Os06g0305200
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0305200 |
|---|---|
| Description |
Non-repetitive/WGA-negative nucleoporin family protein |
| Version |
NM_001064003.1 GI:115467737 GeneID:4340842 |
| Length |
10378 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0305200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:11583409..11593786 |
| Sequence Coding Region |
11583708..11583869,11585847..11586016,11586194..11586320,11586976..11587238,11587320..11588952 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:11583409..11593786 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcttgggcggaggacgaggcgattggccccgacgtggcctccgcggggctccacgtctcggagcggatcggccgcgacgccgccgctcagcccgacctggaggaggccctcgaggcctcgcgctacgcctcccatccctactcctcgcatcccaaggagtggcctcctttggtggaagtagcagaaactaggcagttacctcctatgctggttgaaagatataatgccgctgctggtgaaggaacagctctttgtggaatattttctgaagtacaccgtgcctgggcaactgttgacaattcattttttatttggcgctttgataagtgggatgggcaatgtcaagagcataacgcggatgaacaagtgatttgtgctgttggccttgctagagcaaagcctggtgtttttgttgcagccattcagtaccttttagtattagcaactcctgttgagctgatacttgtcggagtttgctgttcagctagtggtgatggaactgatccgtatgcggagctctcattgcaacctttacctgagtacattatttctactgatggtgtcacaatgacatgcatcacttgtacagataagggtcaaattttcctatctgggcgtgatggccatatatatgagctgcaatatacaactggttcaggttggcgaaagcgctgccgtaaagtttgccttactactggtttaggcagccttctttccaggtgggttttgccaaatgcattcaagttctcggctgttgatcctattgttgatatggttattgatgaggagagaaatacaatttatgcgcgcacagaaggcatgaagatgcagctatttgatttaggagctactggcgatggtcctctgagaaagatcactgaagaaaagaatcttgttgatccacgagatgcaccttatggcagtcggaggcctaatgcacaaagagctgcacgatccccaaaaccatcaattgtctgcattgcacctttgtcagctatggaatcaaaatggcttcatgctgttgctgttttatcagatggcaagagactgttcctttctacatcaggtgggagtagttcagttggacttagcactggtttgcagaggccaagctgtctaaaaattgttgctaccaggccttccccacctctaggggttggtggtggtctcacatttggtgctgtttcagctgctggcagagctcaacctgaggatcttgctttaaaagtggagtccgctttctattctgccggtgctcttataatgtcagattcatctgctacagctatgtcctcccttctcgctgtgcagaaagattcagctgcccaattatcccttcccagtacttttgggacagcatctagaagctcgagggctctgcgagaaacagtctctgctttgcctgttgaaggtcggatgctttgtgcctctgatgtcttcccgcttccagatgctgctttcatcatgcagtcattatatgcagacgtggaatgctttgcatcttttggaaaaccttctgagaagtcatccattaaactgtgggctaaaggagatcttcctacccagcatatcttacctcggaggaggattgttatattcaatactatgggtttgatggaggtagtttttaacagacctgttgatatcctaagaaaattgtttgatgggaacactttgagatctcagttagaagaattctttagccgctttggtgctggagaggctgcagcaatgtgcttaatgctagctgctaagctgctttatgctgaagatagcctgataagcaatgcagtttctgagaaagctgctgaagcatttgaggaccctggacttgtcggaatgcctcaaattgatggcagtactgccttgtctaacactcgaactcaggctggaggctttagtatgggacaagttgttcaagaagcacaacctatattttctggtgcatatgaagggctttgcttgtgctcttctagactactgtatcctatctgggaacttccaattatggtggttcgaggactggtaggttccaatgatcgtggtgatggtgtggttgtttgcaggctttctactggggccatgaaggttcttgagagtaagatccgttcattggaaacatttttgaggtcaagaagaaacaaaagaagaggactttatggttatgttgctggtctaggagattctggttccatactgtacaaagcagggcctatcattgggtctggtggtcatagcagtgggaagagtccatacagctctcgcattagagacgctgatccaacagatcagtctgcatcaaataaaaagcaaaggctgccttacacatcagccgaactagctgcgatggaggtgagggcaattgagtgccttaggcggttgcttcgaagatctggtgaagcactctttctgcttcaacttatttgccagcataatgttgctcgcttggttcagacactaggtaatgatttgcgcaagaaactagttcagttaacatttcatcagttggtatgttctgaggatggtgaccagcttgccatgcgccttatttctgcactcatggagtactatatcggtccagagggcaggggaactgttgatgagatcagcactaaattgagagagggttgtcctagttacttcaatgagtcagattataaatattacttagcagtggaatgccttgagagagcatctatgacaaacaatcatgacgagaaagacatccttgctagagatgccttcaatcttttaactaaaattcctgactctgctgacttgagtgctatatgcaagagatttgagaacctaaggttctacgaggcagtagtccgtttgcctttacagaaagctcaagcacttgattccaatgctgatgttattaatgggcaaatcgacgcaaggcatcatgatactataactgcacagcgtgaacagtgctataaaatagttatgaatgctttacgtaccctcaagggtgttggacagagtggcacacaaggtgcagacaagtcatctgcttcagttactgcacttgatccagcttctcgagggaagtatattaaacagattattcaattaagtgtccagtggccagacacagtgtttcatgagcatctgtataggactcttattgagcttggtttggaaaatgaacttttggaatatggaggttctgatctggttgcttttctccagagcgctggtcgtaagcatcatgaagaggttcaaggactttctgtggttgcatcaaaagcctctaaactgactgatttggatgcacctatttcaactagtcaaaccaagtatcttgagctgctagccaggtattatgttctcaagggggagcatattgctgctgctagaatgttgttgatattggcagaaagacagtgctccagtgcggaagaagctccaactcttgaccagaggtatcaatatctgagcagtgcagcgattcaggccaaaagtgcaggcattactgcagattcttcgaggaatcctattgatagcagcacgatagatctacttgaaggcaaacttgcagttcttcggttccaaatgcaaatcaagcaagaactagagttcatggcttcacagcttgaaaatctgtcaggcagttctgaatcaccaaatgatccctttcctcgtgataacattctagctgatgcggatactgctagatttgccatggacaaggctaaagagctttcactgaatctaaagagtattactcaactttacaacgattatgctgttccatttaatctttgggaggtttgcctggaaatgctcaactttgcaaattattctggagatgctgacagtaaaattgttcgagaaatttgggccaggcttcttgaccaggcacttacaagaggtggtgttgcagaagcatgttctgtggtgagaagagtaggttcaaaacttgatcctgcagatggcgcttgtttaccattggatataatatgccttcatctcgagaaggctgcattggatagattaagctcaggagaagaattagttggtgacgaggatgttgcaagagcccttctcggagcctgtaaaggtctacctgaacctgtgcttgccgtgtatgatcaactgttatcaaatggcgctattgttccctccctaaacctgaagctgcggcttctgagatcagttcttgcaatccttcgtgaatggggcatgactgtcattgcacataaactaggcaccacaactgctggggcttcattctttcttgatggaacattttcgctgaatcaaacatggtctttaaatcaaggcgttcgagataaaataagtagtttggcaaaccggtatatggctgaggtgaggcggttaagccttccaaagaaccaaacagagaatgtctatcgaggtttccaagagctagaggagaaattattaactaattag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAWAEDEAIGPDVASAGLHVSERIGRDAAAQPDLEEALEASRYA SHPYSSHPKEWPPLVEVAETRQLPPMLVERYNAAAGEGTALCGIFSEVHRAWATVDNS FFIWRFDKWDGQCQEHNADEQVICAVGLARAKPGVFVAAIQYLLVLATPVELILVGVC CSASGDGTDPYAELSLQPLPEYIISTDGVTMTCITCTDKGQIFLSGRDGHIYELQYTT GSGWRKRCRKVCLTTGLGSLLSRWVLPNAFKFSAVDPIVDMVIDEERNTIYARTEGMK MQLFDLGATGDGPLRKITEEKNLVDPRDAPYGSRRPNAQRAARSPKPSIVCIAPLSAM ESKWLHAVAVLSDGKRLFLSTSGGSSSVGLSTGLQRPSCLKIVATRPSPPLGVGGGLT FGAVSAAGRAQPEDLALKVESAFYSAGALIMSDSSATAMSSLLAVQKDSAAQLSLPST FGTASRSSRALRETVSALPVEGRMLCASDVFPLPDAAFIMQSLYADVECFASFGKPSE KSSIKLWAKGDLPTQHILPRRRIVIFNTMGLMEVVFNRPVDILRKLFDGNTLRSQLEE FFSRFGAGEAAAMCLMLAAKLLYAEDSLISNAVSEKAAEAFEDPGLVGMPQIDGSTAL SNTRTQAGGFSMGQVVQEAQPIFSGAYEGLCLCSSRLLYPIWELPIMVVRGLVGSNDR GDGVVVCRLSTGAMKVLESKIRSLETFLRSRRNKRRGLYGYVAGLGDSGSILYKAGPI