Os04g0599650
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0599650 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001187149.1 GI:297723428 GeneID:9266263 |
| Length |
8273 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0599650, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:30653563..30661835 |
| Sequence Coding Region |
30653563..30653612,30653847..30654350,30655784..30656984,30657131..30657487,30657775..30658012 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:30653563..30661835 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MYTDEYLDKCRRVKTEGKLEVPVIWDAEHDIIRYRKVLEVDAQE DHDHVDISYAMENSKVSESFLLMKFYSLSSGVAKHLLTATDGSEIDIPFELTDEEQAI IRFPLTSFILGRSGTGKTTVLTMKLIQIWQQSLIASRGLNLDERNSTAQKDLSEVETF VKQVLITVSPKLGSAIRNQICKLTRYGSGDVSDQASILQMPDMVDDLEDFTDIPDSFI GLPCEHYPLTITFRKFLMMLDGTCKTSFFGTFCGELRSSTERGYSKSRALQAFIEMKE VTYEKFSASYWPHFNSELTKKLDASTVFTEIISHIKGGYQANKPFGGKLERLDYLKLS EKRFSSLNSQMRERVYDIFLDYESMKCTAREFDLSDFVNSLHRNLLSEGYNGDIVDCI YIDEVQDLTMTQIALLKYVCRNFEEGFVFAGDTAQTIARGIDFRFEDIRSLFYTYFLP EMEPCGQGINHGKQLRITDMFQLTQNFRTHCGILRLAHSIMSLLYYFFPSCVDKLNPE IGLVYGEAPVLLESGNDENAIMTIFGESKSDPGNLQGFGAEQVILVRDDATKKQVVDL VGKQALVLTIVECKGLEFQDVLLYNFFSSSPLRNKWRVVYDYMKGKNVIESSEEMSHS FFDKNKHYLLCSELKQLYVAITRTRQRLWICENADDNCRPMFDYWKKLCLVEVRVLDS SLIEAMQAGSSTEEDWRQRGTKLFAEGQYEMATMCFEKAGDAYREKLARAAGLLATAD RVISTNFEMGQSSLQKASEIFESIGKHEKAATCYMKLGDYKKAGMVYMEKCGNSRLKD AGDCFELSACWSLAADAYFRAKCYAKCLSMCSKGKLFQKGLLLLQQLEEHLLENSSLV KVAAIRNTFLEDCALHYFECGDIKHMMPFVKSFSSMDHIRVFLNSKNLVDELLSVEMD MGNFVEAAGIAKHTGNILLEADLLEKAGFLENATQLILLQLFVNSLWASHSTGWPPKR FAEKEQLLAKAKEMSRNVSESFYCLVCSEADALSDEHKSLASITYNLIEGNKCGNLLV ELIASRLILDVHLQAEASGYCFESEPGSHDGRHCKDMLVLNQISLETLVYDWNYWSSI IVKVLRHLDHPKDAESNDLAAICEDLCAKYFGWRKDGDYDRYVVLNTDSSWLSNTGRN YLQQDGRRCWLDTLHCHSCAKDFWINELYSVGLSVLKKLESIVQILPTSSCSLGRTIL VIYEIAKFLKESEFGMPKNTIKYYSILCERRFFELVFLVWRDETPKSLLCILDSATTY NLLSDSICSYLGSRNNKMTHSQVGRITMLLLHAARLDDSLISQLVEYLDRGSEWATFF LSLKKYLDNGVSRDILLLDFKFALDCTYKANWRAEHYISPICYVDLIECLGFLATTHL VLNDYMFCTKSLLAKMMKCRTTKGYFETCMAPSTDIDLGYAGHSARCFIYLSVKDLLG SKRMIVEWVQNTSTPTSSYVPILLRLVITLYLVTVNQDDGDLYEVTAFLEKNHVFTDL PPEFSEKIRNALRMKSRTVKNFMRVFADALAAIGTRMVVMGDIKKAMAHKCQPDLNAD MISSVDLSDAKKVMALLSTEKSSSLKQEPQLPEIKSVCNKICNATSGHFPLTSVGGSQ KSTSNFNLSDVDHPLLEKFEAFQVNMPQKKNGSLISQILRSPLSWIEQRAPPVQMLEL RHICKQVEEQHVREKRALSVKDLHSNREHGDGEKNIGKIVDVQGSQSNPDRASEWSGC