Os05g0115900
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0115900 |
|---|---|
| Description |
Glycoside hydrolase, family 20 protein |
| Version |
NM_001061003.1 GI:115461736 GeneID:4337620 |
| Length |
5790 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0115900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:843050..848839 |
| Sequence Coding Region |
843272..843447,843567..843817,843932..843991,844094..844192,844280..844313 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:843050..848839 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:843050..848839 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccccccaaactcctcacttatctcatcctagccctcctcgccgcctccgccgccgcagcgcggcgccacccgtctccggcgagctcagccgccgccggggagcccgtctacctatggccgctgccgaggaacttcacctcgggttcccggaccctgctggtcgaccctgacctcgcgctcgacggccagggccccggcggcgccgccgcggcggtggccgaggcgttcgagaggtacagatcgctcgtcttctctccatgggcgcacgccgcgcgcaacgcctcgggtgggtacgacgtcgggaagctcaccgtcgtcgtcgcctccgccgatgagaagctggagcttggagtggacgagagctacacgatctatgtcgcggcggcgggcggcgtcaattcgatcgtgggtggagcaaccatagaggctaacaccatatatggagctattcgtggattagagacattcagtcaattgtgtgttttcaactacgataccaaaaatgtcgaagtgcgtcatgccccatggtacattgaagacgaaccacgctttgcttttcgtgggttgctccttgacacatcaaggcatttcctcccagtagatgtgattaaacaagtgattgactccatgtcattttctaagctgaatgttcttcattggcatatcatcgacgagcaatcttttccattagaagtaccatcatatccaaaactatggaagggttcatattcaaaattggagcgctacactgtggaagatgcacgtgatattgtcagctatgctaggaaaagaggtatccatgtcatggctgaaattgacgtgcctggccatgcagaatcatggggaaagggatatccaaagctctggccttctcctaagtgcagagaaccgttagatgttactagcaatttcacatttgaagttatttctggaattttgtctgatatgagaaaaatctttccatttgggctcttccacttgggtggtgatgaagtatatacaggttgctggaatgcaacaccccatgtgaaacagtggcttcatgaacgcaacatgactacaaaagatgcttacaaatacttcgtcctgaaggctcaagagatagcaattaaccttaattggattccagtaaattgggaagaaaccttcaactcattcaaagaaaatctcaatcctctaaccgtggtgcataactggctgggtcctggagtctgccctaaagttgttgaaaagggtttcagatgtataatgagtaaccaaggtgtatggtaccttgatcatcttgatgttccctggcaagatttctacactagtgagccactcgctggaattaataacacagcacagcaaaagcttgtacttggtggagaggtttgcatgtggggtgagacagcagacacctctgatgttcagcaaacgatatggccacgagcagctgcagcagcagagcgtatgtggagtcagttagaggccatatctgcccaagacctggaaacaaccgtcttggctcggttacactatttcagatgcctgctgaatcaccgtggaatcgctgcagctccagtcacaaactcttatgctcggcgtcccccaattggtcctggttcatgcttcattcagtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPPKLLTYLILALLAASAAAARRHPSPASSAAAGEPVYLWPLPR NFTSGSRTLLVDPDLALDGQGPGGAAAAVAEAFERYRSLVFSPWAHAARNASGGYDVG KLTVVVASADEKLELGVDESYTIYVAAAGGVNSIVGGATIEANTIYGAIRGLETFSQL CVFNYDTKNVEVRHAPWYIEDEPRFAFRGLLLDTSRHFLPVDVIKQVIDSMSFSKLNV LHWHIIDEQSFPLEVPSYPKLWKGSYSKLERYTVEDARDIVSYARKRGIHVMAEIDVP GHAESWGKGYPKLWPSPKCREPLDVTSNFTFEVISGILSDMRKIFPFGLFHLGGDEVY