Os04g0508200

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Structured Information

Gene Name	Os04g0508200
Description	Isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, eukaryotic family protein
Version	NM_001059804.1 GI:115459337 GeneID:4336353
Length	5753 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os04g0508200, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 4
Location	Chromosome 4:25788188..25793940
Sequence Coding Region	25788237..25788477,25788595..25788638,25788732..25788841,25789938..25789975,25790577..25790654 ,25791060..25791113,25791195..25791296,25791385..25791470,25791576..25791679 ,25792094..25792162,25792243..25792358,25792495..25792529,25792620..25792762 ,25792916..25793038,25793571..25793664
Expression	GEO Profiles:Os04g0508200
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008397:25788188..25793940 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008397:25788188..25793940 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgcgccacctgctgctcctgcgctgcggcatggctcctctctacggctcctcctcctccgccgccgcgaccaaagccctcctcttaaaccccgccgccgcgcacgccttcgtcccttcttcccccggaccccgcgcgctccgccgcggcggcgcctccctccgctgctatgccgccgccgccgcggcggtggccgagcagcaccgcatcaaggtccacaaccccatcgtcgagatggacggtgacgagatgacgcgggtcatttggaagatgataaaggataagctcatcttcccttacctggagctggatgtcaagtatttcgaccttgggctgctcaaccgggatgccaccgatgataaggtcactgttgagagtgccgaggctacgttggagtataatgttgctgttaagtgtgctaccattacacctgatgaaacaagagttaaagagttcaaactcaagtcaatgtggaggagcccaaatggcaccatcaggaatattctaaatggaactgttttccgggagcccatcttgtgtaaaaatgtaccacggatactttctggctggaagaagcccatttgcattggaaggcatgcatttggagaccagtatcgagctactgatacaataattaatggtccaggaaagcttaaaatggtttttgtcccagatggtgctgaacctgtggagttaaatgtttataattttaaagggcctggtgtggctttatcaatgtataatgtggatgagtctattagagcttttgctgagtcatcaatggcaatggcactttccaaaaaatggcctctttatctcagcaccaagaacacaatattgaagaaatatgatggcaggttcaaggacatcttccaggaggtatatgaagagaaatggaaggagaagttcgaggaaaactcgatatggtatgagcaccggttgattgatgacatggtggcatatgctgtgaaaagtgaaggtggatatgtttgggcttgcaaaaactatgatggagatgttcagagtgacttccttgcccaaggttttggttccttgggtttgatgtcatctgttttgttatcttctgatgggaaaacgttagaagctgaggcagctcatgggactgtcactagacatttcaggctacatcagaagggacaggagacaagtacaaatagcattgcttctatatttgcttggactcgtggactagaacatagagcaaagctggataaaaatgataggctgctggatttcacaaagaaacttgaatctgcatgtattgaaacagttgaatcggggaagatgacaaaggatcttgcactccttatccatggccccaaggtaacaagggagttctaccttaacaccgaagaattcattgacgctgtggctcagcaactgcgagaaaagattcaaataccagctgtggtttaa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MRHLLLLRCGMAPLYGSSSSAAATKALLLNPAAAHAFVPSSPGP RALRRGGASLRCYAAAAAAVAEQHRIKVHNPIVEMDGDEMTRVIWKMIKDKLIFPYLE LDVKYFDLGLLNRDATDDKVTVESAEATLEYNVAVKCATITPDETRVKEFKLKSMWRS PNGTIRNILNGTVFREPILCKNVPRILSGWKKPICIGRHAFGDQYRATDTIINGPGKL