SDDEQETGGSNVVQSTKEAPAAASSGPSSKNKPQKKKKSKKSKRSGRK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..50#285..788#2222..3422#3569..3925#4213..4450#5038..7604#7686..7810#7991..8273#atgtacacggatgagtacctcgataagtgcagaagagtaaagactgaggggtatgtgcttttttgttctgccagtgtttatattcaggctctgtggatatcttttccttttgatgctctataaacagtgtaatctggtatcctcagaaaaaaatcactaatcttattgacttaatatatttaatgaatgaaatgtgcctgtacatgtcaaggattcttgatgcttgcaaatgaactaaatataatgtgtcttattttgtgcttcatttttattgtggatactaggaaactggaagtgcctgttatttgggatgccgagcatgatattattcgctatcggaaggttctggaagttgatgctcaggaagaccatgatcatgtggacatatcatatgctatggagaattcaaaagtcagtgaaagcttcttgctaatgaagttctactctctatcatctggtgtggcaaaacatttgctaacagctactgatggatcagaaattgatattccctttgaactgactgatgaagagcaggcgattattcgattcccactcactagttttatacttggaaggtcaggcactggtaaaacaactgtgctcacaatgaagctgattcaaatatggcaacagtctttgattgcatcacgtgggctaaatttggatgaaagaaatagtacagcacagaaggatttgagtgaagtagaaacttttgttaaacaagtcttgatcactgtaagcccaaagctaggttcagctataaggaatcagatttgcaagcttacaaggtaagtatctttgaactggagtctcatgggataattttttttttggggtatgcttcaaagtttttttttccctttttccaaacctgtaataacatgtactattgattaccagtgtgctcgttttataaagctatacgcaatgggatgagtagaaacaaacttataagctaaaccaaaactatgcttaacagattgcaagccacttcaaaatctttcttaatgtgcactctttgaatttactctgttctttttttctttttgggaatacacaagaattgtacataagagaaaaagggaaattcaccacaaacaacagatttactgcacacacaaaagggcatctagcagaacacttgggttataactatttcatgttccagctttagctctaactatgctgtcagactactagccgatgcattcttgcgccagcagcagaccactgctttgcttctgttatttatccttctgaatttttggttatggtccttctaaatgattccctccttttaagtactcttttaaagtaaaagtgatatttttaagcaaattacatctacaaatgataggttatactgtattctccaaaagaaatgaaggtgctccctttagttaagatattgaaaggaaataccagtgaaagcatagaagccatataacttttttatttttgtcctgcaatcttgatcggttttcttgcatctagcctaaccactgtggagcaagcgatcatgggtagatctgtgaatgcgttttcttccgttaggaaaaaaaatgcaacaagctattagtgctagacttgaacttcagatggtcaaaaattctaaccatttttttgtgatgtgcacccccatcaggattttaggaaggatgtcaaaagagtaagaatctagaccgcttccaaaatttgagaacagaatatattggatcactaaaaaaattctctgaattaattaaaacctataaaatttgtctgctttagaacctataaaattttcttttaaaggtatacttctgcaaattcccttttcttctgtttatttagagtgcattgtactccctccattccataatataaggcacaactactttttaaagttgtttcataatgtttcataatataaggcgtgcatgcatgcatgtcattaactagcacatcttttccactaaatgttattatttaaatcctctaccattaagatctctaattttattggatgcatgtattctatttattaggataatccaaactatgaggtgataataattatttcttggtctttgggttaagggtggttgtgccttatattttggaatggagggagtattttttttactgtctccactaattaaaaaaaatgtgctttttttagcttgttagttatgtaaaccgtgctccttcactaaggttatgttatttcaaccatctgtagatatggttctggtgacgtctctgatcaggctagcattcttcaaatgcctgacatggttgatgatcttgaagacttcactgacatacccgatagttttattggtcttccttgtgagcactatcctcttactatcacgtttcggaagtttctgatgatgcttgatggaacatgcaaaacttcattctttggtaccttttgtggtgaactaaggtcttccacggagagagggtattcaaaatctcgagccctgcaagcttttattgaaatgaaggaagtaacatatgaaaaattttctgcttcctattggccgcattttaactctgaactgacaaagaaacttgatgcgtccactgtcttcactgaaataatttctcatataaagggtggatatcaagcgaacaaaccttttggtggcaaacttgaaaggcttgattatttaaagctttctgagaagagattttcgtctctgaacagtcagatgagagaaagggtatatgatatttttcttgattacgaaagtatgaaatgcacagccagggaatttgacttgtcagattttgttaacagtcttcacagaaaccttctttctgagggctacaatggtgatattgtggattgtatttacatagatgaggtgcaggatcttacaatgacacagatagcactgctcaagtatgtctgcaggaacttcgaggagggctttgtttttgctggtgacacagcacagacgatagcaagaggcattgattttaggtttgaagatattcgctcactcttctatacctatttccttccagaaatggagccatgtggtcaagggattaatcatggaaaacagcttcgtatcacggatatgttccagcttacccaaaattttcgcacacactgtggaatccttcgtttggctcacagtatcatgagtcttctgtactactttttcccgtcatgtgttgacaaacttaacccagagattgggcttgtatatggagaagcacctgtgctgcttgaatctggtaatgatgagaacgcaattatgactatctttggagaaagcaagagtgaccctggtaacttgcaagggtttggtgccgaacaagttatattagttcgtgatgatgcaaccaagaaacaggttgttgaccttgttggtaaacaagctcttgttttgacaattgttgaatgtaagggccttgagttccaggtatgagccttaccacttaaatttcaattgtggttgttgataagcatttttcctgtttactgtaagaagccttttaggactgaattatgttgtattaaataaatttctaggatacttatttatttttaaaatatcattttgtgtaggacgtgctgctgtacaatttctttagctcatcacctttaagaaataaatggagagttgtgtatgactacatgaaaggcaaaaatgttatagaatcatctgaagagatgtcccactcttttttcgacaaaaacaagcattatcttctctgttcagagttgaagcagctctatgttgcaattacacgaactaggcaaaggctgtggatatgtgagaatgcagatgataactgccgaccgatgtttgactactggaagaagttgtgccttgttgaagttagagtacttgattcttcactcattgaagcaatgcaggcaggaagcagcacagaagaagattggaggcaacggggtaccaaggttagtgtaatactctccgtccaaaaattcaaggcatgcatgtatttcaaaacgttgacatttacaacttttgtctaatactcgtttccatcatgtttggtcatgttgaatacagtacattagtccattcatcatgctatctgttttgtcaaggttttagtcatgttgattgtttggccctttcttttagacaattgatatgtggacttatgttttttcagttttagctcttctttccagcaccgttgttgagctacttataacacatgcacattctttccttgtagctattcgctgaggggcaatatgaaatggctacgatgtgctttgaaaaggcaggtgatgcttacagagaaaagttagcaagagctgctggacttctagcaactgctgaccgtgtcatctctacaaactttgagatgggccagtcttcattgcaaaaagcttcagaaatctttgagtctattggcaagcatgagaaagctgctacttgctatatgaaattaggtgactacaaaaaagcaggtatgatgactgtcttaaattgttatatggttgtgtattacattttttatgtcttcacctttccatcttgttttaacaaatggcaagtttctcagaaaggttttccccaaaagtaaatgattcttcctcagcgaatttctgcttccagattttttttgtaacatttttttcctggtagtatcatactccctccattccaaattgatctacatatttcataggtacaccaagaccaagaaaagctaataactctctcatactatatttactatagcaacaaactcgatgcatgttccatccccactatttcctagccaatagcaaatcaagatattgcatgtgggttataaatacttgtgtgcatggatgcatgcatcaatgtccatttactccaatgcacaaataacgaatagacttaataaatgaatacaaatatgatgatcatttaggaataa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