Os05g0437300
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0437300 |
|---|---|
| Description |
HnRNP-L/PTB/hephaestus splicing factor family protein |
| Version |
NM_001062187.1 GI:115464104 GeneID:4338905 |
| Length |
5712 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0437300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:21421838..21427549 |
| Sequence Coding Region |
21422162..21422551,21422664..21422807,21423695..21423802,21423902..21423915,21424002..21424050 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:21421838..21427549 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggagccgtctaaggtgatccacatccggaacgtcgggcacgaaatcgctgaggctgatctgctgcagctattgcagccgtttggcaatgtttccaagatcgtcatgctgcgtgccaagaatcaggcacttctccaaatgcaagacttgcataattcagtgagtgcgctgcaatactacagtactgttcaacctagcgtaaggggaaggaatgtgtacatgcaattttcgtcccaccaagaacttaccactgaccaaaactctcatggacgaaattcagatcaggagtcagaacccaaccgaatcctcttagttactattcaccacatgatgtatcctataactgtggaggttctacatcaagttttcaaagcttatggatatgtggagaagattgtcacatttcagaagtcagctggttttcaagcccttatccagtatcagtcactccaagaagctatggatgcatttggtgctttgcatggaaggaacatatatgacggttgctgccagctagacattcaatattcaaatctaagcgaactgcaagtccattacaacaatgatcgttctagggatttcacaaacccatcattgcctacagaacagcgtccaagggcctctcagcaaggctatccagatccaggtggtctttatgccttccaacaaccaggagcttcatatgcacagatgggaagagctgcaatgatcacagctgcattcggtggaactttacctcccggggtgactggtaccaacgaacgttgcacgctaatagtcagtaatttgaacactgataaaataaatgaagataagcttttcaatctgttctctctatatgggaacatagtccgaatcaaaatactgcgcaacaaaccagatcacgcccttgttgaaatggctgatgggtttcaggctgagctagctgtgcattatctgaagggggcagtgctatttgcaaagaagctcgaggttaactactcaaagtacccaaatataacaagcgctcctgatgcgcacgactacacgacttcaagtcttaacaggttcaacagcaatgtaatcaagaactaccgtcactgctgcgctccaaccaaaatgatccacatttcagccctcccacaagagatcacggaggatgcgattcttaaccatgtttcagagcatggttctgttgtaaacacaaagctgtttgaggtgaacggcaagaggcaggcgctcatccagttcgagagcgaagaggaggcgaccgaagcccttgtatcaaaacatgccacctcgctggagggtaacacgatcaggatctcattctcccagatgcagagcatatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAEPSKVIHIRNVGHEIAEADLLQLLQPFGNVSKIVMLRAKNQA LLQMQDLHNSVSALQYYSTVQPSVRGRNVYMQFSSHQELTTDQNSHGRNSDQESEPNR ILLVTIHHMMYPITVEVLHQVFKAYGYVEKIVTFQKSAGFQALIQYQSLQEAMDAFGA LHGRNIYDGCCQLDIQYSNLSELQVHYNNDRSRDFTNPSLPTEQRPRASQQGYPDPGG LYAFQQPGASYAQMGRAAMITAAFGGTLPPGVTGTNERCTLIVSNLNTDKINEDKLFN LFSLYGNIVRIKILRNKPDHALVEMADGFQAELAVHYLKGAVLFAKKLEVNYSKYPNI TSAPDAHDYTTSSLNRFNSNVIKNYRHCCAPTKMIHISALPQEITEDAILNHVSEHGS VVNTKLFEVNGKRQALIQFESEEEATEALVSKHATSLEGNTIRISFSQMQSI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4999..5388#4743..4886#3748..3855#3635..3648#3500..3548#3340..3391#3105..3146#2979..3028#2838..2902#1915..2047#1153..1234#781..855#608..681#401..457#aaacctccaacaacttttacaccaattgtaactgtaatgggcctgactcactccactcccttgcgcttgcgccggccctagccgatctcccctctcctcgtcctcggcctcctccacccccacggagaggtctcctcgcgacttcacccgccgcctccgcgccgatctcatctccatccccccgcgagcagcggcggtgccggtgccggcgtcctgctgcttccgccgccggtgagcaccccgtacggacgtccctcttccttcctcacatccttctctatccgcaccctcttcgccttaaatcttatcttctcttctttggtttggaagcttctctcttttggccttaaccttagtacggttaacaggtagacctgtggtgtggtgcggtgcggggaggatggcggagccgtctaaggtgatccacatccggaacgtcgggcacgaaatcgctgaggtgacggaggattgaatcgtggatcttttgtttcttctcctttctggatttcgtgcttattatgtgcctagatagatggtttggttttactgtgaaagctttattacctttacggcctgttcgctcactgctttgttgctgttgttgtaggctgatctgctgcagctattgcagccgtttggcaatgtttccaagatcgtcatgctgcgtgccaagaatcaggcgagttccttatccgttattttgcctgctatgcctgtagctgctaggtagatgtgtgctgatttatgtttattttgggggtggtttctggtggttcaggcacttctccaaatgcaagacttgcataattcagtgagtgcgctgcaatactacagtactgttcaacctagcgtaaggtaattgcactcttcatgtgatgattttggatgcaagtagctcctaaaaaggatagttttttttatataggtcttattattttagctgctgttgaaatatggcctccttctggacacttatggaagccaggaggttttgggttctgttttatgtgattttttattgacaagtgttaaactgttaatgcgctgagtttactgtgttacattctactttacacaacatataattttactgtccttcatgattttaaatcatctcatttggcatgtggttcacctgttatgctattttaggggaaggaatgtgtacatgcaattttcgtcccaccaagaacttaccactgaccaaaactctcatggacgaaattcagatcaggtatgcacgcacatctatataacactagatttttcctttctgaactttaggacttacttttaagcttttcaagatgaccaaaggtggacaatgtcatgtttgagctctgaagtctgcatgagttttaattattaatttttcttcaaggtcctcattcttaagttcttaaaccacttatgatttttaacttgtttgtggatacaaaaaaaaatgcacaagtctttattcgattgcacaatactcttgtgatggacaatccgctggccattgttggtttactcagtggaatctttaattccctccaatcgcagcacttaagtgctaatggtttaattcttctcaaatggcatggtttaagatgcctaaagttagtaatgcaatataggtgtattctagagccagaaaacaatattaatctgcgaaaaccggaaacttgaatcactgctcataatagaagtgtggcaatatttgactttgaatattttatattacacacttattgtgtcagaactgggagggtgattagctattccatttctcctcatctttcagatagttgagttaaattgcataccgtatctactgtatcttattgttacaactagatctgcgtattcctctctatttattcttctctctcctctctcttgtcttggtgcttgtttgctgctgggcctcaggagtcagaacccaaccgaatcctcttagttactattcaccacatgatgtatcctataactgtggaggttctacatcaagttttcaaagcttatggatatgtggagaagattgtcacatttcagaagtcagctggtcagattcccccatctctctctcactccgcacacacatgcatagttgatatggatgttacttagcagatgcatgtgaatggcaaggctgatttatcaattttataaactcaataatttccaatatgggtattactacgctgtaccctggttacaaaagcatttatgccaactgttgcagcaataatgttgtagtgcatatcaattgattacagtagatgcagcattgcgtatcatagagcaacagatgtttacatgcatgtagtactaatggaagcaacaacatggctcaattatagaagaagcacatagattattagatatcagcctctcatccaattgctgcaaatttcatatgttctccataaagaaatgtgggtgacagcatgattttttccaagcggcctagtctatctgttgtagtaaatattttttatcttttcagttactggtactacctctgtcccaaaataattgtaattctaatttgtttagcatatattaaggtttgagaagaaagactatgatgtcccttgttaaatggtgtataggtaagagtgtgagggtagttgagggtaaaataaggagaaatttaaatgagaagtgattaatgaaaccattagtattctattgtgataactattttgggacaaattcaaatcctaaaaatacaattattatgggacagaggtagtacatgtattcatctcccactgggataaataagtatggaatttcccaccgataatgcttgcaaagtatatttattgcattttgtttgtttgatgcaggttttcaagcccttatccagtatcagtcactccaagaagctatggatgcatttggtgctttgcatgtaatatttttattgttcatttaatttccctgtgtacatttctggtgtcttcattcttgcaaacaaaatattccagggaaggaacatatatgacggttgctgccagctagacattcaatattcaaagtatgacccatgactagtcttagttgaaatttatttatttttctcaatcttattttcttgtttccttgtatttcagtctaagcgaactgcaagtccattacaacaatgatcgttctaggtaaaattaacctctcatccttagtacttacaaatgacattattggacaatttgtaagcatcaataatttttagggagttgtacttgcctttaaaagttatagtacaattaaacttcagttcacaactcctcctttcttttgacttttttttaatcatcttgttgccttctctcaattgtatcctttatacagggatttcacaaacccatcattgcctacagaacagcgtccaagggcctctcaggttagagtgtgcttatgttctttttgttatcacatcacttgtttcatggacccatttttgctctgaaactaaatagagaattttattatttgaaaattattgaagcagcaaggctatccagatccaggtggtctttatgccttccaacaaccaggaggtagcacacttcaattttgtttgaatcaaatatttattgttgatatttgcaaaagttcctgatttaatttccttttgtgtgtgcagcttcatatgcacaggttagtctccagtgatatgtctttcactttgtggaaaatgcagatggataataaccctataagttctcataaaaaaacatttgcatttgattcattcagatgggaagagctgcaatgatcacagctgcattcggtggaactttacctcccggggtgactggtaccaacgaacgttgcacgctaatagtcagtaatttgaacactgatgtaagtctccatctgttctgtatcgttcaagactaccttaaccttaccacttatattcattattcataaacttctaagcttaagctgtttgaattgaacactttggtccctgagtttttgctaaaaggtagctttggtccttggtgttaaagaagtccaatgagggccctgatgttttgaacataaaaccagaggacctaatcaaagttgttatgccaactacacttgtggattgggtcctactcggctaggtggagatcaagtagagtgacagtaagtcgtataattgtgtttacctatgtgagccatcccagtcaatgaaatcatcagtaagtcaacaattcatggccaaactggaataaaacagctgcttgttgcctatctgttatgttatgatagggtcaaatataggtgaaggtgctgatacaagcattcatccctctctctagtcaggccccataagatggttagcaaatgaatgcagaatgctacatgctcattttgctctctgcagcccttagaaaggaagcatcaaagatgcatggctctagtggggtgtgttagtggggtgctcgtcaagagacttcacttccctcatcatgtagagaggttcttgagtacgattgaagctagcaggctgttggcatgaatattaggattgggccattctttggccagagttttgaatagtgaggatctttgtcattttttagaaaattgtagctaccagactgatcctttagtgaaaactcaacgaaccaaagtggtcgtttggcaagagtagtttaagcctgatatgccaacttataaggtattcaaagcttttgtgcaagatgttactggccttaaaccttggcatcttagttcttaactcatctgccttgcagaaaataaatgaagataagcttttcaatctgttctctctatatgggaacatagtccgaatcaaaatactgcgcaacaaaccagatcacgcccttgtt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|
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