IGSGGHSSGKSPYSSRIRDADPTDQSASNKKQRLPYTSAELAAMEVRAIECLRRLLRR SGEALFLLQLICQHNVARLVQTLGNDLRKKLVQLTFHQLVCSEDGDQLAMRLISALME YYIGPEGRGTVDEISTKLREGCPSYFNESDYKYYLAVECLERASMTNNHDEKDILARD AFNLLTKIPDSADLSAICKRFENLRFYEAVVRLPLQKAQALDSNADVINGQIDARHHD TITAQREQCYKIVMNALRTLKGVGQSGTQGADKSSASVTALDPASRGKYIKQIIQLSV QWPDTVFHEHLYRTLIELGLENELLEYGGSDLVAFLQSAGRKHHEEVQGLSVVASKAS KLTDLDAPISTSQTKYLELLARYYVLKGEHIAAARMLLILAERQCSSAEEAPTLDQRY QYLSSAAIQAKSAGITADSSRNPIDSSTIDLLEGKLAVLRFQMQIKQELEFMASQLEN LSGSSESPNDPFPRDNILADADTARFAMDKAKELSLNLKSITQLYNDYAVPFNLWEVC LEMLNFANYSGDADSKIVREIWARLLDQALTRGGVAEACSVVRRVGSKLDPADGACLP LDIICLHLEKAALDRLSSGEELVGDEDVARALLGACKGLPEPVLAVYDQLLSNGAIVP SLNLKLRLLRSVLAILREWGMTVIAHKLGTTTAGASFFLDGTFSLNQTWSLNQGVRDK ISSLANRYMAEVRRLSLPKNQTENVYRGFQELEEKLLTN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>300..461#2439..2608#2786..2912#3568..3830#3912..5544#5616..5828#5962..6209#6313..6724#7424..7629#7749..8094#9048..9266#9376..9704#10177..10276#cccacccaaaccctagccccgcgccgctccatctcccaccggcgcgcgccgtcgccgccgccgccgcctccgcctccgcctcgcgccgtcgccgccacttccgccttcgcctccacctccgcctcgtttccccaacgcgccacggcaaaagcgggggaacccgcgctggaaaacttgaaaaaccccaacctaaccccctcccaccccgccattcctcacatttgcacccccatcgctgcgctctaggtttttttttttcctccgcgccttctccccgcaagaggcgtattgctccggcgatggcttgggcggaggacgaggcgattggccccgacgtggcctccgcggggctccacgtctcggagcggatcggccgcgacgccgccgctcagcccgacctggaggaggccctcgaggcctcgcgctacgcctcccatccctactcctcgcatcccaaggaggtgagctccccggaaccaatcgcgtgctctgtactcggggctgtgcgcggctgagccgttgatctgcagaggctctcgttgtcggggagaaattattcttggtagatttgaggtttgcagcggagttggggagcggtgcgccaagcagctgttgttttgggcgattcgctggaatttttaactagttagttatttgtttcctgagagaaaggggaggggaagctgcgaagtggggtgttgatgagaacgagaaccctgaaatgggccgttatgtttagttaagtagaacgttagggtgaatttttctgtagctactgtggtgcatcatttgaaaattctggtttatcttctgtgtcataatttgagatcccgggaggctggaggcggggacaaaaacagagctcaccaatgtatttatgggccaatttaattttgttaaattttaggatcctgctaaccctggattacgtataataaactgtggaataaactctccagttatatttgaaatccggggaaaactctaggggaagttatcttttgatatacgttaaatagtaacactttttttgtagcatcattaatcactctgtgagcttattttcctgtctcccttaaattccttctttctatgtgaacatccatagtttgattgtagtttggggatcccatacattccaggtaggcagtgaaattttatgaaactaggaaccaacttatatatccttctttcaacagatgggacaaaccgacaaagggtatagagttcacctctcaaactgttaaaatatttggaacctatttgaggtgttttgttttattactttccattttttctattagatatgtgaaacaattcctttatgaaaaaaaatcaactgaagtgcagggatccattgtattggttgcaaatcaacatttcttgtgatactggatacttaggacatgactacgacgagatgtaagctagattgtcttaaccagcggcctctcttgttgctactagtatacccaacagtgcatgtttttttttcttcttatagaattttctcttaaatcactcatccgatttatgatccgattacaccgttgtgttcgtaacaattaaatctttacagcaagatctcacatgattatatttttttatgaaaaatacaatttacttttataatatatctaaattacttttatatttcattaaattacttcttagacatataaaagtaaattcaataaatggtaaaagtaatttacatatattatagaagtaacttaaaacaaaaaaaaaagtaacttgtcacgacatcaaaagtaaatctattatagaggtaaaaacctaagtttatctagaaattaaatctaatcaacatattatagaactaacgataaagtaaatgtctaaaaagtaacttaatcaaatctaaaagtaatttatatgtatgataaaagtaacttacatatatgataaaagtaagttacaacataaatatttttttattataatataatcatgtaagatcttgttataaagatttaattacaacgaacacaatggtgtaatcagattgtatatcgaataaatattttaagagaaaaatctataagaagaaaaaaagagatacactttgtgcagtagtaaacaactagaccatctctcacgtaggtctctcacgtaggtgtactagttgcaagtgaaccttctctcacgggtgtatcgctctttaatactaaaccgagagcattctcggtttagattttaccggatacttatgcttgatgttaatgaagaataaatagacacctttgtgctctcctgtaaaagaggaaattacatagatccgactattcttttctacctcctgtgtattttttaagttatacgctgaagttattatgaaaatgttcctcaatttttttggaaatgcatcttttattcttttgtgcttcacacactcactctgcccctttttatttcagtggcctcctttggtggaagtagcagaaactaggcagttacctcctatgctggttgaaagatataatgccgctgctggtgaaggaacagctctttgtggaatattttctgaagtacaccgtgcctgggcaactgttgacaattcattttttatttggcgctttgataagtggtaattgacttgcttctctttatattttcccgatacattgaacttagttgaaaacaattttttatggatcaaggtgattcttaccttttgtttcgaaattttcatgttgtccttagcatgccgtgctaaccatctaatgtatgaacatatggtttgatattatgatgtaccactcagggatgggcaatgtcaagagcataacgcggatgaacaagtgatttgtgctgttggccttgctagagcaaagcctggtgtttttgttgcagccattcagtaccttttagtattagcaactcctgttgaggtaattatgcccctttgaatcactacgttccgtgctaaatttgagcaaacctatgatgccttgcggacacaccattagttctattttgattaagaatctaaggttaatgttgatctaaaagaatatcacataattagctcataggtgtttttttttctgcaaggacatttagtaaatgctacaaatagaacaacagaagtgcaaggacatttagcgatgcattatctcttggaagctcatatacattacaaaaggtcttctgctgaataaagcttaactagtgtagtgcccatgcattgccatgtatctcaaataaataatacacttattaagatcaatcaagcaagcgcttttgcatatgagatgcaatctttcacaaaagatcctacaaaaatgacgcgcacaggtctgtgtagagtcatccatagtatcaaaggaatgggacaatcactgactccttttataaaaaaaataaagatacaaaatatctgtctcagttactatcaagcttcctctttgctaatctttctctttggtgattgaaatttaccatgtgaactagccaatcttccaagcaacaattttactaccttttcttctatttatgatctttatttccaagccgtcatatactcatctgcaactgttgtgccagctgatacttgtcggagtttgctgttcagctagtggtgatggaactgatccgtatgcggagctctcattgcaacctttacctgagtacattatttctactgatggtgtcacaatgacatgcatcacttgtacagataagggtcaaattttcctatctgggcgtgatggccatatatatgagctgcaatatacaactggttcaggttggcgaaagcgctgccgtaaagtttgccttactactggtttaggcagccttctttccaggtactaaagctgtaggacaagaaatgtgacgctttgctttgtttcttaacagtctcccaattattcaaacatgcttttcaggtgggttttgccaaatgcattcaagttctcggctgttgatcctattgttgatatggttattgatgaggagagaaatacaatttatgcgcgcacagaaggcatgaagatgcagctatttgatttaggagctactggcgatggtcctctgagaaagatcactgaagaaaagaatcttgttgatccacgagatgcaccttatggcagtcggaggcctaatgcacaaagagctgcacgatccccaaaaccatcaattgtctgcattgcacctttgtcagctatggaatcaaaatggcttcatgctgttgctgttttatcagatggcaagagactgttcctttctacatcaggtgggagtagttcagttggacttagcactggtttgcagaggccaagctgtctaaaaattgttgctaccaggccttccccacctctaggggttggtggtggtctcacatttggtgctgtttcagctgctggcagagctcaacctgaggatcttgctttaaaagtggagtccgctttctattctgccggtgctcttataatgtcagattcatctgctacagctatgtcctcccttctcgctgtgcagaaagattcagctgcccaattatcccttcccagtacttttgggacagcatctagaagctcgagggctctgcgagaaacagtctctgctttgcctgttgaaggtcggatgctttgtgcctctgatgtcttcccgcttccagatgctgctttcatcatgcagtcattatatgcagacgtggaatgctttgcatcttttggaaaaccttctgagaagtcatccattaaactgtgggctaaaggagatcttcctacccagcatatcttacctcggaggaggattgttatattcaatactatgggtttgatggaggtagtttttaacagacctgttgatatcctaa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