Os06g0144600

From RiceWiki
Revision as of 20:17, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os06g0144600

Description

Peptidase M14, carboxypeptidase A family protein

Version

NM_001063317.1 GI:115466365 GeneID:4340100

Length

7206 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0144600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:2357311..2364516

Sequence Coding Region

2359262..2359369,2359468..2359570,2359684..2359809,2360221..2360267,2361293..2361406

Expression

GEO Profiles:Os06g0144600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008399:2357311..2364516 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008399:2357311..2364516 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>tgctggcagtttttcaccaacaacgatgaaattaactacagacaacctgaaactagagctattatgaactgggtaaaacaagaacacttcactgcctccgctagtttgcatgggggtgctcttgttgcaaattatccatgggatgggtctagagatcaaagcaaacagtattatggatgtcctgatgataagacattccggtacatggcatcagtttatagtcaatcgcactataacatgtctttgagcaaagaatttaaaggagggattacaaatggagcattctggtatccaatctatggtgggatgcaagactggaactatatacatggaggttgctttgagttaaccctggaaattagtgacgtaaaatggccaaaggcagctgagcttcctgtcatatgggaacagaataggatgagtatgcttaatcttgctgcaagccttgtgaaggtaagacatttccacaggattcatttttttcactggaaaggttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>CWQFFTNNDEINYRQPETRAIMNWVKQEHFTASASLHGGALVAN YPWDGSRDQSKQYYGCPDDKTFRYMASVYSQSHYNMSLSKEFKGGITNGAFWYPIYGG MQDWNYIHGGCFELTLEISDVKWPKAAELPVIWEQNRMSMLNLAASLVKVRHFHRIHF FHWKG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5148..5255#4947..5049#4708..4833#4250..4296#3111..3224#ggctcaagcacgcggccatggcgatctcgcgccgcctcctcctctccctcttcctcctccgcgcattctcctcgcttcccgctcaggccgcagcgagaggcgcctcccatccctcaggtctccctctctctctctctcttaccttgtctgcggtttttttccccgctcatgaaccactgcgtgtggtgccgattggatgttctagagctcgattcgtccgcgtggaatctgtatgttcgatttctcagctggggagctcgggaggacacgaatccactgcttcacttccggatttgtgggggcgatgtctgtgcctggacaattttggtacaagtgacttccggattggggacgatgatgtcagtgcgtggacagtgatgaagagcacaaactcttcgagtgcaatatgagggtgtagttgtgtggaagattgcgtcatgtacttagcttggataattactgtgatgaactcgcacacctctgtccttttctgcgaagaattttagctagactgggagttgtgactttaggcctgcatcatcgtctcatcttatagaatcattgtcaatagacgtagcagatctgttcataggtatgcagttagtgactcaatctatatgtttcttaaccaggtaccagcggaaattatgggtcatttttgcgcaacctgcttcaggataatcccatgataacgtatgtattaattatagccttttatgtttcgtttatttcgtcattgcatattttgcacgccaacatgggattgagcatattggctatgcttttgtaacaaacttagggaggaattggtccgtggatatatgagcaactcggaacttgagattgctgtgcatgccattggaagccgctatcctaatatctccaggatatacaggtacattatgttgtgatactttgcttcttggcgatgcgagtatatcatggagtttctcaacagcattcaagaccctcaatatttttaaccatgccaaatcacatcactggtgaaactgaacatcgattaaaatcacatgaaaagaaaacctataaatttccaaaactctgagaattatgagatacaaggaacttcaaagttatgttaaaattgcaaagtttaaccagattaggattttaacctgacatttcaccatcaaagtatggtattatggtgtaatcaattctttgctgtcaatggtccatacaatctgcactgataggtagttagggtaaagataagatatcttttagagaaaagcaatcataaaagtgctaagttcaaaaccatcagcccactcataaaattctatggtgttctatttgtggcatgcgagagatctgtgagcagataattgagtagtatataataaagaactgaatcttctagttggatactgtcactctgtcagttacactgatggactgtagcttgttatggaacttcaaatttatattgaattcatctcaagtttttcttaaaagtgttatctctcacttttatgtcctgtatgctcatacattcaaactttgcttacctattatttattctctctttgagggattgcacgatcatgttatcagcattggaaagagtgtgaatggtgtcacattggtatgtaactcgagtattttttatttttgttatgctttagttaatgttaaatttgtataagagaacttttatggttcttgtagtgggtgattgaaatatcagacaagcctgggcaaaaggaagctgaaccagcattcaaggtttgtggttctgtttcatgaagagtttcctacattggtgttcccttttcaatttgtatatgcaatgaactcaatggatgaaattctatgccactccactctgataacaattatcctcatcggcttatctagtgttttgtaggcacctttgacagaaaattatattcacacatgtggaatatcttcaatgtcaatgtaatgtctttactccatttaatttatttgactcccgtggggctatagccatttctttcttaattctttaggacttatccccatattgcaactgaaagataagctatagcagaactgtacaagtggttccccacaaccaccaccacaaaagttctttaaaggagaaatcagtgtcctggtaccagcagtgtgacatgctagggaaaaaaaaacacatactaattggagccattagttgtgcctcaagatacttgccactctccatgtctagaccaattctggtggagaggaagattcagtaaggaagatacatctgttgcgttctttccatagtaaccagagatccagaacaccagaattaccagaacactgaaaactttttgaaactgcctgcaacctctttccttgccttcaaccacgaggttcacctgacatcttcccccacagttggcactaggaaatcaatgcagcccaatcacgcactcggagctacattggtcaagtgtaggatggtacgagtaccagagcagaggtgtgacagtataatgcgtaataacaattattcatataactttctttaaataataacctttagcatttattcttactacactataaatctgtaaataaatatctaggttatctatttcgtcagtggttctgattatatatctgtgaattttgatgtattttttgtacaaacttgcagtatgttggtaatgtccatggtgatgaacctgttggaagggaggttcttataaagcttgcaaattggctgtgtgataactatttgaaggatcccttggtaagcaagattctcacattgttatctgctcttaaattcgatgtttgtctggctcaactatggttttacgcaatatatttccatctgttttactgaaattgatagaaatatatggtaagctcaaaaacttaccagttaaactaatatctgtaggcaactcttattgtgaaaaacatgcatcttcatatacttccaacgatgaaccctgatggatttgctcttagaagacgtggtaatgcaaacaatgttgacctcaacagagattttcctgaccaagtcagtgatgcattattttcttcttatggaatatttggattccttttgttctttacctacttgagccttttaattatattgttaatgctggcagtttttcaccaacaacgatgaaattaactacagacaacctgaaactagagctattatgaactgggtaaaacaagaacacttcactgcctccgctagtttgcatggggtaattattctttccctagcacttctatgcaaaaatattaaattagtcatgtaattatcttcccagttatctttctgtgatcaaagcaaatttcagtaaatgatgaggcacctcatcaggttccttttctggtttataatcttgctcatctcatgggaatgtcctccctttttttttgtctttttgttagttattacaagcaagggaactattttgctgctatattgagttacctatgttgcttttaattttaggtgctatctttaccagtattcttactgaaaatgctagggtgtttatgctctctctgctgtttatggtttggatgttattatctgtagttattgatactggtaatgtcatatatttgacaattcttactttgttggataatattgctttctaaaagcaagcaaatgggtttgaattagaccttgtagtccacaaactactttggtataactattagtttcactgaggcattcttcacttagtcttcaagcgttaaacatcattgttttaagttttaacacataaaataaaaacagtaacatatgggagggaaaattatcttgtttaataataatagaaaatctttgtagttcaggaaatattttattgatttattagtttctctgggctgcattcatataatcttcgaatattaacataatttgttttaattttaaccagaataaaaataataacagaccagggggagagaaggttctttttttttaaaaaaaaaatctactgaattgcaagcatgatggttgcaacttgcaagaaggaaatctcgtgcacagcttgtaagattagtttatttgaaatcatgagttatttatcctaccagcccatctactactctactaattgttaatggtgcaatgcatggagtttacagatttgttcacatgttcaaatgacccttattaattgcattgattatttttggtggcagttcatttcaaagttcaaactagtgcctgggattcatccattgccctttgatttgaattttgcagggtgctcttgttgcaaattatccatgggatgggtctagagatcaaaggtgttaccttgtttctattatttacattcagttcaagtattccaattattagttttgtgtaaattttgtacatcataaaaatatctagaaacaatcttttgatcaaggacttcccacgcatttattagtgtatgattcaaaggttgtatggttatgtatttttctcgacttattgctaatgctagtattacaaatttgatgtttgcaaatagtttcatagagtttggagtgcatgtgggtacctttgcttgttctaatgcgacattgtcttgactctttatgctgttgactggtttttcttctttacaagatcattcagatatcttagcatcatggtagttgagaaagacatccgtgatacatgcttactttgaaactttgtcattctcacaaggattgtcattcttacagcaaacagtattatggatgtcctgatgataagacattccggtacatggcatcagtttatagtcaatcgcactataacatgtctttgagcaaagaatttaaaggagggattacaaatggagcattctggtataaaactagttttgtattattgctccttatcattttttttatttcatatcaaacattttgttgctgctacttttcatgctaactagcaatctatgcttttttgtgttgaggtatccaatctatggtgggatgcaagactggaactatatacatggaggttgctttgagttaaccctggaaattagtgacgtaaaatggccaaaggcagctgaggtatttttctttttttttgcatctagttatctgcctatcaatttccagataacttgataatcactttgttgtgttatttcttccaaattcttctatagcttcctgtcatatgggaacagaataggatgagtatgcttaatcttgctgcaagccttgtgaaggtaagacatttccacaggattcatttttttcactggaaaggttaattactgtacttctcgaaatgaaatggtgccagttggttttcggattgagggctcgaggttctcgtaggagggtactggtaatggccaaagttgaaaattttttcatgttggatttctcctgaaacaaagtggttcagtgtagtttttgttggtgccattctggcacatgatcaagttcaaccaggttgtcttggtgtttcatcttttcacactttggtgacctcacaccacgacttgaactctgcactagcaagctggccctttctgttgctgttagacacaacattgttagtaatgtatgccatctctagcttcagtcaacatatttcttggttcaaagatttgaagagattaatgcttgccaagtctatttgatgggagttattgggataggttttctcctagtacttgttaaagttgagaattaagagttaagtcaattaggattacatgcagtcagtgcagttcccatcttttgtctgtaacacagtacagggtaccctatctttttctattttttatttggttttacaaaaggggaatttgagttggaggagcagagaattcttagattgtcagagttatgaccctgctaaggtttataactttatacaggtatatgattgagatgctccattggtatgtgttatcaaggagtaaaagttaaaccaagaggggtgttagtttgtaaccatgtcattgtcagacttatgaaacaagacctttgagtaaccagcactatcctgtactaacgggagatatcatttgaagtttgctcctttgtgtcgttgtctataagaaataactgaaattgctaccttgtccatcatatatggctattgtttcagacgggagttcatggaaggatatttgcggcagatacaggtcatcctataccaggctccctgacgataaagggtatcggttctgaggttagtttattttggcagcgttaaccaataatgatgtgaacagtattggtggcctttggatctgcactgtaaattgattgttggtcaaaatatttttagaacggataaactggtaatatcctaatatcctaagtaacgagtacaacgaaatttattgcataacgttcaggcttatcatttgatagacctaatacttaccgttttcttgcttttagataagggctagcaggacttatggcgattaccatcgaatgcttgcacctggtgagaactatgaaggtagggtttcttctatggacaacatcaatacttatgtatacgattatacagccttttcctcaaaaacattattgaaaatgcctggcaagtgggtacacagctgaaatttctgataatcaccaaccaatcatatttaccactgaccattagctagtgaaggcaaaatttatcctccagttggagctttggctatgaagtgaaccatttgctacccgcatagttaactgtattgatatcatagcatgttttgatgggtgtttctaaaactggatcaatgaatgatctatggtgttaattttttttgatgatcttgtcagtcatggcatctatggagggcttccgaacaaaagctacacgtattgtggtggaggagaaggctgtgagcttggacttcatcttagatcgagatggagctaatggacaagtggtccgtaatgacttaggttgcccatgtgacgacgacaagttgtttcatgtgcagggagctcgcctcgagctgtatctatttgttttgctcattatcatcgcactgtatgttctcttcaagagaaaaacaacatcgaaattcacgattcacagacattcaccgaaacggccaattgctgtataagatttagaaaattttgcgagtcgatacaaatctgtagctgacccaatagtgatgtaatttcttcagtccaatgtaacttcagtttgtactgctacaacattttgagcttaattaatactccctctttccc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0144600, RefSeq:Os06g0144600