Os06g0116500
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0116500 |
|---|---|
| Description |
Pleckstrin homology-type domain containing protein |
| Version |
NM_001063156.1 GI:115466043 GeneID:4339931 |
| Length |
8270 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0116500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:912427..920696 |
| Sequence Coding Region |
912678..912959,913754..913828,914059..914112,914848..914913,915137..915236 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:912427..920696 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:912427..920696 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatgatgagctcgtcgacctcgaggagggaggcggcggcgaagagctccgagctggggcgcgccggcggcgtggatcccccgaggccctccgcggcggcgatggcgcggagcggggagctccccaaggtctcggcggcggcgacggccgcggtgcggcacgaggggtggatgctgcggtacgggcggaggaagattgggaggtcgttcgtccgcacgcgctacttcgtcctcgacaacaagctgctcgcctactacaagaagcagcccaaggacaacatggtgccagtgaaggcgcttcaaatagatggaaattgcagagtggaagacagagggcttaaaacacatcatggtcaaatggtctatgttctgtgcatatacaacaagaaagaaaaggagaatcatatcacgatgggtgcgcatgatatcgaggatgccctggtctggaaaaagaagctagagctccttattgatcagcaacaagacactatgacggctaaaaaccgcaaagcttttgcttcactggactttgacatggagtttggaggcccattatcattctctgatcgtgacagtggaccggaagatgaagaagagccccggcctactttgcttcgtaggacaactatcgggaatggccctcctgattcggtacatgattggaccaaggagcctgatattgggctgtcagatcagaatgacaccaaccatgcttactcaagaaagaactggcggctacttagatgtcagaatggcttgcgcatctttgaagaacttgtggaggttgaataccttgcaagaagctgtagccgagcaatgagagctgttggtgtggtggaagccacatgtgaatccatttttgggctaataatgagtatggatgtaacacgatatgagtgggattgtagcttccagtatgggagtttagttgaagaggttgatggtcacactgcaatactatatcatcggctacagctgaactggttttcaatgttggtctggccccgggatctttgttatgtacgatattggcggcgcaatgatgatggaagttatggtaatctttggatgtctccttgttggtcactttcatcattctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MMMSSSTSRREAAAKSSELGRAGGVDPPRPSAAAMARSGELPKV SAAATAAVRHEGWMLRYGRRKIGRSFVRTRYFVLDNKLLAYYKKQPKDNMVPVKALQI DGNCRVEDRGLKTHHGQMVYVLCIYNKKEKENHITMGAHDIEDALVWKKKLELLIDQQ QDTMTAKNRKAFASLDFDMEFGGPLSFSDRDSGPEDEEEPRPTLLRRTTIGNGPPDSV HDWTKEPDIGLSDQNDTNHAYSRKNWRLLRCQNGLRIFEELVEVEYLARSCSRAMRAV GVVEATCESIFGLIMSMDVTRYEWDCSFQYGSLVEEVDGHTAILYHRLQLNWFSMLVW PRDLCYVRYWRRNDDGSYGNLWMSPCWSLSSF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>252..533#1328..1402#1633..1686#2422..2487#2711..2810#2889..2948#3028..3144#3275..3315#3401..3501#3586..3681#4093..4201#agtggcttacaataataattaatctctcgtcttctctctccgcctcccccgcctcgaaaccctcccctcctcctccgcctgtcgccggccacctcgccggctccggccgccgtgattcggcggggcctgcgccttgcctaggcctccacgttcccctccggtgccacctcacccgctggggtatggctcattgacgtggcggcccgggggacgtgacgcgacccagttggaattcgaaatcaccgccggagatgatgatgagctcgtcgacctcgaggagggaggcggcggcgaagagctccgagctggggcgcgccggcggcgtggatcccccgaggccctccgcggcggcgatggcgcggagcggggagctccccaaggtctcggcggcggcgacggccgcggtgcggcacgaggggtggatgctgcggtacgggcggaggaagattgggaggtcgttcgtccgcacgcgctacttcgtcctcgacaacaagctgctcgcctactacaagaagcagcccaaggacaacatggtatacacatcatcatcctgcaacttatgctcttgattttgctgtcatactcgcgaactcgcgatgcgattcatttgtcgtagtctcgcagaaagctgcgctaccttttttttttcaagagtttctcatgaatttttagcgggatttcgtgacttgtggtttattctgtccaattgggtggagtggaggatcggaggatgttctagttacgataactaaatctgaatgtaggggaatttgcctgcatcatgatgcgatgcacatgagttttctgccgttattttggatttttgagtggtttgactagcacatagaaccacctgccttattttaatggtatatgattattgcaaactgatgccaactatttaaccgtgaagctgagttggaactgtttaccatctgtatctccggatgcttttaatttgaggctaggaagtgctaattaatgacatactgttgttaagtaatggagttttgtctcttcagctctgggtcatttagagtagcgtttgctgtaaatgtactgcttcggtagatgtaaagcatatcgttggagagtaagaatgtctgaatgagtcatggattatgattcttgaataagattcttatagctgaagtactctttattgtagagtacttcagctgaagtactcttgattgtacgccttattcggaggattttaacctaataaattgccatactgatacacgagtttagattggaaattctgcaacaggagcatggtggctgctttattttgattattcatttaagatttgtggatgggcaggtgccagtgaaggcgcttcaaatagatggaaattgcagagtggaagacagagggcttaaaacacatcatggtcaagtaagttccctcttctcatatttaattcatctagcatcataacataaagcataaagcataaagcgtatcatttaattccttcaatgggaaagtttcttgatacctttttcttgaataaattcactatcttttagtttaagaaaaacaccttacttttgaggggtactgctgtactgttgtgacgttaataccgtcatttacttatttgtagtgatattcttgttttgcagatggtctatgttctgtgcatatacaacaagaaagaaaaggagaatcatatcacggttcgttacgatgctaacttgccaaaccagaatacactctatgtttgagaatttgcttttaaacgcacttgctgatattttgtctgcaatatatagtttttactactgcagtgtattggaaaaagcaagtatataagctggatgttaacccttttcttgccatccttttttgtgtactttgtttatgggtcatatatttctgttgacctaaaaaagggagcgatgccctttctacatcattctggttttatagttaaaagaagacgctactttcactagcattagtgtagcttttggatatagttaaaagaagacgctactttcactagcattagtgtagcttttggattccctttctctgcttgataattgactaatgctatgcaattttatttgctcaagtttaattgacaataacagtgtaacactacatatgggagagatgctagtggtccttttgtgtgtactctttcatttagtatcctatagcctttttctgtcacatatacctatacagtaagggtaattttaccatccttgaaaaagtactgagaggtaccacactttctagtataaaatttggtacctccaggtattaagtaccttgagatacaaaaaaaattagtgtaaaatttaggtacatcgaggtacttttttaaggaccataaaatttctcatacagtaaacttgtcattattcaaataccatcttaatcctagtattgttcttctacagatgggtgcgcatgatatcgaggatgccctggtctggaaaaagaagctagagctccttattgatcaggtgtagtaagtccaacagactgtaacaacatatggcaattgttcgaagtaataaggatatttcagcccctttttcattagtttcttgtttagctacggtgtaagaaggttctcccttgtacatattagattcaaaagaaatctataacatccattttttcaataattctatgacacaccaatgaactgtcctaggcataacatcggagatattcattctgcagcaacaagacactatgacggctaaaaaccgcaaagcttttgcttcactggactttgacatggagtttggaggcccattatcattctctgatcgtgacagtgggcaagtgatttcatattttatctagctgtatgtaagtccttctggttaaaagtaataggagattttactctattatagaccggaagatgaagaagagccccggcctactttgcttcgtaggacaactatcgggaatggtaaacatacttttaattttttattaatattttgtaatggctacacgagagaacttaaatacaccatttctttttctaggccctcctgattcggtacatgattggaccaaggagcctgatattgggctgtcagatcagaatgacaccaaccatgcttactcaagaaagaactggcggctacttagatgtcagaatggtaagttcacagccctttacgtagattatatataggcatgcatataaggggtactttaaaattttgaattcaactttaggattgttcaaatgaagttacaattagagtttcctggctttatgattggcaggcttgcgcatctttgaagaacttgtggaggttgaataccttgtatgtacctctcttacctatatactgtcaaaggcagacacgccaatgctatgagtaaccttttatgccttgtgcacccttacaggcaagaagctgtagccgagcaatgagagctgttggtgtggtggaagccacatgtgaatccatttttgggctaataatgagtatggatgtaacacgatatgagtaagtgtgtgctgtttaagtgttttacttcctaattgcttttctatgaatgctgacctcagtattatttatgctccactgtaggtgggattgtagcttccagtatgggagtttagttgaagaggttgatggtcacactgcaatactatatcatcggctacagctgaactggttttcaatgtaacaccttttcttgtactgattatttatgtgcacatatcatctggttctgttataacttgcatgaggattgcattttatatcttattgaaagtctaaataaactatttgagcacgaacttttttcatttggacttgagtgtagaatatttatgcctggcatatattgtacaattcacttgttggaattgcctctgcacccaatagggcaatgccaactgccaaattcattactgtttttgctgtttggacaactgttgctaaattaaaattgtaggatgagaacttctatatggcagtatcatactccacaagacctgggttctttactttatatcgatatattattgcattacctcagatttggaataacatagctacatctaatttaatagataactgaacatgtaggttggtctggccccgggatctttgttatgtacgatattggcggcgcaatgatgatggaagttatggtaatctttggatgtctccttgttggtcactttcatcattctgaagcaacttgtttgattcaatgttcttaaacctgcagttgtactgttccgatctactgagcatcagaattgtggtccccaaccaggatttgtgagggcgtttattgaaagtaatttgccttctgcttatcaggatgcttgatatattaaaacaagtgttgcacaacttttgttttttaaccttaacttcctactagttcaggtggaggttttaaaatttctcctctcaaatgcgtcaacgggagaccacgcactcaagttcaacaccttatgcaaattgatctaaagggatggggcgtcaactatttttcatcgttccagtactactctttgttgcagatgctcaactgtgttgctggtacaaagtacaaaccattcttttaacttttgatgacatgtcctaatttcccgtgaatgctaaaaatgacaaataaatactgttaattaatcacaacgttctttcgtgttgatagtatgtgtctatgttggtctaacatttgcatttatgtccaggattgcgtgagtacttttcccaaactgatgatattcatccagttccgaggattcctgtgatgagtactatggctactgtgtccaaattgaaaaaggataagaaactccaagaaactgacttaaagacaaaacaagctgattttggacaagtcgat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