Os05g0341100
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0341100 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF239, plant domain containing protein |
| Version |
NM_001061779.1 GI:115463288 GeneID:4338466 |
| Length |
7364 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0341100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:15972393..15979756 |
| Sequence Coding Region |
15972393..15972454,15973406..15973487,15973566..15973652,15973987..15974169,15974906..15975103 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:15972393..15979756 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtaaggaactcggcagtcaagggtggcttctcaaagtaccaggagggcatcggaaagaggggggaagaaattcaacatataaacccaaggagaagtactaatcaagatcttacaaatcaagaggttaataaaatcatccaggctgaagatggtgatgtctatgattgcattgatataaataggcaaccagcctttaaccatccattgttaaaagaccacaaaattcagttgaaaccaaactcatttccggtggggattgatgtcgaaaatccatttatgtatcccatctcagaagcacaactacccactgctgaatgccccacaggaaccatcccaatactatgcaacaatagacaagaaaatatttcaactaagaatactgacgcaattgtcaccagtcaacaacaagaggtagcagggataaaatattttgacgacatatatggaacacaggccacaataaacatttatgaaccaatggtgaagcatcattgggatcttagtggatcatggatacaaattgaaaatggcccagatgtaattggtgctggctcttgggtctcaccaagcttcagtggtgatagctttgctaggtttcatatttcatgggacccaaagactgaaaattggtggttggtgtatggtgaggagaaaacagcaataggatattggccaagttctcaatttagttacatgaaggaaatggccagtaaagcattgtggggtggatatgttcagggtccaacagcctcagaagactctccacaaatgggcagtggacattttgcttctgaagggtatggcaaagcagcttttgttagagatattcaggtcgtgaacgacgacaacatgcgtgttattccaaacccagttaaagccgatccaggatctactaatcgaaggaaatatacctatgaatattatggacataatcccaatgattttgaacacgtggtctacacagtcaggcctgctgctccggataccttggaagaagaagaagggaaggagaacaaagggaaagaaggaagcggagggaatcaatgtgaagatggaaatgaggggtttgattaccgctgcccatggaggcctagggtttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVRNSAVKGGFSKYQEGIGKRGEEIQHINPRRSTNQDLTNQEVN KIIQAEDGDVYDCIDINRQPAFNHPLLKDHKIQLKPNSFPVGIDVENPFMYPISEAQL PTAECPTGTIPILCNNRQENISTKNTDAIVTSQQQEVAGIKYFDDIYGTQATINIYEP MVKHHWDLSGSWIQIENGPDVIGAGSWVSPSFSGDSFARFHISWDPKTENWWLVYGEE KTAIGYWPSSQFSYMKEMASKALWGGYVQGPTASEDSPQMGSGHFASEGYGKAAFVRD IQVVNDDNMRVIPNPVKADPGSTNRRKYTYEYYGHNPNDFEHVVYTVRPAAPDTLEEE EGKENKGKEGSGGNQCEDGNEGFDYRCPWRPRV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..62#1014..1095#1174..1260#1595..1777#2514..2711#3477..3807#4342..4385#7204..7313#7358..7364#atggtaaggaactcggcagtcaagggtggcttctcaaagtaccaggagggcatcggaaagaggtattagctagttaatcttataacgaggatgtatgtatagtatgtatactagaagtataggaatagattcttttctattttctttccactcagcttagatagtttaatatgagaatgagtagacttatgtttgtgtgtcattgtaccctttggattatattaacccctgcttagtctatgattattacaagtaacatataaactattagtacggttctctctcctataattttcccacgggattaaacaaatatgatacccttggaatactctcgagtgaaatgctacaatagtatattcatgcgcttgcggataaactctgtaaccataatataccaagtgtatttctgcgccattgctgggaattatatttctagtaatgtcgttaagaaataccaacagtcacaactctcacctacaacactactacaagttgttagcgggctttggtattacaaacgcactattgattagccccatcaagatcagagtcattctctaccctcaacacatatatattcaaatctaagtgtatttttttcctattgttattcgtgtactctatgtaatttcaattgatggtatcttatggaattaacaatgaccacttcaaatatcttgaaaattcattcaaacattaaaacaatgaatttaatgccgtattgatgatatccaatatatcaaatcttatgcattcaatgctacatttatgtatgatcttctcatattgtttatttattcccttaaagcattaaaagaagattatcaaatctattgcattgaatatattaattcttttagtagactaacagctatttagtaaccattggagttctacagataatatatcttttccaagtatcaataccaatcttccaagattttcaaaatgaaagaaagtcaagtgattatcgtcactcttcttctattttgtattgttctaatcattaggggggaagaaattcaacatataaacccaaggagaagtactaatcaagatcttacaaatcaagaggttaataaaatcatccaggtatgtgaaaaaatggatccttttaagtatacttagcatcttttttttacctaacaagcaaaagaaacgtcaaattaggctgaagatggtgatgtctatgattgcattgatataaataggcaaccagcctttaaccatccattgttaaaagaccacaaaattcaggtaagccaacatttttcctcctaagatttaacatcatgtctaaatgtgttgccacttagttttttttttggaatgtaatattctttcctcttgtttcttttgggggggggggagggagggggtgagtggtctataatattcactaatatggcttctttttgataatatcgttaatttatttgtttataacactttgacctggcactatttttatgtgtatatttgctccatcataaaagaatgttgtagaaacctaatcatgtttagagaatttctttatagtgagatataaactcattgtttataaaatgaccatgttttgcttgtcatttagttgaaaccaaactcatttccggtggggattgatgtcgaaaatccatttatgtatcccatctcagaagcacaactacccactgctgaatgccccacaggaaccatcccaatactatgcaacaatagacaagaaaatatttcaactaagaatactgacgcaattgtcaccagtcaacaacaagaggtaagaatttttaaaatatttttagatgtttcaattctcatgagttgattgtgataacatattgtttttgtatggagttgttcttatgtccagctctcacaatagactcacaaaaccactatattaccattggttgatgtaacaactatacaaaagagttaggtgaatctccatctttaagtgctaataaatgaaggcaatcaacaccattagatgaaatatgtgttactaaatgactaaaacagttacacaatagctaaatactccctcctactttgcactgattttactccttctaatttataaataaaattataggtattaaaaatatgtatgttattgaaataggagtatattacatggtagataaaaacatataatttctgccatcacattcaaacaatttcaaatatatcaagtcccaatcaaaattgtcaaatagtaggaaatggatggcgccttactttgaaatatttgttagtaagattatattgttgcagtttcacatcctctttaaaaaaaccaactcctttgtgaatgtttttcaacaaaaataccgactttaaattattatattccctaagtatttcaaagttatactacagaacactaatgaatttatattagctttatcctgactggcaacagtcctctatgtattaatatgatgtaaaactttgcatatgtatgtaagttattattattcacaaaagtcttttcatttttttccttgtaggtagcagggataaaatattttgacgacatatatggaacacaggccacaataaacatttatgaaccaatggtgaagcatcattgggatcttagtggatcatggatacaaattgaaaatggcccagatgtaattggtgctggctcttgggtctcaccaagcttcagtggtgatagctttgctaggtttcatatttcatgggtaatacgtatacattttttctagaaatacattggattctacactatattttttttctagtctctatactgctgagatagtatagagctacatttccactgcttaggtactgactttagaaaaaaaaattggtaacagcgtgatgaagtacaaaacaagtcttgcaacaatcataagtgtcctggtttcgtccaagttagcagttctgttgttcttggaggcagaatacagccagtttctgtatataacggaccgcaatacgcaattaagtttcttatatttaaggtattctctgtcctacatgcagtttaatatgccttgattatttactttatgagaataaaaaatttaagtggttcactatgatgttaattgagttacctaagatatataaaattaataaaacattaatttatttcgcttattatgtcatatctatatactatgttcacatatgatgtgtcagtgcattgcttagatttaaattacctgttagcacacaccattacaacaatatcttaaatcataataggcattccatggacttccaacaatagcatttcactttgaatgcctcactgtacgaaatgatgttatagacttatagcaacaaacgtttattaagacccctagaatacaataaggaaataagtaccatgccttgtgcattcaatagcatattgcccttgcagtcttttgaacaatcattttttagatgattttgaagaagcatttacttgacaatttaatcttgatgaattttaggacccaaagactgaaaattggtggttggtgtatggtgaggagaaaacagcaataggatattggccaagttctcaatttagttacatgaaggaaatggccagtaaagcattgtggggtggatatgttcagggtccaacagcctcagaagactctccacaaatgggcagtggacattttgcttctgaagggtatggcaaagcagcttttgttagagatattcaggtcgtgaacgacgacaacatgcgtgttattccaaacccagttaaagccgatccaggatctactaatcgaaggaaatatacctatgaatattatggacataatcccaatggtatgcatgtttactatggtggaccaggtagctacagctaatggtgtactctgcaaactataataacatatgtatttgtatgtgaaacaatgggattcatagctatatatgtgccatcacaattcacaccaccgtgcatccaccttctagtcataatatcttcaaatttttttcctaaatagtgaagataatcttgtgtaatgaaaagtctgctatgcaaattaacaaatcacgataatgcacatagacaacaggtagagaatctaattcagggaaaatatacacaacggctaattagagaacaaaaatatgatcaatcaatggtcgacatgtaaaagaattacagcagataacgctatgacaatgtgaaactctgttcttctcgtcatcctaattgcgtaccttccctgtgtgacttacaacaacccagtctcagctctgaatcaagttccttccctggagcatctcatgctctcatcaatcaacttgaatgtcttctttacaagtttctggtctagggccgttgttctgtagattttgaacacgtggtctacacagtcaggcctgctgctccggatgtacagctcttcaaatttcttaacaatccttttaaactctgtatgggtataaagggcagcctttaccttttgtattttcttctcaaatatcatagctgaaatgaatagaaatattataagaaaaagaaagcagacaaagataagttcaacaaacaaagaatctatacttactcactaatggctgcataaaagataaaattatgatagattaacactcttaaaactatcagaattttctgttagagccaaaatataatgaatttgagattaagacttacacataagtgtgttaattgtgtgcatgcgaagcttttgtgcacagaatgtgttccctctattctagagcatcaagcttggcctgccatcggttgccgattatttttcctagtttcagtgatgatttccttcgtgttacctcaaacgtgtttccttatcccattagcagcctatagtatgtgtgtagttgcagggctgtcccgtcaaatttggggggcctgtgcaaagtcg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|
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