KMVFVPDGAEPVELNVYNFKGPGVALSMYNVDESIRAFAESSMAMALSKKWPLYLSTK NTILKKYDGRFKDIFQEVYEEKWKEKFEENSIWYEHRLIDDMVAYAVKSEGGYVWACK NYDGDVQSDFLAQGFGSLGLMSSVLLSSDGKTLEAEAAHGTVTRHFRLHQKGQETSTN SIASIFAWTRGLEHRAKLDKNDRLLDFTKKLESACIETVESGKMTKDLALLIHGPKVT REFYLNTEEFIDAVAQQLREKIQIPAVV</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>50..290#408..451#545..654#1751..1788#2390..2467#2873..2926#3008..3109#3198..3283#3389..3492#3907..3975#4056..4171#4308..4342#4433..4575#4729..4851#5384..5477#gcgcctcttcgacctcgtgggtgggtgtgcgggtgcgggactcggtgggatgcgccacctgctgctcctgcgctgcggcatggctcctctctacggctcctcctcctccgccgccgcgaccaaagccctcctcttaaaccccgccgccgcgcacgccttcgtcccttcttcccccggaccccgcgcgctccgccgcggcggcgcctccctccgctgctatgccgccgccgccgcggcggtggccgagcagcaccgcatcaaggtccacaaccccatcgtcgagatggacggtgcgttgttccacccccgatcccaccggcggctcgccccgcttcctcgctccttgttgtacagggctctgttgtaaacctcgctcggatgacgactctcgtgtgtgcccttttcaggtgacgagatgacgcgggtcatttggaagatgataaaggataaggtgcgggattccgcgattgcctcctcgtttttgattctattggacttttctaccttgtttgatgctctgatgacgcgacctgcttcgtgttagctcatcttcccttacctggagctggatgtcaagtatttcgaccttgggctgctcaaccgggatgccaccgatgataaggtcactgttgagagtgccgaggctacgttggagtgagtggatccattccttgctctctgttcacatctcacgatctcagttgcaaccaattcgatgcaaacccttcatgccagcatcatagtaattagcataaattgaagatgaagtacacgcgtaattcattcggaattcgtatgccagcttttggagatgtcatttggttgtcatgtaagttaagctgtcgagttcgtaaatgtgaggttcaactagtatagagatgaaattatcacttacgtagctgaatgcaagtttccatggattttagcttcctgcagcatggaggctagcacctttttcttagaaatggtcgggcaatttcaaaccaagtctttattagatccaattattattggacctacctttgatttaaactagatgaccttaaaacaggcttacatgccccggtttttgggaggaaggcttaaagtgaaatggcctgatgggctggtattcaggacaacgaggggcatgccttttaatagggtcgtcttaattagactgaaagcagttagatcatgtggagtaagttcccacagaggaattgtgcatgtagtgaagtactctcacttcagactttggagaagtttgccctgcagaagctagattttggctttactgttcctttcttctctgctattcagtgtatttcagggatgttctattctatatccagcggtaggtttcttctctccaattcaatatctagcaataggttttcaatgacatgtctatatcttttgtactctggctccttaatggtggttctctttttttctacacatatctcattgtgtgactaactaattgaaacgagtgctctgttgcactgttgttattaagtaggactactgcagctatctcctgtctgtagaccttatggtgtaagtagtgtcatccttcaccaaatgcaacttcttacggaaactgttattctaggtagatagtcctgtgtaagagtgtcaatgctttgaaagagatgatcgtaagttggtcgcaaaagttacattgaacctttttgaagtaaatctctctttggattttcttgttgcttcagtttgtattcaaattccttctttatgactttaacaggtataatgttgctgttaagtgtgctaccattacacctggtagagtcccttaaacttttgttcccatatttgattatatttccttttgcattaaggtgcacatatttcactagtatttatgttttatttttccagtgtcccttttgaatttttttttatatatatgtgcttctgtcataagcatatgatttaatttctgtacctatttctgggacattatttgttctctgaatattttcccttgtcagcttggttttgatgagttcaaaagttacattttaattttcttatgatccccactattttcatgatgcagtactagcattattttgctagagccatagtaaaaaatgttatatatgtgacaatctttgagaaaaactattccgcatacttcaaaagaaacaaattaaaggttctatactttgtaatacttatttgagttatttgagctgtcagcaaagccaactatgattagccaccttttcctgggctacgcaattctaccttaaatgaagttgatagtacctatagatatactatttctgaacttcttttggttgagtgtatgtagattgtatttttaatcttgggtactttgtttgtcttattttcctcttctctttatgcctatatgcagatgaaacaagagttaaagagttcaaactcaagtcaatgtggaggagcccaaatggcaccatcaggaatattctaaatggttaatttttcaactcttgagatgtctttgatcttttatttacttggtgaaatgattctcgaactgaattgacatgcactctgtgaattttgttagtgggataaatttaaatttctagttaatgcttataataaaattttatggggtcaaaattgagaattctggttgccttaatgttggaaattttacacacacatattttcatatgtactatacttcatcctaatgtggagtgtttaaatatacctgtagattctgacaagtagcaataacatgaaatttacttgaaatatacttattttagcacagatactgataatcctgagtagcaataatatgtcaggaactgcaacaatataaaaaatattctgtaccatgatcactaatgttcaccatgacatacaggaactgttttccgggagcccatcttgtgtaaaaatgtaccacggatactttctggtaaggaattattgaaatattgtcatgggaacaagtgactaagtgactgttttccagactaaaggtaattttcttctataggctggaagaagcccatttgcattggaaggcatgcatttggagaccagtatcgagctactgatacaataattaatggtccaggaaagcttaaaatggtttttggtgagcttcagttgacagctacttatttgtataccatctaaagctgttttgttgctcatcagtttgttcttttggtactgaaaatcagtcccagatggtgctgaacctgtggagttaaatgtttataattttaaagggcctggtgtggctttatcaatgtataatgtggatgaggtatgatagaaaatcaatgcagttcactgccttattattctcttgaaagctatgctaacttttactctctctctctctctctctctctctctctctctctcacagtctattagagcttttgctgagtcatcaatggcaatggcactttccaaaaaatggcctctttatctcagcaccaagaacacaatattgaagaaatatgatggcaggtatctgggattgccattatttccagttatttattatgtaccagtactatagtcaagcactcttttgttgccacaaggagtgccttctgacttctattgcaaagttactctcttaacctttatcctctcggtacactgcttcatacgtgtctttatgatttctctggtctcttaacaatttataaattagtatgaggggcactaaatctcattgtaaattagtggacaatagcagtgtaccgagaggataaagcactctttagtatgatggttattgtcctcggtacatatgaaaatatcaagcactctttagcatgatggttattgtccaatgatttaaaaaccatactgcagctgattatattatcataaacaagtccaatcctgacataggcagttttgatatcaccaaaggttcaaggacatcttccaggaggtatatgaagagaaatggaaggagaagttcgaggaaaactcgatatggtatgtgatattttacattaccatattttaccactaaagttcttcgtgaattccaaacaatatttggatcatgcacccaggtatgagcaccggttgattgatgacatggtggcatatgctgtgaaaagtgaaggtggatatgtttgggcttgcaaaaactatgatggagatgttcagagtgacttccttgcccaaggtttgtgctttctagttgtagctttcatgaagctgaatggtgatatttggcagtataattgctttgcagtgtggatttttctcctattcctctttctcatttgatactttttcccctcactgagcacttgtttcaggttttggttccttgggtttgatgtcatctgttttggtaggtcacacgaatccttttgctccattgtagaatctattcatctattgtgttttattggtccctaagtaaacatgctttattctgcagttatcttctgatgggaaaacgttagaagctgaggcagctcatgggactgtcactagacatttcaggctacatcagaagggacaggagacaagtacaaatagcattgcttctatatttgcttggactcgtggactagaacataggtaatcacaatagttggtgtaaatgatgaattcaatgcacaagcaagttgatctgctaggatattcccccttttgcttcttgttcataatcaatagaaaaccggtataccttttcttacccacagatgtaatgactgcccttttctttttcagagcaaagctggataaaaatgataggctgctggatttcacaaagaaacttgaatctgcatgtattgaaacagttgaatcggggaagatgaca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External Link(s)	NCBI Gene:Os04g0508200, RefSeq:Os04g0508200