Os05g0509300
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os05g0509300 |
|---|---|
| Description |
contains InterPro domain(s): IPR001656, IPR011760 |
| Version |
NM_001187554.1 GI:297724238 GeneID:9272465 |
| Length |
5813 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0509300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:25279897..25285709 |
| Sequence Coding Region |
25282620..25282703,25282843..25282916,25283237..25283301,25283480..25283643,25283726..25283793 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:25279897..25285709 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:25279897..25285709 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcgtgaacattacaaggagcatggtgatattgatatggcactaaggaacttccctcgacatcttgtagccgagaaggctattcttcaatgtttgaagaaatgccctggtaactatctgcaagcattaaagagtataccaagaacattacgaatgatgtacgttcatagttaccaaagttacctctggaaccatgctgccagtgccagagttgaaaaatatggcatttcgcaggctgtagaaggtgacttagtttatagcaaagagccccctcctggagaagcaacttcagttgatacttcagaaccttgcgatgaccaaataaattcatctgatattgatctatgttctgagacacttccagaagaaacaatccagtctgtgaagatagttgattctgaagatttattgaagggtgtctacacatttgaagatgttgtccttcctttgcctggttcgcaagcattatttcctggaaacggaattgctgacatttatcatgaattggctaaaaaggatggcattagcttgacagagaatgcacatggtgtcaagtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MREHYKEHGDIDMALRNFPRHLVAEKAILQCLKKCPGNYLQALK SIPRTLRMMYVHSYQSYLWNHAASARVEKYGISQAVEGDLVYSKEPPPGEATSVDTSE PCDDQINSSDIDLCSETLPEETIQSVKIVDSEDLLKGVYTFEDVVLPLPGSQALFPGN GIADIYHELAKKDGISLTENAHGVK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2724..2807#2947..3020#3341..3405#3584..3747#3830..3897#3988..4048#4380..4421#attccctcgcaaaaccctcgtctcctccacactctgctcttctcgcaaaccctaatcccacgcgcggccacctcccatggcgcgctcgacctccctcaccgaggcggaggcggggatcacctgcttcgcctcctccctcccgggcttccgcggcgtcctcaagcaccgctactccgacttcatcgtccacgaggtcgcccgcgacggctccgtcgcccgcctcacctccttcgatctccccgacgaggtaagcttagccctctcgaccccgattccgcggctccctcccgggatccccgattttttttcatcgcgctagctcagctccgccgtgtatcgcagtgcgtggatgtgagtgaggaggacaaggcggcgccgtccgccgacgcggaccactcgcaggccctcgagtcgttccgtgcgctctgtggcgatgcggattgcgacgcgttgaaggggctcctcgagaaggcgtccgcgggggctgaggctgatgtatcgccggttattctctcgccggacgccgataaggctcatcgatcggttggtttgatcccccagttccagtttctggttgtttatgtggttgagattggtggaaatggtgtgatttgggcgtgtttttggctgtaggaggtgcataatttcttcaagaggagcttcaagtttttggtcaccgacacggtcgaacacaatgatggagttcagagatgcattagggtgcggctgggatcaggagctaggggagggcggggtggcggtgggagaagtggtggtgggaggggaaggaagaggaagaacatgggtggttctgattggagagatgacaggccatttgatagcagaggatcaactagctggccaaatcatgttgggaagttcctaaggtggtggaattcagcttgaattgatagtttctattggcctggtatctttagctggcctttgtactcgaatgtgttcatctgacttgctgtgtattttacttggctaaacttaataaaaaacatctaatctatgtgtataaatttgtataagaaatattatgtttttgcttcgtctaattttgctgttaattagcgttataaccggagttgtcattctggtgtgctgaccaggtttcacctttgcaaagagaacaaggacacacaagaagcgttaggagtaattgggaaaatgttaggacttcaggtatacctcggttgctaactcataacattgtgttcttgtttctactgaatgctttgattcttcttttttaccttccttcgcattcctagttgatttctataccttttgcaatttgcagtcacgttcattcgggtttgcagggacaaaagataaacgtgctgttacaacacaacaggtacttattcctcatgtgcataccatctcactcaattttctttacataaatcgtgtttttgtacaatttgtttaaaagttcgcatacaagtatgcaagaaatactggtataattttaattaaggcataatttatggtattatgatgttacaaccagatgagataagtgaagctgctctggtttggaatactacatgtagtattgtcttggcaaaggagttttgtgaaatgaaactacaagatcatttttctttaactagtaccgttcatagtttttagtcttttcacctttagtttgtattgcttggctttgttctcatctctagcctacccagcttggttgagattaaaggctggtgttgttgctgtattttgcatagtgatttttagtctatttgacagatttgtttatgttatctcactcctttttcatggttgtgatcctctgcatgtaattacgttttcttgcaatggttacttttctgattgttttcccctggttaggtgactgttttcaagatatcagccaacagattggctgcacttaataatcgactatttggaattaaagttggaaactttaggtaggtgataaaatgcattatcctctttgttgatatcattgcaatgtaattattctaaatactaattatttttgcattcctttctagttatgtgaaggagggacttgttcttggtcaactaatgggaaatcgatttacaattactctgaggtacttgttttttatttctccttttagtttaatgtaaaaaactaaaaatgttctctagtgctctaaaaaatgatttgcactaatcttagagctcatggagggcctgatttgcagctacatattacttcactacaaacagtactatatttcacatgcaccaaacctcttcttttcttggttcaagaaaaccaaacaaatggagagctgatattttcctgcatttcttcaggggtgttgttgcagaatcagaagacataataaaggcttctgtggagggcttaggaaagaatggatttatcaactactatgggttgcaggtatgaagccagaaccttttcgttatgcttcaaaacctaactggtacgtgtttacttttgaagctcatcaagttcatcttttttgttggttagcgttttggaagtggttcagtacctactcaccttgttggagctgctttgcttagaggagagtggagaagttctgtaaatttgattcttgatccaagggaaggagatatccttgatttattttatccaatcagcagttgcatacttggatatatagctgtgccaacttttgttcaacataacttaatactccgaacagagagatgacataagggagatgcgtgaacattacaaggagcatggtgatattgatatggcactaaggaacttccctcgacatcttgtagccgagaaggctattgtaagtgtagttcttttccttcattacttaacctggaattatttaaaacattggctttttagtttttattcaagttatgtaatgtagatcacattatttggggaagttaaactgatattctttcatgcattgtttccagcttcaatgtttgaagaaatgccctggtaactatctgcaagcattaaagagtataccaagaacattacgaatgatgtatgttgtttaactttcttcgtcttttcatgtttctttacattgatgggttagtcaatttctgttacctcaaaagctaagtagattttataatatacaaaattgtattggaattattatagacattagtcatgaacagtagtagatctgttatatgtacctgtttttaaaattgttctctgctgctcaatatacataccgtttgatatattcaagcttttctgttaccctttttctctgttctgttttgttgaccaatttattaattctcatattttgcttatgcgtctttcttatttgctgttgcctcttttatgaaggtacgttcatagttaccaaagttacctctggaaccatgctgccagtgccagagttgaaaaatatggtcagtgcacttcatccttctacagctactcagttttagttgaatcatgatgcagtttgataattttctgataacggctaaccttgacctttttcttcaggcgtgttaccttttgtagttttatatggtgaacttctcttttcccattcctccttatgctaactggtgtacttgacaggcatttcgcaggctgtagaaggtgacttagtttatagcaaagagccccctcctggagaagcaacttcagttgatacttcagaaccttgcgatgaccaaataaattcatctgatattgatctatgttctgagacacttccagaagaaacaatccagtctgtgaaggtctgtaatttgcagcaaacaatgcggtgtacatgctcatgcacaaaaagttcctaatcatgcactgtcatttctcgtgtagatagttgattctgaagatttattgaagggtgtctacacatttgaagatgttgtccttcctttgcctgggtatttaccattccacatccataacttcaattttcatattgaatcacattgagaaatatatatggtgtgcttatttctgtaaacatgcagttcgcaagcattatttcctggaaacggaattgctgacatttatcatgaattggctaaaaaggtgctactatcctacaaaatttattttatagtttattcagaagtacttcctttgctttgccaggaacttgtgcattcttgaatttcctctataacccttctgttgctaaacgcaaaaaagaaaaacacatattgtaggttattggttgctagatatgtttactgtgaaatgtgtttagtttcccttttctttttgtggataaacgatacttctgtaatgtcacaggtttaattggctaatatattatgaatgaattacacaatattttttaaagtgaaagattaaatccaagaaataggaatcatattgttgatttgctttcatgtctcaggatggcattagcttgacagagaatgcacatggtgtcaagtaagtttctttattttactgtaaagatcaaaggcacctctaaaagtcaatacttagtatatgtgctatgacaagctttatatctttttgttctgatatcctactatattctcattctgttgtatatattaccttggcttgcatatttcaatttgctactttataccctaacttctatgctatatgatacaaactccatttttaagggagttttcaattacaagcatgaaaggaggttatcggcgggtgttccagcggcctattgattttgagtggtatgccttatcccattgacttttcacttcattagatgaccaaaatcatcaccttttctttcgtataaattctagccctgttccactaaaaaatgctttggtgtgactgtagggaactcatgacttatacagatgacacagcatctttagcagaaactgatttggatgttctgtccagaaacaaacctacaaaagccaaggaagtaaatgagactatatctagcgcgatttcaaatgctcaatcacatgattccaaggtggcaggaccattggatagctctatgccaggtagtgaaactggcttagtagaggaaaagtctgtcggtagctcagatatgttagcaaggaaattggccataaaattagcatttactctaccagcatcctcctatgctacaatggctattagggagttgctgaagacttcaacctcggtatgtttctcaactaatattatattactattcttttactagaatttaaatgatgttaaatggactctgtttatggtgttatgcatagttaagaatgcatgcctacttgagaattcaaatacatttaattatggcagttgcccaacagtattgttaatattttaggacgtcaggagaaaatattgctgaatatttcaatatatatgctattgctctaacatgttaacaaataacaacattcatttcataattaccttctgctcgtctgcaggtcacgtatcagaaaacactcgattgttaattttgttattgacatcaattctttatggggaatcttccaagccgcatcttagaggagttgacatagttaagcaacatgagttggtatggtgtttgaattgtgtttgtgtaatttttatcgcgtggcactaagttattaacttataaatcctgatctgattattgcagtattgcatttaacagcccaaatgaatcggcattgagatataccatgctgctcggcctgctcccgttcggtgcatactgaattgctgatgcacgtttgtgctattgtgggggttaaaaacttgttttgccactagaatatgtggcatgccataatattgtatgaacttttgtaaccaaacagggatattaaagttgagaacccttgcgaggtttccttct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
