Os04g0525900

From RiceWiki
Revision as of 19:56, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os04g0525900

Description

Major facilitator superfamily protein

Version

NM_001059895.1 GI:115459519 GeneID:4336451

Length

7629 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0525900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:26698580..26706208

Sequence Coding Region

26698817..26698914,26699964..26700092,26700329..26700430,26700690..26700794,26700903..26700978
,26701546..26701620,26701747..26701849,26701988..26702117,26702375..26702422
,26703379..26703484,26704093..26704212,26704642..26704770,26705055..26705133
,26705866..26705984

Expression

GEO Profiles:Os04g0525900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:26698580..26706208 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008397:26698580..26706208 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcggtcaccgtggcgcgggacgtcgaggcgggcggcctggacgccagcaccagcggggccgcggacgagaagccctcgtggttcacccctaagagattacttgtgatgttctgcctcatcaacatgctaaactatgttgaccggggtgcaatagcaagtaatggtgtgaatggtagccgccaaagttgtactggtggcacatgcacatcaggttctggaattcagggtgatttcaatctgaacaattttgaagatggtgtgctatcatcagcatttatggttgggttgttgattgcttcgcccatatttgcatcattggcaaaaatacacaatcctttcaggcttattggtgttggattattagtctggactattgcaacagctggttgtgggtgctcatttgatttctggtcaattactatatgccgcatgttagttggtgttggtgaagcatcatttataagtcttgcagctccattcattgatgataatgctccagcagcacagaaaacagcatggcttgctatgttctacatgtgtatacccactggaatagcggttggctatgtttatggtggtttggttggaaatagtctgcactggcgtgctgctttctggggagagtcgattttgatgcttccttttgttattctgggctttgtaataaagccattagagctcaaaggatttaatcacagtgtgaagacaaaagagtatggtgagatgctcaatccagagcggcaagatgagacaaagcagggtgcgtctattggagttgatggtcttgcagaaacgctaccacacaagttctccatctcaagttttgggaagaaagttctaaccgaaatcaaacactttatgaaagatataatgtttggtggaataacaattgtctgtggaatatttgggactctttcagggggtttcattcttgacaagatagactcaacaatatctaatgctttcaagcttctttctggtgcaacttttcttggagcaatattttgttttggtgccttttgtttcaagagcctttatggattcatacccttcttttcagtaggagagcttttggtctttgcaactcaggccccagtaaactatgtatgccttcattgtgtaaaaccaagtttgcggccattatcaatggctatgtcaactgttgcaatccatatatttggtgatgtgccttcttcacctcttgttgggcttcttcaggacaaaatccataactggagatcgacagctcttaccttgacatctatcctcttcattgcagctatattttggtttattggcatatttgtccgtagcgttgatcgtttcaacgaacagagtgagcatgatgtccctgccgtcgagagatcaaacctcaggccattgctcgatgaaaacgaagaggcacgggcatcttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAVTVARDVEAGGLDASTSGAADEKPSWFTPKRLLVMFCLINML NYVDRGAIASNGVNGSRQSCTGGTCTSGSGIQGDFNLNNFEDGVLSSAFMVGLLIASP IFASLAKIHNPFRLIGVGLLVWTIATAGCGCSFDFWSITICRMLVGVGEASFISLAAP FIDDNAPAAQKTAWLAMFYMCIPTGIAVGYVYGGLVGNSLHWRAAFWGESILMLPFVI LGFVIKPLELKGFNHSVKTKEYGEMLNPERQDETKQGASIGVDGLAETLPHKFSISSF GKKVLTEIKHFMKDIMFGGITIVCGIFGTLSGGFILDKIDSTISNAFKLLSGATFLGA