataatcagttgggtgtaacatagttggaatcagagttcatcttagttatatgactactactaagattggtactatctatcactactagtaagccagttcatggttgtaaaacaacaggtactctcatgggcatggaatagaagcccttagcaccaaagaaaactatttgagagcctaggcttacagcaacccaaaactacctattttttgttgcaaacaatttctattcctgtttgttggtattacaatcaacagctttgtaagacgttcattctcaatagctctgataaactcttccatttgattctgcaggtaggtatagaagaaattctttttgccatgaatcacacagaatttatgtagcatgatgagtaaaataaacagttgtaaactatagaatgaaacgaaatattcatagctccgtttcaggttatcctattttctcttctcttttttttaccccaacatttttggggcaaacattcggatggcaagacttccgaccctatacaaatacactcatactatacaaagttccctttgttcttttggcaaaatcgatgtatgttaacgggacacaattgtactgaacattcgtaccatttatactactgaactgtttttttcct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0490600, RefSeq:Os04g0490600