TGCWNATPHVKQWLHERNMTTKDAYKYFVLKAQEIAINLNWIPVNWEETFNSFKENLN PLTVVHNWLGPGVCPKVVEKGFRCIMSNQGVWYLDHLDVPWQDFYTSEPLAGINNTAQ QKLVLGGEVCMWGETADTSDVQQTIWPRAAAAAERMWSQLEAISAQDLETTVLARLHY FRCLLNHRGIAAAPVTNSYARRPPIGPGSCFIQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5393..5568#5023..5273#4849..4908#4648..4746#4527..4560#3648..3707#2944..3044#2466..2514#2228..2244#1972..2102#1803..1873#1604..1715#1280..1315#502..588#57..398#cacaaactcctaaacccacaatatacaacccaagatacccgggcacatttacagaaatgccccccaaactcctcacttatctcatcctagccctcctcgccgcctccgccgccgcagcgcggcgccacccgtctccggcgagctcagccgccgccggggagcccgtctacctatggccgctgccgaggaacttcacctcgggttcccggaccctgctggtcgaccctgacctcgcgctcgacggccagggccccggcggcgccgccgcggcggtggccgaggcgttcgagaggtacagatcgctcgtcttctctccatgggcgcacgccgcgcgcaacgcctcgggtgggtacgacgtcgggaagctcaccgtcgtcgtcgcctccgccgatgagaaggtaccgtgtgtgtgtgttcgagctgctcccgagtttggctcgacggttgcttcgtctggatcagcacgcacactgtgaatttctccgtgtttttgtgatgtagctggagcttggagtggacgagagctacacgatctatgtcgcggcggcgggcggcgtcaattcgatcgtgggtggagcaaccatagaggtgatttcatttcctcttctccagattatgcccttttttttacagtagtgttgtgttggtgaagtgttttgggagaatttgacgtgagggctactacttctccctttttgaagtacggtttaactcctagcgtagttatggagcaagtagagtgagctgagtgagtggtaaaaagaagacttcaatgtggaattactgcaaatattgatgaactggtttccagtgaaattcagcttataacggtatagcatagctaaggctgaacttctctaatgcaatgaacttgattttttttaatgagctagctatttgatttttgcgcacttctcagtagatgcatcaactcttgtggtattcttggaaactctgatatgaaatgctcatattattgtgggttttatcaaacgaaactaacggttggtactgtttgtggagtgtgttgattgatacgaacatcatctctgaatattttagagttctactgccaggcttggggtcttggggccttgggggcatgggttcaactaaagtagccctcactcatatacagtttagctttgccggttgtgccccctgcaaactttcagagaactgaagacaaacgttgctattaagttataatattgtccaacatttctcttttatgcacaagtgtatgaaaactgaagctgtattttatctatccttgtaggctaacaccatatatggagctattcgtggattagaggtatgaactttatttatgaggaactcccttttcaatttttgtatgttttccacctgctgattgttgtgttgtgtttcgaggaagtaattattgactatactctaaggttctggagaattagaactcaattgatgatacattttatatatccagtgatcaactggtgtatgttagtccagtaattaattactgtttaaacagtttcatgttcccttttacctttttctgctttcctgaaaaaaaaaagaaacattttctccccttattgtaatggttggcacatggcagacattcagtcaattgtgtgttttcaactacgataccaaaaatgtcgaagtgcgtcatgccccatggtacattgaagacgaaccacgctttgcttttcgtgggttgctccttggtaagaaatataatcttaaatgttcctgatatgactggttagccacaacagaaagaatatttattttccctgtcacatctattgcagacacatcaaggcatttcctcccagtagatgtgattaaacaagtgattgactccatgtcattttctaagctggtaatatattatcttctgtatcgtgttagttgtttttaccagaataacctttccctcttcccttgctatatactgagacctagagttgtgtccagtagaatgttcttcattggcatatcatcgacgagcaatcttttccattagaagtaccatcatatccaaaactatggaagggttcatattcaaaattggagcgctacactgtggaagatgcacgtgatattgtcaggtatcaagtttatcatttgcctttcgcattctctgtatcttctttatattctattgccaagttctttcagttcacttataaaaggtgttctctgatttcacgtctgaaacttcccgactctaaagctatgctaggaaaagaggtatgcttatttccaattacatatattttctttcatctagctgggtgtagtatcgttctattttagttggaagtttgggactctcagccgcaggggattgtatgatactcatgcaattacatgtttattgaactctttgtcacagtttccctagttgttgtttgtctagaatgttattgctctacaaggaatgtgttctgattattatttacatctgttaggtatccatgtcatggctgaaattgacgtgcctggccatgcagaatcatggtgagtttgcacgtacaatttcctattctgttagatttctgcttgtgcatcagtgaggtttgtcccagttgcttttcacgtgcaacagaattatcttatgtgcaaatcaacaaataatcacatgctgtttctttgtgtcgcttagagttgcaatattatgtgattaatccaagctcttagctctagcatttcagccgttatgttacagtaattcaagtgtcactacgttccatttgatccagtgatttaattgagtacattgtatatttgtgtacataaccaagcaactgggattcagttactaccttatatgctgtagcaagcatttcagatttggttttgccctgttgttttgctctgttgtgcttattatatgaagttgacttgttatctactcagagatacttatgcaaatattaatttctgcaggggaaagggatatccaaagctctggccttctcctaagtgcagagaaccgttagatgttactagcaatttcacatttgaagttatttctggaattttgtctggttagttcctctttccttcttaagaaaaaactggctcaatttagggattggttgttactcagagacacatgccttcatattttcatttatagtcaaactcaaatattttttgttttcatggagagtggatgcaaaatcactatagtaatgaattgtgacatgtgaaataggtaaggcactatcaaaatgggtgtacttaccccttagtgctttatctactagcgctgcaccaaaatggactgatcaattcaaattttggccatgtttgattactcatcactgtaaactcaaaacacaaagggattcacatgattagtccttctgcaggacagccagtaattctatattcctatattaggttcagcattttttcggtcactttagcatgcaactgtttgacaactgggtgtctgaatcactacagcagagcaagatgtgcaaaattattagccagagtaggaccatccttctgtacaatatcttcccactaaatattcattataatgttacatgataagcagcgagccaacgacagagagtgcaagttatacagcattctgtctttcctgcaatttaaccaaattaacttcttgcccttttcagatatgagaaaaatctttccatttgggctcttccacttgggtggtgatgaagtatatacaggttagcctgcttctcttgtttaataggaggcacttcattaataagagtgtaagatgctgggatgttgcaaacttttggatttgagtgtgagccaactatcttccattaaactgatatgttagaagctagatcttttatttctaggaagaaaatcttgtctctaatactccctccagtcaaatatatttgatgttgggacttgggagagctaagtcaaatgtatttgacattgggtgagctaaacttaggtctcccaacatcagatatatttgacttgagtgagtaatacttttgccaaacaaggctcgctgtgttgtaagttacaactacaatttatgtccgctttcctttaatgttagtttaaactgtaagctatatattattatccagaatatttattcgtaatctgtgcctacttcataccaaatccagtagagtatcttgtaaccgataaatacattatgttcattgatgtgactggtgacatctcttctgtttgttagactgaggctgtgtttagttcacaccaaaattggaagtttggttataattgaaatgatgtgatggaaaagttggaagtttgtgtgtgtaggaaagttttgatgtgatggaaaagttggaagtttgaagaattattttggaactaaacacggcgtgaacattgttgtaatttgttttccatgtatcagttcagagcaataacggttgatacattatcatgctaaaaatagatgctgatatataattactatctatgtcatggagctcttcttttttcttgtgaatttctttccaacttcattctctttcccacctcaggttgctggaatgcaacaccccatgtgaaacagtggtatgtgctctagtttttgtaaatggttggtcaatcttctgctaaatgttcctttcctttcactgcttaacagcacctattttccaggcttcatgaacgcaacatgactacaaaagatgcttacaaatacttcgtcctgaaggctcaagagatagcaattaaccttaattggattccagtaaattggttcgctctctgcttgctaacttttgcttaggacttcaaatgaaaaaaaaggacatgaggtttactttttatttgtggca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|
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