Os06g0143900

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Structured Information

Gene Name	Os06g0143900
Description	Similar to Coatomer protein complex, beta prime
Version	NM_001063314.1 GI:115466359 GeneID:4340097
Length	8815 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os06g0143900, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 6
Location	Chromosome 6:2319838..2328652
Sequence Coding Region	2320326..2320345,2320800..2320911,2321101..2321245,2321362..2321468,2321581..2321674 ,2321761..2321957,2322320..2322391,2322513..2322627,2323069..2323185 ,2323262..2323353,2323454..2323630,2323755..2323829,2323920..2324060 ,2324680..2324868,2325307..2325372,2325454..2325604,2325727..2325795 ,2326302..2326450,2326535..2326666,2326765..2327090,2327176..2327212 ,2327935..2327988,2328112..2328174,2328298..2328318,2328473..2328475
Expression	GEO Profiles:Os06g0143900
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008399:2319838..2328652 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008399:2319838..2328652 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgccgctcaggttggagatcaagaggaagtttgcgcaacggtcggagagggtcaagtcggtggatctgcaccccacggagccatggatcctgtcgagtctttactccgggagcgtgtgcatctgggactatcagtcgcagacaatggtgaagtcatttgaagtttcagaattgccagtgcggtcagcaaaatttatttcacggaaacaatgggttgtagctggtgcagacgatatgttcattcgtgtctacaactacaacacgatggacaaagttaaggtttttgaggctcatactgattatattagatgtgttgcagtccatccaacacttccatatgtgctttcatcatctgatgacatgttgataaaattgtgggactgggataaagggtggatgtgcactcaaatctttgagggacattcacactacgtgatgcaagttactttcaatccaaaggatactaacacttttgcaagtgcatctcttgaccgaactacaaagatatggagtttgggttctccggatccaaatttcacactcgatggacatcaaaagggtgtgaactgtgttgactacttcactggtggtgacaggccctatttgatcactggttctgatgactccactgcaaaggtctgggattaccaaacgaagagctgtgttcagacacttgaaggacatacacacaacatttctgctgtttgtttccatcctgagcttcctataatcattactggatctgaagatggcacagttcgcatatggcattcgacaacttacagacttgagaacacgctaaactatggtcttgaacgagtctgggctgttggatacatgaagggttcaagaaggatggtaattggttatgatgagggaactataatgataaaaatgggacgtgaagtacctgtggcaagcatggataccagtggaaaaatcatttgggcaaaacataacgagatacagactgtgaacatcaaaactgttggtgcaggctttgaggttacagatggggaaagattgccattggctgttaaagaattaggaagttgtgatctttacccacagagcttaaagcataaccccaatggaagatttgtcgtagtttgtggagatggtgaattcataatttatactgcattggcttggaggaataggtcatttggatctgcattggagtttgtttggtcatcagaaggagagtatgctatcagggaaagtacatcaagaataaagattttcagtaaatcatttcaggagaagaaaactattcgccctacattttcagctgaacgtatttttggtggaatattattggcgatgtgttccagtgatttcatttgcttttatgactgggctgactgtagactaatacgccgcattgatgtgaatgtcaaaaacctttattgggctgatagcggtgacctagttgcaatagcaagtgatacatcattctacatactgaagtacaacagagatgtcgttgcgtcttatctagaatctggaaaacctgtggatgaggaaggcgttgaagatgcttttgagctgcttcatgaggttaatgagcgagtgcggacagggatctgggttggagactgctttatttataacaattcatcatggcgcctgaactattgtgttggtggcgaggtcaccacgatgtatcacttggatcgccctatgtacttgttgggatatctagcgaatcaaagccgagtttatcttattgacaaggaattcaatgtcatggggtacacattacttcttagtttgattgagtacaagacacttgtgatgcgtggggatattgaacgtgcaaatgatattttaccatccataccaaaggcgcaatataataatgttgctcatttcttggagtcaagaggtatgctggaggaagcacttgagatagctactgatgctgattacaggtttgacctagctgtgcaacttggaaaattagaagttgcaaaggctatcgcgatggaagcgcaaagtgaatctaagtggaagcagttgggtgaactggctatgtccacaggcaagctagatatggcggaagagtgccttgtgcaagcgaaggacttaagtggcctgttgctactatattcatctcttggagatgctgagggaatcgagaagcttgcttctcaagcaaaggagcatggcaaaaacaatgttgctttcctctgtctctttatgcttggtaaattggaagattgcatacaattgctgatagacagcaatcgtatacctgaagctgcgttaatggcacgttcttatcttcccagcaaagtttctgagatagtagcaatatggagaaatgacctcagtaaagttaatccaaaagctgcagagtctctggcagatccttctgagtatccaaatttatttgaagactggcaggttgcacttactgtagaaaagaatgttgcttctcggagggtccattatcctcctgctgatgagtacttgaaccatgctgaaaagtcagacatgactcttgtggaagctttcaaaaggatgcaggtcattgaagatgaggaaacagaagatgcactagatgaaaatggagagcccgatgaagaggttttggaagagaacaaagtggaggagagcacagatgaagctgtcgaagttgatgctgatgagcctgaagagaccgttcttgtaaatgggaaagagggtgaggaacagtgggtgctaactgaacatgagtaa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MPLRLEIKRKFAQRSERVKSVDLHPTEPWILSSLYSGSVCIWDY QSQTMVKSFEVSELPVRSAKFISRKQWVVAGADDMFIRVYNYNTMDKVKVFEAHTDYI RCVAVHPTLPYVLSSSDDMLIKLWDWDKGWMCTQIFEGHSHYVMQVTFNPKDTNTFAS ASLDRTTKIWSLGSPDPNFTLDGHQKGVNCVDYFTGGDRPYLITGSDDSTAKVWDYQT KSCVQTLEGHTHNISAVCFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSTTYRLENTLNYGLERVWA VGYMKGSRRMVIGYDEGTIMIKMGREVPVASMDTSGKIIWAKHNEIQTVNIKTVGAGF EVTDGERLPLAVKELGSCDLYPQSLKHNPNGRFVVVCGDGEFIIYTALAWRNRSFGSA LEFVWSSEGEYAIRESTSRIKIFSKSFQEKKTIRPTFSAERIFGGILLAMCSSDFICF YDWADCRLIRRIDVNVKNLYWADSGDLVAIASDTSFYILKYNRDVVASYLESGKPVDE EGVEDAFELLHEVNERVRTGIWVGDCFIYNNSSWRLNYCVGGEVTTMYHLDRPMYLLG YLANQSRVYLIDKEFNVMGYTLLLSLIEYKTLVMRGDIERANDILPSIPKAQYNNVAH FLESRGMLEEALEIATDADYRFDLAVQLGKLEVAKAIAMEAQSESKWKQLGELAMSTG KLDMAEECLVQAKDLSGLLLLYSSLGDAEGIEKLASQAKEHGKNNVAFLCLFMLGKLE DCIQLLIDSNRIPEAALMARSYLPSKVSEIVAIWRNDLSKVNPKAAESLADPSEYPNL FEDWQVALTVEKNVASRRVHYPPADEYLNHAEKSDMTLVEAFKRMQVIEDEETEDALD ENGEPDEEVLEENKVEESTDEAVEVDADEPEETVLVNGKEGEEQWVLTEHE</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os06g0143900, RefSeq:Os06g0143900