Os05g0390800
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0390800 |
|---|---|
| Description |
VQ domain containing protein |
| Version |
NM_001187477.1 GI:297724084 GeneID:9272551 |
| Length |
7921 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0390800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:18958286..18966206 |
| Sequence Coding Region |
18958286..18958294,18965706..18966206 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:18958286..18966206 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggatcggcagaggcagcagagctccaggggcaatgctagtgctactgcaacgcggggtggtggtggtggtggtggtggtaaggggggagggaacgggaaggcggcggcggcggggaagaagccgatcaaggtggtgtacatctccaaccccatgcgggtgaggaccagcgccgccgggttccgcgccctcgtgcaggagctcaccggccgcaacgccgacccttccaagtacagcccccgcgcctccgcgggcgacgacggcggtggcgccacggcgctgcccgacaccggcgcagccagcgacgccgacgccctcgaggcgggcgcggcgccgggtcgtcatccggcggaaacggcgacgttcgacgaaggcggcggcgggggcgggggcggctacgacgacgacgacgacgacgtcttcaggtcgcagctgctggacaccagctactcggtgttctcgccgccgacgctgctctacgacgaccacccgcacagcaagagcaattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDRQRQQSSRGNASATATRGGGGGGGGKGGGNGKAAAAGKKPIK VVYISNPMRVRTSAAGFRALVQELTGRNADPSKYSPRASAGDDGGGATALPDTGAASD ADALEAGAAPGRHPAETATFDEGGGGGGGGYDDDDDDVFRSQLLDTSYSVFSPPTLLY DDHPHSKSN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7913..7921#1..501#atggatcggcagaggcagcagagctccaggggcaatgctagtgctactgcaacgcggggtggtggtggtggtggtggtggtaaggggggagggaacgggaaggcggcggcggcggggaagaagccgatcaaggtggtgtacatctccaaccccatgcgggtgaggaccagcgccgccgggttccgcgccctcgtgcaggagctcaccggccgcaacgccgacccttccaagtacagcccccgcgcctccgcgggcgacgacggcggtggcgccacggcgctgcccgacaccggcgcagccagcgacgccgacgccctcgaggcgggcgcggcgccgggtcgtcatccggcggaaacggcgacgttcgacgaaggcggcggcgggggcgggggcggctacgacgacgacgacgacgacgtcttcaggtcgcagctgctggacaccagctactcggtgttctcgccgccgacgctgctctacgacgaccacccgcacagcaaggtgtagtgacccaccccgatccctcccgccatgaggaagaccaccttgttcgctgtgtgtattgcatgatgaaattgcatgtgtgtgctagcttcaattcagtgtgccgctctatcccttagcctagctcatcaccacatgcctcaaatgaaattaaaaaagagagtggattcttatccctcgagcatacatcctctcgttctgtacgtatcgttcaaaaagttataaaaaaattaaaaaatttatcaagatagatcaatagatcaatagatcaatacatgatagtatatctttttcaaatatgcaagttaaaatttgacttatacaattcgaaacaaaaataaaaaaattgatgatgaattgcacgttctattcatagttaaatttgttatttttttctacttgtataagttgaatttgaatttgtatgtttgtgaagtgatatatcatatattgatctatccaactaattttttttcaaatttttttatgacttttaagtgatatgcaaaaaaaataaggggatatccctttaagggatgaattgagttttgcattaaaaaaaatgaaggcaaaatcttagcctgagctgccgctatctgtgttgtgtgtttggtactgtggacgccacacacctggggggataaattcttcttccttttttaatttcccctcgctctcttcttcttctctattgatatcaatggcttggttaattaattgtcgtcttcactgctagctcttaatttgcaactttgcaagtgatgaactgatgatgcaatgctcgtgtcgtcgccatcgatatatatatatgtatatatcatgatgatcggcggccagctacgagctgatgctagtatattaatttccagatctttttttcttcgatccgagacgtttttttgcctactactgttcctctgattttatggtcacctttttcttttctttctgtgcggttttttttttttggcatggttgagcttggagcatcggttcgccgatcacccccagtcaccaccaattcggggtggcgctgcgctgtgctgccatgccatgccactgctagagtggtagcgtgcgaaacagtaaacacactacaccgtctgtccaaaaaaaaaactctaacgattaatccggataaatgcttatccagattcattcccagaagttgattttttatgggacggaggaagtacttcgctgcaacaatactactactgcactcacctggctaaggcagtgtacacatataagggtgtgtttagttctttgggtgtaaagtttttaaggatacgaacacacatttgaagtattaaatatagactaataacaaaacaaattaccgattccacatgtaaattgtaagacgaatttattaagtctaattaatccatcattagcaaatgtttattgtagcatcacattgttagatcatggcgtaattaggctcaaaagattcgtctcacaatttatatgcaaactatacaattggtttttttccccacatttaatgccttatgcatatgttcaaacatttgatgtgatgtttttgccaaaaatttttaagatataaacaaggcctaaatcacagctagatatcgttggcacgcaccatatctatatcttaactcctaatcagcatcaacgtgctaatataatcattaattaattaattaaccagttataaaccagtatgatataaatgtataggatgacgacctcgatcactttaatttcatttcattttcagtctctaattaataatatatataagatcggcttgaaattgaaagaccactttcatcaggaatatagtggatacatgcatatagtcatgaacacatcttatctatctttgcccttcgaattcattagttatatatgcatggcatggacacaagatcaaagaaaagcaagtgttgcgagcatattttagctagctgcaattatcatgcatggccacccttcattttcatggcgaattccactgtactagagggcatcaggaatttcccccttttttgttttacccgtgaagaaactgaagaattcgaattccggtcctacctacttccaacaggagaaattgacataattaaaaacaacccatctctctttgttcttcgatcaccagttaaatgtatatatatatatagcatacacaagattgaagccttgtgacattcaaactctagaactaatattaattgtagtctcatcagctgcgggccagaagacacaatgcaatacacgagggccaggtatatatactgcaacagaagtgtaagaaagcgacaacatcgtgttggcttactagccagctagccccctacagtccagataatgatttcgttaagaacagtacatgtgaatggatttgcctctcgcactttgttagtgcttgttggatggtcaagtttggaaccgcgagttacaacttacaagcagcagcaaccataagtttcactaattttggtcttcaaggtccttaaaacactcatatacagcactaccatccaaccttttgttcatgattcttctggtttcatattttggcttgtttgatgtgttcatttttgttcttccattcttccactactagttatactactatttgctaggcaaagattttttttttttcgtaagcttgatttcagttactttggttaatttgtttttccattcttctatttcatttgtttgacaatatactgcttcatgggtgttgctttgtgctgttctgttcccactttgattcttggtcattgcttatatatattgctcttgttcattgacccattgcacttaagtttacctttcgttttgtttgacattggctgatgactcgatggcccgtgttgtgttattccttgatgttggaatgatccaaaattaaactttctatcttaattactatcctagaacacactcatataggtttaacactatacatgcatacacgcgatgcactgatgcgtgataataaattagcatattaatccagtggaatttagctgtggcttaatttgatcttttctgctcacatacaggttgtagcattgtgatatccatgcatgttgtgctagctagttgatcttttttatatgtactcaatctatttctcttttcccgatatatgttgtcccaacaatctctcatttttcttgaatcaataatgctttcccgttcaatgtttcctcttttgcttccactgtgtgtacaagtcccaatctgtgtactgcatgcttataaaggaccctcttcgatcagcatttacatcctgcagtctgtatatgatttggtctattttccttcctctttaatttacttttgagacagacattatattgtcatggcattatttccttaattctaacatttcggtacatcgtgtttacttcattacttgtctccaaattttatgcaatgtgataaaagaaattagttgcccagatgttatttacaaacacaccatccaatgtctctacttctgactaatagtaacacgctaaggggtagggtgacaccttgttgatttaaacttgttagcacctcaattagtccacagtctttgagcacatgcatgcatgagtccatcaaatacttgcattttcatacatatgtatgcattatatttgaaccaatacttttcttagctagctagctctggtgctttactaattaagatgacacttcacatgcatactattactccatccgtcccaaaatataaacatttttgaacttcgacacagtcttcgagatgcttctttgaccaacaatatctataaaagtaaaatgtttttaaaaaaatgttgcatattatgatagcttgtttaatgataaaactagtaacatcaattttacattgttgatcttgttaatttttttttttgttattaacagtcaaaattaaaaaagtttgactttgcactatgccaaaaatgattatattttgggatggagggagtagaattttagttcatacaaactatcactacataagtaaattaaaaactttttttgcatacatgttttgagcaatcttgggtttctatgcaactctcttaattagttattacttctgaattcattccattgttttcttttggatttcgttactactctcttctagagaggaagttctaaatctgttttactgtctggttctttggtaaaatcctatttgttatgttaattttggtatttcaatcaactaaatattttaacatattttggtatgaatgtttgtgggtgcacttagggttctatccttttttttctttaatacaaaatgtccatgcttttttggtaaaagaaatatattataacattgccatagcaaaagaatgtatatatttatcaaacatgttaggatcacttgtttgcttttttttatttatgttctttctaaaaacaaaattaaaccacataaattcaacaaattatactttctaattattg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|
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