Os05g0357100
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os05g0357100 |
|---|---|
| Description |
3'-5' exonuclease domain containing protein |
| Version |
NM_001061830.1 GI:115463390 GeneID:4338523 |
| Length |
6098 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0357100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:16896735..16902832 |
| Sequence Coding Region |
16897675..16897822,16898507..16899188,16899281..16899365,16900025..16900166,16900669..16900853 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:16896735..16902832 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:16896735..16902832 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggttgttcaaagacacagactcaggaagactctgaattcaatcaatgcaatgaagagcgctccctgtgcttacactcattttctgacttgtcacatgtttctgcagctacttttatgtatcttttgaaggactgctacctatatggaactgacaaagcaaccccaaagttcaagatccttcagctgcaggttaaaagggtattaaataatgatcctcagccaggcccattcacgtatgttgttcaatgcatgtatattgtgccactgctggggaaaacccatgctgaaggcttcagccatatgttgatctcttctctaaggcatttgaaatctgtggaatctgtacagaaagatttcttagatgcaaagcatcttgctgcgcgacttattcttgatattgttgcttctattgtgccccatgaggaacgcatactgataaagcttctcgaggcatatgatatcgagttgagagatatggctgatgcattatatggttcagagttgggtgatgaagatctagtgaaagcaaaagaacatctcaaacagtatgtacaatgcttaatggaatcagaatcttatgtgaccgctgtgaacctgataacacgattttctattcaatgttatgatgagtcctttcttacaaaactgattgaaaataatcacttggaggcagcagagaagtgggcagttttcatggggaatgaaatgatatgtttgatcatccaaacgtatctggatataaaaatgctaaagagggcaaatgagttggtaaaacaacatgaccttacagaaaagttcccagatgttaactatttgtataaagagagtgtactgaagaagctggctgagaaagggtgctgggatattgcagaggttcgggccaagaaggaaacaaaattgatggaatacctggtatacctagctatggaagctgggtacatggagaaagttgaagaactttgccaaagatactctcttgaaggctatgtcaattctttgggtaatcataaacaccaacgttatttatcatacattaatatctgtagtcctgcagttccagaggagatttgttgtgggtctgactacttagatcttaaagaactgattttggaagacattatctgggttgatgagattgatggacttcttaattcaataagttatattgaagcttgtaaaattattggtgtggattgtgaatggaagcctaattttgagaaaggtagcaaacctaataaggtctctattatccaaattgcgtcagataagaaagcttttatttttgatctgatcaagctgtatgaagatgacccaaaagtgttggatagctgcttcaggcgaattatgtgttcttcaaacatactaaagctaggatataatctgcaatgtgatctgcatcaactatcacaatcatatggagaattgaaatgtttccagtcctatgaaatgctgcttgatatccagaagctcttcaaagggactactggtggtctatctgggctgtccaagaaaatattaggagctggtttgaacaagacgcgacggaatagcaactgggaacagcgccctctcacccagaatcagaaagagtatgctgcccttgatgctgtggtccttgttcatatattccatcacgtcaagggacagcctcagtttggtgtcaccgagggatgcaaagtggaatggaagtcccatattgtttctcgggtgaagaattcacggagtacattacgcttctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGCSKTQTQEDSEFNQCNEERSLCLHSFSDLSHVSAATFMYLLK DCYLYGTDKATPKFKILQLQVKRVLNNDPQPGPFTYVVQCMYIVPLLGKTHAEGFSHM LISSLRHLKSVESVQKDFLDAKHLAARLILDIVASIVPHEERILIKLLEAYDIELRDM ADALYGSELGDEDLVKAKEHLKQYVQCLMESESYVTAVNLITRFSIQCYDESFLTKLI ENNHLEAAEKWAVFMGNEMICLIIQTYLDIKMLKRANELVKQHDLTEKFPDVNYLYKE SVLKKLAEKGCWDIAEVRAKKETKLMEYLVYLAMEAGYMEKVEELCQRYSLEGYVNSL GNHKHQRYLSYINICSPAVPEEICCGSDYLDLKELILEDIIWVDEIDGLLNSISYIEA CKIIGVDCEWKPNFEKGSKPNKVSIIQIASDKKAFIFDLIKLYEDDPKVLDSCFRRIM CSSNILKLGYNLQCDLHQLSQSYGELKCFQSYEMLLDIQKLFKGTTGGLSGLSKKILG AGLNKTRRNSNWEQRPLTQNQKEYAALDAVVLVHIFHHVKGQPQFGVTEGCKVEWKSH