Os05g0144300
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0144300 |
|---|---|
| Description |
DEAD/DEAH box helicase, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001061159.1 GI:115462048 GeneID:4337784 |
| Length |
10512 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0144300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:2526706..2537217 |
| Sequence Coding Region |
2526972..2527639,2528216..2528815,2529063..2529216,2529439..2529640,2530286..2530504 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:2526706..2537217 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:2526706..2537217 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctgcctcggtggaggcggcggcggcggcggtggtggccccgcccgcctccgtgggcggtgacgaggtcgtcgtcggcggcggcggcggcggggcgtcggagcaggccaggacgctcatcggcgcgctcaacctgctctcccgcaacctcccgctgccgcccgccgtcctgcacgccgtctcgtccatctaccacggcggcgacgcgtgggagggggaaggggaggaggggggtgaagaggaggtggcggcggcggcggcggctgtcggggatggatgcggcgagagcggggagggggaggaggaccgcgcggatgcttctcccggtgcggatgagggagtcaccttgattcaagagcttgaagatgctgtattgaagaatcaaggaccgtatatgtcatactcagagttgactgctttaaaagaagaccgcttcaacacttccattcagcataggctgactgaacttgaaggattaccatctactaggggtgaagatttgcaaatgaagtgtttgcttgaattgtacgggcttaagttattagacttgcagaagaaagtaaggactgatatcagtgcagaatactggctacacaaaaaatgtgcacaccctgataggcaattgtttgactgggggatgatgcgtatacggtatccttttaccatgtatggaattggagatagtttttcaatggatgctgatgatatcaaccgcaaaaagagattctcagagaggatctcaagacttgaagaggaggaaaagaaccaggcagagatcaggaagaggaaatttttttcagaaattcttaatgctgctagggagtatcagctacaagtaccggcttcttacaaacgaaaaaaacagcgcaatgatggagttctggcatggcatgttcgtgcacgtcaacgtataaatcgcatggaaaagagtagattacaagttttgaaggctggtgaccaagaagcttatttgcgtatggttgaggagagcaagaacgagcgcctgaaactgctccttggaaaaacaaatgagcttcttgaaggaatagggaaagctgtgcagagacaaaaagatgctgagcatgttagtcgccctgatggatctgaactgccaaaagggtcagaatctgatgattgttctcaaatatcaggcctcaaggttgaatcccctgatgaagagtccccatcagatgttgatgcagaccatcatagttctgctgatcatagtaaatttaatgctggccataggcttgattctaccgtccactctattgaagagaaggtaacggaacaaccatcagctcttgaaggtggggagttaagaccatatcaattagagggcctgcaatggatgctttctttattcaacaataatttgaatggtattctggctgatgaaatgggtttggggaaaacaattcagaccatagctttgatcgcctatctattggagaagaaggaggttacaggaccacacttaataatagcaccaaaggccgtgttaccaaattggtctaatgaattcaaaacttgggctcctagcattgggacaattctgtatgatggtcgtccagatgataggaaggctctaagggaaaagaattttggacaacggcagtttaatgttttgctcacgcactatgacttgatactgaaagatctgaagttcctgaagaaggttcactggcattatctgatagttgatgaaggacatcgtttgaaaaaccatgaatgtgcgcttgctcgcacactagtttctagatatcaaatccgtcgccgattacttttgactggcactccaatccaaaatagcctacaagagctgtggtctttgctgaactttattcttcccaatatttttaattcatcacagaattttgaggaatggtttaatgcaccatttgcatgtgaagtcagccttaatgatgaggaacagctgctaattatacatcgtttgcatcaagtgctgcgtccatttttgctgaggaggaagaaagatgaagtggaaaaatatcttcctgtgaaaacacaagtaatactcaagtgtgacatgtctgcttggcaaaaagcatactatgaacaagtcactagcaatggaagggttagtctaggatctggactcaaatcaaaggctttgcaaaatctgtcgatgcaacttagaaaatgttgcaatcatccctatctattcgttgagcattataacatgtatcaacggcaggaaattgttagatcatcagggaagtttgaattgcttgaccggctacttccaaaattgcagagagctggtcacagggttctgcttttctctcagatgacaaaactgcttgatatcttagaagtatatttgcaaatgtaccagttcaagtacatgaggcttgatggatctacgaagactgaagagcgagggagattattggcagattttaacaagaaggactcagaatatttcttgtttcttctcagcacccgagctggaggccttgggttgaacttgcagactgcagacactgttattatttttgacagtgactggaatcctcaaatggatcagcaggctgaagaccgtgcccaccgtattggacaaaagaatgaagtgcgtgtattcgttcttgttagtgttggctcaattgaagaagagatcttggaccgtgcaaaacagaagatgggtattgatgcaaaagttatccaggctgggctgttcaacacaacctccacagctcaggataggcgagcattgctgcaggagatcctgaggagaggaacaagctcactgggaactgatatccctagtgagcgtgaaataaatcgtttggctgctcgtaatgatgaagaattctggttgtttgagaagatggatgaagaaaggcggcaaagagaaaactacaaaccgaggctcatggagggaattgaggttccagactgggtgtttgccaatgatactttaacagagaagatacctgcagatgaaccccagaatgttctgctaactacgaagagacgcaggaaagaggttgtctactcagactcttttggtgatcagtggatgaaagcagatgatgtagttgaagagactccaaggatggctccaagagcaaagcggagcgcttattcgtctgatgtacaagaagtcgatttcagtgagaggaggaaaaggcataaatctctagtgaacattgcagatgatgccagcattccaatgtggacaccagaaaaagtaagggctggggtttcttcatatagcaaggatgagaatgaagacgatgccgaagatgaatccaccacaagtgttttgcaggggggcagttttacatggaagacccttagaaggaaaaggtcaagccacttctccaattcctcagattcaaaagggcgctcggcattctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAASVEAAAAAVVAPPASVGGDEVVVGGGGGGASEQARTLIGAL NLLSRNLPLPPAVLHAVSSIYHGGDAWEGEGEEGGEEEVAAAAAAVGDGCGESGEGEE DRADASPGADEGVTLIQELEDAVLKNQGPYMSYSELTALKEDRFNTSIQHRLTELEGL PSTRGEDLQMKCLLELYGLKLLDLQKKVRTDISAEYWLHKKCAHPDRQLFDWGMMRIR YPFTMYGIGDSFSMDADDINRKKRFSERISRLEEEEKNQAEIRKRKFFSEILNAAREY QLQVPASYKRKKQRNDGVLAWHVRARQRINRMEKSRLQVLKAGDQEAYLRMVEESKNE RLKLLLGKTNELLEGIGKAVQRQKDAEHVSRPDGSELPKGSESDDCSQISGLKVESPD EESPSDVDADHHSSADHSKFNAGHRLDSTVHSIEEKVTEQPSALEGGELRPYQLEGLQ WMLSLFNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALIAYLLEKKEVTGPHLIIAPKAVLPNWSNE FKTWAPSIGTILYDGRPDDRKALREKNFGQRQFNVLLTHYDLILKDLKFLKKVHWHYL IVDEGHRLKNHECALARTLVSRYQIRRRLLLTGTPIQNSLQELWSLLNFILPNIFNSS QNFEEWFNAPFACEVSLNDEEQLLIIHRLHQVLRPFLLRRKKDEVEKYLPVKTQVILK CDMSAWQKAYYEQVTSNGRVSLGSGLKSKALQNLSMQLRKCCNHPYLFVEHYNMYQRQ EIVRSSGKFELLDRLLPKLQRAGHRVLLFSQMTKLLDILEVYLQMYQFKYMRLDGSTK TEERGRLLADFNKKDSEYFLFLLSTRAGGLGLNLQTADTVIIFDSDWNPQMDQQAEDR AHRIGQKNEVRVFVLVSVGSIEEEILDRAKQKMGIDAKVIQAGLFNTTSTAQDRRALL QEILRRGTSSLGTDIPSEREINRLAARNDEEFWLFEKMDEERRQRENYKPRLMEGIEV PDWVFANDTLTEKIPADEPQNVLLTTKRRRKEVVYSDSFGDQWMKADDVVEETPRMAP