Os05g0400800
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0400800 |
|---|---|
| Description |
Similar to 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5- phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase, chloroplast precursor (EC 5.3.1.16) (Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase) (5-proFAR isomerase) (BBM II) |
| Version |
NM_001187488.1 GI:297724106 GeneID:9270806 |
| Length |
6595 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0400800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:19497490..19504084 |
| Sequence Coding Region |
19497762..19497858,19497958..19498013,19498303..19498510,19501399..19501409 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:19497490..19504084 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcatcgagggttccgtctccaccgtgcgcggcggcgcggtccggttgggctgtcccgatggtctccgtccggccggcgagatccggcgtggcgagaggacgtgctgtggtgtgcgccgttatcttcaggccgtgtatcgatattcataaggggaaagttaaacagattgttggctctactcttcgggattcatcaaacgatggcacggcacttgttacaaattttgaatcagacaaacctccagcagaatttgcaaatatatataaagaggatgaacttattggtggacatgtaatcatgcttggtgcagatcctgctagtcaagctgctgccatggaagcactacatgcatatcctgtatgtgtttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASRVPSPPCAAARSGWAVPMVSVRPARSGVARGRAVVCAVIFR PCIDIHKGKVKQIVGSTLRDSSNDGTALVTNFESDKPPAEFANIYKEDELIGGHVIML GADPASQAAAMEALHAYPVCV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>273..369#469..524#814..1021#3910..3920#aataaatctctttacctagttcggcttgggcctcgcaccgactccgactccgaccccgactccgactcgccgccgcccttgcgccgcctccgcggagccctcccctccccgccggcggcggctgcgaaggtgcggcacgtacgcgctggtttcttcttcttctctccgaatcgtgtcctgggttggggggggggggggctcccgcatgcttgcttgcttctgaatttgcttcgcgggtgtttgtttgttggttgtggcagcgactggattggatggcatcgagggttccgtctccaccgtgcgcggcggcgcggtccggttgggctgtcccgatggtctccgtccggccggcgagatccggcgtggcgagtatgatgtccctttcgattcgattctctgtatggctcgatttgttactgcttgtcgcgaattgggggaaaaactgggattgctcgtttgttttggcaggaggacgtgctgtggtgtgcgccgttatcttcaggccgtgtatcgatattcataaggtccgtacgagtggaacacttgcttcctcttatgtttcatgggtgttctgaacattaacatgatcgtaaattgataccccaactttgtaagcaaagtactttcagaagttttttcagcttgtatgctccaaattttcctgcgatgcgattcacctggaacaccgtgatattaaaactaaaggcttatgcattgatttctactgtcattttgcaaccatgtgagttcagttacttctggcattaacagtgtcatttatctgatgggctgtttcttaatataaattttcaggggaaagttaaacagattgttggctctactcttcgggattcatcaaacgatggcacggcacttgttacaaattttgaatcagacaaacctccagcagaatttgcaaatatatataaagaggatgaacttattggtggacatgtaatcatgcttggtgcagatcctgctagtcaagctgctgccatggaagcactacatgcatatcctggtgagaatgttatctagctgttacctgttagcataattatgttgttatttggactagttcttttgtgagcagctgtctgtagttgtttgttctttactgttatcaataataattatgatataaagccacatttgtgactattgaatatatgggtgcttacagtgtatataatttaataagtgcagtgtttgtttttattttctaaaaaaaactagctgatacaaaatatcatgtagctatttgagagcaatgaaaaatactttgccaaaatgcaactctaggggaaaaaacttaataacacttcttccttttccgttgttgtttcatgatattttccagtggtatacctgtcagattccactattgcggggtttgaattatgtatggttcatgctgacagccatgtttcatgttcattgccataaaattaagcccaagagatgctaatttaggttattatggttctggtcattggagcctttggagagtttttttttcacctgctaatggtgcttctgctagtatggtttgtttctactatggccatgaagcaaaatcaatttgaagtatttgtaataaacgtgggctattataatactaggtggtttgcaagttggaggtggaataaatttggagaatgcgatatcttaccttaatgaaggtgccagtcacgtgattgttacttctgtacgtgttcatgccttgatccgtgtatataagttctgtttctctttcattctttgaaaccacatatagttgtgtatgttaatacgtgcatcagttaaccggaacaaaattaagcctggccccattgcatttccatttcatatccatttcttgttaaatacaatttgttggttcactgtaacgttaccccaaagcctagcatgatataagagcaacctatcaaaaaccctaccactagtcattgatctacaggcaatggcattgcctatagtcctgtccagtcagtcaataacattccggtggtttctccttcctggtgtaatttgcttgctggttgcctccttttttcttcttgacggaaaagtgttccaaaagccacaaggtctaaggaatctcctgttctctttgggtgatcactgtaaaatctaagggagtctttgttgtggggcttaggagccttgtacctactggctactgttggcgatcagccacaaaccccgaaggtgtttgatgaaatgacaatttagaactggaacaaactcaaatgcgatcacaagagaacttttgtgttgctaaacttggcagcattttctaatgcattgatcaacttaaatagcaaagatgcaatgcaggtccgttaatctccttacaggaatgtgcgatccacgttggggggcttgctgcaccatgcgctgcatgcttccctacttagccacgccatcccacgtggtggtgtggcaagcctccgaaccatttgttgtaggacacatggcgtggcaagcctccgaatgtgggatggcacattcctgtagggagattgacagactttcatcacatcttttctattttagttgatcaatgtatcagaaaacattgccaagtttaccagcacaaaggttctcttacgttcaagttcgagttcattccagttcatgatttgcatttcgttgaacaccttcggggttccaggctgatcgccaacagctactaataggtcggtgctatttgtgagtgctggctgcagcattagattgcatattataaaaagtgtatttaatattgttcctcattgctgtcatgcttcatttgcatacatgtaacgagtcaagtcttttagaacttcaattgcttgtgattttcaactgaaacatggtcaacaccagttgacatgacgagacatttgatctatttgatcatatgactatcgctcatccctcattgatgcacctacttacataaatagatgtagctatttcactgtatattagtaaattgatatgaagtggatttttcatcatggtgacttcaggagataaatttgaagcttctcatgtccacctggtcatgtctgttatctttgatgaacccatcataccataaacatgaaccatagagcttagtttgagtattttggttgtttagtttctattttctttactcatcattctctgtgagtactatcaaatctagtaatagatgtcaaagcatattgcaatgtcttgattaaggttcatcacaaattacttacatgttttctgttatagaggtcgcttccatggtataaaatgttaattttacttttagttcaacaaaatacattcatagccgataattactaacagcagtggcgaagccaagatttatgtatgaggggggccaattttgtaagtgattacgggctgttttggtttgctgccaaaatttgccctaccaaatagttggcactttgaatagtaccttatagatgtttggattgatgccaaaatttgacaaagttaatacaactcctatgaaccaactctaccaaaacattagtagtaccaaatcttgcccatgatttggcacttaccgatgatttggtggggcaccaaaccaaatgagccctacaattgaagaaaatagtgtagaaatatatgtgaattcaaggctcccaatagataatatatcaatatcaatgatataaaaatttgcattgggggaggccaggcctcttctcgccccctctggcttctcccctaactagcagccaggcaaattttgcctttgttggcaaaatattgcacttgcacatagctgaccccattttacaaatgcttgataggatttttttttgtgtaatttacctgcattttgtttttactgtacttgggcttatcagtagttgaatattgtgaatcatgcatctgagtctttttatgcagtatgtgtttagtgaaggcaaaatgaacattgaacggctgaagcaacttgtcgatctggttgggaaacataggcttgttttggaccttagttgtagaaaaaaggtaccaagtacttcggacatcttcttttcaaatttaattaattcattactgtgtgtgcaatgagaaagttagcacttcaaatacttcacgtgagctgttctcgttacattcttacaaatgttacaccttttgtacctgcagttcacgctcttctagtgtgatgcctatgctgcatgtcggcatacggacaattccaaacgcatggcatgcatggcatttcataggcaaaaagtgttagaacagtggcatggttgattacatctttttggaatttcgcttagaacagttcatgagggtccctttcttgaatttttcaatttgatctgttcaagtttaacctaaaatggtttaatgattgtgaaatataatttgcactatgtatgccctgatagttatatagagagcagtatacaatataccaaagtatagttgaattccaactaactggtttctgtgataaactgacatccaagagcatgaaccaacaacaataagtgtatatcactattttaggtgtaattactccatgtattccttttcatattcagaatgatttttactgataaagataattagtcataccatcagatatgagcattttacccctgaaacaagataaaatttaacctaaacaagttagtccttttaatagtttatatcgaagttagagaaacacaagctagctacattctcttctgtaaatacaagaaagaacaattaggattaccctaatgtgtttgtcattatcttattattgacaggtactttgatacttaattacgttcttacaataatatttcttgataggatggaagatatgccatcgtgactgacagatggcagaaattcagtgatgtctttgtggatgagccaacattaaaacatcttgctgcctatgcagatgaatttttggttcatggtgttgatgtggagggg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|
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