IVSRVKNSRSTLRF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>941..1088#1773..2454#2547..2631#3291..3432#3935..4119#4555..4687#4813..4949#5074..5148#5604..5717#5808..5849#gacgagtggtgttttctggtcacctgcggcagccgtcgtggtccgtgaaacgaaacccctgtctttcgtccgcgaaaattttccattcttgcgcttccaagtatcgagccccaacttcctagaagaccgcgaaccctagaagcaagagaccaagagtcgaggaggaggaggaggagttggccggaatccccgtgtggaaggcaggtatcgcgctcgtcttcttgcttcgtttcgtctcatctccattttcgtcgttgcttcttctgtctgtggttggcgagttgcggcgacgggagcctcgcctccccaatctcagtagtgagagcttgatttagggtgggggattttttttttcgaaaagaaaaaccaaaaaaaacagagaaaaaaaatcccctctggcgatcggttttgggatgaatggaggaaatgtgtgagcatttcaatctcccttttgcctgtccaaagtgttgtatcttgttcttgatctttgatgttctggaggcggagagggtgggggaaacaatatcaattgttgttagttcgttcagactagtgttacagagattttgtggaagtattgctgtagcattgttgtctccattagcatatgccatatatatagtctgaggtgctagaatggataatctgatggtgttaatgttttatatcttgcgaaaacaaatactacttcagcttgttaggaattcctggagtgagaagaaatgtcagcttgatagatgtatataaattctctagcagaatcgtagttttgtattcgcaaactcagcaacctccactgagcagaactaaatagttagtttcccatcgtttatgacgatatggagctgtctcagattatttgttttggtggagaggttcaatttatgatttaatgtggaatatatgttctcatacgcaggttgggatgattttatgaagtatgggttgttcaaagacacagactcaggaagactctgaattcaatcaatgcaatgaagagcgctccctgtgcttacactcattttctgacttgtcacatgtttctgcagctacttttatgtatcttttgaaggactgctacctatatggtatacctagttctttttcatgctattcgaaaactactccttccgtttcataataactgatactcatattttttgttgaatatttacaaacctagaaatgataccatgttactaaagtggggtttgccctaaatcaaaactttcgttcactttggtctaacaatttaagggcaattaattgtcaaagtttaattgggaaagtcaaaattgtcagttattaagaaagaggtagtatcatctatgtggcactgttataatttaatatctacatgattggtgtgctaaaatatttctttctgtaagcttcggtgcaactaattctgcttgattatgatatgaaaatgctgtcacacaatcttcccagaaataaacacgtgataggaaaataaataaagttacctacatagtaataattacaggttaaatccatagtagtttgtatggaaccttggttgaggtaaatatcatcaaatatgattttcaaattcggttaatgcaaaatgcaggctcttgaattccttgggtcttcaaactttttgcataaccaactctctgctatgaatttgctacaagcttgctttattattttattttatttgttttcgatatcaatttcatccttgatcttatgcacttattaattgtccatactctgatgttttacaatcttttttgaaaaatcaggaactgacaaagcaaccccaaagttcaagatccttcagctgcaggttaaaagggtattaaataatgatcctcagccaggcccattcacgtatgttgttcaatgcatgtatattgtgccactgctggggaaaacccatgctgaaggcttcagccatatgttgatctcttctctaaggcatttgaaatctgtggaatctgtacagaaagatttcttagatgcaaagcatcttgctgcgcgacttattcttgatattgttgcttctattgtgccccatgaggaacgcatactgataaagcttctcgaggcatatgatatcgagttgagagatatggctgatgcattatatggttcagagttgggtgatgaagatctagtgaaagcaaaagaacatctcaaacagtatgtacaatgcttaatggaatcagaatcttatgtgaccgctgtgaacctgataacacgattttctattcaatgttatgatgagtcctttcttacaaaactgattgaaaataatcacttggaggcagcagagaagtgggcagttttcatggggaatgaaatgatatgtttgatcatccaaacgtatctggatataaaaatgctaaagagggcaaatgagttggtaaaacaacatgaccttacagaaaagttcccagatgttaactatttgtataaagagaggtaacttttgttttgctcaatgcaaattgcaaaatatttctactataatgtttactaatcttatagatctctgaattatattgtatttgcagtgtactgaagaagctggctgagaaagggtgctgggatattgcagaggttcgggccaagaaggaaacaaaattgatggaatacctggtaatatgcatccacattgtcagagtcatcttttagacatgtttgttgtttgtacatgtcatcatgaaagtatctgctgcaatggaagatggattcactcgagacacagtttcctatatgcctctatctttgttcatcggatgaaatggctaggatgtattgcttttgttacatgtggattgatggtcgttattgtgaagccatgctgtcatctatttcatagtgttcatatttatttattttttgctggcatccttgtgtataaaatctatatatcctatatagttggcaccaaaagcttaacatgcattgagccacataactgacaaaataagagccattggattattcccatgcttcatcacaatcatccaagatatattaaaatagttacatttacttctcattagttcctagataacttaatattgattatcccacatagtgtagttattattgcttaaagaaggcaggtcatgccatttgtcatcttatcatcagatggtgcttttacggttcatatcaactaacaatctctctcatattaatatatagactttttataatcgtattgcacacaccattatcccgccgcaacgcgcgggttgccatctagtaaaatataattgctttactcatgactttgttaccttgtgcaggtatacctagctatggaagctgggtacatggagaaagttgaagaactttgccaaagatactctcttgaaggctatgtcaattctttgggtaatcataaacaccaacgttatttatcatacattaatatctgtagtcctgcaggtgtgtattcttttaattttctagctatttattttcaacctgctgtagaaactatctcctttacgtttgcattaacttttaaatagccaccctgctgacattccttttggttattacaacccactagaatgattaagttgattactttcagctggaactttgaaatctgggttgctgatatagaattactagaaaaacattataatggaaaggtttactacatgcatccgacgttccaaatttaacttacataggaagagctgtaattaggaacaaggtattttaaagactaacatttttaccaatgcaaaaatcatggacgcgtgagagggagggagggagggagaatgcaggatgggttaatgcaaaattatgatatatgaaacacagctttatgatacattcattgaattttatctgtactcttgatacgttgtaattgactttatcccatcaactccatttctactgttgatcccctatattaattgtgtatgagcagttccagaggagatttgttgtgggtctgactacttagatcttaaagaactgattttggaagacattatctgggttgatgagattgatggacttcttaattcaataagttatattgaagcttgtaaaattattggtgtggattgtgaatggaagcctaattttgagaaaggtagcaaacctaataaggtaagcgatgtcttaatttaaatttctgtcagtttccatgtttaacttagttttctggtacaattataatcatttttcctaatgtatggtaatcatatgttgcattattgtggcgatacagcaggctgaatgaaaatctccccctgttcttcctcaaaaggcatcactggataaaataggataaataaattgtattaggtatcatttaagcaatttagtagttctagtattcagttatccatatcactccctgtgtagtaagctatggccttgtgatcatctcagtgatattttctttacagtgtttattgttttggaacgactatcttatccttaagttcccatgatattttttacttgttcctctttcagaaattctgcattttatctatctatgtcagttcttgcattaattgaattttgctctatggttaggtctctattatccaaattgcgtcagataagaaagcttttatttttgatctgatcaagctgtatgaagatgacccaaaagtgttggatagctgcttcaggcgaattatgtgttcttcaaacatactaaagctaggtagcgtactattttgattaaaaaacccatatcttcccatacactcttgttttcctgaaaacaacatttctttcttatgcatcctgttaaacaagtacttatttttgccccattgtaaaccaaaggatataatctgcaatgtgatctgcatcaactatcacaatcatatggagaattgaaatgtttccagtcctatgaaatgctgcttgatatccagaagctcttcaaagggactactggtggtctatctgggctgtccaaggtaattgctatagcggtataggctccacttaactggacgttgaaccagttttgattttttttaagcttatagtttagtgtgaatcatctggtcctccatctttatttatcacggaatgtatcagaaaatattaggagctggtttgaacaagacgcgacggaatagcaactgggaacagcgccctctcacccagaatcaggtctgtcatctttcatattccttaaaagctgtcctcacgagtccttattccttgaaaggccctatttgttggtatgagtgattaattaatttctcataattttgtattgtgagttttttttttcagtctcattctgaatttattttcacaatacttttctaaccatgacaggtgtttgtatgaaaaaagtagaaaaagaaatttactttagaaatgagcctgtcgattaccacatttttaacatcaccttaagatgcctctccttattctcatgtacaagcaaattttctatcagatcttgtgctaagcttatcttggtaaacaccattagttaaaactaagtcaaacatgcttcatcttgcaatctaaagccacgagttagtttgatagcctactgttcatcgaggacaaaaagcgccatccctaaaacagagagattcttcctccttttgcagaaagagtatgctgcccttgatgctgtggtccttgttcatatattccatcacgtcaagggacagcctcagtttggtgtcaccgagggatgcaaagtggaatggaagtcccatattgtaagtgcaatctaaaaacatcaaagtatcaaactgccatgtttatatgctaatcctgaacatcatgtgacattttaaccatcgttgcaggtttctcgggtgaagaattcacggagtacattacgcttctaaaattaagggctgatcaaagttgactgtggacgtagtatcttgctaaagtgttagccaggaagaagttaagaatcaatctgttcatatctttctcacatcttacatgatctcagcagctgttgctgccatctgtaaatattatatgctcagatttcttccatgttgtgttatcgctaattaggagctatgagcctatgacagttcaggcatgcatctttttggtggcaatggactttattatcaggaagc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