RAKRSAYSSDVQEVDFSERRKRHKSLVNIADDASIPMWTPEKVRAGVSSYSKDENEDD AEDESTTSVLQGGSFTWKTLRRKRSSHFSNSSDSKGRSAF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9579..10246#8403..9002#8002..8155#7578..7779#6714..6932#6357..6616#4929..5327#4144..4293#3853..4047#2097..2161#1454..1589#86..424#gaccgtttgccgcgccccgatttgaaccctcgccgcctcgcctcgcctcgcggccgtggaggcggagcgaaaccctagggaggcgatggctgcctcggtggaggcggcggcggcggcggtggtggccccgcccgcctccgtgggcggtgacgaggtcgtcgtcggcggcggcggcggcggggcgtcggagcaggccaggacgctcatcggcgcgctcaacctgctctcccgcaacctcccgctgccgcccgccgtcctgcacgccgtctcgtccatctaccacggcggcgacgcgtgggagggggaaggggaggaggggggtgaagaggaggtggcggcggcggcggcggctgtcggggatggatgcggcgagagcggggagggggaggaggaccgcgcggatgcttctcccggtgcggatgaggtgcgtgcgcgcccctgtgcttcatcaattttgctgtgcgttcccctttcggttgggtgtgcttcgagttgctcgattagtgctagctgttggattagctagcatgttcagtagaattggcgagatgtagttagggtttcccgtgctgctggattctagagtggtttacagttggggaatgtgggctgcacttgtagaacgctcctccggtgacattttttgatgaatgtctatacctagtatggttttgggtttcatcgggtggaggcattgcaaggcatacttacctgattaatctggagctagaactgctttgtggatcggatgcttgttccaccaaaaaaaaaaaagagatgtttagtgttttagggatttctgatgatgtggaaacatcatttttttttattttttacaaatgcatatatgtttgtggtgtgtaatattttagatgtcattaatcatttttttttacagttggtatgccaccatgtttgtgaagtgtgtactagcgtctaggattatattagtaaaagccttattgtctttaaggccttgttcggtttggagggggttgaaggggattggaggggtttgagggggaataattgcacaccacaataggtgtggaataaatcccctccaatccctccctcttggggattaaccgaacatagcctaaacgggatataagttccagagaacttggttaatactgggtctatacaaggatttgccctcagtagatgtatttacttacgtacattacctcatattgtttttatgtgattgaaacaaaattctggtccaaaagttagattcatactatttgggccttgttgagttgcgtgctgttgattttgttgttagggttgtagtttcaaagcaccatattgtcactgcgatgattgggtgtgtcattacctcttgttctcctttttgggttatggctgaggcatagtgcttatgagtaggcttttgaatggccttctcatttgcgttttaactgagaataaatcgattgccttatagggagtcaccttgattcaagagcttgaagatgctgtattgaagaatcaaggaccgtatatgtcatactcagagttgactgctttaaaagaagaccgcttcaacacttccattcagcataggctgactgaacttgaaggtctgctcatacatcacctatttttactttctgatttattctaagttaaattactttaacggcaagactcctctttggtgtttgtgattatcctgctttgattttcctgttcttacaaaactggatgggttgggatgtgttttcccggcctactacgttttggtcttacgaagttcccaggcctggccttggtgtaaactgcaaaccttttgcttttgggcctgtaagcttgcactgtgaaaaagttgaattataactggccttctgaaacggtgcaaaagctgatgttgttgtgtttgactttttaaagtctatacgtgttttattgtcaacagtttagttttttctgaaactattcttagcatatattccaccaataggatgctgcctactaatattatcatgcataagatatttttaatattcagcctctctaaaacctgctttgttgttgactactgtattagttatgtaccaccaccaaactcatttctgtttatgtgccaggattaccatctactaggggtgaagatttgcaaatgaagtgtttgcttgaattgtacgggcttaaggtaaatgtgatattagaagcaaatgttactttggaggcgttgatgttttctgctgttactgcttttcttagatggtgccttttgtgtacagtgatgtccctagtggtgtgaagtatacaaattaactttgtttggaaagcgacatttgtgcaaacatgcataatctattgcattttagacttctagtacattttatggacgggcagatttcagacgttactacccaataatgtactgcagtagtcttgtccagggaaaaactgttcgtcttttcttttgactgtaccaaaaaacttattgtctttaactagcagtttgcctaccaaatcttgatgcatgtgtgaagaaaaccataactgtactatcctaggcagttgttttagctcctagaacagaaaccaaggaaactattgatgtggcgatgattactatgtaaacgtcgggggcgcctaatgggcgagggagtgtgtggcacgcaatttgcgctcacgttatcacgcgtaacatgcgtagcattaggtacgagccatctaggaagttttgataacttcctatatgggtttaaatctttccattagaaaaatcactctacagatttttattctgagagaaaacttcccatagttattatggatacaaactttaatatggtaaaactgtcaatagagagaaaaaaatccaatgatccattggaaaaacttccttttcttgaaaattttatctactcaaagatttctttttgaaccaaaattgataaaacctaaaaagaagaaagctcatgtagccctctacctctaaagcccagcgctctgtcagtggaatgaccacacatacgttcgcgtaaacagattgttttatgcggaacagaaaacggatatcactcactgggagaacgctaaaatggaaagcgtgagaaccattcacactgaacgcgcttgcgaatcaggagttcaaatatatatgtggccggttgaggaattcagggatggaggtgtgaagctacatcaaccgcaatggtgattttgcaaattatctaataggccctctactcaatagataaataagcttcactactaaaaatgttcgaattggtgattgtgatggtgtgttctaaaccacattcctcctccccactccctcagtagtaactagtaaagatgtttgactgcatgctttctaaaatatcatatttctgaacggatagaatttgttcctaaatttgggtcttgaatgtacatgtaaataactcacgccttactgattttttttatttaatatgcctcagtacttctataaaaaaaccacaaaggatctctgtaatttctcaactgtacaatgatttgcataagtaattaagtattgtgcttttccacaaaaactgctatgcacctagctagatccaactccgttttgatcaaggcattgaaacaattaatcagttgagtagttggtatggaggacgtctttaggcagggagtactagtacaatagtagtatcatcatatgatctgtgcactatcctttagtgaggtgttaattctattttgttggacagtttggctatttgaaaattgaaactatctagtgcaaagctcaacaagtgtatgaattccataggtctatatcaagaagtacgatattagaagtgagttatcctatcaagctcgctgattattcatatacttgtgcagttattagacttgcagaagaaagtaaggactgatatcagtgcagaatactggctacacaaaaaatgtgcacaccctgataggcaattgtttgactgggggatgatgcgtatacggtatccttttaccatgtatggaattggagatagtttttcaatggatgctgatgatatcaaccgcaaaaagagattctcagaggttttgtatcatgtatcttttgattattatatgtttggttaatttatatacacttgaattaataaggactccctttttggtatttgggaacaacagaggatctcaagacttgaagaggaggaaaagaaccaggcagagatcaggaagaggaaatttttttcagaaattcttaatgctgctagggagtatcagctacaagtaccggcttcttacaaacgaaaaaaacagcgcaatgatggagttctggtacggtcaatataattttcattagagattaacagatagcttgagattggcctaattggttccttccctatggagaaactaactcaccatattttggaccaattattcccttttttttggttacaaagactaggttgcactggtaccagtaccttatgacagtgttgtttgccaatagtgcctataggtataagagaaaagaaactatttttgttttactatgccttggaataatattttatgccctatgcccctatctgtaatggtctcgcgcctataacttatgatatgccttggaataatattttatgctgttggtgattatggaagatgagaattttgatggcacacacattttggtgagaaaacaagtgaacaataccttatggatgatgacttaattgtgtaccctgcaaaaataatgaattaaagattgagtttttgtgtgatagtatggatcaagtctctataaaagatgtttaaattcttgattcttgtttgctacttcatcaatacattatcgagttatcattgtactgcatttcctttgttagagcatatgt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|
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