IFCFGAFCFKSLYGFIPFFSVGELLVFATQAPVNYVCLHCVKPSLRPLSMAMSTVAIH IFGDVPSSPLVGLLQDKIHNWRSTALTLTSILFIAAIFWFIGIFVRSVDRFNEQSEHD VPAVERSNLRPLLDENEEARAS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>238..335#1385..1513#1750..1851#2111..2215#2324..2399#2967..3041#3168..3270#3409..3538#3796..3843#4800..4905#5514..5633#6063..6191#6476..6554#7287..7405#ggatcggaagaagtggcccaaggctccgacggcgcgcgagttgctgtggtggttgtgggagcccccgtcggcgacgactccgccgctcctccgcccgcggctgcagctggagcagccccggcggtgacccccggcgaggaggcggctaagcgggagtccttgttggcggcggcggcggcggcggcggctgctgagtgcaagcaggaggcagcggcggcggcgacggggttgcaggccatggcggtcaccgtggcgcgggacgtcgaggcgggcggcctggacgccagcaccagcggggccgcggacgagaagccctcgtggttcacccctaagaggtaaggtgcttagcgcgattgggctcgggatcattgattttgcgggtggaggtgggtttgaattgcttggttgcacggggtttgcgcacctcgtggactgtttgatccgaatttgggcgatttgattgttttgcttggggagttcgagttatcgtgagctcgattgctcaaacctgccgcactggtgcagatgattgcgggatatcgagtagctgatatgcgtctatatgaattggagcttttggcgatgccaatttgtagtgtgaatgtaaataggagcaggccagcggaggttgccatttagttgcttgatagcaaatcatctctgatgcgtattggctgttccattcgtgacctggagttttagaatttgtatgtttctcctcgttagttttcttttgtgtaaaatggatctgcgttaggtacaagtttggtgttggcttgatgcaattcgaggtgcatttttttggttttcagacggcatttttgtgggataagctaagttaattttcatggcattggaattggaaaggagattggtctggcctcgcgtgttgtattttggtgccgactgagctgtgcacttcaatgttggagagataagcttgagagttcatgaaatctgctacatggccccagctgatcctgtttgtacatcttctgctttcctgtgcttattatccctctggattttagctctagatctctctcatctgcgtttggacaagatggagtaggaatgatagtgtttcactgcaataattccgaactctgaagtcgaacctcgtgtaggtatcgagttcagatgaagattgtggtttcaatgcagattgctcagtacatcctgtgctcgttatgcctctgaattttactttctatttgaatttagccaatattttcatgttatgtggtattgtcttcagaacagctgtttgtgtagtcagtggacatctggtgtttgtgtatttgatagttatgttttctttattgtaattgagaactctatctatttatcccttctttgggttgattagtttatattgctgcagattacttgtgatgttctgcctcatcaacatgctaaactatgttgaccggggtgcaatagcaagtaatggtgtgaatggtagccgccaaagttgtactggtggcacatgcacatcaggttctggaattcagtaagtcccagtggaaattccatacagttttttttttagattgctgtatgtcagactcattgtatctcatggaatgagagaacagatcaggacaaacactctcattctttttaacctttttatgttgttatatatattcacactgaatttcttttttgcaataaattcattataagtcatcactgatttatcaatttttgagtttactcctgaatgcccttaccatgctgatacaggggtgatttcaatctgaacaattttgaagatggtgtgctatcatcagcatttatggttgggttgttgattgcttcgcccatatttgcatcattggcaaaaatgttagtttcctattaattccaattttcgatatgtggtacattatcctgttattggtgctcaatccacaagaagaaaatattaaagatgggcaactgcttttcaaagaacaatatatgctaatgctacagattgtcagattaaggaatatagaaacattcatacttcacgttctgctggaggctaacataggtttctgaaacatcaaaccttttatagtgtaatgttctgacgcatgatagtttgttccccttctttcagacacaatcctttcaggcttattggtgttggattattagtctggactattgcaacagctggttgtgggtgctcatttgatttctggtcaattactatatgccgcatgtaagtaccttgtcattgtgaataatcaattcatgtttcagatctgttacttaaaataaatcttactctgataatgacacgaacaattctccaattattgttacttaggttagttggtgttggtgaagcatcatttataagtcttgcagctccattcattgatgataatgctccagcagcacaggttctgtcattcttagaatgcctttacaatctttctctgcactgagctgatatattatgttcaaacaaatcttatttttacacagtattgtttctgtgctcaatatacgcttatattcttctgggaaacaatctacatcttcaggcatacaagtacaatatctatcagttaagatatatatgtttactatgtagtcaaggatacacatgattttactccagatcattgtatatttataccagatgaaccaattatcacacctgtgtaatctaggcttaatttcgaagggtcccttccagatatcctttgttaaaatgacctgtacggcacataggtatcatcagactgtgagctacaacggagcactgtaatatagcatttgtctggctagcagttctgagaactctttactggttgctaatagatgttgaatcagcattaaattgctcttgaatacatccagctagctatgcatattacttggaggttctgtttttaattgtacttgttttcatgtctagtctctagtgtcaaccaggaacttacttgctactcctatgttaccagaaaacagcatggcttgctatgttctacatgtgtatacccactggaatagcggttggctatgtttatggtggtttggtaagtcttatgctacacatgatctttcttctatttttttagttgtcaagttaagcagttttgagtaacaattgcattttcgatattaacttacctcatgccctcttctattcaaaatcacatcaggttggaaatagtctgcactggcgtgctgctttctggggagagtcgattttgatgcttccttttgttattctgggctttgtaataaagccattagagctcaaaggtgtggtttattttgtgtcacgagagtataaagcactactgtttatatagcactccattaattgttacggtatctttggttctatcatgattttattcccttctttttattctttttggcgggcgttttgtgcaacaggatttaatcacagtgtgaagacaaaagagtatggtgagatgctcaatccagagcggcaagatgagacaaagcagggtgcgtctattggagttgatggtcttgcagaaacgctaccacacaagttctccatgtaagcacctcctccctaaaatatttgttttacttcagatgttgattcacttatttaatgaccatattacttcagatatttgataaaatgagttttgattgttgatcatgtgaacataatcaaattgtggaatgtgttcacttgtttgacatagtgacatgctgtgttcgttctttaatgttaattgcaaatgctatcagctcatgcacttttaatagaaaataatattctgaacattcctcacttcaatcatgcagctcaagttttgggaagaaagttctaaccgaaatcaaacactttatgaaagatatgaaagaactgctccaagagaaagtctatgtgatcaatgtcttaggtcagatctttcatacattatgcaatttctgaacttaattctgattaagctgatctgttgtagtcccccctgtatatgtgttctgtaaatatagttgaaacaactgctttctttgctcacttcagttaagtcaatccattaaatattttttttcataagatttagtatagcatcgttaccctggatcagtagggtaatggtgttagtgtgacatgtgtatgttcaaatgtgctctctctctaaaaaaaagggaatagtagtagggtaaacaaacttgtcgtattgatcttgaggcagattcacaccaaaatcactataaattggtactaatatcctcattttgcaacataatcttgcaagaagcaattttcacaatttgaggacaatatggttttcagatggtatatcacttcaaaatgaagcttagttatagatatttcctgatcaaaacttgatgtttgagttcatactgctaaaaagagtcatatttaaattattatatctggtagattctactatttgggactggagttcatttccctgtgctgttccacaggttacatctcttacaactttgtcattggtgcctattcctactggggccctaaggctggtcaggatatctacaatatggtacctcctattcgcttactgatgcgcagggacatatgccttttacatatggctatttaaccattttttttatgcgcttacctcttttcagtggatttggttttgtagctttgcacggattttcttgcatgaaaaatcattctgtttggtgtttatatgaagctctagtgtagtgtagcatacatctaactgcagatatttggaatatctttaatacattcttgtttcattggttaacctttcttgttgaactttgtcacaccaggcgagtgcagatataatgtttggtggaataacaattgtctgtggaatatttgggactctttcagggggtttcattcttgacaagatagactcaacaatatctaatgctttcaaggtaagaggtgacttttcaaagtaattaattatctgcacttagttttggacatattatgttgaaaaagaaccagattttgtttgattaaaaatatgtttgccaattaaagattttgtaagataacatgtacttcctccgtttcatattataagactttctagcattgcccatattcatatatatgttaatgaatctaggcatacatatatgcctagattcattaacatctatatgaatgtgggcaatgctagaaagtcttataacctgaaacggaggtagtagttaccattgcctccatacgatgcaaaaaatgtatttttctttaattttagaggccatctagattctactttgaacaccaaattttgtttccatatattttaatgaagttgtagaaatgcaattttctgaaaccatttttaataactatttttttgcatccatatgttcgtagaccttttgacaaagtttatacattttgactgcaagcattctatgatgcaatatatgcaaagtatatatataagtgcggagtaatgaagtcaaaggaagttgtttcttgtgcaacttatttgcttgcttcagttcacaaaattgttttcttgcagcttctttctggtgcaacttttcttggagcaatattttgttttggtgccttttgtttcaagagcctttatggattcatacccttcttttcagtaggagagcttttggtctttgcaactcaggttggttacttctttcacttcactatttcatcaaatttcggattttattaacttgttttgtattgaaaggtctctgcatgacagcaactctggtttctgtatggttagatgccaaagaaaagtttttcagcactttattaagtactccatccgttcctttatatatggcaccagacatttcatatttaaattttgactgctcgtcttatttaaaaatatcataaagacttgaaatgatgccatattgttgaagtgttacatccctaatataagcaccaacttttgtttatcctagggtaaccatttcaaaattattagcagtcaaagtttaaacagtgctggtcaatgggaacggagggagtatatattgatttttctcatcctgatatgcatatctaattaatttcttttgattgttgtaacttgtaggccccagtaaactatgtatgccttcattgtgtaaaaccaagtttgcggccattatcaatggctatgtcaactgttgcaatccatatatttggtgatgtgccttcttcacctcttgttgggcttcttcaggtaatgttgtttgtgtttgttcacactaaatttgtaattttgaatattgaataattgtctaattgccgaatttcccatgaataaatccatttgttcattttagatgagactggcccttgtagtgcacatattatgttgcacaaatctttgtagtacatagattcttgctatgtgcgatgcgttatgacactgaaatgcatccaatacctcctaaatgacagttaatttgggtattcatcgtgttcaaagctcatggttttactgcttgaacttgttgaatgcaggacaaaatccataactggagatcgacagctcttaccttgacatctatcctcttcattgcagctatattttggtttattggtacgttctcttagcacaacaattataacgtcttgttacaggtttacaaccccgcaggcccaatttcttttctgttgtctattattccctgtaacaattgtaaatctgccactatcacatgccatatctatactcctttaaccacatccaaacagaaaaaagacagaaccaagctaatttgggaagcctaagtgctcgtggtgagttgtttgttgtgtcaaacatgtttgtaagggtgtgagtgtaagtacttctgttagttgtttggctgtattttggatgtagaggccagattttaatccattatctaaaataatatctatattcctttgaaagggtgtgctggtggtgagtggtgaatttataatcaccccaccaccaactccccaaaattctgacataccactccaaaccaaacatacccaaaattctggcatgccactccaaaccaaacataatatagaacagtagaagtcacgtatagactttggaacacacaatattgaaaccaaaaactgctaattaattctaaaattaagccaatatgtttctttaaattatgtaataacgtacagatatttttgctggtatattactaaaatgaaatttagcatagaaacatttcaggcggtttctgtcggttgtcatcgatgcggatagaagactagtagtgcgttgtggtgtggatgtaatatttctctgtttgcactgagttgagatgttgtcttgcaggcatatttgtccgtagcgttgatcgtttcaacgaacagagtgagcatgatgtccctgccgtcgagagatcaaacctcaggccattgctcgatgaaaacgaagaggcacgggcatcttagtaatctgcgcaatcattaaatccgtgtttttctcttgtagattactcttggccggattatgtccatcacgccaggaacatgtgaaatgcaaatttgcatgtgtatcggctgtacctgtaaatatagaagaaagcagaatcttttgctttgtgatttttcttttctttttgtgtacagaccacagatacaagcaacagagtatcagaactacttggtttctggtg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0525900, RefSeq:Os04g0525900