Os10g0140200

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Structured Information

Gene Name	Os10g0140200
Description	Glycoside hydrolase, family 38 domain containing protein
Version	NM_001070675.1 GI:115481093 GeneID:4348080
Length	12531 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os10g0140200, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 10
Location	Chromosome 10:2456218..2468748
Sequence Coding Region	2456449..2456652,2456814..2456897,2459113..2459201,2459278..2459452,2459764..2459883 ,2460004..2460087,2460171..2460242,2460342..2460455,2460852..2460952 ,2461024..2461117,2461265..2461432,2461539..2461616,2461908..2461973 ,2462052..2462108,2462353..2462572,2462867..2463003,2464745..2464813 ,2464899..2464958,2465379..2465450,2465530..2465577,2465681..2465806 ,2465982..2466047,2466508..2466620,2467348..2467432,2467540..2467650 ,2467885..2467980,2468067..2468114,2468190..2468258,2468393..2468581
Expression	GEO Profiles:Os10g0140200
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008403:2456218..2468748 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008403:2456218..2468748 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggcgtcgtcgtcgtcggcgctggtggtggtggtggcggttcttgcgttggcggaggcggcggtggcgttctcggggtacaacacgagcgccggggcggtggccgggaagctgaacgtgcacctggtgccgcactcccacgacgacgtcgggtggctcaagaccatcgaccagtacttcgtcggcaccaacaactccatccagggcgcgtgcgtgatgaacacgctcgactccgtggtggacgcgctcatcctggaccccgcgcgcaagttcgtcttcgcagagcaggctttcttccaaagatggtgggcagagaaaagcccaaaaatccaggccatagtccacaagctagttgattctggtcagctagagttcataaatggtgggtggtgtatgcatgatgaagccgccgtccattatattgacatgattgatcagaccacacttggtcatcgggtaatcaagaaacagtttaacaagatcccaagagctggctggcaaattgatccttttggtcattctgcagttcaaggttatttgcttggggcagagcttggtttcgattctatgcattttgcgagaatcgattaccaagatagagcaaagcgtaaaggagacaaaggcctagaggttatatggcgcggctcaagaacatttggttcatcttctcagatcttcacaaatgcatttcctgtccattatagccctccagatggcttcggcttcgaaattttcgatgattttgtacctgtacaggatgacatgttgctgtttgactacaatcttaaagaacgtgtgaatgattttgttgctgcagccttaaaacaggcaaatgttacgcgcacaaaccacataatgtggactatgggggacgattttaattaccagtatgctgagtcttggttccggaacatggacaggcttatcaattatgtgaacaaggatggccgtgtgcatgcactgtactctactccatctatttacacagatgcaaaacatgcgtcgaatgaatcatggccactcaaatacgatgattatttcccgtatgctgatgcaaaaaatgcttactggactggatattttacaagccgtccaactttcaagcgatatattcgaatgatcagtggatattacctggctgcgcgtcaattggaatttttggtgggtagaagttccttaggattgtttacttctagcttggaagatccactggggattgcccaacatcatgatgcagtctcaggaacggcaaagcaacacacaactgatgattattcgaaacgccttgcgattggggtttctcaggttgagaaaggtgttaatactgctctaagttgtctcacaagttccaaaggaacatgtacagcaacaaaatttagtcagtgccaacttctcaatattagctactgcccttcaactgaggaaggaatttcatccgcaaagagtttagttatagttgtttataatcctcttggatgggaacgtagtgactttgtaagagttccagtaaatgatgccaacttaattgtaaaaacctctgatggaacttctctggagtcacaactagttgaagttgatatcgtgacagcacgtttaaggaagttatacataaaggcttatcttggaatcacgtccgataaacccccaaagtattggctagtttttcaagcttctgtaccaccactcggctggaacacctacttcatatcaaaatctactggaacaggatctaatggaatggggtatgtctcaaccatggtttctccaagtaatgacacaatagaaattggaccagggcctctgaagatgtcctattcatcaaaatctggacaactcaagagaatgttcaattctatctctgcagtggatttgccaattcaacagagctttctttggtatgcttcaagcacgggagattctgaagattcacaggcatccggagcatatattttcagaccaaataggactacaccgactatagtttcaggaatggcgccattgaaagttatccatggacctcttgttgacgaagtccaccaacagttcagctcatggatttatcaggtcacgagactctacaagaataaggagcacgctgaagttgaatatactattggaccaatacctgttgatgatgatgatgacataggaaaggaggttgttaccagactgacaacaaatatggccaccaacaaaatattttatacagattctaatggaagagatttcctcgaaagggtgagaaaccacagggatgattgggaccttaatttgtctcaacctgttgcaggaaattactacccggtcaatcaaggaatatatgtagcagatgggaaatatgaactatctgtccttgtggatcatgctgttggagcttcgagtattcaagatggtcagattgaagttatgctccacaggcgtctttctgcagacgatggcagaggagttggggaaccacttaatgaagtagtatgtgtggatcaaaagtgcgatgggctagtggccagggcaacttactatatcaatgtcaataagaaaggacatggagctcattggcgccgaacatatagccaacaagtttattcaccgttccttgttgcttttgcacatgaggacgaacgcagttggaaatccaacaatattgcaaaagcaagtacggtagaaggaaactatagtcttcctgataatgttgcaatcatcaccttgcagagtcttgatgatggcaccacactccttcgattggcgcatctttttcaggctcaagaggacacacaatattcagtaatggcaaaggttgaattgagaaagctgtttggaaagaggataatcaaagatttgactgagactagcctatctgcaaaccaaaagaagtcagagatgaagaagctcaattggagagtaaccggggagagcaaaactgatcctgcaccattgaagggtggcccagttgacagccacgcccttgttgttgagcttggaccgatggagatacgcacattcttgctgaaattctga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MASSSSALVVVVAVLALAEAAVAFSGYNTSAGAVAGKLNVHLVP HSHDDVGWLKTIDQYFVGTNNSIQGACVMNTLDSVVDALILDPARKFVFAEQAFFQRW WAEKSPKIQAIVHKLVDSGQLEFINGGWCMHDEAAVHYIDMIDQTTLGHRVIKKQFNK IPRAGWQIDPFGHSAVQGYLLGAELGFDSMHFARIDYQDRAKRKGDKGLEVIWRGSRT FGSSSQIFTNAFPVHYSPPDGFGFEIFDDFVPVQDDMLLFDYNLKERVNDFVAAALKQ ANVTRTNHIMWTMGDDFNYQYAESWFRNMDRLINYVNKDGRVHALYSTPSIYTDAKHA SNESWPLKYDDYFPYADAKNAYWTGYFTSRPTFKRYIRMISGYYLAARQLEFLVGRSS LGLFTSSLEDPLGIAQHHDAVSGTAKQHTTDDYSKRLAIGVSQVEKGVNTALSCLTSS KGTCTATKFSQCQLLNISYCPSTEEGISSAKSLVIVVYNPLGWERSDFVRVPVNDANL IVKTSDGTSLESQLVEVDIVTARLRKLYIKAYLGITSDKPPKYWLVFQASVPPLGWNT YFISKSTGTGSNGMGYVSTMVSPSNDTIEIGPGPLKMSYSSKSGQLKRMFNSISAVDL PIQQSFLWYASSTGDSEDSQASGAYIFRPNRTTPTIVSGMAPLKVIHGPLVDEVHQQF SSWIYQVTRLYKNKEHAEVEYTIGPIPVDDDDDIGKEVVTRLTTNMATNKIFYTDSNG RDFLERVRNHRDDWDLNLSQPVAGNYYPVNQGIYVADGKYELSVLVDHAVGASSIQDG QIEVMLHRRLSADDGRGVGEPLNEVVCVDQKCDGLVARATYYINVNKKGHGAHWRRTY SQQVYSPFLVAFAHEDERSWKSNNIAKASTVEGNYSLPDNVAIITLQSLDDGTTLLRL AHLFQAQEDTQYSVMAKVELRKLFGKRIIKDLTETSLSANQKKSEMKKLNWRVTGESK TDPAPLKGGPVDSHALVVELGPMEIRTFLLKF</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os10g0140200, RefSeq:Os10g0140200