Os04g0557200

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os04g0557200

Description

Similar to Anthocyanin regulatory B protein (Fragment)

Version

NM_001060065.1 GI:115459859 GeneID:4336634

Length

9619 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0557200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:28279660..28289278

Sequence Coding Region

28279827..28279895,28279993..28280367,28280454..28281128,28284246..28284302,28284642..28284656
,28284856..28284952,28285205..28285459,28288028..28288164

Expression

GEO Profiles:Os04g0557200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcatctgctcctccagttcaggaagaacccctacagccagggacgaaccacttcaggagcctgcttgctgctgctgtgaggagcatcagttggagttatgcgatcttttggtccatttcaaccagttgcccaggagttttgacttggaatgatgggttctacaacggcgtggtaaagacgaggaagatatccaactcagcagacctcacggctggtcagctcgtcgtgcagagaagcgagcaactgagggagctttactactctctcctgtccggcgagtgcgaccaccgggcgaggaggcccattgccgcgctatcgccggaagatctcgcagacacagaatggtactacgtcgtctgcatgacctactccttccaacccggccaagggctgccaggcaaaagctatgcaagcaatgcatctgtttggctgcgcaatgctcagtctgcagatagcaaaacatttctacgctcgctattagctaagagcgcgtctattcagacaatcatctgcatccccttcacgagtggcgtgcttgagctggggaccactgatccggttttggaggacccaaagttggtaaaccgaatcgttgcatatttccaggagcttcagtttccgatatgcttagaggtactaatgagcactagcccttctccgaacgaaacggaagatgccgacatcgtgtccgaaggcctcatcactcacaacgccatcgaagaggggcagatggttgtctctgatgagtgcgtgtccaacgccaaccgcgatccaatcaccatggagatcgacgagctctacagcatctacgaggacctggacctggacatggacctggacctggacaccgtgcgctttctcgaggataatggctggcctgtgaaccccagctcttttcaactggtcccggcgtcgtcaacggaggcggtggcggcggcggcggcggctaatgatgtcgacggtgttgcgaattctcaagtgtcgtgcttcatggcttggaagagcgcgaagtcaaacgagatggctgtgccggtcgtcaccggtatagagtcacagaagttgctgaagaaagttgtggactgtggtgcacggatgagcactggtcgtggtagtagagcagcgctaactcaagagagtggcatcaagaaccatgtcatatcagagagaaggcgccgagagaagctcaatgagatgttcctgattctgaagtcaatagtcccctccatccacaaggtggacaaagcatccatccttgaagaaacgattgcctacctcaaagtgttggagaaaagggtgaaagagttggagtccagcagcgagccatcacatcagcgcgcaaccgaaacaggacagcaaaggcgctgtgagatcaccgggaaggagctggtctctgagatcggtgtcagcggcggcggcgatgcagggagagaacaccaccacgtgaatgtcaccgtcacggacaaggtggttctcctggaggtgcagtgccgatggaaggagttggtgatgacacgagtgttcgacgcgatcaagagcctctgtcttgacgttctctccgtgcaggcgtcggcaccggatggtcttcttggactgaagatacaagctaagtttgcttgttctggttcagtggcacctgggatgatcagcgaagctctccagaaagctatcggtggctag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASAPPVQEEPLQPGTNHFRSLLAAAVRSISWSYAIFWSISTSC PGVLTWNDGFYNGVVKTRKISNSADLTAGQLVVQRSEQLRELYYSLLSGECDHRARRP IAALSPEDLADTEWYYVVCMTYSFQPGQGLPGKSYASNASVWLRNAQSADSKTFLRSL LAKSASIQTIICIPFTSGVLELGTTDPVLEDPKLVNRIVAYFQELQFPICLEVLMSTS PSPNETEDADIVSEGLITHNAIEEGQMVVSDECVSNANRDPITMEIDELYSIYEDLDL DMDLDLDTVRFLEDNGWPVNPSSFQLVPASSTEAVAAAAAANDVDGVANSQVSCFMAW KSAKSNEMAVPVVTGIESQKLLKKVVDCGARMSTGRGSRAALTQESGIKNHVISERRR REKLNEMFLILKSIVPSIHKVDKASILEETIAYLKVLEKRVKELESSSEPSHQRATET GQQRRCEITGKELVSEIGVSGGGDAGREHHHVNVTVTDKVVLLEVQCRWKELVMTRVF DAIKSLCLDVLSVQASAPDGLLGLKIQAKFACSGSVAPGMISEALQKAIGG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9384..9452#8912..9286#8151..8825#4977..5033#4623..4637#4327..4423#3820..4074#1115..1251#gggttgcagaagagtgaacttggatagttggcagctagagcagccagctagctagctggagtccttcttgcattggtgggcagactggaaagagtaagctagcgttaattttccctttgtttttctccgtctatatgcatgggttatcttaaattgcaggttatttctttaatttgtccattccagtaccttcagcagcttgttcttgttcttcgtgatcaacaagagatcgaacagcaagctagcatagcagtctaccagctaacttacaggctatctcgcggtctcgccatgttttgtagatcagctttagtgcaaaactacagattataaggtacttgattaattaattacatgtagagcttaccgctagcctaagctagctagctagctatacgaaacaattagggataaccatatactacgcttgatatatatgactgtaacttgtgaattaattcgtaacctccttcattctacgcttcttttgcttgtacgtactgacagtggcagagccaaaatttactgaaggttagagctaaactatatctcaattgatgggttgttagattttatctaaaatttacattatgatttaaagagatataaacttaattttagagataagactactttagacctgcataagcccctgcgtacatgacagtatcatcaccatatgtttgtcatcttctttccttattttgcacatacatacgcccatctcacaaacgaaaaataatttgtgaataaatttttatatacgtattcttagcctaaaagccaaggctgaaaaataaacttcgatatgaaaaatcctgaaattaactctaaatttaaggttgaaaattcaaattttaattgataagtatatgtataaacacttattttgggacagatgcattatatacaggacattaaacagctactataagtttctacttctagtgtggtgatggctgtgccctaggcctgcattcgcccctccgtactgatgacagtgtcattaccatatgcttgtcagctttatctgcttgtctgattctttccttgattttgcgcacacctatgcaggaaattaaacagctagataggtttctagacttgtgtggtgatggcatctgctcctccagttcaggaagaacccctacagccagggacgaaccacttcaggagcctgcttgctgctgctgtgaggagcatcagttggagttatgcgatcttttggtccatttcaaccagttgcccagggtaataattagttcaatacgaatgcagttgcttggtgatattgttcacaaatataaaagattatggtattttaatttatccataaatataaaagatttgttatcctgagacataattttgtactattttatttcatacctatcaacttttgtactaatttgttcctcacctaccatagtttatatgtactccctcaatcccaatttaatcattccctaagcaaaaagcaccaaaactaaggacatcaaaatatgcatcattctcaaattaatcattacagttaattacagttaaggtgtttcatcgcttcatgtcccgtggattcccatgttttaaatattacatgtcattgcaccaatataaattaatcttggttggttgcatacaacacatttaatgatgtgcatttactgtttgcataagttcatttcataaaaaactatttgcataaataaacgaaaagacacttgttagatgatgatcattttgggaagacctcaaaaattttaagctgggatggaaggagtactactttattctcccgtataccactatgacgtgacattttgttatttccttaattctttacttaaaaatattataatcccttatatttatgaaggaaggtagtaactagttgtagaccagtggcgcaggtaaggagaaaaaaagtacggaccatagacaagtgctagagtgattactcaagaagaacaaagagaaaaacaacatattctcaattgcatgatattattggaacacaagaaggtcaaaattcgacagggcaacaaccacgattcattggcaaaagcacataaaagtacgaatgaaaaaataattcaacaaaacaggaagcaatgacgaatgttgatcaattattcaatttgatgctaaatcgacaaaattcccaatgtccttgagcctttccctttcctcttctatcagcttctcagttatcaaatctcgaaataaaaaacggcaaaggatcacaaattcacaattacaaatgagagaagtgtaggatcgaatcacaacaactaagccaaccagaggggggtgaatgattggtatacccaaaaaccgaaaaccgatcggtctgaccggagtagactagccagtctgaccgaagcgtagccgccggtctgaccagtgttgatattccggtctaaccgccaaaacttgtcgctgcctcctgttgccgacgctggtttgaccgtcgtgtgcccaccggtatgaccgccgcgatgccgccgatctgaccgccgtgtttttgattttacaagaagcacccaaccttcaactgaagtccgcctgcctccgatggtccaatctacaacctgcatgccttgtcagcactttgcctccctggctggcactgcccaacaggggaccctaatcggtgactaggcatgcgcccctccccttgcgtgacgctcccccctctagtccattactgttccttcatttgtttactgctagctaaatggccaaatgttccttgtaataaatgggtggtgctagagccttaacacccagagccttgcatgctaatgtatggaagtggatgctcattctaaagcaacataacaacaataccttatcataggcatctgtcttcacaatggactcatgaaagaaatctggcaatcctagaattggtgcttgtaccaaagccaacttaacgtaattaaaagtttgttgcaatgattcaatccatttatacttaacatcttttttgaccaactctgtcaagggtttgatgaccactccgtagtttttcatgaactttatgtagtaagcaaccaacccttagaatccacttagttgtttgaggttgttggcactgacgaattttgcacaaccttgattttctatggatctatagccactgcattgacaccaattatatgccttgttaaacagtttgtactgctataagatagcaaaaacttcctttaggtgttgcacgtgctcctcaaggttttcgctgtaattgaatatgtcatccacaaatagatagaagcacacattttcctattagggtagtaaagatagtattcatgaggccctgcaaagtggttgaagcattagtcaggccaaatggcttcaccctaaattcataaaggccttggcgtcttttaaaagttgttttgtgctcatcttggtttaacaacctgatctggtgataaccatacctgggatcaagcttagtaaaccattgtgcactagccagctcatcaaggacttaatctattacctatatggggaaatatccaatgaaaaccatcaaataaataaaaaccgataaaaactggacctatgagctttctaaattcatctaaaaaaatagagacggatgtaggcatgaactatattaattgccactgaatttttaagtaatttgttttatgaatttagaaaacttttaatccgatttttacccttttttcacttatttgattttatttacctgatattcccttacttacataatatacgttccgttagatattatctcccagtatttatatactaaattatataatacctaaaaaatattacctgtagagttttgacttggaatgatgggttctacaacggcgtggtaaagacgaggaagatatccaactcagcagacctcacggctggtcagctcgtcgtgcagagaagcgagcaactgagggagctttactactctctcctgtccggcgagtgcgaccaccgggcgaggaggcccattgccgcgctatcgccggaagatctcgcagacacagaatggtactacgtcgtctgcatgacctactccttccaacccggccaagggtgagtatttcatctgctagcttgatgccaatacacacatacgagatgatctgttgatcgatctgtgcctatacacatgactgatcaaacttgtcggttgatctgctagcttgatagcaactccaataataggagaaaacaaaagctgggtaaaccagcctggaaatgtctctcatgacatcttaataacaagatatacattgctgtactgtagtgttgttattgatctgctggggtacattctgtctgcaggctgccaggcaaaagctatgcaagcaatgcatctgtttggctgcgcaatgctcagtctgcagatagcaaaacatttctacgctcgctattagctaaggtacctatatatttccatgctgtgctgctcgatcatggcatgtcaaccatgatgccttcaaacaaagataatgttcatgcattatatatcctccatataatcatcatatttaattatttactccatatataatgtcatgatctgactcgatcgcacgctctccatgcatgcaccaatataatgtcgtcgaatgctgcagagcgcgtctattcaggtatatatgtaggtagagttgtacatagtactccctccttccaaaagtctaagtcatatttcattctttggttttttttaaaagtctaagttctatttgtagtcactatgtgctatattaatttttttatcgaaacccaaaaaatcattttagtacttattggttgcatatttattagttttatcacatagtgaaagagttaactatacattagtcttaatgaaaaagaaataggatttaaacttttagaaggaggaagta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External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0557200, RefSeq:Os04g0557200