Os06g0698859
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0698859 |
|---|---|
| Description |
Similar to C2H2 zinc-finger protein SERRATE (Fragment) |
| Version |
NM_001188050.1 GI:297725230 GeneID:9270793 |
| Length |
6966 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0698859, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:30234592..30241557 |
| Sequence Coding Region |
30234849..30234909,30235195..30235389,30235475..30235710,30236349..30236397,30236476..30237267 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:30234592..30241557 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctgacgtcatcgaccccgcctccaccgaggccccccgcgcgcgccgcccgccgccgcctccgcccgacagcccggagggccgctcgccgccgctcccgcccccgccccccggtggcccgccgcagccggcggccacccgcaagcggagccgctcgccaccgccgcctcccccgccgccctccctcccgccgcccccgccgctcggctcgtcgcgccccgagcgctaccgcgacaaccaccaccggggaggaggcggtggccggggtgggggtagttccagccccccgccgtatcggagtggccgccgccactccccgtcgaggagatccccttcgccgccgttcaagaggtcgcggcgggacgacgggtacgaccgccgtggcggccgtgggagcccgccgccgcggtacgggtacggcgacaggaggtatggatatgaccacgagcgtggtggaggcagaggtgggtatgatgatgaccgataccatggcaggtatcaaaatcgcgcagcagattgggccgattcagggtttggggcatccaatgatggtcctggaattacccaaagggaaggactgatgacttacaaacagttcatccaagttcttgaggatgatatttcacctgctgaagctgagaaacggtatcaagaatacaggacagagtacatcactactcaaaaacgtgcttattttgaccttaacaagaatgatgatcggttgaaagacaagtaccatccgaccaacttgtcatctgttattgacaggaggaatgatagttgtaaggcaacagcaaaggatttctttcatgatttgcaaaatggaactctggaccttggccctggaataactgcggctgcagcaagtggcagtgatggaaattctgatgatgatggagacagtgacaagagaagaaagcatggcaggggttcctcaaaagaaacagaccctctttctggtgctcccgtggctcatccagttagctctgaatctcgacgggttcaagttgacattgaacaagctctagcccttgtgcgtaagcttgacactgagaagggtattgtggggaatatcctatcaagtggcgatcatgacaaatcagatgtagacaagtctcatattggatctatggggcctataattataatccgaggcttaaccactgtcaaaggccttgaaggtgttgagctcctagatactcttcttacctatttatggcgtattcatggtgttgattactatggcatgtctgagacaaatgaagcaaaaggcagtcgccatgtcagagcagacaataagacgtctaatacaaccaatattaatgccgctgactgggaaaagaaggtggatactttctggcaagaaaggctgagaggtcaggaccccatggtaatattagcagccaaggacaaaatcgatgcagcagctgtggaagttctggaaccttatgtcaggaagataagggatgaaaaatatggttggaaatatggctgtggagctaagggttgtacgaaacttttccatgctcctgagttcgttcacaagcatttgaggctgaagcatccagagcttgtgttagagttgacttccaaagtccgagaggatctctatttccaaaattacatgaatgatcctaatgcacctggtggaactccagttatgcaacagtctgcaccagacaaatcaagacagagacctggtatggataatcgtctgagatatgaccgtgccaatcgtagagaatatgatagggcagagagagatggaagcagatatggtagaggtgatcgttctccaagtcttgatggcgctgatgatcagatgtttgatgctttccgtgggcgaggtccaaatgctccttttgttcctgaacttcccgctccgccaattttgatgcctattcctggtgctggtcctttgggtccatttgttcctgcacctccagaaatagccatgcatatgctgagagagcaagggccgccacctccatttgaaccaaacggacctcctcatgccaacccaggagtgcttggaccaatgatgggtggtcctgcgccaattataaccatgcctccatcttttcgtcaagatcctcgccgtttgcgaagttacaatgaccttgatgctccggacgaggaagttaccgttcttgactacagaagtttgtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADVIDPASTEAPRARRPPPPPPDSPEGRSPPLPPPPPGGPPQP AATRKRSRSPPPPPPPPSLPPPPPLGSSRPERYRDNHHRGGGGGRGGGSSSPPPYRSG RRHSPSRRSPSPPFKRSRRDDGYDRRGGRGSPPPRYGYGDRRYGYDHERGGGRGGYDD DRYHGRYQNRAADWADSGFGASNDGPGITQREGLMTYKQFIQVLEDDISPAEAEKRYQ EYRTEYITTQKRAYFDLNKNDDRLKDKYHPTNLSSVIDRRNDSCKATAKDFFHDLQNG TLDLGPGITAAAASGSDGNSDDDGDSDKRRKHGRGSSKETDPLSGAPVAHPVSSESRR VQVDIEQALALVRKLDTEKGIVGNILSSGDHDKSDVDKSHIGSMGPIIIIRGLTTVKG LEGVELLDTLLTYLWRIHGVDYYGMSETNEAKGSRHVRADNKTSNTTNINAADWEKKV DTFWQERLRGQDPMVILAAKDKIDAAAVEVLEPYVRKIRDEKYGWKYGCGAKGCTKLF HAPEFVHKHLRLKHPELVLELTSKVREDLYFQNYMNDPNAPGGTPVMQQSAPDKSRQR PGMDNRLRYDRANRREYDRAERDGSRYGRGDRSPSLDGADDQMFDAFRGRGPNAPFVP ELPAPPILMPIPGAGPLGPFVPAPPEIAMHMLREQGPPPPFEPNGPPHANPGVLGPMM GGPAPIITMPPSFRQDPRRLRSYNDLDAPDEEVTVLDYRSL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6649..6709#6169..6363#5848..6083#5161..5209#4291..5082#4145..4213#3762..3809#3600..3674#3450..3524#1532..1586#651..736#112..542#gtgcgccgcagcccgcagcctagcctaccctctctctctcccccctcctcaagctgtgcgcgattcgcttcctcactcccaaaccctaaccccaccgcgacgctcccccccatggctgacgtcatcgaccccgcctccaccgaggccccccgcgcgcgccgcccgccgccgcctccgcccgacagcccggagggccgctcgccgccgctcccgcccccgccccccggtggcccgccgcagccggcggccacccgcaagcggagccgctcgccaccgccgcctcccccgccgccctccctcccgccgcccccgccgctcggctcgtcgcgccccgagcgctaccgcgacaaccaccaccggggaggaggcggtggccggggtgggggtagttccagccccccgccgtatcggagtggccgccgccactccccgtcgaggagatccccttcgccgccgttcaagaggtcgcggcgggacgacgggtacgaccgccgtggcggccgtgggagcccgccgccgcggtacgggtacggcgacaggaggtgaggggtttcttcttggtcatttggtcgaaatctgtactggattggtggttagttcttcgaggctctgcggtttcatcgcgtgtgcttgggtgatgtgttgggtaggtatggatatgaccacgagcgtggtggaggcagaggtgggtatgatgatgaccgataccatggcaggtatcaaaatcgcgcagcaggtgaggattcttctcctcgggcaaagtttcgtttcgatctcagaagtaagctgtttgagtagcacagcatgagcgaaccccaaatggtatgagggaaattgattatttgcctgtagttagttccccaccaaattagattggttttgatgatctacaacatagtttagtgaaaactatcagatcctttgctccatagtcagtatgagtttactgaattcaagtgaacagcatggggctgttctacttggtaaacattagcaaccttgctttgttagcacttgctaatgtactccctgcggtcataaatatttgacgtttagaacaaaattcggttgaattttcaaaattccgactgtaatttcccaaatgcttagttttaaaacaaaataaaatgttgtatatagattttccttgaaaagtactatcataatataaaaagttattagattttataaacttatttctactacaaaattgatggttgtaattttaaattttgaccaaatcttgtcctaaatgttaaatatttatggcagggaggttcaggatttcagatctgtagatgttgggtgttagggctattagctctttgatttgtttggtgtgttatagttgtagtaagaattttaccactatcttctaatttgttcctgcttcgaatcattctagtcgggatgaagacaaagtatatgcatggctgtttttttttactttagctagcacttacactcctcatttagaacatagattcttgatacttgtgaatatgttctgacaattcgatttcaatgtcagattgggccgattcagggtttggggcatccaatgatggtcctggaattacccaaaggtacttattcctttaccatgtttactctttctgattgttaggcactttgatgttgtctcctgggtactgtaactatgtagcgatcgacaatactggagctaattgccactactattgggaaatgcaaattaagccttctatgctagatgctgtaaggcatcgttaacagatagagaatcttctcagaaaattctccaaatttgatgtttgaaatctgactgattctttgagaactgtgagcctgtagttaagctatcagcttgaaatcctttactgcagcactacatactccggaaccttgttactgttattagccaccagcaagccagctcaatttacagttagtgccaccacaaaaggactcttcccagttatatgtaagctataccacccagatattcagctacaccttgaaggcataagaagcatatgcttttggatacaatcaaatggagaatctgatgggaatattctttatctgttaacaacaaacaaaggctcagaggctttatttgaatctctagtagtggatttctttttctttcttttttttaattctataccatgttatcttaaatatacattgataactccatggaacacaacacttccaatgctaatttgcataagtagatgttatcatgttaacactatgcatttttgtcctattgatggtagactgttagattgtgttaacattgttaacaggaaaaaggtgagggattcttgttttcttctcttgtatatcttcttttgccactatttagttgctgaaatatgttcatcaatttatgatacttgttcagaggaacgaaatggatgaattgcttcctatgtaacatgaaatcattgaagcatgatcacgcttgttaggagtagttgatgcttgggcttttcattagaaaattataatttagtgtttttagtgttaattctctataatactgggcttgctaatcaattttgtattctgttgaattgtagccttttattttagtgatgctattaataaacctgagggtcttttcttggatttggttgctggcattgagaaattagattcgttctccttatctttgcttcccgtagttgtcatctgaaggaattctagaattttcttggacaaaaacaatagcggaaagatagtaattggaatcagctgatggatgggcagaagttattggtataccccatcaaccatcacatggttgtaatgacttcttcaagtttttaagaaataacaattattctatgctgataatacttttggtggcaacgcatgtaattagcaaatgtttattcagttgtttcctctagttatgtgtatgtcacatttacatttatcattgagtgttattgtgtgcttaaggtgtcttagttaggaagaacatgaaatgttagagaaggtagaccatgttgctaaggaagataatatttagttagttattggtcaggattttttttaattaggagaatcttttgcccgaccaatgcagttgttcctggtgaccgatttgcataaaacattgtaatgagtggcagttcatatgaaggccacatgttagatgacatctctgtagggagaggtggattgccttcttttttgttatttgtaaaaaaatattcaacatgcataccttttaaactgatctttgaactgttgaaacagatttatgaaaacttctattgcagattaaagaaatctgaactgttgtcacatttaaacttgttttcaaatattgttccctccattcattttgacgagctaaccgttctaacatattgagcagaggattgggatatagtttcatgagtttctcttagtgtatttctgttatcttatatgattatgcatcttttcagggaaggactgatgacttacaaacagttcatccaagttcttgaggatgatatttcacctgctgaagctgagaaacggtaaatgcacaacacttactgattatatctttgtgctacctttttagtattgatgggctatgtctgtttaaaaaggtatcaagaatacaggacagagtacatcactactcaaaaacgtgcttattttgaccttaacaagaatgatgatcggtaagtcaaaatgatttagctgtacacaactaggaacaaaaatggtccacttgctttaactgacatttcatttgctttcacttgcaggttgaaagacaagtaccatccgaccaacttgtcatctgttattgacaggtggagttgaattcctttttattgagcctgttcccttatgcattcataaacattattatgttgtggaaaaaattttcttgcagaacaataccctttatactgctcatcttaactccttttacatttttgttaagtaaatttcagaaaactacaggtgctttgaccaaattatcacaaaagtatagatttaaggcgctgtatcacaaaactacatatttgatttcgaagttatcacaaaactgcagatattacaatttaaatccctagtactactgttatgttagagttataaatgttgtagtttcgtctaactgcaacttttccatataatgcaggaggaatgatagttgtaaggcaacagcaaaggatttctttcatgatttgcaaaatggaactctggacctgtgagttatatctgcacagcttgtgttatgatgatcttctggacttcttgtttataccttgattttttactgagcagtggccctggaataactgcggctgcagcaagtggcagtgatggaaattctgatgatgatggagacagtgacaagagaagaaagcatggcaggggttcctcaaaagaaacagaccctctttctggtgctcccgtggctcatccagttagctctgaatctcgacgggttcaagttgacattgaacaagctctagcccttgtgcgtaagcttgacactgagaagggtattgtggggaatatcctatcaagtggcgatcatgacaaatcagatgtagacaagtctcatattggatctatggggcctataattataatccgaggcttaaccactgtcaaaggccttgaaggtgttgagctcctagatactcttcttacctatttatggcgtattcatggtgttgattactatggcatgtctgagacaaatgaagcaaaaggcagtcgccatgtcagagcagacaataagacgtctaatacaaccaatattaatgccgctgactgggaaaagaaggtggatactttctggcaagaaaggctgagaggtcaggaccccatggtaatattagcagcc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