Os06g0217300
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os06g0217300 |
|---|---|
| Description |
Similar to Transcription factor MADS55 |
| Version |
NM_001063684.1 GI:115467099 GeneID:4340495 |
| Length |
10711 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0217300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:5951600..5962310 |
| Sequence Coding Region |
5952020..5952029,5952598..5952749,5952893..5952934,5956946..5956987,5957087..5957186 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:5951600..5962310 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:5951600..5962310 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgagggagaggagggagatacggaggatagagagcgcggcggcgcggcaggtgacgttctcgaagcggcggcgggggctgttcaagaaggcggaggagctggcggtgctgtgcgacgccgacgtcgcgctcgtcgtcttctcctccaccggcaagctctcccagttcgccagctccaatatgaacgagatcattgacaagtatactacacattcaaagaacctggggaaaacagataagcagccttctattgatctgaatttagagcacagcaagtgtagcagtttgaatgaacaactggcagaagcaagtcttcaacttagacagatgagaggtgaggagcttgagggattgagtgtggaagagctgcagcagatggaaaagaacctcgaggcaggactgcagcgggtgctctgtacaaaggaccagcaattcatgcaagaaatcagtgagctccaacgaaagggcattcagctggcagaagagaatatgcgcctcagagaccaaatgcctcaggtgcctactgctggcttggcggttcctgatactgaaaatgttcttactgaagatggacaatcatctgaatctgtgatgactgcattaaattcgggaagctcgcaggataatgatgatggttctgatatatccctgaaactagggttgccttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARERREIRRIESAAARQVTFSKRRRGLFKKAEELAVLCDADVA LVVFSSTGKLSQFASSNMNEIIDKYTTHSKNLGKTDKQPSIDLNLEHSKCSSLNEQLA EASLQLRQMRGEELEGLSVEELQQMEKNLEAGLQRVLCTKDQQFMQEISELQRKGIQL AEENMRLRDQMPQVPTAGLAVPDTENVLTEDGQSSESVMTALNSGSSQDNDDGSDISL KLGLP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10282..10291#9562..9713#9377..9418#5324..5365#5125..5224#4950..5011#3497..3578#126..307#gtttctctctctccttgtctctctgtgctgttgttgttgcgggtgaatctgcttggatttcgtcggagttttctgtcgcggaggaggagggggtggtggttgatcggaggggaggggggagggagatggcgagggagaggagggagatacggaggatagagagcgcggcggcgcggcaggtgacgttctcgaagcggcggcgggggctgttcaagaaggcggaggagctggcggtgctgtgcgacgccgacgtcgcgctcgtcgtcttctcctccaccggcaagctctcccagttcgccagctccaagtaagcgcgttctctgatcccctctctctctctactgttgatgctgctactgctcacccgatgatctcaccctttttttagttttcgatccgctcgagatttttttggggggtttagatctagctacctgctgctgtgttcctctctcgtttgaaagggctccagatcctcccggtcgctagggcttcctccctcttctacagttttacttcttcggttttagggtttgtgtttggttgatgcgatgcttctcgcgaaacgccacttcgggatcgagccttcttttctacttccagaacaatcatccttgcggtttttggggctgattcctgggtcgattccggtggattctaccacccgggatggtcctccgaaaatggggaatttttctactgtagtttcaatcacaatctccacagctaagtacggggaaaattcgatcgcttgctttttgcagatgagagatatgcatatttctcgtgtattccatttgctttcatgtggagaggaacactctaaaatccggttaattttgcttacgtacgctgctcgataaaaaataaatcccaaaaccgatcggcgcggcgcgcggccttgggcgcctccgctaatcgcggcgccgccgtacctgtgattttatgtgtggtgtggcatggcatgccgtatgcatgagccgtcaaccaaccaaccaacgaaccagctgccgatcagttcatcctctcctactgcctctctctctctcgtggtctgcgcaggtggccggctggtactttgctgtagctatagctatatatgggatcactcttgtagcctttgggtatttgggcttgctagcttaccattattggtgttctccaagagagaaaaataaacatttcaagtaccaagagggtacgtggcctttgcatgttccatatataagtatgtcgtccaagaaaaaaaagggttaatttagtatagtaggactatacgcatataagcatgcccaaagagaagggggttaattaattaatataatgatgagtagtacggtactccattttaagagtgtgatcgatcttgatcagtttctttttggcagtcgaagctatttaagaatataattgcatcatttagggattgagcgcatgcatcagagaacataattgtatgcacgttttctgaagctcctttgtttaatttctgtgtgatttttttatgtgcctatatagttgactgcatatgggtgcttctttcccaaaaataatggaactgtgcgttcttcttttggaacgtactgtccttgggtgtaacttaatatttgatgcttgtaatttacaacttgatatatagttcatgataacttgtttcgttcttataattagaaccatgccatgaactttataatagaataatctcgtgtcatttatgtgttttgtgtaactaacaatgaaggtgagaagatcaaggtcgtagtacctcataaactttacactattcctccactattccttttttagggtcctcattttatatacttttttctacttatcatttggaacatctacacagttctacaatacacctaagacgctaagaccattatctttcacaatcttatgtcccaagccgctaagtataattgtttatctattatatgcccaatatcatgctctctagtttttcttccctacaatttgtcatctcgttatttctccatcaacgtacaactccattatgtacgaggaaaagatcattccgctatgatactatttgagtgaacaattatcagacaacaattaaataggagtaacatagcatttattgaggtgaagttaattttcagaagggcaaatgttaacgaagacctggtaattaaactggtcttttcgatctccatgcccaattgcactgatcgagaacgtaaagaccttggcatagttttttttatggcacctatatattcagtatgtatttcagtaggaattattgtacaagagggacaattcatatcatcaaaacctactggtggcatttctaattttcttacatgactgaactttacacttttgtgcacatattactagattagtgccatagtttttgtaagttcaagtgcgtgctgctaaactgtatcctagttgagaacggtgggagttatattatataacttaatttttttctacaaaacgttgaacagaaatcactggacaaccttaagtcagataagaaactatgcacactgttataatttaagatcagtgattctgctgacattattactaagagcatatatgatgaagacatcaaaatgtactttaaacatgggcatgcgtattacgagtagcacataactctagcagaaatgtatgaattctacacaagctcagcatatccttggctggctggctacatcttcttggagaacatccaaagctatctttttccacccctttgaaaggatataaaatattgtgcaagtgttagtccaacgcagtttatattatgattacacaacaatcccaattcccagggtttcaaattgaagtttacttctagaattaggttccaaccattaagcaatacgtacgtagtatattctttatatatgcttatgtttttttcctgagaaaaatatgcattgtagtttagaccaatgggccagaattcatctgacaacaataaacaatatgtacttgagtggtgtctgactggtttccttcatgttaccctcttttgaatatgggattcctatagacaataacagaagaaacaaaaaaaatgcattatattagattaaattcagagtgctttagacaatcatatatagagtttaattttccattgatatatatgaacatgatatgatatgataattgaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgatgctcgcagaatctcttaccaattttcagcgtaactagtaacaaataattaagatttattctcttattaaagaggctgtacttgaaggtgttagactatagatggttttgtatattagatatacattattattatatcttcagagttcaaacccctttgaagtcaatttacaaaaccttgcttgaagacatgtattttatagataccgcatgtataggcagcttggtgcaaatactgattattggtatttttctttggtcaagcagtatgaacgagatcattgacaagtatactacacattcaaagaacctggggaaaacagataagcagccttctattgatctgaatgtatgtaaagcaatctctgtgttttgtagttcataatcataagtggatttgtactaactagtattagatcatatgtggtgtaatgtttcatatatttatatacatgcataagtcaacatgcaatgataacagcactttttttttctgcaaacagttctgctgactatgtttagttctttagagcaaatttaatagtatagcccactactagctccaattcatctatagtcaatctaatagccaattcatacaatagttgcttactatactactaatatgtggtcccacctatcatacacacattgcgtcttggagtccgtgctgcagctggctacagatctgtagcctgctgctcttctctctcatcttttatctcattaaaatatgtttacagctggctaatagcctgctattgtacctgctcttatagctagttgcttatgcttaattaagaaattagttacacatgtaaaggtataactttacccactcatataatgaaaatattcttaaattaattaactaggacagtagtggagggtgcagaaatcttctcacttattttttgtcttcccaaacagggattttttttaaagaaaatggttagattaagaaaaaaaatcatgctaggttattactcgatctacagttgtaacggattgcagccttagttgtaccaacttataaacgattggatcagtagcatgttgttttttttacattatatatatatatatatatatgtgtgctagtttcatttttgagtattttataggttccccatattaactcaaaagcatgatctctgcaccattaaatttttcatgagtttagagcacaacaacgatgtccacaaacttgtagaagtgcgcgcttcatatgatgatgcaagcttagagcaagtttaatagtatagcccgctactatctctaattcatatataatcaatctaatagccaattcatacaataattgcttactatattattaatatatggtcccacctgtcatgcacacattacgtcttggagtctgcgctgcagctggctatagatctgtagcccgctgctattctctctcatcttttatctcattaaaatatgtttacagctagctaatagcctgctattgtacctgctcttaatgaaaataagaccatgtaattaatgtaaatgtgagacactatttaatatcctggatctgcaaagaaaagtgacataaagtactaactccacacatttatatgtcctctaacctaggaatataaatgcaagaatctcatagaaattgtctttgtaactagccttcttcttaattatattgcttcgtacatatactaacagttatgcatatattcaccttcttcttcagttagagcacagcaagtgtagcagtttgaatgaacaactggcagaagcaagtcttcaacttaggttaattatgttctgatccatattgattttattatttcgatatatcacaaaattgtttgcaacagaaatagcccgtattataagttgataatgtcacaattccacatttatagacagatgagaggtgaggagcttgagggattgagtgtggaagagctgcagcagatggaaaagaacctcgaggcaggactgcagcgggtgctctgtacaaaggttgggtgtcatccgatggtgttcccttttcagcttcgtatgaattggcaggcacaatatcaagtttttcagacaactaatcaatatatgcttatgcaggaccagcaattcatgcaagaaatcagtgagctccaacgaaaggtaaacaaaatgattagattccactagttacttttgttaacctcgtaataatgtccttaattacattgatttcactattgtctgccaaacatgttagtctagttaagggtattttgaatcatagctagtaattctctatgggttctcaaaattctgtgtccctgtaagcagctaataagctagatcctagaggaaaaaaaaagttagtcacaacttaattaccgtcagttgtataaatttaaccgagtgaaaataggttttgtagatgttttattgtcattgttgtactgttatagatatattggtgataaagatgattattaatacaacaagacactagtacagaacccataatatgtgccagttgagaacccccataggtgttggatttttcaactggcaccctattagaggcactgatggggagaatcaaaagtgctagtataggaaccggtacctttgaggtgtcacgaataaaaaaaactaaaactggcttgatgcatcagctcgaaccaaagccgatgctttgagcgttccccatagcccccaaggtttgattgacatccaagaacaaacacacataataacatccaagaacaaggtcgtctctgagctcgattgacattagaaatcattaacatacaaactcacagaatcaacaacaataatatgaggaggttcactggagagaaggtcgccatccccgttgctgctcaccatgggtgaaggtgaaatctgcttgctcgcccaccaccatacaagccagatttgtcccccggggatctctagttctactgctcgccggcttggcagagaggaggtggctggatttggctgctcccgagcagcgaacagtaggatcaggagatggaggcgtggtgactagcgaggaactccatgaggcacggttggtgttcgcggatgatcagatctggtagaggtcaacaaggacctcaaggccattgctcgccggcttgggggagaggacacgtggccacgccgctcgttggctaagtagagaggagccagctgcgccgctcaaaggctatgggagagggcggccccactactcacgagttggggagagagaaggcagccccgtcgcttgtcggcttgggggagaggaggtggccgtgctgcccataggctaggggagaggaggcagacggccgaggggaccggcgtgtcattcgagaagagagaaggctagggagataaagatcatgaagaaaggatggtgtgttggggatggagtcagggagataagatcgagaggtacctaataaatcgaggtgggctcccacagtcccacattttgttggctcggctgcatccttaacagtgctgtgtttttgttaaaactagcaattatatccacattataagttttggtttattaaaaaattcggtacatatattttatgtatcgattgattttctttaataatctggcacctataaggggtgataggtgctggttttcaatatttaatccatgtgcgggttttgggaggataggaaatatatacctcatgtgctggttttagatgaccagcacatgagggtgtcctcaattaatggttttgtagtagtgagtgtacggcaaaaactatgcagtgtagccagttgcaagaaacttgtataaaatggcgctaaattagtggaagtttacaatatgacatacaacaatatactaattctgaagatgtcaatatgatatgctttttggagtatttctagggaggacacactgctagagaacgggtcatctctgatggttcagaaagactatcaacggcgggttgggtgagcaacccgacatttaactattggtcagtggtgagaatgacacccccgttaatgatgaaatcatatgtaacggtctacaagttgtgacccatcacagataggaaaattctgcacaaaaaaggccaaaattgccatgactatgatagggaaatttggccaaaaaaatccaaaaaggttgtgcttgtcgccacgccgccatcatttccgtgccatggctcttattgttctactatccccgtcccgcgcgcagcttcttgtcactgtactattcctgtcatcgtggtgcacggctgcttgtcgatgtcaccatcatcatcttccctcaggtggctgaatccatagttattggaactggactagaccggtggttggaccgaaaaaactagaactagagcctccgccagtttggtccagctaaaagaccgtttgcgcaattgacccggtagaaaccggttgggtcacccgtttttgtagaaaaattgctattgaactggaattgaaccaccaaggattgccttgtgcaaggtcacatgcgtcctggaggctgttggagagggaaaatgtgggaaaaagtacgcatgtgggattcgatcccacgatcacatgcatagaagcaaaccaaacgaccagcatgctacgatgcaccttgtgttttgaaagaataacctatctatttaaattgcattgatccgcttcaaaccagtggtttaactggttgaaccaataaatcatcaaaacgagagcctcactggttcaattaccagtccggtctcaataactatggttgaatctagccaccacgaggtgagagtggtcagatctaacgtccctcgaccttggggaggttggatgtagcatccctaaggcaatgtccaatgctaaagggtggaggagatagcggccagcccttggggtggagcagacggcggctaacgctcgggatctagccaacatgcacgaggttgattgtggtcaaatccggcgtcccccgaccttggggaggccactagtccatgaggtggtgcccgacgcttaaggatgaaggaggtgccagtcgacacttggggatttgggagtgagagagtggtcgtatactttgtagtagggtcatctgtggcggtccgaaaattaagcccatttgagatgatagctcatcctaaacatgtgttactaacaccgacgctgagatgtctttatcatttgtggcggttcatatgaccacacccatcacatcggggtcatcatggttgatctttatttacagttcatactttgacccattgtcccatgtagtagtatcttaaagtttttttttccagttggagatgaggtcatcaaagatgggtcactttgaccctctacagatggcccgtcaccgatgtcccattctgtagtggtgactagaagtcgagaactagctaaagggtactaatattcactattcagtgccggaactttatatatagcaaaaattattatatatagcaaaaattatattgacgagtgaaacatgtgcatgtactatattggaatgttgcttgcagacggtatacgatggcaataaatcaataatagactgtcaatgaaatgctgaggttcgataggatctctgtacgagagtcaatttttgttgtgaacttattgcacaatttttcaggcatgaaatgttttctcgacatatattggatggaaatgttatcattcagcagcttcctgtttatttatgcatagattttcagatacagtaaactttctcgtgaggcttatgaggagtattatttatttagaaattgatattttcaccgatatccaacaatgcaactaaggattacatttagaatagaattttactccctttgctcttaaatatttaatgtttaggataagattcagtcaatcttttaaaaagttgaccatcaataatttgagattctcaaatgtttagtttaaaaacaaaagaaatgatatatatggatttacctttaaaaataaccttttagatttcataaatttattctaatacaaaactgattgtcggaattacaaaattttgataaaattttgtatgaacgtaaaacatttatgtctggatataatattttgtatttatcagcacaaaacgtaaaattgatttggttggttttgaaaatgaatcaggtataatttcacaaatcttatgatacaatttatttgttcttgtagggcattcagctggcagaagagaatatgcgcctcagagaccaagtaattaatacatactgtgtatatgcgttcgaaatatttgcatagttttacaaaataaaatgcaaattcgaggaccctttggtttctccatatcaggcacggcggaatatgcatttatattctgtgcatttgcttgtatgcagatgcctcaggtgcctactgctggcttggcggttcctgatactgaaaatgttcttactgaagatggacaatcatctgaatctgtgatgactgcattaaattcgggaagctcgcaggataatgatgatggttctgatatatccctgaaactagggtgagtttccgctggaacccttgtcgcttctttgtagctaatttaaattttctcagatgggacaattttaataattctgctcgttctgttggaacatgataaaacgaaatttaaattctttctagacgattgaatacgatatcatgatcttttcccagaactcaattagtttttaatatacttaaggatttgatcttttactagctagttggtcccggcaggtaagctttccctgcagatggtatccattttcacactaaatccaaatgaaaactgcactaagggataaacgacaaagaaaatcaacttaagaactatgaattattgattgaaataatgccctttttattacttgattcgtgcccccctaaacctgagatcgatcagaactatgtactctgaatgtgttgtgttctccttcaagggtgttaagttaccaagcgaatttattttcctcatgtaacttatttctttgtgctgttcaacataagcgcaaatattggatggctgtgtttggatgtagagaccggtttaatccattctctcttaaaaaaattgatatcttcaggttgccttgaaataaaaggaccagctagagagctgagaaatgggatgacgaccaccatgaattatttgtctgtgtgcatgagtggatgaagttggaagttaaatgcatcttaagaagatcaagaagatgtcatgctatgagattaccaacaaggctgcaataatcctatcctatgttaaaaaggagatcgattgacttgtcatcctatgcctgctgatgcaatggtccggttgcttggatctttttttctcaacttgtactagtgtaccatactaccttcgtcgcacttaatttaaatgcgacatgtacgtatgtatcgttcgcttaattcgtgcaagttatgtacgtacctgtatgggaactgtatggaaacttgtgacctcggctgagacttattattggcacaattattaagctagtcattctcatc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
