Os04g0643300
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0643300 |
|---|---|
| Description |
Similar to 3-ketoacyl carrier protein synthase III |
| Version |
NM_001060585.1 GI:115460899 GeneID:4337178 |
| Length |
5023 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0643300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:33139969..33144991 |
| Sequence Coding Region |
33140205..33140419,33141269..33141417,33141979..33142115,33143381..33143483,33143584..33143702 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:33139969..33144991 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtcaccgcctccggcctcgcgccaccgcggctggcggtctcctgcccgcgtgcggcggggcgcggctgcggcggacaccaccgggttggcttcctccgatccgctcccgtggcgttggcggggcccgcggccgcgcagctccggtgctgcgcctccaccgtcgacgacggcgtcgtctccgccgcggcggcccccaagccccgcctccccagggtcgtcggtatgggttcaaaactcattggatgcggatcggccactccatcgcttagcgtttcaaatgatgacctttctaaaatagttgaaacatcagatgaatggatcgcagcacggactgggattcggaataggcgagttctttcaggaaatgagacactgcgcgagctttcagtacaggcagcaaaaaaagctcttgagatggctcaagtaaatgctgatgatgttgaccttgttctcctttgcacgtctaccccagatgatctgtttggaggtgctgctcaggtgctggcggaggtgggatgcgcaaatgcatttggctttgatatcactgctgcatgtagtgggtttattattggtttaattacggctactcgttttatcaaaggtggaggcatccggaatattctagtaattggtgccgatgctctttcacaatttgtggattggacagacagaggtacatgcatcctctttggtgatgctgctggtgctgttttggttcaggcatgcagtgctgatgaagatggcttgctaggtttttgcgttcaaagtgatggcaacggacaaaagcacttaaattgtgtctcgtcgcatgttgagtctatcctgtcgaagaccaatggtgtccctagcttcccacctaaaaaggcaaccttctccaacattgaaatgaatggaaaggaggtttttcgctttgctgtgcgatgtgtgccacaatctattgagaaggcattggaagaggctggtttacctgcttccagtattgattggttgttgctgcatcaagctaatcagcggattattgatgctgctgccagtaggttggatatcccatctgacaaagttatttcaaatcttgctaattacggaaacaccagtgcggcctcaattccattagcattagatgaggctgttcgagctggcaaggtgaaggcaggcgatgttattgcagcatcaggttttggtgctggacttacatggggttcagctattgtcaaatggtgctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVTASGLAPPRLAVSCPRAAGRGCGGHHRVGFLRSAPVALAGPA AAQLRCCASTVDDGVVSAAAAPKPRLPRVVGMGSKLIGCGSATPSLSVSNDDLSKIVE TSDEWIAARTGIRNRRVLSGNETLRELSVQAAKKALEMAQVNADDVDLVLLCTSTPDD LFGGAAQVLAEVGCANAFGFDITAACSGFIIGLITATRFIKGGGIRNILVIGADALSQ FVDWTDRGTCILFGDAAGAVLVQACSADEDGLLGFCVQSDGNGQKHLNCVSSHVESIL SKTNGVPSFPPKKATFSNIEMNGKEVFRFAVRCVPQSIEKALEEAGLPASSIDWLLLH QANQRIIDAAASRLDIPSDKVISNLANYGNTSAASIPLALDEAVRAGKVKAGDVIAAS GFGAGLTWGSAIVKWC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>237..451#1301..1449#2011..2147#3413..3515#3616..3734#3937..4001#4081..4297#4368..4589#cagacatcaccccgcccaccgttcccatcccccccgccgtcctctcccccgcccgcgcctatatcatcttctcccccccacccctcgcgtacagcaacgcatgccccccctcctcccctcccctcccgctcgccgccattgaccgagtgattcgctgcctcgctcgcgaactcctaccccgcccgagcccgagcccaggccgcggccgccgcgagatctccggctgcttttcaggtatggtcaccgcctccggcctcgcgccaccgcggctggcggtctcctgcccgcgtgcggcggggcgcggctgcggcggacaccaccgggttggcttcctccgatccgctcccgtggcgttggcggggcccgcggccgcgcagctccggtgctgcgcctccaccgtcgacgacggcgtcgtctccgccgcggcggcccccaagccccgcctccccaggtaaacccccgcggtgcctctgtgccggtgtgccccacgcgtgggcgcgtggctcgtggtccagtggttaagcactttggctgcgagatgtggctggttgtgtaaaagttaaagagatcctacagtccgttcacctcgcgcagaaggtaccatttgcgtgttgttcgatcgcgaacggtgttaccattaatgtgatttttgtgcgtactgcggggctttcccctggtttctgtaagaatggtgcgatttttcagttggcatgctgttgatttagcctgggttttgacttaaatcacgcatgctgctcaatgtgctttggttgttcagtggtagagggttttaggtgggaaatttgccgttgcctgtgatgattgttcatttattaggttggtcggatcggagtgccaccgggactttccttataatcttgtactaggggtttatgtgggcttcttattgtcgaaatgcactagttttatgtagtcagattgctataactgctcagaatctctgatattttgatactccattgagatattttgataccccattgctgatgtgaatttgcctcaactcgtttattgttactatgtgtgaccggaataggccgtttccgtgtatagcggaagaatggtacctcatggttcctcttattatagaccagcattgtcattaaatgtggtggcaaatgatgcagttgatgtacctttcactgtattgcagcactattgctatggttggtccaacagcactggttggacttactcgttgatctgcactttttttgttaaggagtctaaattattttcgactgtggaatgaactcataaaattaatgggaacctgtagggtcgtcggtatgggttcaaaactcattggatgcggatcggccactccatcgcttagcgtttcaaatgatgacctttctaaaatagttgaaacatcagatgaatggatcgcagcacggactgggattcggaataggcgagttctttcaggtacttctagttcaccttattccatcgagtttcatgacaagttagtttcattagcgtcagttgtgcctcctctatgtggatgcataataaatatttgtggcacatcatcatagttgattggtacatcacaccaccattgatgattgaagtatttttacatcgtggacttgttgattctatgaagaatgttgatagattatagatgaacatatgttctgctacaaggcatttttgtgtctatggtctaggcttaacagcatcattcagataccatggctcacagactatgtacgaagatagataagagtgaattttgataatttgctgttaccaaagtaaaactccagtaaacatgtatcttgttactgttccaagattgtatataaacagcgtggcacttttcacatatttattctagttatctttaatacaatagatgtgaaccacaccattgaaagttggtcttttgtgttgtgaacgtattatgatcaatagctattcaggtgtgcagcgtgcttcatttgtttattctcaggagtaatttatagttttcatgtttaggaaatgagacactgcgcgagctttcagtacaggcagcaaaaaaagctcttgagatggctcaagtaaatgctgatgatgttgaccttgttctcctttgcacgtctaccccagatgatctgtttggaggtgctgctcaggtatggctagaaatatgcattagcattgtactatattgtagtagttatcgttcacatgttttcttactactacttactaaaaatattaagagaaagtaattatctctcaacctaatatatgtcttcaaagatcagaattgcatgacattcccaattgcaagtaagaatattagtatgttagatgtaaattatgttatgttctgtaaagtaatgatattggccccaatcccatggaccatggtcttgtgtgtatttacttcttaattagttttacatgtatgccacctgtgggtattgtgcgagttactgcttattcctggttttgattaaagtcatctcattcttgataatctacatctgtttgtattttaatgtatagcataactagagtggaatggggttttctttagcgttaggtttattcaatgaattgttgttcaactccagttgctagtatatatttcatgttggagattgacacttttatatttactccctgaccactagtttttctattatgagtctttttatccttaggagacattgagtggtagaggtatattctactgttaatcacgatgtatgtactcccaaggaataggaccataaaaatatctcctgttacactcccatctgttgacttgttttctctgttttagacaaacatcttaaattttgacctctaatatgtaacaaacaattgagattgatcatgtgaaatggtagcatagaagtttttttgtgggaaagattcaaaatattattaaatttatacatagctattaaaatgttacgacaacaaggtgttggagatcacgatagtatccaaaacatcatatattcttgaatagaggagtattatgttgttatacatgaaggtaagtatatattacgaaagtgtgtttcatattatatcctgcaatacacacttgaccaatctcgataatttttgacatactgatggtcaaactaaaatgtttggttgcacatttgtattacttcctatatgtagcatcagatggagtagctataaaataatatatacacaataacacaatgaatccggtctttgtatctttcttatttccttctatgttttcttgcctgtttagtattttaatcgctttgaactacatctaccagtaaaactataaattcccatcataaatgtatattgatttattaacttgactgctctcttatgttcttttaaaaaaagatgtgcacaattttgcattaaaaacatctggtaaaaatataaacaggtgctggcggaggtgggatgcgcaaatgcatttggctttgatatcactgctgcatgtagtgggtttattattggtttaattacggctactcgttttatcaaaggtaactcttttttttttccttgtgaggattgttggctatcaaacactcacaggaggttgttgttgtcaccttgttcgattaatatatgacaatttcgtaggtggaggcatccggaatattctagtaattggtgccgatgctctttcacaatttgtggattggacagacagaggtacatgcatcctctttggtgatgctgctggtgctgttttggttcaggtatttgttacttttgctgaaatatcgatatgctttccactatccaccaaattattactccgtactaagtatgagcgtcccatgcttaagttggttttcatagaccattgttgggcaaacatgataatttatatattgcaactgtatagtggtacgcattgtacacaatcttttgcaagttatttaattcacagtttttcaggcatgcagtgctgatgaagatggcttgctaggtttttgcgttcaaagtgatggcaacggacaaaagtgtgacttcttttaatatttaactgagatcacatttctgctaccatgtcttattaatttctctgtttacctattttaggcacttaaattgtgtctcgtcgcatgttgagtctatcctgtcgaagaccaatggtgtccctagcttcccacctaaaaaggcaaccttctccaacattgaaatgaatggaaaggaggtttttcgctttgctgtgcgatgtgtgccacaatctattgagaaggcattggaagaggctggtttacctgcttccagtattgattggttgttgctgcatcaagtgagtatctttatatcgatgaatttactttgaccggaagcatcaatctaattgacctgccattttacaggctaatcagcggattattgatgctgctgccagtaggttggatatcccatctgacaaagttatttcaaatcttgctaattacggaaacaccagtgcggcctcaattccattagcattagatgaggctgttcgagctggcaaggtgaaggcaggcgatgttattgcagcatcaggttttggtgctggacttacatggggttcagctattgtcaaatggtgctaatcattccgcgcggtaaacatttgcaacaaccaaacaccgttccgagatttcatgtacgtggcctaggtttaagtcttccagggtcatttgccctttccctgtccgacattgttttttgggttaaatctccgtcattttgcttgcacatgaaacagtggtgcgtccttattcatatattcctttggctcgttacacagcttggctgtcagtgtggtaacaagtctggattgtactactagctctttgtagttcaagcgatgcgtagaaatatttaaatccgggattgaacttagctggccttgagggaatattaatattgtaaagttactgggccttcttaacagggtgcgccctgaaaaattttaattgaactgtggtcagcgttctggcactgataataagcatgtaagaaagtgatggatgtttgttgtagg</dnaseqindica> |
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